MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG02

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013924	AGTGG	2	10	5132	5141	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013924	ACTCC	2	10	5461	5470	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_013924	TTGGC	2	10	5700	5709	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013924	CTACG	2	10	5992	6001	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013924	CTACG	2	10	6074	6083	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013924	CTACG	2	10	6156	6165	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013924	TAAAC	2	10	10185	10194	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013924	TCTCC	2	10	11206	11215	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013924	TTTGT	2	10	13058	13067	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013924	CACAA	2	10	18417	18426	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013924	TCAAC	2	10	22977	22986	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013924	TCATT	2	10	23775	23784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013924	CCCCA	2	10	27937	27946	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_013924	ATTCC	2	10	29363	29372	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013924	TACAT	2	10	38223	38232	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013924	TATAT	2	10	50157	50166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013924	GATCG	2	10	52520	52529	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013924	TTGAC	2	10	54873	54882	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013924	CGCGA	2	10	56485	56494	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013924	TATTG	2	10	57439	57448	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013924	TTATT	2	10	69610	69619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013924	TTCGA	2	10	82346	82355	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013924	CGTCC	2	10	84565	84574	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_013924	ACGAC	2	10	84599	84608	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013924	TGCAG	2	10	84717	84726	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013924	CTTGT	2	10	90111	90120	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013924	TACCC	2	10	93594	93603	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_013924	TTCCG	2	10	101317	101326	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013924	TGAGT	2	10	101772	101781	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013924	TCGGT	2	10	117491	117500	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013924	TGCAC	2	10	121182	121191	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_013924	TCTGT	2	10	124213	124222	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013924	TGGAC	2	10	124823	124832	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013924	AGGTC	2	10	132284	132293	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013924	GTTAT	2	10	138891	138900	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013924	TCACC	2	10	139591	139600	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_013924	AGTTG	2	10	143139	143148	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013924	CTGCG	2	10	153366	153375	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013924	CAGAA	2	10	153398	153407	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013924	ACCCG	2	10	156989	156998	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_013924	GCACA	2	10	157024	157033	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013924	TCCAC	2	10	157291	157300	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_013924	ATCCG	2	10	169285	169294	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_013924	GGGGC	2	10	173374	173383	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013924	AGCGG	2	10	177679	177688	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013924	GTACG	2	10	183725	183734	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013924	ACTCG	2	10	185091	185100	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_013924	GAGTG	2	10	188438	188447	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013924	AAAAC	2	10	194343	194352	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013924	GCTTC	2	10	198058	198067	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_013924	CGTTC	2	10	198101	198110	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013924	CTGAC	2	10	200318	200327	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013924	CTCTT	2	10	201583	201592	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_013924	GGCCT	2	10	201643	201652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_013924	ACTTC	2	10	201834	201843	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_013924	CGGCC	2	10	205837	205846	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_013924	CTCGA	2	10	212195	212204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_013924	AGCAA	2	10	214334	214343	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013924	CGTGT	2	10	221150	221159	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013924	GTTCG	2	10	221984	221993	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013924	GAAGC	2	10	224522	224531	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013924	GCGGG	2	10	225693	225702	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013924	CGACG	2	10	226230	226239	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_013924	CCAAA	2	10	226241	226250	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_013924	TGTAT	2	10	230770	230779	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013924	TCTCC	2	10	233669	233678	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_013924	TCCCC	2	10	240316	240325	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
68	NC_013924	ACCAC	2	10	241732	241741	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_013924	AAGGG	2	10	254789	254798	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.