MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG02

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013924	TTAG	2	8	6198	6205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013924	GGCT	2	8	6255	6262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013924	GTCG	2	8	9957	9964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013924	TGTA	2	8	10284	10291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013924	CGAG	2	8	11035	11042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013924	CGAC	2	8	11300	11307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013924	CTGT	2	8	12960	12967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013924	ACGC	2	8	22926	22933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013924	AGGT	2	8	23268	23275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013924	AACG	2	8	27877	27884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013924	ACGA	2	8	29393	29400	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013924	CATT	2	8	29453	29460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013924	GCAT	2	8	38329	38336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013924	TAGT	2	8	41701	41708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013924	TCAC	2	8	41858	41865	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013924	TTCG	2	8	41866	41873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013924	TCAC	2	8	41887	41894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013924	TTCG	2	8	41895	41902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013924	TCAC	2	8	41943	41950	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013924	TTCG	2	8	41951	41958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013924	TCAC	2	8	41999	42006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013924	TTCG	2	8	42007	42014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013924	TCAC	2	8	42055	42062	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013924	TTCG	2	8	42063	42070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013924	CGCT	2	8	42081	42088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013924	CGCT	2	8	42097	42104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013924	GGTA	2	8	43557	43564	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013924	CAAC	2	8	43771	43778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013924	ACTA	2	8	46016	46023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013924	CAAT	2	8	50307	50314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013924	TGGT	2	8	50581	50588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013924	CTTC	2	8	50625	50632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013924	ATCC	2	8	50744	50751	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013924	TTTC	2	8	52407	52414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013924	CAAC	2	8	52437	52444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013924	GTTT	2	8	53223	53230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013924	CCGA	2	8	53372	53379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013924	GATA	2	8	58959	58966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013924	GATT	2	8	65770	65777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013924	TTTA	2	8	66002	66009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013924	GTGA	2	8	69341	69348	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013924	ATCG	2	8	69545	69552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013924	GATA	2	8	76866	76873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013924	TGGA	2	8	81889	81896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013924	CTCC	2	8	82044	82051	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_013924	TTAT	2	8	82316	82323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013924	AATA	2	8	84297	84304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013924	ATTC	2	8	84370	84377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013924	ACGA	2	8	86279	86286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013924	GTTC	2	8	86425	86432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013924	ATCG	2	8	86542	86549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013924	AACG	2	8	86977	86984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013924	GTCT	2	8	87006	87013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013924	CTGA	2	8	97034	97041	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013924	CTCC	2	8	97182	97189	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_013924	TCGG	2	8	98127	98134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013924	TAGT	2	8	100827	100834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013924	ACAG	2	8	100945	100952	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013924	TACT	2	8	101142	101149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013924	ATCG	2	8	101212	101219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013924	GCCA	2	8	101841	101848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013924	GAAG	2	8	101854	101861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013924	ATCC	2	8	101979	101986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013924	ATTT	2	8	102502	102509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013924	GTGA	2	8	103448	103455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013924	ACGC	2	8	109454	109461	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013924	CACT	2	8	111852	111859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013924	AAGG	2	8	112259	112266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013924	GTTT	2	8	119605	119612	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013924	GTAG	2	8	120784	120791	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013924	ATAG	2	8	121145	121152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013924	ATCG	2	8	121153	121160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013924	GAAC	2	8	123696	123703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013924	ATAC	2	8	124255	124262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013924	AAAT	2	8	124460	124467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013924	CGAG	2	8	125415	125422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013924	ACCG	2	8	126998	127005	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013924	TCGG	2	8	127144	127151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013924	AACC	2	8	127338	127345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013924	GGGA	2	8	128828	128835	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013924	GTCG	2	8	132464	132471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013924	CTGT	2	8	137625	137632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013924	CCGA	2	8	137732	137739	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013924	GAGC	2	8	138214	138221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013924	GAGT	2	8	138910	138917	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013924	