MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 1004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013921	AAAAGT	2	12	3231	3242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577268
2	NC_013921	ATGGCA	2	12	5956	5967	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289577271
3	NC_013921	TATATC	2	12	7559	7570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289577272
4	NC_013921	TCAAAT	2	12	9455	9466	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289577274
5	NC_013921	ACAAGC	2	12	12584	12595	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	289577275
6	NC_013921	GAGAAA	2	12	13294	13305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577275
7	NC_013921	TAAAGT	2	12	15063	15074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013921	GATAAA	2	12	15123	15134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013921	AAGTAG	2	12	17600	17611	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289577279
10	NC_013921	GTAGAT	2	12	18186	18197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577280
11	NC_013921	ATATTG	2	12	23487	23498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289577284
12	NC_013921	GGAGAA	2	12	24356	24367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013921	CAGAAC	2	12	28241	28252	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	289577289
14	NC_013921	TAAAAA	2	12	29085	29096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013921	TTATTG	2	12	32325	32336	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289577293
16	NC_013921	AATTAA	2	12	36019	36030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013921	AATTTT	2	12	36207	36218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013921	AAGCGA	2	12	48897	48908	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013921	ATCCTC	2	12	55952	55963	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	289577310
20	NC_013921	TTGCAA	2	12	56939	56950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289577311
21	NC_013921	TGAAAT	2	12	57314	57325	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289577311
22	NC_013921	TAGCAG	2	12	58850	58861	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289577313
23	NC_013921	GAAAAA	2	12	59421	59432	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289577314
24	NC_013921	TTGCAA	2	12	59665	59676	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289577314
25	NC_013921	AAAAGG	2	12	59891	59902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577314
26	NC_013921	GAAAAA	2	12	60331	60342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289577315
27	NC_013921	AAATTT	2	12	66959	66970	50 %	50 %	0 %	0 %	289577321
28	NC_013921	TTCAAT	2	12	70136	70147	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289577324
29	NC_013921	GATAAA	2	12	74326	74337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577326
30	NC_013921	AATAGT	2	12	79018	79029	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289577327
31	NC_013921	TTTTCT	2	12	81649	81660	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289577330
32	NC_013921	GAAATA	2	12	86182	86193	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577333
33	NC_013921	GTAGAT	2	12	86903	86914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577334
34	NC_013921	ATGTTG	2	12	89479	89490	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289577336
35	NC_013921	AAGCGA	2	12	92899	92910	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013921	AAAAAG	2	12	96686	96697	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289577339
37	NC_013921	TTAAAA	2	12	97902	97913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577341
38	NC_013921	TGTAGA	2	12	98861	98872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577342
39	NC_013921	TAAGAA	2	12	101076	101087	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577343
40	NC_013921	ACTTGA	2	12	101955	101966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289577344
41	NC_013921	TGAAAT	2	12	103238	103249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013921	AGAAAG	2	12	105480	105491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577348
43	NC_013921	GAATTT	2	12	107125	107136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289577351
44	NC_013921	TAAATT	2	12	109838	109849	50 %	50 %	0 %	0 %	289577354
45	NC_013921	TTGAAT	2	12	114332	114343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289577360
46	NC_013921	GTACAT	2	12	119042	119053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289577363
47	NC_013921	TTTTAT	2	12	121650	121661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013921	TAAGAA	2	12	123072	123083	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577366
49	NC_013921	TCTTTT	2	12	125945	125956	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289577369
50	NC_013921	AGCTTC	2	12	128161	128172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289577371
51	NC_013921	AAATTT	2	12	131409	131420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013921	ATATTG	2	12	132669	132680	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289577375
53	NC_013921	ATTAAT	2	12	133126	133137	50 %	50 %	0 %	0 %	289577376
54	NC_013921	TTTTAG	2	12	136875	136886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289577381
55	NC_013921	TAGCTA	2	12	137863	137874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289577383
56	NC_013921	TGAAGA	2	12	140972	140983	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289577387
57	NC_013921	TATTTT	2	12	141435	141446	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	289577387
58	NC_013921	GCAGGA	2	12	143120	143131	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289577389
59	NC_013921	TGGCAA	2	12	147121	147132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289577393
60	NC_013921	AATATG	2	12	151135	151146	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289577398
61	NC_013921	TAAAAA	2	12	151975	151986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289577399
62	NC_013921	AGTAAT	2	12	158262	158273	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289577403
63	NC_013921	GTTTTG	2	12	158838	158849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577404
64	NC_013921	AATAAA	2	12	159859	159870	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289577405
65	NC_013921	AGATAA	2	12	160330	160341	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577406
66	NC_013921	AGTAGG	2	12	161261	161272	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	289577407
67	NC_013921	TGTAAA	2	12	169078	169089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289577416
68	NC_013921	ATGTAA	2	12	170959	170970	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289577417
69	NC_013921	ATTTTG	2	12	171425	171436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289577418
70	NC_013921	AAAGGT	2	12	172993	173004	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013921	GGAGTA	2	12	173304	173315	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	289577420
72	NC_013921	TAAATT	2	12	173726	173737	50 %	50 %	0 %	0 %	289577420
73	NC_013921	TGTAGC	2	12	176441	176452	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289577423
74	NC_013921	AAAGGG	2	12	188682	188693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013921	AGATGA	2	12	191767	191778	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289577437
76	NC_013921	AGTAAG	2	12	195200	195211	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289577440
