MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG02

Total Repeats: 437

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013924	TG	6	12	83	94	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013924	AC	3	6	762	767	50 %	0 %	0 %	50 %	289937460
3	NC_013924	TG	3	6	885	890	0 %	50 %	50 %	0 %	289937460
4	NC_013924	GC	3	6	2058	2063	0 %	0 %	50 %	50 %	289937461
5	NC_013924	CT	3	6	3913	3918	0 %	50 %	0 %	50 %	289937463
6	NC_013924	AC	3	6	4081	4086	50 %	0 %	0 %	50 %	289937463
7	NC_013924	CA	3	6	5379	5384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013924	CG	3	6	6613	6618	0 %	0 %	50 %	50 %	289937465
9	NC_013924	GA	3	6	6943	6948	50 %	0 %	50 %	0 %	289937465
10	NC_013924	AC	3	6	7078	7083	50 %	0 %	0 %	50 %	289937465
11	NC_013924	GT	3	6	7906	7911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013924	GC	3	6	8228	8233	0 %	0 %	50 %	50 %	289937467
13	NC_013924	CG	3	6	8384	8389	0 %	0 %	50 %	50 %	289937467
14	NC_013924	TC	3	6	8680	8685	0 %	50 %	0 %	50 %	289937467
15	NC_013924	CG	3	6	10060	10065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013924	AC	3	6	10193	10198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013924	GT	3	6	10396	10401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013924	CA	3	6	10792	10797	50 %	0 %	0 %	50 %	289937468
19	NC_013924	AT	3	6	10840	10845	50 %	50 %	0 %	0 %	289937468
20	NC_013924	GT	3	6	11062	11067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013924	GA	3	6	11423	11428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013924	GA	3	6	11437	11442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013924	CT	3	6	11449	11454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013924	GC	3	6	11713	11718	0 %	0 %	50 %	50 %	289937469
25	NC_013924	AG	3	6	12332	12337	50 %	0 %	50 %	0 %	289937469
26	NC_013924	GC	3	6	13368	13373	0 %	0 %	50 %	50 %	289937470
27	NC_013924	GC	3	6	13554	13559	0 %	0 %	50 %	50 %	289937470
28	NC_013924	AT	3	6	13761	13766	50 %	50 %	0 %	0 %	289937470
29	NC_013924	AC	3	6	14376	14381	50 %	0 %	0 %	50 %	289937471
30	NC_013924	CA	3	6	14591	14596	50 %	0 %	0 %	50 %	289937471
31	NC_013924	TC	3	6	14659	14664	0 %	50 %	0 %	50 %	289937471
32	NC_013924	AC	3	6	14711	14716	50 %	0 %	0 %	50 %	289937471
33	NC_013924	GC	3	6	16327	16332	0 %	0 %	50 %	50 %	289937473
34	NC_013924	GT	3	6	16661	16666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013924	CG	4	8	16798	16805	0 %	0 %	50 %	50 %	289937474
36	NC_013924	CG	3	6	17731	17736	0 %	0 %	50 %	50 %	289937474
37	NC_013924	GC	3	6	17738	17743	0 %	0 %	50 %	50 %	289937474
38	NC_013924	CA	3	6	17758	17763	50 %	0 %	0 %	50 %	289937474
39	NC_013924	AC	3	6	17766	17771	50 %	0 %	0 %	50 %	289937474
40	NC_013924	TG	3	6	18704	18709	0 %	50 %	50 %	0 %	289937475
41	NC_013924	TC	3	6	18893	18898	0 %	50 %	0 %	50 %	289937475
42	NC_013924	CA	3	6	20860	20865	50 %	0 %	0 %	50 %	289937476
43	NC_013924	TG	3	6	21237	21242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013924	AC	3	6	21342	21347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013924	TC	3	6	22570	22575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013924	GA	3	6	23165	23170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013924	AC	3	6	23706	23711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013924	GA	3	6	24334	24339	50 %	0 %	50 %	0 %	289937478
