MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridiales genomosp. BVAB3 str. UPII9-5 chromosome

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013895	TAAAAG	2	12	8485	8496	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013895	AAAGCA	2	12	8666	8677	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013895	TAAGGT	2	12	43328	43339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013895	TACTTG	2	12	87034	87045	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013895	TCAGGT	2	12	107047	107058	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013895	CGAAAA	2	12	107193	107204	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013895	CTACTG	3	18	110315	110332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013895	GCTATT	2	12	123409	123420	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013895	AAAGTT	2	12	171144	171155	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013895	TAAAAC	2	12	182748	182759	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013895	TGAGAG	2	12	200794	200805	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013895	TTTTGG	2	12	322342	322353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013895	AAAACA	2	12	327343	327354	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013895	GAGGTA	2	12	346638	346649	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013895	CTCTTG	3	18	382879	382896	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013895	GCCTGA	4	24	386209	386232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013895	ATTATC	2	12	480396	480407	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013895	GGAAGG	2	12	492413	492424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013895	AATGAG	2	12	524770	524781	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013895	GCGATC	2	12	578835	578846	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013895	AATGAG	2	12	637742	637753	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013895	TAAAAG	2	12	641343	641354	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013895	GAAGTT	2	12	641722	641733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013895	ATCATT	2	12	654768	654779	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013895	TGGGAC	2	12	686386	686397	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013895	ACTGGG	2	12	698125	698136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013895	AAAATT	2	12	706787	706798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013895	ATATTA	2	12	720726	720737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013895	AAGGTA	2	12	733166	733177	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013895	AATGAA	2	12	754327	754338	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013895	CCTTAG	3	18	765525	765542	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013895	ATTTTT	2	12	779713	779724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013895	AAATTA	2	12	811206	811217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013895	TTGCCA	2	12	865606	865617	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013895	TATCCA	2	12	880013	880024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013895	TAAATT	2	12	896979	896990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013895	TGTCGG	2	12	981756	981767	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013895	TACCAT	2	12	1013189	1013200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013895	AATTGT	2	12	1023547	1023558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013895	CAGGCT	2	12	1026789	1026800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013895	AATCGT	2	12	1038609	1038620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013895	TTGAGT	2	12	1044890	1044901	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013895	TATTTT	2	12	1092065	1092076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013895	TGTTTT	2	12	1096226	1096237	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013895	TTTGTT	2	12	1112664	1112675	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013895	TAAAAA	2	12	1119510	1119521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013895	AAATTT	2	12	1136330	1136341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013895	AACCTC	2	12	1146809	1146820	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013895	ATTTTT	2	12	1159058	1159069	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013895	ACAGAC	2	12	1174218	1174229	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013895	ATTTAT	2	12	1182164	1182175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013895	CGCCCG	2	12	1211546	1211557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013895	TTAATT	3	18	1234040	1234057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013895	TAAAAC	2	12	1240987	1240998	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013895	AACCGA	2	12	1263134	1263145	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013895	ACGAGT	2	12	1267241	1267252	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013895	TTTTCA	2	12	1280298	1280309	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013895	TAAATT	2	12	1290084	1290095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013895	AAGTAT	2	12	1299942	1299953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013895	GCAACC	2	12	1302551	1302562	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013895	CGGCAG	2	12	1312571	1312582	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013895	TAGCGT	2	12	1428032	1428043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013895	AGCTAT	2	12	1516793	1516804	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013895	TTCCCC	2	12	1584399	1584410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013895	ATCCTT	2	12	1631264	1631275	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013895	TGCAAC	2	12	1632578	1632589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013895	AATTAT	2	12	1639880	1639891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013895	ACGCGC	2	12	1640190	1640201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013895	GCCTAG	2	12	1656443	1656454	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013895	GGCTTG	5	30	1656460	1656489	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013895	GAAGTT	2	12	1669889	1669900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013895	GCTTAT	2	12	1707183	1707194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013895	TATTTT	2	12	1750942	1750953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013895	GTTTGA	2	12	1767021	1767032	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013895	TATTTT	2	12	1770193	1770204	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013895	TTAAAT	2	12	1777257	1777268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.