MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aciduliprofundum boonei T469 chromosome

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013926	TCATA	2	10	19	28	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013926	TACCT	2	10	14138	14147	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013926	TGGCT	2	10	14388	14397	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013926	TCAAT	2	10	63592	63601	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013926	CAGAG	2	10	69974	69983	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013926	ATTAA	2	10	76497	76506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013926	TAAAT	2	10	88196	88205	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013926	GTCCC	2	10	132741	132750	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013926	AAAAG	2	10	141656	141665	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013926	TATTT	2	10	142605	142614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013926	TAAAA	2	10	144789	144798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013926	TTTAA	2	10	187955	187964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013926	TTTTA	2	10	197793	197802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013926	ATTTT	2	10	197848	197857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013926	AATTA	2	10	234213	234222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013926	TATTT	2	10	246784	246793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013926	TATTT	2	10	252102	252111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013926	TATTT	2	10	268850	268859	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013926	TATAA	2	10	272808	272817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013926	AAATA	2	10	321074	321083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013926	AGAAA	2	10	357240	357249	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013926	TTAAG	2	10	366176	366185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013926	ATATT	2	10	384105	384114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013926	TTCTA	2	10	389590	389599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013926	TTCTG	2	10	401671	401680	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013926	CCCTT	2	10	402016	402025	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_013926	GATAG	2	10	436338	436347	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013926	AGATG	2	10	439283	439292	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013926	AAAAT	2	10	444243	444252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013926	TTAAT	2	10	452180	452189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013926	GAAAA	2	10	478733	478742	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013926	TGAAT	2	10	498997	499006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013926	CATGA	2	10	525290	525299	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013926	TATTT	2	10	534133	534142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013926	TTTTA	2	10	585687	585696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013926	TATAA	2	10	595046	595055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013926	ATCAA	2	10	612895	612904	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013926	TATAA	2	10	617685	617694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013926	TTATT	2	10	620983	620992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013926	GAATG	2	10	647536	647545	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013926	AGGAT	2	10	687105	687114	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013926	AAAGG	2	10	700968	700977	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013926	ATTTG	2	10	702979	702988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013926	AGCTA	2	10	712285	712294	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013926	AACTT	2	10	722816	722825	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013926	TTTTA	2	10	724186	724195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013926	TATTT	2	10	726570	726579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013926	TTAAT	2	10	730686	730695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013926	AAAAG	2	10	763312	763321	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013926	TAAAA	2	10	766067	766076	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013926	AATGA	2	10	778084	778093	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013926	TAAAG	2	10	826041	826050	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013926	TATAT	2	10	832431	832440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013926	TTTTC	2	10	856280	856289	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013926	CTTTT	2	10	860836	860845	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013926	TTACC	2	10	866167	866176	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_013926	TAATT	2	10	933343	933352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013926	ACACC	2	10	934307	934316	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_013926	TGATA	2	10	934329	934338	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013926	GGCTA	2	10	934423	934432	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013926	AAATG	2	10	958772	958781	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013926	TTGTA	2	10	962845	962854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013926	CCACA	2	10	977791	977800	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_013926	CCACA	2	10	977857	977866	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_013926	CCACA	2	10	977924	977933	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_013926	CCACA	2	10	977989	977998	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_013926	CCACA	2	10	978055	978064	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_013926	CCACA	2	10	978121	978130	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_013926	CCACA	2	10	978187	978196	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_013926	CCACA	2	10	978255	978264	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_013926	CCACA	2	10	983171	983180	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
72	NC_013926	CCACA	2	10	983237	983246	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_013926	CCACA	2	10	983302	983311	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_013926	CCACA	2	10	983374	983383	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_013926	CCACA	2	10	983440	983449	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_013926	CCACA	2	10	983507	983516	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_013926	CCACA	2	10	983573	983582	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_013926	CCACA	2	10	983642	983651	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_013926	CCACA	2	10	983711	983720	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_013926	CCACA	2	10	983777	983786	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_013926	CCACA	2	10	983846	983855	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_013926	CCACA	2	10	983917	983926	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_013926	CCACA	2	10	983983	983992	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_013926	CCACA	2	10	984047	984056	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_013926	CCACA	2	10	984108	984117	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_013926	CCTAT	2	10	994146	994155	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_013926	TTTAT	2	10	1005213	1005222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013926	TTCGT	2	10	1007880	1007889	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013926	TGCCA	2	10	1008909	1008918	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_013926	ATAAA	2	10	1030758	1030767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013926	GATTT	2	10	1036076	1036085	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013926	TGATT	2	10	1051825	1051834	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013926	CTTTT	2	10	1095286	1095295	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013926	AAATA	2	10	1105505	1105514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013926	TATAA	2	10	1153940	1153949	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013926	TCAAA	2	10	1159868	1159877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013926	TAAAA	2	10	1165006	1165015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013926	CCCTA	2	10	1181298	1181307	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_013926	TTTAT	2	10	1197243	1197252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013926	TCCAC	2	10	1197742	1197751	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_013926	ACATA	2	10	1197853	1197862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013926	TAAAA	2	10	1220729	1220738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013926	TAAAG	2	10	1276347	1276356	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013926	GTGAT	2	10	1290759	1290768	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013926	TGCAA	2	10	1299807	1299816	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013926	AATAT	2	10	1313757	1313766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013926	GTAGT	2	10	1330869	1330878	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013926	ACCCC	2	10	1344442	1344451	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
109	NC_013926	ACCCC	2	10	1344504	1344513	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
110	NC_013926	CCTTT	2	10	1359322	1359331	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_013926	GTTTT	2	10	1359462	1359471	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013926	CTCTT	2	10	1395707	1395716	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013926	AAAAT	2	10	1416564	1416573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013926	CATCC	2	10	1439236	1439245	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_013926	GAAGG	2	10	1440741	1440750	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013926	ATGAA	2	10	1458348	1458357	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013926	CTTTT	2	10	1466332	1466341	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.