MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 67518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013922	AGT	2	6	65	70	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013922	TCG	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013922	GCT	2	6	398	403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013922	TTG	2	6	512	517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013922	GGC	2	6	546	551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013922	ACG	2	6	687	692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579697
7	NC_013922	ACG	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579697
8	NC_013922	CGA	2	6	733	738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579697
9	NC_013922	TCG	2	6	780	785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579697
10	NC_013922	ACC	2	6	852	857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579697
11	NC_013922	GAC	2	6	941	946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579697
12	NC_013922	ATC	2	6	1001	1006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579697
13	NC_013922	ACT	2	6	1083	1088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579697
14	NC_013922	GAC	2	6	1166	1171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579697
15	NC_013922	TCC	2	6	1176	1181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579697
16	NC_013922	ATC	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579697
17	NC_013922	TCT	2	6	1317	1322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579697
18	NC_013922	TCG	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579697
19	NC_013922	ACG	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579697
20	NC_013922	GAA	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579697
21	NC_013922	CGG	2	6	1518	1523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579697
22	NC_013922	CAG	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579697
23	NC_013922	GCT	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579697
24	NC_013922	CGA	2	6	1659	1664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579697
25	NC_013922	ATC	2	6	1667	1672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579697
26	NC_013922	AGG	2	6	1686	1691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579697
27	NC_013922	TCC	2	6	1743	1748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579697
28	NC_013922	CTC	2	6	1829	1834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579697
29	NC_013922	AAG	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579697
30	NC_013922	TGC	3	9	1860	1868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579697
31	NC_013922	CGC	2	6	1884	1889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579697
32	NC_013922	GGT	2	6	1898	1903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579697
33	NC_013922	GAA	2	6	1945	1950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579697
34	NC_013922	GGA	2	6	1978	1983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579697
35	NC_013922	CGA	2	6	1993	1998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579697
36	NC_013922	TAT	2	6	2068	2073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013922	CTC	2	6	2275	2280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013922	CGA	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579698
39	NC_013922	CCG	2	6	2335	2340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579698
40	NC_013922	ACG	2	6	2396	2401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579698
41	NC_013922	CGA	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579698
42	NC_013922	TCG	2	6	2459	2464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579698
43	NC_013922	GAG	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579698
44	NC_013922	GAG	2	6	2611	2616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579698
45	NC_013922	ACG	2	6	2696	2701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579698
46	NC_013922	GGC	2	6	2769	2774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579698
47	NC_013922	GGC	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579698
48	NC_013922	GAC	2	6	2911	2916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579698
49	NC_013922	CCG	2	6	2928	2933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579698
50	NC_013922	GAA	2	6	2985	2990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579698
51	NC_013922	GAA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579698
52	NC_013922	ACG	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579698
53	NC_013922	TCG	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579698
54	NC_013922	GCG	2	6	3322	3327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579698
55	NC_013922	CGA	2	6	3453	3458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579698
56	NC_013922	CTG	2	6	3562	3567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579698
57	NC_013922	GGC	2	6	3619	3624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013922	ATT	2	6	3674	3679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013922	GAC	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013922	CAC	2	6	3864	3869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579699
61	NC_013922	CGC	2	6	3891	3896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579699
62	NC_013922	CGA	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579699
63	NC_013922	GCC	2	6	4018	4023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579699
64	NC_013922	CGG	2	6	4091	4096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579699
65	NC_013922	CGT	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579699
66	NC_013922	GAC	2	6	4168	4173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579699
67	NC_013922	TCC	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579699
68	NC_013922	CGA	2	6	4187	4192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579699
69	NC_013922	CGG	2	6	4227	4232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579699
70	NC_013922	TCG	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579699
71	NC_013922	CGA	3	9	4311	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579699
72	NC_013922	ACT	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579699
73	NC_013922	CGA	2	6	4413	4418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579699
74	NC_013922	GCG	2	6	4419	4424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579699
75	NC_013922	GGT	3	9	4468	4476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013922	CGG	2	6	4593	4598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013922	CGT	2	6	4710	4715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013922	CTC	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_013922	GTC	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013922	CAC	2	6	4968	4973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013922	GTG	3	9	5084	5092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013922	TCG	2	6	5108	5113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013922	CGT	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013922	CTG	2	6	5154	5159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013922	CTG	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013922	CGC	2	6	5223	5228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579700
