MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013894	ATCTT	2	10	108	117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013894	ATATT	2	10	372	381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013894	AGAGG	2	10	464	473	40 %	0 %	60 %	0 %	289547778
4	NC_013894	AGAGG	2	10	2282	2291	40 %	0 %	60 %	0 %	289547781
5	NC_013894	TGGTA	2	10	2389	2398	20 %	40 %	40 %	0 %	289547781
6	NC_013894	TTTGG	2	10	3177	3186	0 %	60 %	40 %	0 %	289547781
7	NC_013894	CAAAA	2	10	3810	3819	80 %	0 %	0 %	20 %	289547782
8	NC_013894	CAGGA	2	10	6979	6988	40 %	0 %	40 %	20 %	289547784
9	NC_013894	TGAGG	2	10	7355	7364	20 %	20 %	60 %	0 %	289547784
10	NC_013894	AAAGG	2	10	7988	7997	60 %	0 %	40 %	0 %	289547785
11	NC_013894	AAGGG	2	10	11136	11145	40 %	0 %	60 %	0 %	289547789
12	NC_013894	TATGA	2	10	11371	11380	40 %	40 %	20 %	0 %	289547790
13	NC_013894	CTTCT	2	10	13931	13940	0 %	60 %	0 %	40 %	289547792
14	NC_013894	TGTAG	2	10	16619	16628	20 %	40 %	40 %	0 %	289547795
15	NC_013894	AAGAG	2	10	17362	17371	60 %	0 %	40 %	0 %	289547795
16	NC_013894	AAAGG	2	10	20455	20464	60 %	0 %	40 %	0 %	289547799
17	NC_013894	TTCAG	2	10	21382	21391	20 %	40 %	20 %	20 %	289547800
18	NC_013894	TTTGT	2	10	21931	21940	0 %	80 %	20 %	0 %	289547802
19	NC_013894	GAAGG	2	10	23196	23205	40 %	0 %	60 %	0 %	289547804
20	NC_013894	TCCCA	2	10	24878	24887	20 %	20 %	0 %	60 %	289547804
21	NC_013894	ACGGG	2	10	26074	26083	20 %	0 %	60 %	20 %	289547806
22	NC_013894	CCAGT	2	10	26469	26478	20 %	20 %	20 %	40 %	289547806
23	NC_013894	AAACT	2	10	28935	28944	60 %	20 %	0 %	20 %	289547808
24	NC_013894	TCTTT	2	10	28957	28966	0 %	80 %	0 %	20 %	289547808
25	NC_013894	CGTAG	2	10	30253	30262	20 %	20 %	40 %	20 %	289547810
26	NC_013894	TCCTC	2	10	30360	30369	0 %	40 %	0 %	60 %	289547810
27	NC_013894	AAGGG	2	10	31723	31732	40 %	0 %	60 %	0 %	289547811
28	NC_013894	CAGGT	2	10	35055	35064	20 %	20 %	40 %	20 %	289547813
29	NC_013894	CCAAC	2	10	35761	35770	40 %	0 %	0 %	60 %	289547813
30	NC_013894	CCTCC	2	10	36872	36881	0 %	20 %	0 %	80 %	289547815
31	NC_013894	GTATT	2	10	37419	37428	20 %	60 %	20 %	0 %	289547816
32	NC_013894	TTGAG	2	10	38765	38774	20 %	40 %	40 %	0 %	289547818
33	NC_013894	CCTCC	2	10	42974	42983	0 %	20 %	0 %	80 %	289547824
34	NC_013894	ACCTT	2	10	44426	44435	20 %	40 %	0 %	40 %	289547825
35	NC_013894	ACACC	2	10	47987	47996	40 %	0 %	0 %	60 %	289547827
36	NC_013894	AGCCT	2	10	48067	48076	20 %	20 %	20 %	40 %	289547827
37	NC_013894	TGAGA	2	10	50415	50424	40 %	20 %	40 %	0 %	289547829
38	NC_013894	CCCAT	2	10	54014	54023	20 %	20 %	0 %	60 %	289547832
39	NC_013894	TTAAT	2	10	54178	54187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013894	GAGAA	2	10	54466	54475	60 %	0 %	40 %	0 %	289547833
