MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG02

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013924	TCACGA	2	12	423	434	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289937460
2	NC_013924	GAACTC	2	12	2301	2312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289937461
3	NC_013924	TCGTAC	2	12	5495	5506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013924	CGGAAC	2	12	7527	7538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937466
5	NC_013924	CGGAAC	2	12	7557	7568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937466
6	NC_013924	CGGAAC	2	12	7587	7598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937466
7	NC_013924	GACAGC	2	12	8877	8888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937467
8	NC_013924	GCGTAC	2	12	9317	9328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937467
9	NC_013924	TCCGAC	2	12	12543	12554	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937469
10	NC_013924	CATCGC	2	12	13378	13389	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937470
11	NC_013924	TGAGGA	2	12	14674	14685	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	289937471
12	NC_013924	TCGTGT	2	12	14831	14842	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289937471
13	NC_013924	CACTCC	2	12	16961	16972	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	289937474
14	NC_013924	GTTCCC	2	12	18749	18760	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	289937475
15	NC_013924	CGTCAC	2	12	20346	20357	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937476
16	NC_013924	CAAGCG	2	12	20526	20537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937476
17	NC_013924	GTTTGA	2	12	21927	21938	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289937477
18	NC_013924	TGTGAG	2	12	24579	24590	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289937479
19	NC_013924	GGGATT	2	12	28444	28455	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289937482
20	NC_013924	CCGGAA	2	12	32632	32643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937485
21	NC_013924	TATTGA	2	12	36732	36743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289937489
22	NC_013924	ACTCGT	2	12	37842	37853	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289937489
23	NC_013924	ATCTTG	2	12	43410	43421	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289937492
24	NC_013924	GCGATC	2	12	45873	45884	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937494
25	NC_013924	GGGAAA	2	12	46364	46375	50 %	0 %	50 %	0 %	289937495
26	NC_013924	CCCCGA	2	12	53537	53548	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	289937504
27	NC_013924	CGGCAA	2	12	59178	59189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937509
28	NC_013924	TTCTAT	2	12	60116	60127	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013924	GCGAGC	2	12	65397	65408	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289937513
30	NC_013924	GGGTAC	2	12	67524	67535	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289937515
31	NC_013924	CACCTA	2	12	78038	78049	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	289937525
32	NC_013924	ATCGCC	2	12	84137	84148	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937531
33	NC_013924	TCTCGC	2	12	84625	84636	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013924	GAGTGT	2	12	85266	85277	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289937532
35	NC_013924	GCAATT	2	12	87533	87544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289937533
36	NC_013924	TTCGGA	2	12	88887	88898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289937534
37	NC_013924	TGCGAG	2	12	89585	89596	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289937535
38	NC_013924	CCATCG	2	12	93398	93409	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937538
39	NC_013924	ACTCGA	2	12	93845	93856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289937539
40	NC_013924	GGCATC	2	12	95967	95978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937540
41	NC_013924	GAGACG	2	12	102424	102435	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013924	ATCTGG	2	12	106888	106899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013924	ATTGGT	2	12	108124	108135	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289937550
44	NC_013924	ACGATG	2	12	111139	111150	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289937554
45	NC_013924	TGATAT	2	12	113634	113645	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289937556
46	NC_013924	TCGACC	2	12	127152	127163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013924	CGGTTC	2	12	133101	133112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937576
48	NC_013924	CGCCAG	2	12	133830	133841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289937577
49	NC_013924	TCCGCG	2	12	137131	137142	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289937579
50	NC_013924	TCGGTC	2	12	137798	137809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013924	CGGTGA	2	12	141186	141197	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289937580
52	NC_013924	GTCAGT	2	12	142831	142842	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289937580
53	NC_013924	TGAAAC	2	12	143904	143915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289937581
54	NC_013924	TTCGCT	2	12	144439	144450	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289937582
55	NC_013924	GTCGAC	2	12	144864	144875	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937582
56	NC_013924	ATCGAC	2	12	146241	146252	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289937582
57	NC_013924	CGAGGA	2	12	147060	147071	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289937583
58	NC_013924	TCGACG	2	12	147913	147924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937584
59	NC_013924	ACGGCG	2	12	150103	150114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289937587
60	NC_013924	GATCGC	2	12	150639	150650	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937587
61	NC_013924	GCTGGA	2	12	155961	155972	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289937591
