MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 6348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013921	TAAA	2	8	108	115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013921	TTTA	2	8	852	859	25 %	75 %	0 %	0 %	289577266
3	NC_013921	ATGC	2	8	895	902	25 %	25 %	25 %	25 %	289577266
4	NC_013921	GAAC	2	8	1081	1088	50 %	0 %	25 %	25 %	289577266
5	NC_013921	CAAA	3	12	1130	1141	75 %	0 %	0 %	25 %	289577266
6	NC_013921	TCAA	2	8	1338	1345	50 %	25 %	0 %	25 %	289577266
7	NC_013921	CTTT	2	8	1865	1872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013921	GAAG	2	8	2714	2721	50 %	0 %	50 %	0 %	289577267
9	NC_013921	ATTT	2	8	3216	3223	25 %	75 %	0 %	0 %	289577268
10	NC_013921	AATA	2	8	3412	3419	75 %	25 %	0 %	0 %	289577269
11	NC_013921	GAAA	2	8	4063	4070	75 %	0 %	25 %	0 %	289577269
12	NC_013921	TTAT	3	12	4634	4645	25 %	75 %	0 %	0 %	289577270
13	NC_013921	AGAA	2	8	4842	4849	75 %	0 %	25 %	0 %	289577271
14	NC_013921	TAAT	2	8	4979	4986	50 %	50 %	0 %	0 %	289577271
15	NC_013921	ATGA	2	8	5839	5846	50 %	25 %	25 %	0 %	289577271
16	NC_013921	CTTA	2	8	6344	6351	25 %	50 %	0 %	25 %	289577271
17	NC_013921	ATTG	2	8	6474	6481	25 %	50 %	25 %	0 %	289577271
18	NC_013921	TATT	2	8	7745	7752	25 %	75 %	0 %	0 %	289577273
19	NC_013921	TTAG	2	8	7802	7809	25 %	50 %	25 %	0 %	289577273
20	NC_013921	CTTC	2	8	8144	8151	0 %	50 %	0 %	50 %	289577273
21	NC_013921	GTTA	2	8	8671	8678	25 %	50 %	25 %	0 %	289577273
22	NC_013921	CTTT	2	8	8927	8934	0 %	75 %	0 %	25 %	289577273
23	NC_013921	AAGA	2	8	9488	9495	75 %	0 %	25 %	0 %	289577274
24	NC_013921	TGCA	2	8	10188	10195	25 %	25 %	25 %	25 %	289577274
25	NC_013921	AATG	2	8	11144	11151	50 %	25 %	25 %	0 %	289577274
26	NC_013921	ATGA	2	8	11487	11494	50 %	25 %	25 %	0 %	289577275
27	NC_013921	ATAA	2	8	11745	11752	75 %	25 %	0 %	0 %	289577275
28	NC_013921	CTTC	2	8	11808	11815	0 %	50 %	0 %	50 %	289577275
29	NC_013921	GAAA	2	8	12708	12715	75 %	0 %	25 %	0 %	289577275
30	NC_013921	ACAA	2	8	13005	13012	75 %	0 %	0 %	25 %	289577275
31	NC_013921	AGGC	2	8	13059	13066	25 %	0 %	50 %	25 %	289577275
32	NC_013921	CTTA	2	8	13781	13788	25 %	50 %	0 %	25 %	289577276
33	NC_013921	TATT	2	8	14115	14122	25 %	75 %	0 %	0 %	289577276
34	NC_013921	GAAA	2	8	14276	14283	75 %	0 %	25 %	0 %	289577276
35	NC_013921	TACA	2	8	14720	14727	50 %	25 %	0 %	25 %	289577276
36	NC_013921	GGTG	2	8	15178	15185	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013921	GATT	2	8	15381	15388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013921	GTTA	2	8	15667	15674	25 %	50 %	25 %	0 %	289577277
39	NC_013921	TAAT	2	8	15816	15823	50 %	50 %	0 %	0 %	289577277
40	NC_013921	GAAA	2	8	16071	16078	75 %	0 %	25 %	0 %	289577278
41	NC_013921	AAAG	2	8	16183	16190	75 %	0 %	25 %	0 %	289577278
42	NC_013921	ACAT	2	8	16244	16251	50 %	25 %	0 %	25 %	289577278
43	NC_013921	TGAG	2	8	16748	16755	25 %	25 %	50 %	0 %	289577278
44	NC_013921	GAAT	2	8	16903	16910	50 %	25 %	25 %	0 %	289577278
45	NC_013921	ATAG	2	8	17170	17177	50 %	25 %	25 %	0 %	289577279
46	NC_013921	ACTG	2	8	17365	17372	25 %	25 %	25 %	25 %	289577279
47	NC_013921	TCTG	2	8	17571	17578	0 %	50 %	25 %	25 %	289577279
48	NC_013921	AATA	2	8	17709	17716	75 %	25 %	0 %	0 %	289577279
