MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 2032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013921	ATTAA	2	10	321	330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013921	AATTA	2	10	341	350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013921	TTATT	2	10	1930	1939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013921	AAGCA	2	10	3206	3215	60 %	0 %	20 %	20 %	289577268
5	NC_013921	AGAAT	2	10	3392	3401	60 %	20 %	20 %	0 %	289577269
6	NC_013921	AATAA	2	10	3638	3647	80 %	20 %	0 %	0 %	289577269
7	NC_013921	TATAG	2	10	8292	8301	40 %	40 %	20 %	0 %	289577273
8	NC_013921	ATCTC	2	10	8528	8537	20 %	40 %	0 %	40 %	289577273
9	NC_013921	TATAT	2	10	9258	9267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013921	ATAAA	2	10	9385	9394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013921	ATGAA	2	10	11377	11386	60 %	20 %	20 %	0 %	289577275
12	NC_013921	GCTAT	2	10	13327	13336	20 %	40 %	20 %	20 %	289577275
13	NC_013921	GTTTG	2	10	14166	14175	0 %	60 %	40 %	0 %	289577276
14	NC_013921	TTTGC	2	10	14522	14531	0 %	60 %	20 %	20 %	289577276
15	NC_013921	AGAGA	2	10	16465	16474	60 %	0 %	40 %	0 %	289577278
16	NC_013921	ATGAA	2	10	16601	16610	60 %	20 %	20 %	0 %	289577278
17	NC_013921	ATAAA	2	10	17117	17126	80 %	20 %	0 %	0 %	289577279
18	NC_013921	TTGAA	2	10	17939	17948	40 %	40 %	20 %	0 %	289577279
19	NC_013921	CCTTG	2	10	19188	19197	0 %	40 %	20 %	40 %	289577280
20	NC_013921	GGAAC	2	10	21562	21571	40 %	0 %	40 %	20 %	289577283
21	NC_013921	TTTAG	2	10	21696	21705	20 %	60 %	20 %	0 %	289577283
22	NC_013921	ACAGG	2	10	22883	22892	40 %	0 %	40 %	20 %	289577284
23	NC_013921	GTAAA	2	10	23547	23556	60 %	20 %	20 %	0 %	289577284
24	NC_013921	ATAGA	2	10	25489	25498	60 %	20 %	20 %	0 %	289577285
25	NC_013921	ATAGC	2	10	25658	25667	40 %	20 %	20 %	20 %	289577286
26	NC_013921	GATAG	2	10	26213	26222	40 %	20 %	40 %	0 %	289577287
27	NC_013921	AGGGC	2	10	26618	26627	20 %	0 %	60 %	20 %	289577287
28	NC_013921	TGAAT	2	10	27412	27421	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013921	AATAA	2	10	27938	27947	80 %	20 %	0 %	0 %	289577288
30	NC_013921	TTATT	2	10	27961	27970	20 %	80 %	0 %	0 %	289577289
31	NC_013921	AAATA	2	10	28954	28963	80 %	20 %	0 %	0 %	289577289
32	NC_013921	TTTAA	2	10	29309	29318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013921	TGAAA	2	10	30444	30453	60 %	20 %	20 %	0 %	289577292
34	NC_013921	TATGA	2	10	34277	34286	40 %	40 %	20 %	0 %	289577294
35	NC_013921	ATTGT	2	10	36943	36952	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013921	AAAAT	2	10	38482	38491	80 %	20 %	0 %	0 %	289577297
37	NC_013921	ATAGG	2	10	40439	40448	40 %	20 %	40 %	0 %	289577298
38	NC_013921	GCGAT	2	10	40979	40988	20 %	20 %	40 %	20 %	289577298
39	NC_013921	TTTAC	2	10	43127	43136	20 %	60 %	0 %	20 %	289577301
40	NC_013921	AATTT	2	10	43836	43845	40 %	60 %	0 %	0 %	289577302
41	NC_013921	AAGAG	2	10	45348	45357	60 %	0 %	40 %	0 %	289577304
42	NC_013921	TCGTG	2	10	47486	47495	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013921	GGGAG	2	10	48670	48679	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013921	AAGAG	2	10	48788	48797	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013921	AGAGG	2	10	50020	50029	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013921	AGGGG	2	10	50119	50128	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013921	ATTTT	2	10	51532	51541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013921	ATTCA	2	10	53154	53163	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013921	TAAGA	2	10	53241	53250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013921	AAAAT	2	10	55547	55556	80 %	20 %	0 %	0 %	289577310