77	NC_013921	GAAAAA	2	12	197284	197295	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289577442
78	NC_013921	GAAGTA	2	12	200356	200367	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289577445
79	NC_013921	GTTATT	2	12	205003	205014	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289577449
80	NC_013921	ACAAAA	2	12	208089	208100	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	289577451
81	NC_013921	TTTGAA	2	12	208466	208477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289577451
82	NC_013921	GAAATA	2	12	209192	209203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577452
83	NC_013921	ACTTTT	2	12	210547	210558	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289577452
84	NC_013921	ATATTA	2	12	215835	215846	50 %	50 %	0 %	0 %	289577455
85	NC_013921	TAAATT	2	12	216286	216297	50 %	50 %	0 %	0 %	289577455
86	NC_013921	CACCAA	2	12	217281	217292	50 %	0 %	0 %	50 %	289577455
87	NC_013921	TAATTT	2	12	219723	219734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013921	TGGAAT	2	12	226240	226251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577461
89	NC_013921	ATAAAA	2	12	228266	228277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289577462
90	NC_013921	TAAAGA	2	12	228555	228566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577462
91	NC_013921	GGATTA	2	12	234803	234814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577468
92	NC_013921	ATTCAT	2	12	236186	236197	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289577469
93	NC_013921	ATAAAA	2	12	252326	252337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289577484
94	NC_013921	GAAAAT	2	12	253318	253329	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289577484
95	NC_013921	AGAAAA	2	12	256577	256588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289577486
96	NC_013921	GAAGTA	2	12	266941	266952	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289577494
97	NC_013921	GTTTAT	2	12	268929	268940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289577496
98	NC_013921	CGTCTT	2	12	269494	269505	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013921	ACAAAG	2	12	269867	269878	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289577497
100	NC_013921	AAATTG	2	12	271166	271177	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289577498
101	NC_013921	ATGTAG	2	12	273662	273673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577501
102	NC_013921	ATTTTG	2	12	274147	274158	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289577502
103	NC_013921	AGTAGA	2	12	276228	276239	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289577503
104	NC_013921	GAGTTA	2	12	277016	277027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577504
105	NC_013921	AAAATT	2	12	278367	278378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577505
106	NC_013921	AGAGAT	2	12	279673	279684	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289577506
107	NC_013921	AACAAA	2	12	280171	280182	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	289577506
108	NC_013921	TAAAAA	2	12	281797	281808	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289577507
109	NC_013921	CAATTT	2	12	288386	288397	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289577512
110	NC_013921	GCAAAG	2	12	292872	292883	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289577515
111	NC_013921	TATCTA	2	12	293532	293543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289577516
112	NC_013921	TAAAAT	2	12	293730	293741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577516
113	NC_013921	ATAGCA	2	12	296280	296291	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289577518
114	NC_013921	TTAATT	2	12	299311	299322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013921	ATAAAG	2	12	299332	299343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013921	TTTTTC	2	12	305943	305954	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013921	TTACTT	2	12	305993	306004	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013921	GAATTT	2	12	307729	307740	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013921	GAAGTA	2	12	308909	308920	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013921	TGCTCT	2	12	313899	313910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289577527
121	NC_013921	AACTCG	2	12	314875	314886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289577527
122	NC_013921	GGGACA	2	12	315792	315803	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289577528
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239	NC_013921	TTGGTT	2	12	578305	578316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577768
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241	NC_013921	TTATTT	2	12	583752	583763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_013921	AGGATA	2	12	584818	584829	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289577774
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250	NC_013921	CTTTTG	2	12	614992	615003	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	289577803
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357	NC_013921	GTTGTG	2	12	902058	902069	0 %	50 %	50 %	0 %	289578050
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468	NC_013921	CTTTTT	2	12	1141939	1141950	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
469	NC_013921	TAATGG	2	12	1144064	1144075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289578302
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471	NC_013921	AGACAT	2	12	1146482	1146493	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289578305
472	NC_013921	TGTATT	2	12	1147323	1147334	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289578307
473	NC_013921	CATGTT	2	12	1147522	1147533	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289578308
474	NC_013921	GAAATT	2	12	1147762	1147773	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289578308
475	NC_013921	TAAATT	2	12	1148696	1148707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_013921	ACTTAT	2	12	1155504	1155515	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
477	NC_013921	AAAATA	2	12	1156468	1156479	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289578319
478	NC_013921	GAAATA	2	12	1157845	1157856	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289578321
479	NC_013921	ATTAAA	2	12	1159797	1159808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289578324
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483	NC_013921	AGTTAA	2	12	1164669	1164680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289578329
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492	NC_013921	TAGACG	2	12	1177374	1177385	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
493	NC_013921	TAAAAT	2	12	1182026	1182037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_013921	CATTTG	2	12	1184188	1184199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289578350
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498	NC_013921	TGCTCG	2	12	1192337	1192348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289578357
499	NC_013921	AATATA	2	12	1192584	1192595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289578357
500	NC_013921	AGGAAA	2	12	1192628	1192639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289578357

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