MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridiales genomosp. BVAB3 str. UPII9-5 chromosome

Total Repeats: 20746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013895	TTC	2	6	274	279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289450862
2	NC_013895	GCA	2	6	457	462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289450862
3	NC_013895	CGG	2	6	513	518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289450862
4	NC_013895	ATT	2	6	592	597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450862
5	NC_013895	TTA	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450862
6	NC_013895	TGA	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450862
7	NC_013895	GTA	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450862
8	NC_013895	GAA	2	6	835	840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450862
9	NC_013895	TTG	2	6	872	877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450862
10	NC_013895	TAA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450862
11	NC_013895	GCT	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450862
12	NC_013895	ATA	2	6	1135	1140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450862
13	NC_013895	CGG	2	6	1287	1292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289450862
14	NC_013895	CAT	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289450862
15	NC_013895	ATG	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450862
16	NC_013895	AGG	2	6	1347	1352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289450862
17	NC_013895	AAT	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450862
18	NC_013895	CAG	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289450862
19	NC_013895	GGT	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289450862
20	NC_013895	TTA	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
21	NC_013895	AAC	2	6	1724	1729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289450447
22	NC_013895	GAA	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450447
23	NC_013895	ATT	2	6	1866	1871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
24	NC_013895	GCT	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450447
25	NC_013895	ATT	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
26	NC_013895	CTG	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450447
27	NC_013895	TAG	2	6	2002	2007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450447
28	NC_013895	TAA	2	6	2065	2070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450447
29	NC_013895	TTA	2	6	2262	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
30	NC_013895	GAA	2	6	2277	2282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450447
31	NC_013895	GAT	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450447
32	NC_013895	ATT	2	6	2568	2573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
33	NC_013895	TTA	2	6	2618	2623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
34	NC_013895	GAT	2	6	2649	2654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450447
35	NC_013895	TTA	2	6	2695	2700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450447
36	NC_013895	AAT	2	6	2752	2757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450447
37	NC_013895	ATA	2	6	2823	2828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449549
38	NC_013895	ATC	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289449549
39	NC_013895	CAT	2	6	2875	2880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289449549
40	NC_013895	TTA	2	6	2998	3003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289449549
41	NC_013895	AGC	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289449549
42	NC_013895	TCT	2	6	3099	3104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289449549
43	NC_013895	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449549
44	NC_013895	ATG	2	6	3130	3135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289449549
45	NC_013895	TTG	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289449549
46	NC_013895	GGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289449549
47	NC_013895	AAG	3	9	3233	3241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289449549
48	NC_013895	AAT	2	6	3308	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449549
49	NC_013895	CAA	2	6	3474	3479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289449549
50	NC_013895	TCT	2	6	3483	3488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289449549
51	NC_013895	ATG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289449549
52	NC_013895	CAT	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289449549
53	NC_013895	TAA	3	9	3662	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449549
54	NC_013895	TAT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289449549
55	NC_013895	GAT	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289449549
56	NC_013895	GAA	2	6	3888	3893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289449549
57	NC_013895	GAT	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289449682
58	NC_013895	TGA	2	6	4334	4339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
59	NC_013895	ATG	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
60	NC_013895	TAA	2	6	4493	4498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
61	NC_013895	CAT	2	6	4599	4604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289450191
62	NC_013895	TTG	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450191
63	NC_013895	ATG	2	6	4684	4689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
64	NC_013895	GAT	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
65	NC_013895	GTT	2	6	4767	4772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450191
66	NC_013895	GGA	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289450191
67	NC_013895	TGG	2	6	4802	4807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289450191
68	NC_013895	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450191
69	NC_013895	AAT	2	6	4955	4960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
70	NC_013895	TAA	2	6	5084	5089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
71	NC_013895	GAA	3	9	5124	5132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450191
72	NC_013895	GTA	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
73	NC_013895	ATG	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