49	NC_013924	TC	3	6	25211	25216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013924	AC	3	6	25327	25332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013924	CT	3	6	25420	25425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013924	TG	4	8	25461	25468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013924	AC	3	6	26321	26326	50 %	0 %	0 %	50 %	289937480
54	NC_013924	AT	3	6	28899	28904	50 %	50 %	0 %	0 %	289937482
55	NC_013924	AC	3	6	30626	30631	50 %	0 %	0 %	50 %	289937483
56	NC_013924	GA	3	6	30727	30732	50 %	0 %	50 %	0 %	289937483
57	NC_013924	CA	3	6	30736	30741	50 %	0 %	0 %	50 %	289937483
58	NC_013924	AC	3	6	31470	31475	50 %	0 %	0 %	50 %	289937484
59	NC_013924	TG	3	6	32661	32666	0 %	50 %	50 %	0 %	289937485
60	NC_013924	GA	3	6	32769	32774	50 %	0 %	50 %	0 %	289937485
61	NC_013924	GT	3	6	34616	34621	0 %	50 %	50 %	0 %	289937487
62	NC_013924	TC	3	6	35601	35606	0 %	50 %	0 %	50 %	289937488
63	NC_013924	AT	3	6	36102	36107	50 %	50 %	0 %	0 %	289937488
64	NC_013924	GT	3	6	36745	36750	0 %	50 %	50 %	0 %	289937489
65	NC_013924	TC	3	6	36941	36946	0 %	50 %	0 %	50 %	289937489
66	NC_013924	GA	3	6	37863	37868	50 %	0 %	50 %	0 %	289937489
67	NC_013924	AC	3	6	39393	39398	50 %	0 %	0 %	50 %	289937490
68	NC_013924	AC	3	6	39644	39649	50 %	0 %	0 %	50 %	289937490
69	NC_013924	CG	3	6	40036	40041	0 %	0 %	50 %	50 %	289937491
70	NC_013924	CG	3	6	40427	40432	0 %	0 %	50 %	50 %	289937491
71	NC_013924	TC	3	6	40908	40913	0 %	50 %	0 %	50 %	289937491
72	NC_013924	CA	3	6	41217	41222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013924	TG	4	8	41275	41282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013924	GA	3	6	41302	41307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013924	TC	3	6	42863	42868	0 %	50 %	0 %	50 %	289937492
76	NC_013924	TG	3	6	43474	43479	0 %	50 %	50 %	0 %	289937492
77	NC_013924	AC	3	6	43613	43618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013924	AG	3	6	44026	44031	50 %	0 %	50 %	0 %	289937493
79	NC_013924	GA	3	6	44039	44044	50 %	0 %	50 %	0 %	289937493
80	NC_013924	GA	4	8	45380	45387	50 %	0 %	50 %	0 %	289937494
81	NC_013924	TA	3	6	45581	45586	50 %	50 %	0 %	0 %	289937494
82	NC_013924	AC	3	6	46327	46332	50 %	0 %	0 %	50 %	289937495
83	NC_013924	GA	3	6	46463	46468	50 %	0 %	50 %	0 %	289937495
84	NC_013924	TG	3	6	46588	46593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013924	GT	3	6	47817	47822	0 %	50 %	50 %	0 %	289937498
86	NC_013924	AG	3	6	48211	48216	50 %	0 %	50 %	0 %	289937498
87	NC_013924	TG	3	6	48777	48782	0 %	50 %	50 %	0 %	289937498
88	NC_013924	AG	7	14	50652	50665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013924	CA	4	8	51218	51225	50 %	0 %	0 %	50 %	289937502
90	NC_013924	CG	3	6	51463	51468	0 %	0 %	50 %	50 %	289937502
91	NC_013924	CG	3	6	51524	51529	0 %	0 %	50 %	50 %	289937502
92	NC_013924	TC	3	6	52806	52811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013924	TG	3	6	52910	52915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013924	AC	3	6	53097	53102	50 %	0 %	0 %	50 %	289937503
95	NC_013924	CA	3	6	53657	53662	50 %	0 %	0 %	50 %	289937504
96	NC_013924	GC	3	6	53696	53701	0 %	0 %	50 %	50 %	289937504
97	NC_013924	CG	3	6	53854	53859	0 %	0 %	50 %	50 %	289937504
98	NC_013924	TC	3	6	55676	55681	0 %	50 %	0 %	50 %	289937506
99	NC_013924	AC	3	6	56476	56481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013924	CG	3	6	56923	56928	0 %	0 %	50 %	50 %	289937507
