MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG02

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013924	GCGAT	2	10	3848	3857	20 %	20 %	40 %	20 %	289937463
2	NC_013924	AGTGG	2	10	5132	5141	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013924	ACTCC	2	10	5461	5470	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_013924	TTGGC	2	10	5700	5709	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013924	CTACG	2	10	5992	6001	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013924	CTACG	2	10	6074	6083	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013924	CTACG	2	10	6156	6165	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013924	GACTG	2	10	6593	6602	20 %	20 %	40 %	20 %	289937465
9	NC_013924	GACCG	2	10	7639	7648	20 %	0 %	40 %	40 %	289937466
10	NC_013924	CACGG	2	10	9767	9776	20 %	0 %	40 %	40 %	289937467
11	NC_013924	TAAAC	2	10	10185	10194	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013924	ATCGT	2	10	10656	10665	20 %	40 %	20 %	20 %	289937468
13	NC_013924	TCTCC	2	10	11206	11215	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_013924	CACCC	2	10	12006	12015	20 %	0 %	0 %	80 %	289937469
15	NC_013924	TTTGT	2	10	13058	13067	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013924	GTACG	2	10	13438	13447	20 %	20 %	40 %	20 %	289937470
17	NC_013924	AGTCA	2	10	14016	14025	40 %	20 %	20 %	20 %	289937471
18	NC_013924	GACGG	2	10	15721	15730	20 %	0 %	60 %	20 %	289937473
19	NC_013924	GTCAC	2	10	16127	16136	20 %	20 %	20 %	40 %	289937473
20	NC_013924	GACGG	2	10	16811	16820	20 %	0 %	60 %	20 %	289937474
21	NC_013924	CCGAG	2	10	18227	18236	20 %	0 %	40 %	40 %	289937474
22	NC_013924	CACAA	2	10	18417	18426	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013924	ATCGT	2	10	18610	18619	20 %	40 %	20 %	20 %	289937475
24	NC_013924	TTCGA	2	10	18762	18771	20 %	40 %	20 %	20 %	289937475
25	NC_013924	CCCGA	2	10	19302	19311	20 %	0 %	20 %	60 %	289937475
26	NC_013924	CGGAA	2	10	19440	19449	40 %	0 %	40 %	20 %	289937475
27	NC_013924	CGGTT	2	10	20186	20195	0 %	40 %	40 %	20 %	289937476
28	NC_013924	TCAAC	2	10	22977	22986	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013924	TCATT	2	10	23775	23784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013924	GATTC	2	10	24517	24526	20 %	40 %	20 %	20 %	289937479
31	NC_013924	AGCGC	2	10	27093	27102	20 %	0 %	40 %	40 %	289937481
32	NC_013924	TGTCT	2	10	27431	27440	0 %	60 %	20 %	20 %	289937481
33	NC_013924	CCCCA	2	10	27937	27946	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
34	NC_013924	ATTCC	2	10	29363	29372	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013924	ACGGG	2	10	29809	29818	20 %	0 %	60 %	20 %	289937483
36	NC_013924	CACAA	2	10	32088	32097	60 %	0 %	0 %	40 %	289937484
37	NC_013924	CGATC	2	10	32740	32749	20 %	20 %	20 %	40 %	289937485
38	NC_013924	CGTAT	2	10	33071	33080	20 %	40 %	20 %	20 %	289937485
39	NC_013924	TCGAT	2	10	33515	33524	20 %	40 %	20 %	20 %	289937486
40	NC_013924	TCGAA	2	10	37286	37295	40 %	20 %	20 %	20 %	289937489
41	NC_013924	TACAT	2	10	38223	38232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013924	ATTGC	2	10	45410	45419	20 %	40 %	20 %	20 %	289937494
43	NC_013924	GCCCT	2	10	46242	46251	0 %	20 %	20 %	60 %	289937495
44	NC_013924	GGGTT	2	10	48738	48747	0 %	40 %	60 %	0 %	289937498
45	NC_013924	GTCAC	2	10	48989	48998	20 %	20 %	20 %	40 %	289937499
46	NC_013924	GAATC	2	10	49439	49448	40 %	20 %	20 %	20 %	289937500
47	NC_013924	GCGTG	2	10	49753	49762	0 %	20 %	60 %	20 %	289937500
48	NC_013924	TATAT	2	10	50157	50166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013924	GATCG	2	10	52520	52529	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013924	TTGAC	2	10	54873	54882	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013924	CCGAT	2	10	55924	55933	20 %	20 %	20 %	40 %	289937506
