MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridiales genomosp. BVAB3 str. UPII9-5 chromosome

Total Repeats: 1355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013895	ATTAA	2	10	319	328	60 %	40 %	0 %	0 %	289450862
2	NC_013895	AATTT	2	10	1090	1099	40 %	60 %	0 %	0 %	289450862
3	NC_013895	TATAA	2	10	1562	1571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013895	TAATT	2	10	1769	1778	40 %	60 %	0 %	0 %	289450447
5	NC_013895	AAGGT	2	10	1840	1849	40 %	20 %	40 %	0 %	289450447
6	NC_013895	ATTTG	2	10	5945	5954	20 %	60 %	20 %	0 %	289450191
7	NC_013895	CTTAT	2	10	6470	6479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013895	AAACT	2	10	8355	8364	60 %	20 %	0 %	20 %	289450601
9	NC_013895	ACAAA	2	10	9016	9025	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013895	GATTT	2	10	10280	10289	20 %	60 %	20 %	0 %	308513212
11	NC_013895	AACAA	2	10	12496	12505	80 %	0 %	0 %	20 %	289450193
12	NC_013895	ATTTT	2	10	13457	13466	20 %	80 %	0 %	0 %	289449699
13	NC_013895	CTGCC	2	10	14097	14106	0 %	20 %	20 %	60 %	289450368
14	NC_013895	GATGA	2	10	14397	14406	40 %	20 %	40 %	0 %	289450368
15	NC_013895	AGGTC	2	10	16320	16329	20 %	20 %	40 %	20 %	289449447
16	NC_013895	TAACT	2	10	17383	17392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013895	AGCCA	2	10	19032	19041	40 %	0 %	20 %	40 %	289450540
18	NC_013895	CTGTG	2	10	21156	21165	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013895	ATTTT	2	10	21471	21480	20 %	80 %	0 %	0 %	289450098
20	NC_013895	CAAAG	2	10	23235	23244	60 %	0 %	20 %	20 %	289450352
21	NC_013895	TAAAC	2	10	24922	24931	60 %	20 %	0 %	20 %	289449839
22	NC_013895	GGCGT	2	10	26266	26275	0 %	20 %	60 %	20 %	289449771
23	NC_013895	TCGGT	2	10	26988	26997	0 %	40 %	40 %	20 %	289450795
24	NC_013895	CCTTT	2	10	30024	30033	0 %	60 %	0 %	40 %	289449586
25	NC_013895	TCCGG	2	10	30647	30656	0 %	20 %	40 %	40 %	289449586
26	NC_013895	ATCTT	2	10	30931	30940	20 %	60 %	0 %	20 %	289449586
27	NC_013895	ATTGT	2	10	31032	31041	20 %	60 %	20 %	0 %	289449586
28	NC_013895	GTTTG	2	10	32177	32186	0 %	60 %	40 %	0 %	289450018
29	NC_013895	AATCA	2	10	33861	33870	60 %	20 %	0 %	20 %	289449865
30	NC_013895	GGAAG	2	10	33960	33969	40 %	0 %	60 %	0 %	289449865
31	NC_013895	TTTTC	2	10	35783	35792	0 %	80 %	0 %	20 %	289450738
32	NC_013895	ATTTG	2	10	36058	36067	20 %	60 %	20 %	0 %	289450398
33	NC_013895	CGGCG	2	10	37105	37114	0 %	0 %	60 %	40 %	289450662
34	NC_013895	GAGAG	2	10	37410	37419	40 %	0 %	60 %	0 %	289450662
35	NC_013895	GGGCA	2	10	37428	37437	20 %	0 %	60 %	20 %	289450662
36	NC_013895	CGAAG	2	10	38273	38282	40 %	0 %	40 %	20 %	289450662
37	NC_013895	AAAGT	2	10	39885	39894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013895	CGGTT	2	10	40464	40473	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013895	ATGGT	2	10	40506	40515	20 %	40 %	40 %	0 %	289449948
40	NC_013895	AAGGC	2	10	43056	43065	40 %	0 %	40 %	20 %	289450616
41	NC_013895	AAGGT	2	10	44777	44786	40 %	20 %	40 %	0 %	289449689
42	NC_013895	TCTTG	2	10	44883	44892	0 %	60 %	20 %	20 %	289449689
43	NC_013895	GCTGA	2	10	45045	45054	20 %	20 %	40 %	20 %	289449689
44	NC_013895	CGAAA	2	10	47432	47441	60 %	0 %	20 %	20 %	289450307
45	NC_013895	CTTTT	2	10	48314	48323	0 %	80 %	0 %	20 %	289450626
46	NC_013895	GGCCT	2	10	49931	49940	0 %	20 %	40 %	40 %	289450312
47	NC_013895	CCCCA	2	10	53369	53378	20 %	0 %	0 %	80 %	289450622
48	NC_013895	CTTGT	2	10	54887	54896	0 %	60 %	20 %	20 %	289449950