GTCG	2	8	139349	139356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013924	GGTC	2	8	139531	139538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013924	ACTC	2	8	152089	152096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013924	TCGT	2	8	152104	152111	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013924	GACA	2	8	152483	152490	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013924	GATC	2	8	152681	152688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013924	CGGG	2	8	152812	152819	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013924	GCGA	2	8	152905	152912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013924	GGTG	2	8	153571	153578	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013924	TCTG	2	8	157205	157212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013924	CCCT	2	8	163897	163904	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_013924	GGGA	2	8	169366	169373	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013924	TCAC	2	8	169445	169452	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013924	ATGG	2	8	171948	171955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013924	ACTC	2	8	172045	172052	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013924	AGTC	2	8	177110	177117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013924	CGTT	2	8	186073	186080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013924	GTTT	2	8	192307	192314	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013924	TCGG	2	8	197868	197875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013924	GCTC	2	8	198187	198194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013924	GTTC	2	8	198978	198985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013924	TCTG	2	8	199036	199043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013924	ACGC	2	8	199211	199218	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013924	GAGC	2	8	199885	199892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013924	GAAC	2	8	199901	199908	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013924	AGTG	2	8	199911	199918	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013924	CGAA	2	8	199960	199967	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013924	CGAA	2	8	200016	200023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013924	ACTG	2	8	200820	200827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013924	TTGA	2	8	201132	201139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013924	TATT	2	8	201860	201867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013924	AATT	2	8	202074	202081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013924	ACAA	2	8	202184	202191	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013924	AATC	2	8	202270	202277	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013924	GTCT	2	8	202359	202366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013924	ACTT	2	8	204681	204688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013924	AGGG	2	8	205759	205766	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013924	TCAA	2	8	205783	205790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013924	GTTT	2	8	207807	207814	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013924	TCCA	2	8	207905	207912	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013924	GGTT	2	8	208724	208731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013924	CCGC	2	8	212433	212440	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_013924	CTAT	2	8	214099	214106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013924	CAGG	2	8	214188	214195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013924	GGTT	2	8	216314	216321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013924	GAAC	2	8	221364	221371	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013924	CTGG	2	8	222031	222038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013924	TATG	2	8	223644	223651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013924	AGTG	2	8	223679	223686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013924	AATC	2	8	224380	224387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013924	TACC	2	8	224588	224595	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013924	CGAC	2	8	225558	225565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013924	CTCG	2	8	225584	225591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013924	CAAC	2	8	225721	225728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013924	GCGA	2	8	225910	225917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013924	GTTG	2	8	225935	225942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013924	GTTC	2	8	225974	225981	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013924	CGAC	2	8	226037	226044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013924	GATT	2	8	228857	228864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013924	GCAT	2	8	228872	228879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013924	CGGT	2	8	228887	228894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013924	TGGA	2	8	232481	232488	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013924	ATGG	2	8	232970	232977	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013924	GTCG	2	8	233018	233025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013924	ACCA	2	8	233517	233524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013924	TGTT	2	8	233528	233535	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013924	AAAC	2	8	233912	233919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_013924	TGAT	2	8	234001	234008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013924	AACG	2	8	234489	234496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_013924	ATAG	2	8	238570	238577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013924	ATAC	2	8	240093	240100	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_013924	ACCA	3	12	241769	241780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_013924	CACC	2	8	242370	242377	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
159	NC_013924	ATGA	2	8	244891	244898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013924	GTTA	2	8	245366	245373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013924	AGTG	2	8	245374	245381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013924	CGTA	2	8	246339	246346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_013924	GCAA	2	8	252734	252741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_013924	ACTG	2	8	253172	253179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_013924	CATT	2	8	254446	254453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_013924	TTCG	2	8	254539	254546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_013924	CCAT	2	8	254565	254572	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_013924	ATTC	2	8	254627	254634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
169	NC_013924	GAAG	2	8	254834	254841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.