51	NC_013921	TGAAA	2	10	55857	55866	60 %	20 %	20 %	0 %	289577310
52	NC_013921	ATTTT	2	10	57183	57192	20 %	80 %	0 %	0 %	289577311
53	NC_013921	ATCAA	2	10	57843	57852	60 %	20 %	0 %	20 %	289577312
54	NC_013921	TGAAA	2	10	59180	59189	60 %	20 %	20 %	0 %	289577313
55	NC_013921	CATGT	2	10	60142	60151	20 %	40 %	20 %	20 %	289577314
56	NC_013921	TAATG	2	10	60496	60505	40 %	40 %	20 %	0 %	289577316
57	NC_013921	AAATT	2	10	60720	60729	60 %	40 %	0 %	0 %	289577316
58	NC_013921	TTTTG	2	10	60771	60780	0 %	80 %	20 %	0 %	289577316
59	NC_013921	GAATA	2	10	62001	62010	60 %	20 %	20 %	0 %	289577316
60	NC_013921	TACCA	2	10	65808	65817	40 %	20 %	0 %	40 %	289577320
61	NC_013921	ACAAA	2	10	67100	67109	80 %	0 %	0 %	20 %	289577321
62	NC_013921	CATAC	2	10	67918	67927	40 %	20 %	0 %	40 %	289577322
63	NC_013921	AAAAG	2	10	69585	69594	80 %	0 %	20 %	0 %	289577324
64	NC_013921	ATGGT	2	10	71986	71995	20 %	40 %	40 %	0 %	289577325
65	NC_013921	AAGAA	2	10	73935	73944	80 %	0 %	20 %	0 %	289577326
66	NC_013921	TTTAA	2	10	77602	77611	40 %	60 %	0 %	0 %	289577326
67	NC_013921	AAGAG	2	10	78315	78324	60 %	0 %	40 %	0 %	289577326
68	NC_013921	AATTG	2	10	79943	79952	40 %	40 %	20 %	0 %	289577328
69	NC_013921	AAAAG	2	10	81873	81882	80 %	0 %	20 %	0 %	289577330
70	NC_013921	CAATC	2	10	83143	83152	40 %	20 %	0 %	40 %	289577331
71	NC_013921	TGATT	2	10	84178	84187	20 %	60 %	20 %	0 %	289577332
72	NC_013921	GTATA	2	10	85166	85175	40 %	40 %	20 %	0 %	289577333
73	NC_013921	GTATT	2	10	86328	86337	20 %	60 %	20 %	0 %	289577333
74	NC_013921	TGATT	2	10	87421	87430	20 %	60 %	20 %	0 %	289577334
75	NC_013921	ATGCG	2	10	88360	88369	20 %	20 %	40 %	20 %	289577335
76	NC_013921	TTTAA	2	10	89177	89186	40 %	60 %	0 %	0 %	289577335
77	NC_013921	CTTAC	2	10	89268	89277	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_013921	AAAAG	2	10	89969	89978	80 %	0 %	20 %	0 %	289577336
79	NC_013921	TCGTG	2	10	91572	91581	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013921	GTAAG	2	10	92194	92203	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013921	GGGAG	2	10	92755	92764	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013921	AGAGG	2	10	94023	94032	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013921	AGGGG	2	10	94122	94131	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013921	TTTAA	2	10	96530	96539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013921	GTTCA	2	10	97839	97848	20 %	40 %	20 %	20 %	289577341
86	NC_013921	GAAAA	2	10	98166	98175	80 %	0 %	20 %	0 %	289577342
87	NC_013921	TTATA	2	10	98948	98957	40 %	60 %	0 %	0 %	289577342
88	NC_013921	TTTAG	2	10	99563	99572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013921	GATGG	2	10	100322	100331	20 %	20 %	60 %	0 %	289577343
90	NC_013921	AATAA	2	10	101550	101559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013921	AAAAT	2	10	106493	106502	80 %	20 %	0 %	0 %	289577351
92	NC_013921	AGAAA	2	10	107062	107071	80 %	0 %	20 %	0 %	289577351
93	NC_013921	AAATA	2	10	107256	107265	80 %	20 %	0 %	0 %	289577351
94	NC_013921	ATTTT	2	10	107756	107765	20 %	80 %	0 %	0 %	289577352
95	NC_013921	ATTTC	2	10	108523	108532	20 %	60 %	0 %	20 %	289577353
96	NC_013921	ATAAA	2	10	109735	109744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013921	TATAT	2	10	110530	110539	40 %	60 %	0 %	0 %	289577355
