MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG01

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013923	GTACG	2	10	4707	4716	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013923	GTGGG	2	10	9356	9365	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013923	GACCC	2	10	10632	10641	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_013923	AGGTC	2	10	10681	10690	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013923	TGACT	2	10	12477	12486	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013923	TCAAA	2	10	15215	15224	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013923	CTCTC	2	10	19001	19010	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_013923	CCTTC	2	10	27885	27894	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013923	TTTTG	2	10	29067	29076	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013923	TCGAA	2	10	40533	40542	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013923	TCGCG	2	10	41427	41436	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013923	GGGTT	2	10	47186	47195	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013923	CATCG	2	10	58834	58843	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013923	TTTCG	2	10	60817	60826	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013923	CCGGC	2	10	61492	61501	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_013923	CCTTC	2	10	61804	61813	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_013923	AATAT	2	10	68341	68350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013923	TAGTG	2	10	69144	69153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013923	AGTGT	2	10	69155	69164	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013923	TACAG	2	10	76989	76998	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013923	GGTGA	2	10	77399	77408	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013923	TGACC	2	10	77632	77641	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013923	GTTCC	2	10	78543	78552	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013923	GTGTG	2	10	86254	86263	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013923	ATGTG	2	10	86264	86273	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013923	GTGTG	2	10	86274	86283	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013923	TGTGG	5	25	86285	86309	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013923	TGTGA	3	15	86310	86324	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013923	TGCTG	2	10	86347	86356	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013923	ACTGC	2	10	90274	90283	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013923	CACAA	2	10	93213	93222	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_013923	ATTGT	2	10	102638	102647	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013923	GTGCT	2	10	105551	105560	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013923	CCGAT	2	10	111053	111062	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013923	GAAAA	2	10	111250	111259	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013923	CTACG	2	10	123041	123050	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_013923	AGGCA	2	10	123947	123956	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013923	GTAGG	3	15	124109	124123	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013923	TGACT	2	10	148908	148917	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013923	AGGAT	2	10	149476	149485	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013923	TTCGA	2	10	172671	172680	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013923	CTACC	2	10	194505	194514	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_013923	GTCGC	2	10	200000	200009	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_013923	CACCC	2	10	207701	207710	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_013923	AGTGT	2	10	227852	227861	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013923	TACCG	2	10	229410	229419	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_013923	GAGCG	2	10	239710	239719	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013923	ATACT	2	10	268407	268416	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013923	ATTCC	2	10	276988	276997	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013923	GATCA	2	10	281291	281300	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013923	AACGA	2	10	283181	283190	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013923	GGAAC	2	10	306601	306610	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013923	ACGCG	2	10	309676	309685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_013923	CGGGT	2	10	316929	316938	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013923	AGGAG	2	10	324036	324045	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013923	GTCGA	2	10	333341	333350	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013923	GAACA	2	10	341366	341375	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013923	CACAA	2	10	346620	346629	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_013923	TGAAA	2	10	355442	355451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013923	TCGAA	2	10	369188	369197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013923	ACGTT	2	10	372442	372451	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013923	ATCGG	2	10	372647	372656	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013923	GTTCG	2	10	372976	372985	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.