62	NC_013924	GAGCAT	2	12	156019	156030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289937591
63	NC_013924	GCGATG	2	12	156282	156293	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289937591
64	NC_013924	GCGACG	2	12	156300	156311	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289937591
65	NC_013924	GCGTCG	2	12	156312	156323	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289937591
66	NC_013924	GGGATC	2	12	158651	158662	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289937593
67	NC_013924	GTCGCC	2	12	159308	159319	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289937594
68	NC_013924	GACGTG	2	12	159326	159337	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289937594
69	NC_013924	GTTCGA	2	12	159805	159816	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289937594
70	NC_013924	TGACTG	2	12	164259	164270	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289937596
71	NC_013924	CCTCAG	2	12	164889	164900	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937597
72	NC_013924	GAGAAC	2	12	165752	165763	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289937598
73	NC_013924	CCACCC	2	12	166794	166805	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	289937599
74	NC_013924	ACCGCC	2	12	166964	166975	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	289937599
75	NC_013924	TCGCGG	2	12	167293	167304	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289937599
76	NC_013924	CGTCGG	2	12	167717	167728	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289937599
77	NC_013924	ACCGCC	2	12	167828	167839	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	289937599
78	NC_013924	CGCCAG	2	12	168277	168288	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289937599
79	NC_013924	CTCGAC	2	12	168672	168683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937599
80	NC_013924	TGCCAT	2	12	168970	168981	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289937599
81	NC_013924	ATCGGA	2	12	169635	169646	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013924	GTCCCA	2	12	173160	173171	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937602
83	NC_013924	CGAGCG	2	12	174965	174976	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289937603
84	NC_013924	GGCGAT	2	12	177773	177784	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289937605
85	NC_013924	CTTCGT	2	12	181123	181134	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289937612
86	NC_013924	AGCGTC	2	12	182001	182012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937612
87	NC_013924	GTTCGA	2	12	184184	184195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289937614
88	NC_013924	TCTCGA	2	12	184634	184645	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289937614
89	NC_013924	CTCGAC	2	12	185249	185260	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937615
90	NC_013924	GATGCT	2	12	186395	186406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289937616
91	NC_013924	ACCGAG	2	12	188175	188186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937616
92	NC_013924	TCAAAC	2	12	189316	189327	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289937617
93	NC_013924	GAAGCA	2	12	190137	190148	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289937618
94	NC_013924	GGTCGA	2	12	191549	191560	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289937619
95	NC_013924	GCACCA	2	12	191649	191660	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289937619
96	NC_013924	GAAAGA	2	12	192690	192701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013924	GAGGGC	2	12	195407	195418	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	289937625
98	NC_013924	ACGGCG	2	12	200900	200911	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013924	TCCCAC	2	12	204140	204151	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	289937631
100	NC_013924	GTTTTC	2	12	210324	210335	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	289937638
101	NC_013924	GGACCG	2	12	211701	211712	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289937640
102	NC_013924	GAAGCG	2	12	211795	211806	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289937640
103	NC_013924	CGACAG	2	12	212046	212057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937640
104	NC_013924	AACACG	2	12	212441	212452	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013924	CCGTCC	2	12	219369	219380	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	289937648
106	NC_013924	CACCTC	2	12	219404	219415	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	289937648
107	NC_013924	ACCGCT	2	12	220552	220563	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937649
108	NC_013924	AGTTCG	2	12	222734	222745	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289937651
109	NC_013924	GATCGG	2	12	227192	227203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289937655
110	NC_013924	CGTCGC	2	12	227495	227506	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289937655
111	NC_013924	TGACGA	2	12	234851	234862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289937660
112	NC_013924	TCGACG	2	12	235014	235025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937661
113	NC_013924	AAGGTA	2	12	235810	235821	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013924	TCGCCG	2	12	240559	240570	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289937668
115	NC_013924	TGACGA	2	12	242343	242354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013924	CGTTCA	2	12	243495	243506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289937673
117	NC_013924	TCACCG	2	12	248348	248359	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289937677
118	NC_013924	TGAGCT	2	12	251770	251781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289937677
119	NC_013924	CTCGAG	2	12	253892	253903	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937678
120	NC_013924	TCTGAC	2	12	253906	253917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289937678

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.