52	NC_013924	CGCGA	2	10	56485	56494	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013924	TATTG	2	10	57439	57448	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013924	CTGAA	2	10	57706	57715	40 %	20 %	20 %	20 %	289937508
55	NC_013924	TTCGT	2	10	58430	58439	0 %	60 %	20 %	20 %	289937508
56	NC_013924	CGATC	2	10	61582	61591	20 %	20 %	20 %	40 %	289937510
57	NC_013924	TGGCT	2	10	62269	62278	0 %	40 %	40 %	20 %	289937511
58	NC_013924	GCAGA	2	10	64064	64073	40 %	0 %	40 %	20 %	289937512
59	NC_013924	ATCGG	2	10	64850	64859	20 %	20 %	40 %	20 %	289937513
60	NC_013924	GAACG	2	10	65074	65083	40 %	0 %	40 %	20 %	289937513
61	NC_013924	TTATT	2	10	69610	69619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013924	CGCGG	2	10	75357	75366	0 %	0 %	60 %	40 %	289937522
63	NC_013924	CAGAG	2	10	75758	75767	40 %	0 %	40 %	20 %	289937522
64	NC_013924	AACCC	2	10	76543	76552	40 %	0 %	0 %	60 %	289937523
65	NC_013924	TCGAC	2	10	77711	77720	20 %	20 %	20 %	40 %	289937525
66	NC_013924	CGGTC	2	10	80950	80959	0 %	20 %	40 %	40 %	289937528
67	NC_013924	CTCGT	2	10	82067	82076	0 %	40 %	20 %	40 %	289937529
68	NC_013924	TTCGA	2	10	82346	82355	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013924	CGTCC	2	10	84565	84574	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_013924	ACGAC	2	10	84599	84608	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013924	TGCAG	2	10	84717	84726	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013924	TCGCG	2	10	85746	85755	0 %	20 %	40 %	40 %	289937532
73	NC_013924	CGCGA	2	10	88267	88276	20 %	0 %	40 %	40 %	289937534
74	NC_013924	CCGTC	2	10	88913	88922	0 %	20 %	20 %	60 %	289937534
75	NC_013924	CCGAC	2	10	89978	89987	20 %	0 %	20 %	60 %	289937535
76	NC_013924	CTTGT	2	10	90111	90120	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013924	TTCCC	2	10	91201	91210	0 %	40 %	0 %	60 %	289937537
78	NC_013924	GTCCA	2	10	92488	92497	20 %	20 %	20 %	40 %	289937538
79	NC_013924	TTCGT	2	10	93227	93236	0 %	60 %	20 %	20 %	289937538
80	NC_013924	TACCC	2	10	93594	93603	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_013924	ACACC	2	10	94616	94625	40 %	0 %	0 %	60 %	289937539
82	NC_013924	GCGTC	2	10	97679	97688	0 %	20 %	40 %	40 %	289937542
83	NC_013924	TTCCG	2	10	101317	101326	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013924	TGAGT	2	10	101772	101781	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013924	ATTCT	2	10	106773	106782	20 %	60 %	0 %	20 %	289937549
86	NC_013924	ACGAA	2	10	107472	107481	60 %	0 %	20 %	20 %	289937550
87	NC_013924	GTCCA	2	10	115118	115127	20 %	20 %	20 %	40 %	289937558
88	NC_013924	CACAA	2	10	115981	115990	60 %	0 %	0 %	40 %	289937559
89	NC_013924	TCGGT	2	10	117491	117500	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013924	GGGAC	2	10	119812	119821	20 %	0 %	60 %	20 %	289937563
91	NC_013924	GTCAC	2	10	120408	120417	20 %	20 %	20 %	40 %	289937563
92	NC_013924	TCACC	2	10	120586	120595	20 %	20 %	0 %	60 %	289937563
93	NC_013924	GCAGA	2	10	120654	120663	40 %	0 %	40 %	20 %	289937563
94	NC_013924	TGCAC	2	10	121182	121191	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013924	TCTGT	2	10	124213	124222	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013924	TGGAC	2	10	124823	124832	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013924	GAACG	2	10	125568	125577	40 %	0 %	40 %	20 %	289937568
98	NC_013924	TGGCG	2	10	127506	127515	0 %	20 %	60 %	20 %	289937569
99	NC_013924	CCAAC	2	10	128170	128179	40 %	0 %	0 %	60 %	289937570
100	NC_013924	GTTGG	2	10	128614	128623	0 %	40 %	60 %	0 %	289937570
101	NC_013924	TTCGA	2	10	129923	129932	20 %	40 %	20 %	20 %	289937572
102	NC_013924	AGGTC	2	10	132284	132293	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013924	CCGCG	2	10	136691	136700	0 %	0 %	40 %	60 %	289937579
104	NC_013924	GCAGG	2	10	137003	137012	20 %	0 %	60 %	20 %	289937579
105	NC_013924	CGATC	2	10	137400	137409	20 %	20 %	20 %	40 %	289937579
