MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG01

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013923	CTTCG	2	10	353	362	0 %	40 %	20 %	40 %	289583312
2	NC_013923	CGCAG	2	10	6814	6823	20 %	0 %	40 %	40 %	289583320
3	NC_013923	ATTTC	2	10	7654	7663	20 %	60 %	0 %	20 %	289583322
4	NC_013923	GCCGC	2	10	8799	8808	0 %	0 %	40 %	60 %	289583324
5	NC_013923	CGAGT	2	10	9225	9234	20 %	20 %	40 %	20 %	289583324
6	NC_013923	TCGGG	2	10	9318	9327	0 %	20 %	60 %	20 %	289583324
7	NC_013923	CGCAG	2	10	15531	15540	20 %	0 %	40 %	40 %	289583332
8	NC_013923	TCGTT	2	10	16911	16920	0 %	60 %	20 %	20 %	289583333
9	NC_013923	CGTTC	2	10	20712	20721	0 %	40 %	20 %	40 %	289583336
10	NC_013923	TTCGA	2	10	22977	22986	20 %	40 %	20 %	20 %	289583338
11	NC_013923	CATCG	2	10	23337	23346	20 %	20 %	20 %	40 %	289583338
12	NC_013923	ACTCG	2	10	26219	26228	20 %	20 %	20 %	40 %	289583341
13	NC_013923	CCGAA	2	10	26348	26357	40 %	0 %	20 %	40 %	289583341
14	NC_013923	CTCTC	2	10	27232	27241	0 %	40 %	0 %	60 %	289583342
15	NC_013923	CTCTC	2	10	27246	27255	0 %	40 %	0 %	60 %	289583342
16	NC_013923	ACTGA	2	10	27656	27665	40 %	20 %	20 %	20 %	289583343
17	NC_013923	GCGGG	2	10	28799	28808	0 %	0 %	80 %	20 %	289583345
18	NC_013923	CAGCG	2	10	29123	29132	20 %	0 %	40 %	40 %	289583346
19	NC_013923	CGTCG	2	10	29255	29264	0 %	20 %	40 %	40 %	289583346
20	NC_013923	CGAGC	2	10	33859	33868	20 %	0 %	40 %	40 %	289583348
21	NC_013923	ACGAG	2	10	36734	36743	40 %	0 %	40 %	20 %	289583351
22	NC_013923	CGGCG	2	10	39244	39253	0 %	0 %	60 %	40 %	289583353
23	NC_013923	GTCGA	2	10	40271	40280	20 %	20 %	40 %	20 %	289583353
24	NC_013923	TCGAG	2	10	44823	44832	20 %	20 %	40 %	20 %	289583358
25	NC_013923	CGGCG	2	10	46209	46218	0 %	0 %	60 %	40 %	289583359
26	NC_013923	GCGCC	2	10	47505	47514	0 %	0 %	40 %	60 %	289583360
27	NC_013923	TGCAC	2	10	48909	48918	20 %	20 %	20 %	40 %	289583361
28	NC_013923	GTTCG	2	10	49930	49939	0 %	40 %	40 %	20 %	289583362
29	NC_013923	GTCCG	2	10	50575	50584	0 %	20 %	40 %	40 %	289583362
30	NC_013923	GGTGG	2	10	50587	50596	0 %	20 %	80 %	0 %	289583362
31	NC_013923	CGCAA	2	10	52765	52774	40 %	0 %	20 %	40 %	289583365
32	NC_013923	ATCTG	2	10	52919	52928	20 %	40 %	20 %	20 %	289583365
33	NC_013923	TGTAT	2	10	53144	53153	20 %	60 %	20 %	0 %	289583365
34	NC_013923	ACTCG	2	10	55214	55223	20 %	20 %	20 %	40 %	289583370
35	NC_013923	ATCGA	2	10	57721	57730	40 %	20 %	20 %	20 %	289583372
36	NC_013923	GAACG	2	10	59331	59340	40 %	0 %	40 %	20 %	289583373
37	NC_013923	ACCCG	2	10	63897	63906	20 %	0 %	20 %	60 %	289583375
38	NC_013923	ACCAC	2	10	63917	63926	40 %	0 %	0 %	60 %	289583375
39	NC_013923	ATCGA	2	10	64523	64532	40 %	20 %	20 %	20 %	289583376
40	NC_013923	CGTCC	2	10	67375	67384	0 %	20 %	20 %	60 %	289583379
41	NC_013923	ACGCC	2	10	71216	71225	20 %	0 %	20 %	60 %	289583382
42	NC_013923	GCCCC	2	10	72178	72187	0 %	0 %	20 %	80 %	289583383
43	NC_013923	GTCAC	2	10	79369	79378	20 %	20 %	20 %	40 %	289583392
44	NC_013923	CAGTG	2	10	80025	80034	20 %	20 %	40 %	20 %	289583393
45	NC_013923	GTCGA	2	10	81598	81607	20 %	20 %	40 %	20 %	289583396
46	NC_013923	TCGGC	2	10	83116	83125	0 %	20 %	40 %	40 %	289583397