98	NC_013921	ATTTG	2	10	112040	112049	20 %	60 %	20 %	0 %	289577356
99	NC_013921	AACTT	2	10	112662	112671	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013921	AAATA	2	10	113629	113638	80 %	20 %	0 %	0 %	289577359
101	NC_013921	AAAAG	2	10	114573	114582	80 %	0 %	20 %	0 %	289577360
102	NC_013921	TAAAG	2	10	114816	114825	60 %	20 %	20 %	0 %	289577360
103	NC_013921	GTACT	2	10	116113	116122	20 %	40 %	20 %	20 %	289577361
104	NC_013921	AATGA	2	10	116300	116309	60 %	20 %	20 %	0 %	289577361
105	NC_013921	TAAAT	2	10	118578	118587	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013921	AATTA	2	10	118814	118823	60 %	40 %	0 %	0 %	289577363
107	NC_013921	AGGAG	2	10	120424	120433	40 %	0 %	60 %	0 %	289577364
108	NC_013921	GACAG	2	10	121575	121584	40 %	0 %	40 %	20 %	289577365
109	NC_013921	GATGG	2	10	122318	122327	20 %	20 %	60 %	0 %	289577366
110	NC_013921	AATAA	2	10	123546	123555	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013921	ATATT	2	10	124650	124659	40 %	60 %	0 %	0 %	289577368
112	NC_013921	TTATT	2	10	125226	125235	20 %	80 %	0 %	0 %	289577368
113	NC_013921	ATTTA	2	10	126001	126010	40 %	60 %	0 %	0 %	289577369
114	NC_013921	TATAA	2	10	127381	127390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013921	TTTTG	2	10	128621	128630	0 %	80 %	20 %	0 %	289577372
116	NC_013921	AAAAT	2	10	129229	129238	80 %	20 %	0 %	0 %	289577373
117	NC_013921	AAGAA	2	10	131072	131081	80 %	0 %	20 %	0 %	289577374
118	NC_013921	AAATA	2	10	131433	131442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013921	CATAT	2	10	133674	133683	40 %	40 %	0 %	20 %	289577376
120	NC_013921	TGGCT	2	10	134630	134639	0 %	40 %	40 %	20 %	289577378
121	NC_013921	ATAAC	2	10	137776	137785	60 %	20 %	0 %	20 %	289577383
122	NC_013921	ATTTA	2	10	140290	140299	40 %	60 %	0 %	0 %	289577385
123	NC_013921	AATAA	2	10	141754	141763	80 %	20 %	0 %	0 %	289577387
124	NC_013921	TTATT	2	10	144735	144744	20 %	80 %	0 %	0 %	289577390
125	NC_013921	AATTT	2	10	146223	146232	40 %	60 %	0 %	0 %	289577392
126	NC_013921	AATCT	2	10	149636	149645	40 %	40 %	0 %	20 %	289577396
127	NC_013921	CTTTT	2	10	150965	150974	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013921	CTTTG	2	10	154591	154600	0 %	60 %	20 %	20 %	289577401
129	NC_013921	TTTGG	2	10	155179	155188	0 %	60 %	40 %	0 %	289577401
130	NC_013921	CCCAA	2	10	156332	156341	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_013921	AAAAT	2	10	156984	156993	80 %	20 %	0 %	0 %	289577402
132	NC_013921	CTTAT	2	10	159621	159630	20 %	60 %	0 %	20 %	289577405
133	NC_013921	GAATC	2	10	160968	160977	40 %	20 %	20 %	20 %	289577406
134	NC_013921	ATGAG	2	10	162063	162072	40 %	20 %	40 %	0 %	289577408
135	NC_013921	TTAAT	2	10	163996	164005	40 %	60 %	0 %	0 %	289577410
136	NC_013921	AAAAG	2	10	164094	164103	80 %	0 %	20 %	0 %	289577410
137	NC_013921	TATTG	2	10	164291	164300	20 %	60 %	20 %	0 %	289577410
138	NC_013921	TGATT	2	10	167379	167388	20 %	60 %	20 %	0 %	289577415
139	NC_013921	CTTAA	2	10	167463	167472	40 %	40 %	0 %	20 %	289577415
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252	NC_013921	AGATA	2	10	308596	308605	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_013921	GTGCA	2	10	310406	310415	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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444	NC_013921	GACAG	2	10	559732	559741	40 %	0 %	40 %	20 %	289577753
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