106	NC_013924	GTTAT	2	10	138891	138900	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013924	TCACC	2	10	139591	139600	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_013924	CGATC	2	10	140256	140265	20 %	20 %	20 %	40 %	289937580
109	NC_013924	AGTTG	2	10	143139	143148	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013924	CTCCC	2	10	144880	144889	0 %	20 %	0 %	80 %	289937582
111	NC_013924	GCGAC	2	10	147296	147305	20 %	0 %	40 %	40 %	289937583
112	NC_013924	GATCG	2	10	147846	147855	20 %	20 %	40 %	20 %	289937584
113	NC_013924	CGTCC	2	10	148943	148952	0 %	20 %	20 %	60 %	289937585
114	NC_013924	GAACC	2	10	149135	149144	40 %	0 %	20 %	40 %	289937585
115	NC_013924	CCGCC	2	10	150701	150710	0 %	0 %	20 %	80 %	289937587
116	NC_013924	CGAAT	2	10	151585	151594	40 %	20 %	20 %	20 %	289937588
117	NC_013924	GACTC	3	15	151893	151907	20 %	20 %	20 %	40 %	289937588
118	NC_013924	CTGCG	2	10	153366	153375	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_013924	CAGAA	2	10	153398	153407	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013924	GGTCG	2	10	155291	155300	0 %	20 %	60 %	20 %	289937590
121	NC_013924	GCACT	2	10	156701	156710	20 %	20 %	20 %	40 %	289937591
122	NC_013924	ACCCG	2	10	156989	156998	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_013924	GCACA	2	10	157024	157033	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_013924	TCCAC	2	10	157291	157300	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_013924	GCGAC	2	10	160973	160982	20 %	0 %	40 %	40 %	289937595
126	NC_013924	ACCAG	2	10	162210	162219	40 %	0 %	20 %	40 %	289937595
127	NC_013924	TGATC	2	10	164383	164392	20 %	40 %	20 %	20 %	289937597
128	NC_013924	GTTGC	2	10	165450	165459	0 %	40 %	40 %	20 %	289937598
129	NC_013924	GGCGA	2	10	165628	165637	20 %	0 %	60 %	20 %	289937598
130	NC_013924	CGCGT	2	10	166735	166744	0 %	20 %	40 %	40 %	289937599
131	NC_013924	AATCG	2	10	167025	167034	40 %	20 %	20 %	20 %	289937599
132	NC_013924	CGGCG	2	10	169047	169056	0 %	0 %	60 %	40 %	289937599
133	NC_013924	ATCCG	2	10	169285	169294	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_013924	CGGAC	2	10	170051	170060	20 %	0 %	40 %	40 %	289937600
135	NC_013924	GTCGA	2	10	171521	171530	20 %	20 %	40 %	20 %	289937601
136	NC_013924	ACCGA	2	10	171864	171873	40 %	0 %	20 %	40 %	289937601
137	NC_013924	GAACC	2	10	172944	172953	40 %	0 %	20 %	40 %	289937602
138	NC_013924	GGGGC	2	10	173374	173383	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013924	TCGAC	2	10	173738	173747	20 %	20 %	20 %	40 %	289937603
140	NC_013924	GAGGG	2	10	174367	174376	20 %	0 %	80 %	0 %	289937603
141	NC_013924	GCAAC	2	10	175232	175241	40 %	0 %	20 %	40 %	289937603
142	NC_013924	AGCGG	2	10	177679	177688	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013924	CATCA	2	10	177834	177843	40 %	20 %	0 %	40 %	289937605
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146	NC_013924	TCGAC	2	10	181674	181683	20 %	20 %	20 %	40 %	289937612
147	NC_013924	TCGAC	2	10	182044	182053	20 %	20 %	20 %	40 %	289937612
148	NC_013924	TCACC	2	10	182212	182221	20 %	20 %	0 %	60 %	289937612
149	NC_013924	CAACT	2	10	182463	182472	40 %	20 %	0 %	40 %	289937613
150	NC_013924	GAATC	2	10	183279	183288	40 %	20 %	20 %	20 %	289937613
151	NC_013924	CTGGC	2	10	183514	183523	0 %	20 %	40 %	40 %	289937613
152	NC_013924	GTACG	2	10	183725	183734	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_013924	ATCGA	2	10	184688	184697	40 %	20 %	20 %	20 %	289937614
154	NC_013924	ACTCG	2	10	185091	185100	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_013924	GGCGC	2	10	185525	185534	0 %	0 %	60 %	40 %	289937615
156	NC_013924	GATCC	2	10	186340	186349	20 %	20 %	20 %	40 %	289937616
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158	NC_013924	ACCGA	2	10	186579	186588	40 %	0 %	20 %	40 %	289937616
159	NC_013924	GAGTG	2	10	188438	188447	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013924	CGATG	2	10	190353	190362	20 %	20 %	40 %	20 %	289937618
161	NC_013924	GATCG	2	10	190506	190515	20 %	20 %	40 %	20 %	289937618