47	NC_013923	GTATC	2	10	83788	83797	20 %	40 %	20 %	20 %	289583399
48	NC_013923	GATGC	2	10	88913	88922	20 %	20 %	40 %	20 %	289583404
49	NC_013923	CCACG	2	10	92095	92104	20 %	0 %	20 %	60 %	289583410
50	NC_013923	GCCGT	2	10	92463	92472	0 %	20 %	40 %	40 %	289583411
51	NC_013923	ACCTC	2	10	95289	95298	20 %	20 %	0 %	60 %	289583415
52	NC_013923	GTCTC	2	10	95349	95358	0 %	40 %	20 %	40 %	289583415
53	NC_013923	CGGAT	2	10	95561	95570	20 %	20 %	40 %	20 %	289583415
54	NC_013923	TGGCA	2	10	99372	99381	20 %	20 %	40 %	20 %	289583418
55	NC_013923	TTCGT	2	10	100153	100162	0 %	60 %	20 %	20 %	289583420
56	NC_013923	ATCGT	2	10	103469	103478	20 %	40 %	20 %	20 %	289583424
57	NC_013923	CGGTT	2	10	103724	103733	0 %	40 %	40 %	20 %	289583424
58	NC_013923	CCAGC	2	10	103964	103973	20 %	0 %	20 %	60 %	289583424
59	NC_013923	ACTCG	2	10	105255	105264	20 %	20 %	20 %	40 %	289583426
60	NC_013923	TTCCA	2	10	109364	109373	20 %	40 %	0 %	40 %	289583432
61	NC_013923	CGTCG	2	10	109994	110003	0 %	20 %	40 %	40 %	289583432
62	NC_013923	TCAGT	2	10	114953	114962	20 %	40 %	20 %	20 %	289583434
63	NC_013923	GACTC	2	10	118317	118326	20 %	20 %	20 %	40 %	289583436
64	NC_013923	CTCGT	2	10	120783	120792	0 %	40 %	20 %	40 %	289583438
65	NC_013923	GTCAC	2	10	126936	126945	20 %	20 %	20 %	40 %	289583444
66	NC_013923	TCCGT	2	10	127098	127107	0 %	40 %	20 %	40 %	289583444
67	NC_013923	CGAGT	2	10	128063	128072	20 %	20 %	40 %	20 %	289583444
68	NC_013923	GCTGT	2	10	131125	131134	0 %	40 %	40 %	20 %	289583447
69	NC_013923	AGAAC	2	10	132823	132832	60 %	0 %	20 %	20 %	289583449
70	NC_013923	GATCG	2	10	133945	133954	20 %	20 %	40 %	20 %	289583450
71	NC_013923	TCACT	2	10	134250	134259	20 %	40 %	0 %	40 %	289583450
72	NC_013923	GATCG	2	10	134664	134673	20 %	20 %	40 %	20 %	289583451
73	NC_013923	CGACG	2	10	136601	136610	20 %	0 %	40 %	40 %	289583453
74	NC_013923	GCCCG	2	10	136656	136665	0 %	0 %	40 %	60 %	289583453
75	NC_013923	GTCGA	2	10	140246	140255	20 %	20 %	40 %	20 %	289583455
76	NC_013923	GTTGT	2	10	145617	145626	0 %	60 %	40 %	0 %	289583459
77	NC_013923	CGACG	2	10	146828	146837	20 %	0 %	40 %	40 %	289583460
78	NC_013923	GGCAG	2	10	147805	147814	20 %	0 %	60 %	20 %	289583461
79	NC_013923	CGGAT	2	10	154737	154746	20 %	20 %	40 %	20 %	289583467
80	NC_013923	AGTCC	2	10	158919	158928	20 %	20 %	20 %	40 %	289583470
81	NC_013923	TACCA	2	10	162259	162268	40 %	20 %	0 %	40 %	289583473
82	NC_013923	CGGTG	2	10	162845	162854	0 %	20 %	60 %	20 %	289583474
83	NC_013923	GTCTG	2	10	164960	164969	0 %	40 %	40 %	20 %	289583476
84	NC_013923	ACGGC	2	10	168131	168140	20 %	0 %	40 %	40 %	289583479
85	NC_013923	CGGGT	2	10	168324	168333	0 %	20 %	60 %	20 %	289583479
86	NC_013923	GGTCA	2	10	170417	170426	20 %	20 %	40 %	20 %	289583482
87	NC_013923	GATGG	2	10	170479	170488	20 %	20 %	60 %	0 %	289583482
88	NC_013923	GGGTC	2	10	170940	170949	0 %	20 %	60 %	20 %	289583482
89	NC_013923	GTACT	2	10	170996	171005	20 %	40 %	20 %	20 %	289583482
90	NC_013923	CGGTC	2	10	175485	175494	0 %	20 %	40 %	40 %	289583486
91	NC_013923	TCGGA	2	10	176766	176775	20 %	20 %	40 %	20 %	289583487
92	NC_013923	CGGGA	2	10	178023	178032	20 %	0 %	60 %	20 %	289583488