87	NC_013922	GTC	2	6	5251	5256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
88	NC_013922	GGT	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579700
89	NC_013922	CTG	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
90	NC_013922	GAG	2	6	5350	5355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579700
91	NC_013922	GAC	2	6	5356	5361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579700
92	NC_013922	TGC	2	6	5415	5420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
93	NC_013922	GGC	2	6	5442	5447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579700
94	NC_013922	CGA	3	9	5493	5501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579700
95	NC_013922	CTG	2	6	5526	5531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
96	NC_013922	TCG	2	6	5597	5602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
97	NC_013922	CGA	2	6	5623	5628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579700
98	NC_013922	GAG	2	6	5629	5634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579700
99	NC_013922	GTC	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
100	NC_013922	TCG	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
101	NC_013922	CGA	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579700
102	NC_013922	CGA	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579700
103	NC_013922	CGT	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
104	NC_013922	GAG	2	6	5887	5892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579700
105	NC_013922	ACC	2	6	5950	5955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579700
106	NC_013922	TCG	2	6	5957	5962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
107	NC_013922	GGA	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579700
108	NC_013922	CGA	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579700
109	NC_013922	TCG	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
110	NC_013922	TTC	2	6	6221	6226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579700
111	NC_013922	CGT	2	6	6256	6261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
112	NC_013922	CGA	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579700
113	NC_013922	TGT	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579700
114	NC_013922	TCG	2	6	6329	6334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579700
115	NC_013922	GCC	2	6	6415	6420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579700
116	NC_013922	GCC	2	6	6500	6505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579700
117	NC_013922	GGA	2	6	6514	6519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013922	ACG	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013922	TGA	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013922	ACG	2	6	6776	6781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579701
121	NC_013922	CCT	2	6	6785	6790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579701
122	NC_013922	CGA	3	9	6908	6916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579701
123	NC_013922	CGA	2	6	6928	6933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579701
124	NC_013922	ACG	2	6	7039	7044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579701
125	NC_013922	CGA	2	6	7070	7075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579701
126	NC_013922	ACG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579701
127	NC_013922	CGA	2	6	7175	7180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579701
128	NC_013922	CGT	2	6	7262	7267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579701
129	NC_013922	CGG	2	6	7286	7291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579701
130	NC_013922	ACC	2	6	7319	7324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579701
131	NC_013922	GCG	2	6	7325	7330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579701
132	NC_013922	ATC	2	6	7341	7346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579701
133	NC_013922	TCG	2	6	7444	7449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579701
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153	NC_013922	TCG	2	6	8818	8823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579702
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257	NC_013922	TCA	2	6	14945	14950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579707
258	NC_013922	TCG	2	6	14990	14995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579707
259	NC_013922	TCG	2	6	15017	15022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579707
260	NC_013922	GTC	2	6	15031	15036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579707
261	NC_013922	TCG	2	6	15044	15049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579707
262	NC_013922	TCA	2	6	15051	15056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579707
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264	NC_013922	GAT	2	6	15102	15107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579708
265	NC_013922	CTG	2	6	15140	15145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579708
266	NC_013922	CCG	2	6	15169	15174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579708
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270	NC_013922	CGT	2	6	15365	15370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579708
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272	NC_013922	CAG	2	6	15552	15557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579708
273	NC_013922	GAA	2	6	15558	15563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579708
274	NC_013922	GAT	2	6	15603	15608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579708
275	NC_013922	GAA	2	6	15684	15689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579708
276	NC_013922	CTG	2	6	15729	15734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579708
277	NC_013922	CGA	2	6	15755	15760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579708
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279	NC_013922	CGA	2	6	15848	15853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579708
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281	NC_013922	ATG	2	6	15913	15918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579708
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287	NC_013922	TCG	2	6	16328	16333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579709
288	NC_013922	CCT	2	6	16341	16346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579709
289	NC_013922	TCG	2	6	16406	16411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579709
290	NC_013922	TCG	2	6	16442	16447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579709
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362	NC_013922	CGG	2	6	20383	20388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
363	NC_013922	GAT	2	6	20399	20404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_013922	GTA	2	6	30714	30719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_013922	GCA	2	6	30891	30896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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