49	NC_013921	CAGA	2	8	18020	18027	50 %	0 %	25 %	25 %	289577279
50	NC_013921	AGAA	2	8	19835	19842	75 %	0 %	25 %	0 %	289577281
51	NC_013921	ATTT	2	8	20269	20276	25 %	75 %	0 %	0 %	289577282
52	NC_013921	AGAA	2	8	20392	20399	75 %	0 %	25 %	0 %	289577282
53	NC_013921	GTAA	2	8	20470	20477	50 %	25 %	25 %	0 %	289577282
54	NC_013921	ATGT	2	8	20506	20513	25 %	50 %	25 %	0 %	289577282
55	NC_013921	CTTC	2	8	20635	20642	0 %	50 %	0 %	50 %	289577282
56	NC_013921	TAAA	2	8	20813	20820	75 %	25 %	0 %	0 %	289577282
57	NC_013921	AAGC	2	8	21609	21616	50 %	0 %	25 %	25 %	289577283
58	NC_013921	TGAG	2	8	22456	22463	25 %	25 %	50 %	0 %	289577283
59	NC_013921	CTAT	2	8	22683	22690	25 %	50 %	0 %	25 %	289577284
60	NC_013921	GTTT	2	8	22793	22800	0 %	75 %	25 %	0 %	289577284
61	NC_013921	TCAT	2	8	23588	23595	25 %	50 %	0 %	25 %	289577284
62	NC_013921	GAAA	2	8	23597	23604	75 %	0 %	25 %	0 %	289577284
63	NC_013921	TTTC	2	8	23622	23629	0 %	75 %	0 %	25 %	289577284
64	NC_013921	GAAT	2	8	23913	23920	50 %	25 %	25 %	0 %	289577284
65	NC_013921	CAGA	2	8	24041	24048	50 %	0 %	25 %	25 %	289577284
66	NC_013921	AGAA	2	8	25200	25207	75 %	0 %	25 %	0 %	289577285
67	NC_013921	ATTG	2	8	25313	25320	25 %	50 %	25 %	0 %	289577285
68	NC_013921	AGCA	2	8	25746	25753	50 %	0 %	25 %	25 %	289577286
69	NC_013921	GGAT	2	8	25989	25996	25 %	25 %	50 %	0 %	289577286
70	NC_013921	TAAA	2	8	26928	26935	75 %	25 %	0 %	0 %	289577287
71	NC_013921	AGGA	2	8	27045	27052	50 %	0 %	50 %	0 %	289577287
72	NC_013921	AGGA	2	8	27075	27082	50 %	0 %	50 %	0 %	289577287
73	NC_013921	GAAA	2	8	27517	27524	75 %	0 %	25 %	0 %	289577288
74	NC_013921	TTTG	2	8	29368	29375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013921	AGGA	2	8	31389	31396	50 %	0 %	50 %	0 %	289577292
76	NC_013921	AAAT	2	8	31492	31499	75 %	25 %	0 %	0 %	289577292
77	NC_013921	TGCC	2	8	32492	32499	0 %	25 %	25 %	50 %	289577293
78	NC_013921	GTAT	2	8	32752	32759	25 %	50 %	25 %	0 %	289577293
79	NC_013921	TATT	2	8	32778	32785	25 %	75 %	0 %	0 %	289577293
80	NC_013921	ATTT	2	8	32901	32908	25 %	75 %	0 %	0 %	289577293
81	NC_013921	TTTA	2	8	33172	33179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013921	CTTT	2	8	33181	33188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013921	TAAT	2	8	33218	33225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013921	ATTT	2	8	33834	33841	25 %	75 %	0 %	0 %	289577294
85	NC_013921	TAGA	2	8	34254	34261	50 %	25 %	25 %	0 %	289577294
86	NC_013921	ATAG	2	8	34427	34434	50 %	25 %	25 %	0 %	289577294
87	NC_013921	ATTT	2	8	34667	34674	25 %	75 %	0 %	0 %	289577294
88	NC_013921	TGAC	2	8	35265	35272	25 %	25 %	25 %	25 %	289577294
89	NC_013921	TAAT	2	8	36244	36251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013921	GGTA	2	8	36287	36294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013921	TACC	2	8	36304	36311	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013921	GGAA	2	8	38024	38031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013921	AAGC	2	8	38040	38047	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013921	GAAA	2	8	38826	38833	75 %	0 %	25 %	0 %	289577297
95	NC_013921	GACA	2	8	38876	38883	50 %	0 %	25 %	25 %	289577297