93	NC_013923	GACGG	2	10	178565	178574	20 %	0 %	60 %	20 %	289583488
94	NC_013923	TCGAC	2	10	179980	179989	20 %	20 %	20 %	40 %	289583490
95	NC_013923	CGGAA	2	10	180258	180267	40 %	0 %	40 %	20 %	289583490
96	NC_013923	TCTCC	2	10	180982	180991	0 %	40 %	0 %	60 %	289583490
97	NC_013923	GTACG	2	10	181664	181673	20 %	20 %	40 %	20 %	289583491
98	NC_013923	CGGTC	2	10	181816	181825	0 %	20 %	40 %	40 %	289583491
99	NC_013923	TCACG	2	10	182365	182374	20 %	20 %	20 %	40 %	289583491
100	NC_013923	AGCGG	2	10	188419	188428	20 %	0 %	60 %	20 %	289583499
101	NC_013923	CCTCG	2	10	190086	190095	0 %	20 %	20 %	60 %	289583500
102	NC_013923	CCGTC	2	10	190490	190499	0 %	20 %	20 %	60 %	289583500
103	NC_013923	ACCGA	2	10	190942	190951	40 %	0 %	20 %	40 %	289583501
104	NC_013923	CGAGC	2	10	192339	192348	20 %	0 %	40 %	40 %	289583502
105	NC_013923	GAACC	2	10	193675	193684	40 %	0 %	20 %	40 %	289583503
106	NC_013923	TTGAT	2	10	193878	193887	20 %	60 %	20 %	0 %	289583503
107	NC_013923	GTCGA	2	10	193912	193921	20 %	20 %	40 %	20 %	289583503
108	NC_013923	GACGC	2	10	194212	194221	20 %	0 %	40 %	40 %	289583504
109	NC_013923	CGCGC	2	10	195255	195264	0 %	0 %	40 %	60 %	289583505
110	NC_013923	TCGTC	2	10	196815	196824	0 %	40 %	20 %	40 %	289583507
111	NC_013923	AAGCG	2	10	198458	198467	40 %	0 %	40 %	20 %	289583508
112	NC_013923	ACCGT	2	10	198755	198764	20 %	20 %	20 %	40 %	289583508
113	NC_013923	TCGCT	2	10	198928	198937	0 %	40 %	20 %	40 %	289583508
114	NC_013923	CGACG	2	10	199821	199830	20 %	0 %	40 %	40 %	289583509
115	NC_013923	ACGCG	2	10	200343	200352	20 %	0 %	40 %	40 %	289583510
116	NC_013923	GACTG	2	10	200832	200841	20 %	20 %	40 %	20 %	289583510
117	NC_013923	CCGAG	2	10	205549	205558	20 %	0 %	40 %	40 %	289583513
118	NC_013923	CCGAG	2	10	208470	208479	20 %	0 %	40 %	40 %	289583517
119	NC_013923	GATCC	2	10	209241	209250	20 %	20 %	20 %	40 %	289583517
120	NC_013923	CGTCG	2	10	210153	210162	0 %	20 %	40 %	40 %	289583518
121	NC_013923	GACGA	2	10	212305	212314	40 %	0 %	40 %	20 %	289583519
122	NC_013923	CGGTC	2	10	213180	213189	0 %	20 %	40 %	40 %	289583520
123	NC_013923	CAGCT	2	10	214219	214228	20 %	20 %	20 %	40 %	289583522
124	NC_013923	GGCCC	2	10	214850	214859	0 %	0 %	40 %	60 %	289583522
125	NC_013923	TCGAT	2	10	216097	216106	20 %	40 %	20 %	20 %	289583522
126	NC_013923	ATCGA	2	10	218379	218388	40 %	20 %	20 %	20 %	289583524
127	NC_013923	CGTGA	2	10	220353	220362	20 %	20 %	40 %	20 %	289583526
128	NC_013923	CACCG	2	10	221743	221752	20 %	0 %	20 %	60 %	289583527
129	NC_013923	TCGAC	2	10	225729	225738	20 %	20 %	20 %	40 %	289583530
130	NC_013923	CAGCG	2	10	227270	227279	20 %	0 %	40 %	40 %	289583531
131	NC_013923	TCGGT	2	10	228322	228331	0 %	40 %	40 %	20 %	289583532
132	NC_013923	ATGGC	2	10	229027	229036	20 %	20 %	40 %	20 %	289583532
133	NC_013923	ACGAG	2	10	231491	231500	40 %	0 %	40 %	20 %	289583534
134	NC_013923	TCGTC	2	10	232800	232809	0 %	40 %	20 %	40 %	289583536
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215	NC_013923	CCAAG	2	10	368595	368604	40 %	0 %	20 %	40 %	289583649

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.