162	NC_013924	GGGGT	2	10	191167	191176	0 %	20 %	80 %	0 %	289937618
163	NC_013924	CTCTC	2	10	191731	191740	0 %	40 %	0 %	60 %	289937619
164	NC_013924	CTCGC	2	10	191815	191824	0 %	20 %	20 %	60 %	289937619
165	NC_013924	AAAAC	2	10	194343	194352	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_013924	CTCGT	2	10	194655	194664	0 %	40 %	20 %	40 %	289937624
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168	NC_013924	ACGAT	2	10	196739	196748	40 %	20 %	20 %	20 %	289937626
169	NC_013924	GCTTC	2	10	198058	198067	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
170	NC_013924	CGTTC	2	10	198101	198110	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
171	NC_013924	TCGCG	2	10	198675	198684	0 %	20 %	40 %	40 %	289937628
172	NC_013924	CTGAC	2	10	200318	200327	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
173	NC_013924	CTCTT	2	10	201583	201592	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
174	NC_013924	GGCCT	2	10	201643	201652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
175	NC_013924	ACTTC	2	10	201834	201843	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
176	NC_013924	ACGAG	2	10	202921	202930	40 %	0 %	40 %	20 %	289937630
177	NC_013924	TACAT	2	10	204299	204308	40 %	40 %	0 %	20 %	289937631
178	NC_013924	CGGCC	2	10	205837	205846	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
179	NC_013924	TCGTC	2	10	207289	207298	0 %	40 %	20 %	40 %	289937635
180	NC_013924	ACGAC	2	10	210924	210933	40 %	0 %	20 %	40 %	289937639
181	NC_013924	TGGCG	2	10	211592	211601	0 %	20 %	60 %	20 %	289937640
182	NC_013924	CTCGA	2	10	212195	212204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
183	NC_013924	ACCCT	2	10	212792	212801	20 %	20 %	0 %	60 %	289937641
184	NC_013924	AGCAA	2	10	214334	214343	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_013924	TTCGA	2	10	217929	217938	20 %	40 %	20 %	20 %	289937647
186	NC_013924	CGTGT	2	10	221150	221159	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
187	NC_013924	GTTCG	2	10	221984	221993	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
188	NC_013924	GAAGC	2	10	224522	224531	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
189	NC_013924	GCGGG	2	10	225693	225702	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
190	NC_013924	CGACG	2	10	226230	226239	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
191	NC_013924	CCAAA	2	10	226241	226250	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
192	NC_013924	CGACC	2	10	227022	227031	20 %	0 %	20 %	60 %	289937655
193	NC_013924	CGCGG	2	10	228115	228124	0 %	0 %	60 %	40 %	289937655
194	NC_013924	CTCGA	2	10	230445	230454	20 %	20 %	20 %	40 %	289937656
195	NC_013924	TGTAT	2	10	230770	230779	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_013924	TCTCC	2	10	233669	233678	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
197	NC_013924	GATCG	2	10	234947	234956	20 %	20 %	40 %	20 %	289937661
198	NC_013924	GTCAC	2	10	236719	236728	20 %	20 %	20 %	40 %	289937663
199	NC_013924	AGACG	2	10	236823	236832	40 %	0 %	40 %	20 %	289937663
200	NC_013924	CGGAA	2	10	236997	237006	40 %	0 %	40 %	20 %	289937663
201	NC_013924	TCCCC	2	10	240316	240325	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
202	NC_013924	GTCAG	2	10	241144	241153	20 %	20 %	40 %	20 %	289937668
203	NC_013924	ACCAC	2	10	241732	241741	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
204	NC_013924	GATCG	2	10	242439	242448	20 %	20 %	40 %	20 %	289937670
205	NC_013924	CCGTT	2	10	244101	244110	0 %	40 %	20 %	40 %	289937673
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208	NC_013924	ATGAT	2	10	247838	247847	40 %	40 %	20 %	0 %	289937676
209	NC_013924	ATCAG	2	10	251984	251993	40 %	20 %	20 %	20 %	289937677
210	NC_013924	TTGAT	2	10	252245	252254	20 %	60 %	20 %	0 %	289937677
211	NC_013924	AAGGG	2	10	254789	254798	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.