96	NC_013921	GAAG	2	8	39245	39252	50 %	0 %	50 %	0 %	289577297
97	NC_013921	ATGA	2	8	39414	39421	50 %	25 %	25 %	0 %	289577297
98	NC_013921	GAAA	2	8	39434	39441	75 %	0 %	25 %	0 %	289577297
99	NC_013921	TTAT	2	8	39678	39685	25 %	75 %	0 %	0 %	289577297
100	NC_013921	GAAT	2	8	40129	40136	50 %	25 %	25 %	0 %	289577297
101	NC_013921	ATGA	2	8	40221	40228	50 %	25 %	25 %	0 %	289577297
102	NC_013921	GTAT	2	8	40337	40344	25 %	50 %	25 %	0 %	289577298
103	NC_013921	CAAA	2	8	40684	40691	75 %	0 %	0 %	25 %	289577298
104	NC_013921	TTTA	2	8	41715	41722	25 %	75 %	0 %	0 %	289577298
105	NC_013921	TGGT	2	8	41780	41787	0 %	50 %	50 %	0 %	289577298
106	NC_013921	AATC	2	8	41789	41796	50 %	25 %	0 %	25 %	289577298
107	NC_013921	CGGG	2	8	41972	41979	0 %	0 %	75 %	25 %	289577299
108	NC_013921	ATAA	2	8	41986	41993	75 %	25 %	0 %	0 %	289577299
109	NC_013921	GCTT	2	8	42381	42388	0 %	50 %	25 %	25 %	289577300
110	NC_013921	AAGA	2	8	42524	42531	75 %	0 %	25 %	0 %	289577300
111	NC_013921	AAAG	2	8	43539	43546	75 %	0 %	25 %	0 %	289577302
112	NC_013921	AAAT	2	8	43627	43634	75 %	25 %	0 %	0 %	289577302
113	NC_013921	TTAA	2	8	43728	43735	50 %	50 %	0 %	0 %	289577302
114	NC_013921	AAAT	2	8	43873	43880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013921	AAAG	2	8	44322	44329	75 %	0 %	25 %	0 %	289577303
116	NC_013921	AGCT	2	8	44698	44705	25 %	25 %	25 %	25 %	289577303
117	NC_013921	AGTA	2	8	45029	45036	50 %	25 %	25 %	0 %	289577303
118	NC_013921	ATTT	2	8	45250	45257	25 %	75 %	0 %	0 %	289577304
119	NC_013921	GATT	2	8	45585	45592	25 %	50 %	25 %	0 %	289577305
120	NC_013921	GTTA	2	8	46282	46289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013921	TCAA	2	8	46997	47004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013921	GGGA	2	8	47933	47940	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013921	ACCC	2	8	48229	48236	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_013921	AGAA	2	8	48323	48330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013921	GGGA	2	8	49791	49798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013921	AGTG	2	8	50660	50667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013921	TGAT	2	8	51805	51812	25 %	50 %	25 %	0 %	289577307
128	NC_013921	ATTT	2	8	52319	52326	25 %	75 %	0 %	0 %	289577307
129	NC_013921	TCGT	2	8	52722	52729	0 %	50 %	25 %	25 %	289577308
130	NC_013921	AACA	2	8	53255	53262	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013921	TGGT	2	8	53746	53753	0 %	50 %	50 %	0 %	289577309
132	NC_013921	AAAG	2	8	53955	53962	75 %	0 %	25 %	0 %	289577309
133	NC_013921	ATAA	2	8	54279	54286	75 %	25 %	0 %	0 %	289577309
134	NC_013921	AAAT	2	8	55266	55273	75 %	25 %	0 %	0 %	289577310
135	NC_013921	GGCA	2	8	55574	55581	25 %	0 %	50 %	25 %	289577310
136	NC_013921	TAAA	2	8	56354	56361	75 %	25 %	0 %	0 %	289577311
137	NC_013921	TATT	2	8	56368	56375	25 %	75 %	0 %	0 %	289577311
138	NC_013921	TTTG	2	8	56814	56821	0 %	75 %	25 %	0 %	289577311
139	NC_013921	CTAT	2	8	58097	58104	25 %	50 %	0 %	25 %	289577312
140	NC_013921	GAAT	2	8	58196	58203	50 %	25 %	25 %	0 %	289577312
141	NC_013921	GAAA	2	8	58473	58480	75 %	0 %	25 %	0 %	289577313
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