41	NC_013894	AGAGA	2	10	54946	54955	60 %	0 %	40 %	0 %	289547833
42	NC_013894	ACCTT	2	10	57740	57749	20 %	40 %	0 %	40 %	289547837
43	NC_013894	AGGAA	2	10	61780	61789	60 %	0 %	40 %	0 %	289547841
44	NC_013894	ACACC	2	10	61812	61821	40 %	0 %	0 %	60 %	289547841
45	NC_013894	GGTTC	2	10	63056	63065	0 %	40 %	40 %	20 %	289547842
46	NC_013894	GTCAT	2	10	63646	63655	20 %	40 %	20 %	20 %	289547842
47	NC_013894	ACCTT	2	10	63933	63942	20 %	40 %	0 %	40 %	289547842
48	NC_013894	ACAGA	2	10	64340	64349	60 %	0 %	20 %	20 %	289547843
49	NC_013894	CTCCC	2	10	64917	64926	0 %	20 %	0 %	80 %	289547843
50	NC_013894	CCATC	2	10	65294	65303	20 %	20 %	0 %	60 %	289547844
51	NC_013894	CCCTT	2	10	66250	66259	0 %	40 %	0 %	60 %	289547844
52	NC_013894	CGGGG	2	10	67523	67532	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013894	AAGGC	2	10	67847	67856	40 %	0 %	40 %	20 %	289547846
54	NC_013894	CTTCC	2	10	69225	69234	0 %	40 %	0 %	60 %	289547848
55	NC_013894	CAGAA	2	10	69540	69549	60 %	0 %	20 %	20 %	289547848
56	NC_013894	TATCC	2	10	70223	70232	20 %	40 %	0 %	40 %	289547849
57	NC_013894	TGGAG	2	10	79990	79999	20 %	20 %	60 %	0 %	289547858
58	NC_013894	CTTAT	2	10	81463	81472	20 %	60 %	0 %	20 %	289547860
59	NC_013894	TCCTC	2	10	82197	82206	0 %	40 %	0 %	60 %	289547862
60	NC_013894	CATCC	2	10	82495	82504	20 %	20 %	0 %	60 %	289547862
61	NC_013894	GTACA	2	10	84135	84144	40 %	20 %	20 %	20 %	289547864
62	NC_013894	CCTCT	2	10	84486	84495	0 %	40 %	0 %	60 %	289547865
63	NC_013894	GGGTT	2	10	88897	88906	0 %	40 %	60 %	0 %	289547868
64	NC_013894	TAACA	2	10	90008	90017	60 %	20 %	0 %	20 %	289547869
65	NC_013894	AGGAT	2	10	90816	90825	40 %	20 %	40 %	0 %	289547871
66	NC_013894	CACCG	2	10	91661	91670	20 %	0 %	20 %	60 %	289547873
67	NC_013894	GGTAA	2	10	94714	94723	40 %	20 %	40 %	0 %	289547876
68	NC_013894	CCATC	2	10	94744	94753	20 %	20 %	0 %	60 %	289547876
69	NC_013894	ACCTT	2	10	99921	99930	20 %	40 %	0 %	40 %	289547881
70	NC_013894	ACGCC	2	10	101592	101601	20 %	0 %	20 %	60 %	289547883
71	NC_013894	TCCCC	2	10	101913	101922	0 %	20 %	0 %	80 %	289547883
72	NC_013894	ATGGG	2	10	102409	102418	20 %	20 %	60 %	0 %	289547884
73	NC_013894	AGGGA	2	10	104597	104606	40 %	0 %	60 %	0 %	289547886
74	NC_013894	GAAAG	2	10	112572	112581	60 %	0 %	40 %	0 %	289547895
75	NC_013894	CCTAA	2	10	112856	112865	40 %	20 %	0 %	40 %	289547895
76	NC_013894	ACTCT	2	10	113339	113348	20 %	40 %	0 %	40 %	289547896
77	NC_013894	ACACC	2	10	113363	113372	40 %	0 %	0 %	60 %	289547896
78	NC_013894	GGTGC	2	10	120042	120051	0 %	20 %	60 %	20 %	289547901
79	NC_013894	GAAGA	2	10	122546	122555	60 %	0 %	40 %	0 %	289547904
80	NC_013894	TCTTT	2	10	125271	125280	0 %	80 %	0 %	20 %	289547908