49	NC_013895	CCCTA	2	10	55900	55909	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_013895	TTTTA	2	10	56352	56361	20 %	80 %	0 %	0 %	289449585
51	NC_013895	ATTAT	2	10	57290	57299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013895	ATCGG	2	10	62079	62088	20 %	20 %	40 %	20 %	289450011
53	NC_013895	AAAAT	2	10	62659	62668	80 %	20 %	0 %	0 %	289450011
54	NC_013895	AATTT	2	10	68631	68640	40 %	60 %	0 %	0 %	289450050
55	NC_013895	CGCTT	2	10	68850	68859	0 %	40 %	20 %	40 %	289450050
56	NC_013895	TATAG	2	10	69414	69423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013895	GCAAA	2	10	69529	69538	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013895	CAGAA	2	10	69819	69828	60 %	0 %	20 %	20 %	289450553
59	NC_013895	CAGCG	2	10	70380	70389	20 %	0 %	40 %	40 %	289450553
60	NC_013895	AAATA	2	10	73497	73506	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013895	AAAAT	2	10	73633	73642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013895	TTCCG	2	10	76918	76927	0 %	40 %	20 %	40 %	289449847
63	NC_013895	CGGAG	2	10	79809	79818	20 %	0 %	60 %	20 %	289449869
64	NC_013895	TCAAA	2	10	80434	80443	60 %	20 %	0 %	20 %	289449869
65	NC_013895	GAATC	2	10	80596	80605	40 %	20 %	20 %	20 %	289450543
66	NC_013895	CCGGC	2	10	84437	84446	0 %	0 %	40 %	60 %	289450408
67	NC_013895	GGCGA	2	10	85700	85709	20 %	0 %	60 %	20 %	289449376
68	NC_013895	GGCAT	2	10	87491	87500	20 %	20 %	40 %	20 %	289450528
69	NC_013895	GATCT	2	10	87508	87517	20 %	40 %	20 %	20 %	289450528
70	NC_013895	AAATT	2	10	87794	87803	60 %	40 %	0 %	0 %	289450528
71	NC_013895	CATTT	2	10	89161	89170	20 %	60 %	0 %	20 %	289449867
72	NC_013895	AGGGC	2	10	90907	90916	20 %	0 %	60 %	20 %	289450577
73	NC_013895	TAGCA	2	10	93438	93447	40 %	20 %	20 %	20 %	289450169
74	NC_013895	GGTTA	2	10	94048	94057	20 %	40 %	40 %	0 %	289450169
75	NC_013895	CAAAG	2	10	99427	99436	60 %	0 %	20 %	20 %	289449878
76	NC_013895	CGCGG	2	10	99979	99988	0 %	0 %	60 %	40 %	289449878
77	NC_013895	TAGCA	2	10	100613	100622	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013895	GGAAA	2	10	101299	101308	60 %	0 %	40 %	0 %	289450804
79	NC_013895	CCGAC	2	10	101812	101821	20 %	0 %	20 %	60 %	289450001
80	NC_013895	GACCC	2	10	101917	101926	20 %	0 %	20 %	60 %	289450001
81	NC_013895	TCGTG	2	10	105335	105344	0 %	40 %	40 %	20 %	289450001
82	NC_013895	CGGCA	2	10	107665	107674	20 %	0 %	40 %	40 %	289450686
83	NC_013895	GCTCA	2	10	108735	108744	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013895	TCCCT	2	10	109913	109922	0 %	40 %	0 %	60 %	289449543
85	NC_013895	TGGCT	2	10	110197	110206	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013895	ATGCG	2	10	110419	110428	20 %	20 %	40 %	20 %	289450137
87	NC_013895	ATGGC	2	10	110904	110913	20 %	20 %	40 %	20 %	289450137
88	NC_013895	TTTTG	2	10	111430	111439	0 %	80 %	20 %	0 %	289450137
89	NC_013895	TTGAC	2	10	115179	115188	20 %	40 %	20 %	20 %	289449661
90	NC_013895	TGCTG	2	10	115234	115243	0 %	40 %	40 %	20 %	289449661
91	NC_013895	GGCAA	2	10	116711	116720	40 %	0 %	40 %	20 %	289449983
92	NC_013895	TTTTC	2	10	120099	120108	0 %	80 %	0 %	20 %	289449659
93	NC_013895	TTGTC	2	10	122007	122016	0 %	60 %	20 %	20 %	289449769
94	NC_013895	AAGAA	2	10	124171	124180	80 %	0 %	20 %	0 %	289450776
95	NC_013895	ATAAA	2	10	126104	126113	80 %	20 %	0 %	0 %	289449582
96	NC_013895	AACTG	2	10	126340	126349	40 %	20 %	20 %	20 %	289449582
97	NC_013895	AAAAG	2	10	130141	130150	80 %	0 %	20 %	0 %	289449459
98	NC_013895	TGGCC	2	10	131511	131520	0 %	20 %	40 %	40 %	289449830
99	NC_013895	CTCAG	2	10	131578	131587	20 %	20 %	20 %	40 %	289449830
