MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG01

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013923	GTATGA	2	12	2338	2349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013923	CTCTTC	2	12	6506	6517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013923	CATTCG	2	12	17414	17425	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013923	ACTTCT	2	12	19148	19159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013923	GCACCG	2	12	34974	34985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013923	ACTGAC	2	12	35000	35011	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013923	ACTATA	2	12	40850	40861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013923	GTGGGA	2	12	67710	67721	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013923	GCGACC	2	12	74688	74699	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013923	CTCCGA	2	12	75069	75080	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013923	GCGACG	2	12	90368	90379	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013923	GCAACG	2	12	90380	90391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013923	GCAACA	2	12	90392	90403	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013923	GAAAAC	2	12	90406	90417	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013923	GTTTCT	2	12	99078	99089	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013923	TCATCG	3	18	122040	122057	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013923	AGCCGA	2	12	168491	168502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013923	ATCTGA	2	12	172781	172792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013923	TAAGAA	2	12	173920	173931	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013923	GTACCG	2	12	206948	206959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013923	TCGAGT	2	12	207883	207894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013923	TGAGCA	2	12	216403	216414	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013923	CAGCGA	2	12	241130	241141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013923	CGTACT	2	12	259433	259444	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013923	TCGCAC	2	12	265634	265645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013923	GAACGG	2	12	268433	268444	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013923	CGCTGT	2	12	286331	286342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013923	TGGCTC	2	12	303085	303096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013923	TCGCCC	2	12	303101	303112	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013923	ACCCTC	2	12	303139	303150	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013923	CCCTTA	2	12	303152	303163	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013923	CCCTCA	2	12	303164	303175	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013923	CCCTCG	2	12	303176	303187	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013923	GACAGG	5	30	307359	307388	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013923	CTGACA	2	12	307816	307827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013923	AGTGGC	2	12	307833	307844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013923	GTTGCA	3	18	322934	322951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013923	CAGTTG	2	12	322956	322967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013923	CAGTTA	2	12	322968	322979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013923	AGTGGG	2	12	339933	339944	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013923	CCAGTA	2	12	340043	340054	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013923	GTGTGA	2	12	341929	341940	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013923	TGAGTG	3	18	341954	341971	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013923	TGAGTG	3	18	341982	341999	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013923	TGAGTG	3	18	342010	342027	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013923	GTGTGA	2	12	342047	342058	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013923	GTGCGA	4	24	342059	342082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013923	ACAGAG	2	12	342103	342114	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013923	CTCGGT	2	12	371385	371396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013923	GTCGAT	2	12	375333	375344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013923	GAACAC	2	12	377620	377631	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.