81	NC_013894	TTTTG	2	10	128037	128046	0 %	80 %	20 %	0 %	289547911
82	NC_013894	ATCAA	2	10	128192	128201	60 %	20 %	0 %	20 %	289547911
83	NC_013894	AGAAA	2	10	129143	129152	80 %	0 %	20 %	0 %	289547912
84	NC_013894	CCTTT	2	10	130742	130751	0 %	60 %	0 %	40 %	289547914
85	NC_013894	GAAGA	2	10	131108	131117	60 %	0 %	40 %	0 %	289547914
86	NC_013894	GGGCT	2	10	134097	134106	0 %	20 %	60 %	20 %	289547917
87	NC_013894	AGGGT	2	10	136061	136070	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013894	TTTCT	2	10	136728	136737	0 %	80 %	0 %	20 %	289547923
89	NC_013894	AAGAT	2	10	136941	136950	60 %	20 %	20 %	0 %	289547923
90	NC_013894	CTCTT	2	10	139976	139985	0 %	60 %	0 %	40 %	289547927
91	NC_013894	CTTTT	2	10	140603	140612	0 %	80 %	0 %	20 %	289547927
92	NC_013894	TTATC	2	10	140937	140946	20 %	60 %	0 %	20 %	289547927
93	NC_013894	CTGAG	2	10	143330	143339	20 %	20 %	40 %	20 %	289547929
94	NC_013894	ATACG	2	10	145321	145330	40 %	20 %	20 %	20 %	289547932
95	NC_013894	AAGGT	2	10	146229	146238	40 %	20 %	40 %	0 %	289547932
96	NC_013894	TCCTC	2	10	147097	147106	0 %	40 %	0 %	60 %	289547933
97	NC_013894	CGGGG	2	10	148611	148620	0 %	0 %	80 %	20 %	289547934
98	NC_013894	ATAGG	2	10	152318	152327	40 %	20 %	40 %	0 %	289547938
99	NC_013894	GGTGA	2	10	153400	153409	20 %	20 %	60 %	0 %	289547938
100	NC_013894	TGGAC	2	10	154750	154759	20 %	20 %	40 %	20 %	289547940
101	NC_013894	ACACC	2	10	155088	155097	40 %	0 %	0 %	60 %	289547940
102	NC_013894	TGGGA	2	10	155444	155453	20 %	20 %	60 %	0 %	289547941
103	NC_013894	TAGTC	2	10	156107	156116	20 %	40 %	20 %	20 %	289547942
104	NC_013894	CACAG	2	10	158407	158416	40 %	0 %	20 %	40 %	289547944
105	NC_013894	TCAAC	2	10	159240	159249	40 %	20 %	0 %	40 %	289547945
106	NC_013894	TCACC	2	10	160856	160865	20 %	20 %	0 %	60 %	289547946
107	NC_013894	GGAGG	2	10	160889	160898	20 %	0 %	80 %	0 %	289547946
108	NC_013894	GGATG	2	10	161251	161260	20 %	20 %	60 %	0 %	289547946
109	NC_013894	ACCAG	2	10	161503	161512	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_013894	CCAAA	2	10	167421	167430	60 %	0 %	0 %	40 %	289547955
111	NC_013894	TGTAC	2	10	168361	168370	20 %	40 %	20 %	20 %	289547956
112	NC_013894	ATCAG	2	10	169475	169484	40 %	20 %	20 %	20 %	289547957
113	NC_013894	TAAAG	2	10	171743	171752	60 %	20 %	20 %	0 %	289547960
114	NC_013894	AAGGA	2	10	172564	172573	60 %	0 %	40 %	0 %	289547960
115	NC_013894	AGAGG	2	10	182394	182403	40 %	0 %	60 %	0 %	289547969
116	NC_013894	CTTTA	2	10	185341	185350	20 %	60 %	0 %	20 %	289547971
117	NC_013894	CCTCT	2	10	188041	188050	0 %	40 %	0 %	60 %	289547974
118	NC_013894	CTAAG	2	10	189514	189523	40 %	20 %	20 %	20 %	289547975
119	NC_013894	CCCTA	2	10	192983	192992	20 %	20 %	0 %	60 %	289547978