100	NC_013895	GCTAA	2	10	132514	132523	40 %	20 %	20 %	20 %	289449830
101	NC_013895	TTTAT	2	10	134091	134100	20 %	80 %	0 %	0 %	289450833
102	NC_013895	ACTTG	2	10	136280	136289	20 %	40 %	20 %	20 %	289450013
103	NC_013895	GCTTT	2	10	136903	136912	0 %	60 %	20 %	20 %	289450866
104	NC_013895	AAGCT	2	10	138066	138075	40 %	20 %	20 %	20 %	289450116
105	NC_013895	GCGGT	2	10	139170	139179	0 %	20 %	60 %	20 %	289450116
106	NC_013895	AGTTT	2	10	139843	139852	20 %	60 %	20 %	0 %	289449611
107	NC_013895	ATCAA	2	10	142141	142150	60 %	20 %	0 %	20 %	289449770
108	NC_013895	TGCGA	2	10	142406	142415	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013895	AGCAA	2	10	142881	142890	60 %	0 %	20 %	20 %	289449395
110	NC_013895	TTTGG	2	10	144779	144788	0 %	60 %	40 %	0 %	289449544
111	NC_013895	TACCG	2	10	152403	152412	20 %	20 %	20 %	40 %	289449773
112	NC_013895	AAAAT	2	10	152813	152822	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013895	CGGTA	2	10	158157	158166	20 %	20 %	40 %	20 %	289450848
114	NC_013895	AATAT	2	10	158216	158225	60 %	40 %	0 %	0 %	289450848
115	NC_013895	GCGAT	2	10	158846	158855	20 %	20 %	40 %	20 %	289450848
116	NC_013895	TTTAT	2	10	161016	161025	20 %	80 %	0 %	0 %	289450109
117	NC_013895	CAAAT	2	10	161794	161803	60 %	20 %	0 %	20 %	289450331
118	NC_013895	GGAAA	2	10	162055	162064	60 %	0 %	40 %	0 %	289450331
119	NC_013895	CGGCG	2	10	162243	162252	0 %	0 %	60 %	40 %	289450103
120	NC_013895	GGTCG	2	10	162637	162646	0 %	20 %	60 %	20 %	289450103
121	NC_013895	TTGAT	2	10	163783	163792	20 %	60 %	20 %	0 %	289450648
122	NC_013895	CTTCG	2	10	164930	164939	0 %	40 %	20 %	40 %	289449792
123	NC_013895	TAAAT	2	10	166481	166490	60 %	40 %	0 %	0 %	289450476
124	NC_013895	GCCAA	2	10	166833	166842	40 %	0 %	20 %	40 %	289450476
125	NC_013895	GCCAA	2	10	166914	166923	40 %	0 %	20 %	40 %	289450476
126	NC_013895	ATTCC	2	10	168582	168591	20 %	40 %	0 %	40 %	289450231
127	NC_013895	CAAGA	2	10	169362	169371	60 %	0 %	20 %	20 %	289450231
128	NC_013895	CCAAA	2	10	169737	169746	60 %	0 %	0 %	40 %	289450231
129	NC_013895	TAATG	2	10	171815	171824	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013895	CCGAA	2	10	172819	172828	40 %	0 %	20 %	40 %	289450796
131	NC_013895	TGATT	2	10	173396	173405	20 %	60 %	20 %	0 %	289450796
132	NC_013895	CTCGG	2	10	175161	175170	0 %	20 %	40 %	40 %	289450796
133	NC_013895	CAACC	2	10	176118	176127	40 %	0 %	0 %	60 %	289450796
134	NC_013895	ATATA	2	10	176558	176567	60 %	40 %	0 %	0 %	289450796
135	NC_013895	CGGCA	2	10	178430	178439	20 %	0 %	40 %	40 %	289449815
136	NC_013895	TGGTC	2	10	178850	178859	0 %	40 %	40 %	20 %	289449815
137	NC_013895	AGCGT	2	10	181127	181136	20 %	20 %	40 %	20 %	289449880
138	NC_013895	ATGTG	2	10	181406	181415	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013895	CCGAA	2	10	183941	183950	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_013895	GTGTT	2	10	184847	184856	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_013895	CAAAG	2	10	198566	198575	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_013895	GTACA	2	10	202607	202616	40 %	20 %	20 %	20 %	289449574
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155	NC_013895	TCAAC	2	10	207516	207525	40 %	20 %	0 %	40 %	289450654
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251	NC_013895	TATTT	2	10	326401	326410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_013895	AGATA	2	10	326546	326555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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