MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 1250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013921	TAAA	2	8	108	115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013921	CTTT	2	8	1865	1872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013921	GGTG	2	8	15178	15185	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013921	GATT	2	8	15381	15388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013921	TTTG	2	8	29368	29375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013921	TTTA	2	8	33172	33179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013921	CTTT	2	8	33181	33188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013921	TAAT	2	8	33218	33225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013921	TAAT	2	8	36244	36251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013921	GGTA	2	8	36287	36294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013921	TACC	2	8	36304	36311	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013921	GGAA	2	8	38024	38031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013921	AAGC	2	8	38040	38047	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013921	AAAT	2	8	43873	43880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013921	GTTA	2	8	46282	46289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013921	TCAA	2	8	46997	47004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013921	GGGA	2	8	47933	47940	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013921	ACCC	2	8	48229	48236	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_013921	AGAA	2	8	48323	48330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013921	GGGA	2	8	49791	49798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013921	AGTG	2	8	50660	50667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013921	AACA	2	8	53255	53262	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013921	ATTA	2	8	64127	64134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013921	TCAC	3	12	64214	64225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013921	ATAA	2	8	64264	64271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013921	ATTT	2	8	68652	68659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013921	ATGG	2	8	70282	70289	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013921	ATAC	2	8	78636	78643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013921	ATTT	2	8	84839	84846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013921	CAAA	2	8	85043	85050	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013921	AGAA	2	8	86388	86395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013921	GGGT	2	8	90131	90138	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013921	ATAA	2	8	90268	90275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013921	TCAA	2	8	91083	91090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013921	GGGA	2	8	92019	92026	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013921	GCGG	2	8	92280	92287	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013921	ACCC	2	8	92314	92321	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_013921	AGAA	2	8	92408	92415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013921	GAAG	2	8	93298	93305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013921	GGGA	2	8	93794	93801	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013921	AGTG	2	8	94663	94670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013921	GGGA	2	8	96652	96659	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013921	TAAG	2	8	99448	99455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013921	GAAG	2	8	99771	99778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013921	GATG	2	8	99833	99840	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013921	AAGG	2	8	100051	100058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013921	GTAC	2	8	101522	101529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013921	AATA	2	8	115450	115457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013921	AATC	2	8	118540	118547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013921	TTAC	2	8	118562	118569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013921	GAAG	2	8	121767	121774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013921	GATG	2	8	121829	121836	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013921	AAGG	2	8	122047	122054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013921	GTAC	2	8	123518	123525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013921	ACGG	2	8	124057	124064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013921	TAAA	2	8	128879	128886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013921	CTTT	2	8	128937	128944	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013921	ATAA	2	8	131554	131561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013921	ATTT	2	8	136792	136799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013921	AAAC	2	8	136829	136836	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013921	TAAA	2	8	138312	138319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013921	AATC	2	8	142756	142763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013921	GAAA	2	8	146911	146918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013921	TCAA	2	8	148064	148071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013921	AAAG	2	8	153053	153060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013921	ATTT	2	8	156400	156407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013921	ACAA	2	8	156506	156513	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013921	TGGC	2	8	156561	156568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013921	AGTA	2	8	156614	156621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013921	TTAT	2	8	156700	156707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013921	GGGA	2	8	167004	167011	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013921	ATAA	2	8	171564	171571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013921	AGGG	2	8	173050	173057	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013921	TAAT	2	8	178460	178467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013921	TAGT	2	8	182548	182555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013921	GTGA	2	8	185152	185159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013921	ATAG	2	8	185743	185750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013921	TTTC	2	8	185752	185759	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013921	GACA	2	8	187485	187492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013921	GGAA	2	8	205922	205929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013921	AAGA	2	8	207688	207695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013921	GGGA	2	8	210876	210883	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013921	AATA	2	8	214022	214029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013921	GAAA	2	8	219373	219380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013921	AATT	2	8	219442	219449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013921	ATTA	2	8	227184	227191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013921	AAAT	2	8	231026	231033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013921	TAAA	2	8	232877	232884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013921	AAAT	2	8	235540	235547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013921	AGTT	2	8	238834	238841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013921	CAAT	2	8	259443	259450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013921	ATTT	2	8	259505	259512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013921	ATTT	2	8	261000	261007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013921	ACGA	2	8	261172	261179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013921	ATGG	2	8	261195	261202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013921	ATTT	2	8	262357	262364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013921	AGGC	2	8	266330	266337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013921	ATGG	2	8	267992	267999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013921	TAAT	2	8	269671	269678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013921	AGAA	2	8	272331	272338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013921	AATA	2	8	273978	273985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013921	TTAA	2	8	280596	280603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013921	TCAA	2	8	288006	288013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013921	TCTT	2	8	288202	288209	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013921	TTTG	2	8	290893	290900	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013921	AGAA	2	8	290912	290919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013921	AAAT	2	8	292641	292648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013921	TAAT	2	8	293171	293178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013921	TTTA	2	8	294160	294167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013921	AATA	2	8	294182	294189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013921	TAAT	2	8	294218	294225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013921	TATT	2	8	299194	299201	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013921	TTAT	2	8	299214	299221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013921	AGAA	2	8	301181	301188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013921	TAAA	2	8	301326	301333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013921	AAAG	2	8	301508	301515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013921	TTGA	2	8	301701	301708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013921	ATGT	2	8	302141	302148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013921	TGTA	2	8	302275	302282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013921	TACA	2	8	302312	302319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013921	GTTG	2	8	302424	302431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013921	TCCT	2	8	302757	302764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013921	AGCG	2	8	302999	303006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013921	GAAA	2	8	303104	303111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013921	GCAA	2	8	303140	303147	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013921	GCCA	2	8	303453	303460	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013921	TAAA	2	8	303585	303592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013921	TAAA	2	8	303744	303751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013921	ATTA	2	8	303956	303963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013921	TAAT	2	8	304008	304015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013921	TTTC	2	8	305343	305350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013921	TGTC	2	8	306248	306255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013921	GTTT	2	8	306348	306355	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013921	AATA	2	8	306405	306412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013921	TCTT	2	8	306518	306525	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013921	CTTC	2	8	306606	306613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013921	TAAT	2	8	307596	307603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013921	AACA	2	8	308417	308424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013921	GAAT	2	8	308508	308515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013921	GAAA	2	8	308626	308633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013921	ACAG	2	8	308875	308882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013921	ATAC	2	8	309025	309032	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013921	GTAA	2	8	309196	309203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013921	TTTG	2	8	309447	309454	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013921	ATTC	2	8	309901	309908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013921	ATAC	2	8	310346	310353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013921	GAAG	2	8	310572	310579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013921	ATAA	2	8	310647	310654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013921	AGTC	2	8	312252	312259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013921	TTAA	2	8	316430	316437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013921	TAAA	2	8	316556	316563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013921	GCAA	2	8	316606	316613	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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