74	NC_013895	AAT	2	6	5165	5170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
75	NC_013895	TTG	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450191
76	NC_013895	TAG	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
77	NC_013895	AAT	2	6	5277	5282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
78	NC_013895	AGG	2	6	5333	5338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289450191
79	NC_013895	TAA	2	6	5377	5382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
80	NC_013895	TAG	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
81	NC_013895	ATT	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450191
82	NC_013895	TGC	2	6	5651	5656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450191
83	NC_013895	TTG	2	6	5767	5772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450191
84	NC_013895	GGA	2	6	5787	5792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289450191
85	NC_013895	ACA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289450191
86	NC_013895	TGA	2	6	5939	5944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
87	NC_013895	TAA	2	6	5969	5974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450191
88	NC_013895	ATT	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450191
89	NC_013895	ATG	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450191
90	NC_013895	AAC	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289450191
91	NC_013895	ATT	2	6	6272	6277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450191
92	NC_013895	GAA	2	6	6336	6341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289450191
93	NC_013895	GTT	2	6	6501	6506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289449556
94	NC_013895	ATT	2	6	6507	6512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289449556
95	NC_013895	TCA	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289449556
96	NC_013895	AAT	2	6	6551	6556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449556
97	NC_013895	TTC	2	6	6569	6574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289449556
98	NC_013895	GGA	2	6	6688	6693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289449556
99	NC_013895	CTT	2	6	6752	6757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289449556
100	NC_013895	TTC	2	6	6777	6782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289449556
101	NC_013895	CCA	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289449556
102	NC_013895	ATC	2	6	6825	6830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289449556
103	NC_013895	GAA	2	6	6892	6897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289449556
104	NC_013895	CTT	2	6	6923	6928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289449556
105	NC_013895	CTT	2	6	7070	7075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289449556
106	NC_013895	GCT	2	6	7093	7098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289449556
107	NC_013895	AAT	2	6	7167	7172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449556
108	NC_013895	TTC	2	6	7200	7205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289449556
109	NC_013895	ATT	2	6	7314	7319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289449556
110	NC_013895	ATC	2	6	7320	7325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289449556
111	NC_013895	GAT	2	6	7339	7344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289449556
112	NC_013895	TAA	2	6	7371	7376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289449556
113	NC_013895	TTG	2	6	7382	7387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289449556
114	NC_013895	ATT	2	6	7392	7397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289449556
115	NC_013895	ATA	2	6	7642	7647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450601
116	NC_013895	TTG	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450601
117	NC_013895	CTG	2	6	7805	7810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450601
118	NC_013895	ATT	2	6	7934	7939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450601
119	NC_013895	TAA	2	6	7972	7977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450601
120	NC_013895	TCT	2	6	8059	8064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289450601
121	NC_013895	TTA	2	6	8069	8074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450601
122	NC_013895	CTC	2	6	8088	8093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289450601
123	NC_013895	TAT	2	6	8176	8181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289450601
124	NC_013895	CAT	2	6	8184	8189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289450601
125	NC_013895	TAG	2	6	8229	8234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450601
126	NC_013895	GTA	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450601
127	NC_013895	TGG	2	6	8749	8754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289450810
128	NC_013895	ATG	3	9	9498	9506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308513211
129	NC_013895	GAA	2	6	9752	9757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308513211
130	NC_013895	GAT	2	6	9796	9801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308513211
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255	NC_013895	ATA	2	6	20592	20597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289450540
256	NC_013895	GTT	2	6	20602	20607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289450540
257	NC_013895	GAT	2	6	20660	20665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289450540
258	NC_013895	TGC	2	6	20671	20676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289450540
259	NC_013895	TGG	2	6	20722	20727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289450540
260	NC_013895	AGC	2	6	20733	20738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289450540
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262	NC_013895	CTA	2	6	20796	20801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289450540
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271	NC_013895	TTC	2	6	21633	21638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289450098
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279	NC_013895	AAC	2	6	22488	22493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289450098
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