101	NC_013924	TG	3	6	57146	57151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013924	GT	3	6	57654	57659	0 %	50 %	50 %	0 %	289937508
103	NC_013924	TG	3	6	57678	57683	0 %	50 %	50 %	0 %	289937508
104	NC_013924	GC	3	6	58107	58112	0 %	0 %	50 %	50 %	289937508
105	NC_013924	CG	3	6	58286	58291	0 %	0 %	50 %	50 %	289937508
106	NC_013924	CT	3	6	59563	59568	0 %	50 %	0 %	50 %	289937509
107	NC_013924	CT	3	6	59976	59981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013924	TC	3	6	60199	60204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013924	AC	3	6	60754	60759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013924	CG	3	6	61125	61130	0 %	0 %	50 %	50 %	289937510
111	NC_013924	CT	3	6	61301	61306	0 %	50 %	0 %	50 %	289937510
112	NC_013924	CG	3	6	61386	61391	0 %	0 %	50 %	50 %	289937510
113	NC_013924	CG	3	6	62225	62230	0 %	0 %	50 %	50 %	289937511
114	NC_013924	CG	3	6	62384	62389	0 %	0 %	50 %	50 %	289937511
115	NC_013924	CG	3	6	62398	62403	0 %	0 %	50 %	50 %	289937511
116	NC_013924	GC	3	6	62882	62887	0 %	0 %	50 %	50 %	289937511
117	NC_013924	CG	4	8	65248	65255	0 %	0 %	50 %	50 %	289937513
118	NC_013924	CG	3	6	67044	67049	0 %	0 %	50 %	50 %	289937514
119	NC_013924	CT	3	6	67171	67176	0 %	50 %	0 %	50 %	289937515
120	NC_013924	TC	3	6	68071	68076	0 %	50 %	0 %	50 %	289937515
121	NC_013924	GT	3	6	68941	68946	0 %	50 %	50 %	0 %	289937515
122	NC_013924	TG	3	6	69224	69229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013924	GA	3	6	69706	69711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013924	GA	3	6	70242	70247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013924	AT	3	6	70580	70585	50 %	50 %	0 %	0 %	289937517
126	NC_013924	TG	3	6	74876	74881	0 %	50 %	50 %	0 %	289937522
127	NC_013924	AC	3	6	75461	75466	50 %	0 %	0 %	50 %	289937522
128	NC_013924	CG	3	6	76275	76280	0 %	0 %	50 %	50 %	289937523
129	NC_013924	AG	3	6	76470	76475	50 %	0 %	50 %	0 %	289937523
130	NC_013924	CT	3	6	77204	77209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013924	GT	3	6	77226	77231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013924	CT	3	6	77288	77293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013924	GT	3	6	77349	77354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013924	CA	4	8	78064	78071	50 %	0 %	0 %	50 %	289937525
135	NC_013924	CT	3	6	79969	79974	0 %	50 %	0 %	50 %	289937527
136	NC_013924	TC	3	6	80510	80515	0 %	50 %	0 %	50 %	289937527
137	NC_013924	AC	3	6	81519	81524	50 %	0 %	0 %	50 %	289937528
138	NC_013924	GT	3	6	83090	83095	0 %	50 %	50 %	0 %	289937530
139	NC_013924	AG	3	6	83351	83356	50 %	0 %	50 %	0 %	289937530
140	NC_013924	CA	3	6	84665	84670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013924	AC	3	6	85486	85491	50 %	0 %	0 %	50 %	289937532
142	NC_013924	TC	4	8	85494	85501	0 %	50 %	0 %	50 %	289937532
143	NC_013924	CT	3	6	86132	86137	0 %	50 %	0 %	50 %	289937532
144	NC_013924	GT	4	8	86649	86656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013924	TG	3	6	87275	87280	0 %	50 %	50 %	0 %	289937533
146	NC_013924	GT	3	6	88020	88025	0 %	50 %	50 %	0 %	289937533
147	NC_013924	CG	3	6	89451	89456	0 %	0 %	50 %	50 %	289937535
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435	NC_013924	AC	3	6	254483	254488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.