120	NC_013894	ATGTT	2	10	199408	199417	20 %	60 %	20 %	0 %	289547986
121	NC_013894	AGGAG	2	10	204107	204116	40 %	0 %	60 %	0 %	289547990
122	NC_013894	CTGTC	2	10	204680	204689	0 %	40 %	20 %	40 %	289547990
123	NC_013894	CGTGA	2	10	208259	208268	20 %	20 %	40 %	20 %	289547991
124	NC_013894	ACCTG	2	10	208458	208467	20 %	20 %	20 %	40 %	289547992
125	NC_013894	TCTCC	2	10	209056	209065	0 %	40 %	0 %	60 %	289547992
126	NC_013894	CTTCC	2	10	210372	210381	0 %	40 %	0 %	60 %	289547993
127	NC_013894	ACCAC	2	10	212734	212743	40 %	0 %	0 %	60 %	289547994
128	NC_013894	CCCTC	2	10	214079	214088	0 %	20 %	0 %	80 %	289547996
129	NC_013894	CCCTT	2	10	214672	214681	0 %	40 %	0 %	60 %	289547997
130	NC_013894	AGCTT	2	10	215478	215487	20 %	40 %	20 %	20 %	289547998
131	NC_013894	AGGGA	2	10	216936	216945	40 %	0 %	60 %	0 %	289547999
132	NC_013894	CATAT	2	10	219039	219048	40 %	40 %	0 %	20 %	289548000
133	NC_013894	TTTGG	2	10	219447	219456	0 %	60 %	40 %	0 %	289548000
134	NC_013894	ACCAC	2	10	220862	220871	40 %	0 %	0 %	60 %	289548001
135	NC_013894	TTACT	2	10	222256	222265	20 %	60 %	0 %	20 %	289548002
136	NC_013894	GAGAG	2	10	222633	222642	40 %	0 %	60 %	0 %	289548003
137	NC_013894	TACCG	2	10	224590	224599	20 %	20 %	20 %	40 %	289548003
138	NC_013894	TAACA	2	10	226894	226903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013894	TACTT	2	10	230447	230456	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013894	AGAAC	2	10	233481	233490	60 %	0 %	20 %	20 %	289548014
141	NC_013894	GGAGT	2	10	234251	234260	20 %	20 %	60 %	0 %	289548014
142	NC_013894	CCTTT	2	10	234307	234316	0 %	60 %	0 %	40 %	289548014
143	NC_013894	ATGTT	2	10	236328	236337	20 %	60 %	20 %	0 %	289548015
144	NC_013894	GTGTG	2	10	236713	236722	0 %	40 %	60 %	0 %	289548015
145	NC_013894	GAGGT	2	10	236774	236783	20 %	20 %	60 %	0 %	289548015
146	NC_013894	CATAC	2	10	242208	242217	40 %	20 %	0 %	40 %	289548021
147	NC_013894	GATAG	2	10	242531	242540	40 %	20 %	40 %	0 %	289548022
148	NC_013894	TTCTA	2	10	243506	243515	20 %	60 %	0 %	20 %	289548022
149	NC_013894	CCTTT	2	10	245547	245556	0 %	60 %	0 %	40 %	289548023
150	NC_013894	CAGGA	2	10	248014	248023	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_013894	AGGAT	2	10	248132	248141	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013894	AGGAT	2	10	248672	248681	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013894	CGTGC	2	10	249215	249224	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_013894	ACCGT	2	10	250271	250280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_013894	CCATC	2	10	253808	253817	20 %	20 %	0 %	60 %	289548028
156	NC_013894	AAAGT	2	10	254468	254477	60 %	20 %	20 %	0 %	289548028
157	NC_013894	AGGAA	2	10	255025	255034	60 %	0 %	40 %	0 %	289548028
158	NC_013894	ACCAC	2	10	256341	256350	40 %	0 %	0 %	60 %	289548029
159	NC_013894	TACCG	2	10	257652	257661	20 %	20 %	20 %	40 %	289548030
160	NC_013894	CCTCC	2	10	258149	258158	0 %	20 %	0 %	80 %	289548031
161	NC_013894	CTGAG	2	10	258336	258345	20 %	20 %	40 %	20 %	289548031
162	NC_013894	AAGTT	2	10	258382	258391	40 %	40 %	20 %	0 %	289548031
163	NC_013894	TAAGA	2	10	260221	260230	60 %	20 %	20 %	0 %	289548033
164	NC_013894	GAACT	2	10	270039	270048	40 %	20 %	20 %	20 %	289548045
165	NC_013894	CGAAG	2	10	275919	275928	40 %	0 %	40 %	20 %	289548049
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167	NC_013894	TCCTC	2	10	276849	276858	0 %	40 %	0 %	60 %	289548050
168	NC_013894	ACCCT	2	10	276930	276939	20 %	20 %	0 %	60 %	289548050
169	NC_013894	CCATC	2	10	277729	277738	20 %	20 %	0 %	60 %	289548051
170	NC_013894	GAAGA	2	10	279380	279389	60 %	0 %	40 %	0 %	289548053
171	NC_013894	TTCCC	2	10	280729	280738	0 %	40 %	0 %	60 %	289548053
172	NC_013894	AGGAG	2	10	281961	281970	40 %	0 %	60 %	0 %	289548054
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174	NC_013894	AAAGT	2	10	285537	285546	60 %	20 %	20 %	0 %	289548058
175	NC_013894	TGTGT	2	10	288760	288769	0 %	60 %	40 %	0 %	289548062
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177	NC_013894	CTTCA	2	10	291559	291568	20 %	40 %	0 %	40 %	289548064
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182	NC_013894	TGCTT	2	10	297839	297848	0 %	60 %	20 %	20 %	289548072
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185	NC_013894	TTTAT	2	10	304335	304344	20 %	80 %	0 %	0 %	289548078
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189	NC_013894	TCACA	2	10	312009	312018	40 %	20 %	0 %	40 %	289548084
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191	NC_013894	GTAAG	2	10	313992	314001	40 %	20 %	40 %	0 %	289548087
192	NC_013894	GGACT	2	10	314556	314565	20 %	20 %	40 %	20 %	289548088
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194	NC_013894	CTCAC	2	10	318034	318043	20 %	20 %	0 %	60 %	289548089
195	NC_013894	ACTTT	2	10	322899	322908	20 %	60 %	0 %	20 %	289548095
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197	NC_013894	ACTTC	2	10	326797	326806	20 %	40 %	0 %	40 %	289548100
198	NC_013894	TCTCT	2	10	327455	327464	0 %	60 %	0 %	40 %	289548100
199	NC_013894	GTAAC	2	10	327633	327642	40 %	20 %	20 %	20 %	289548100
200	NC_013894	TGGTG	2	10	329292	329301	0 %	40 %	60 %	0 %	289548101
201	NC_013894	TATGA	2	10	330760	330769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
202	NC_013894	GACAG	2	10	331116	331125	40 %	0 %	40 %	20 %	289548104
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210	NC_013894	GTGAC	2	10	344804	344813	20 %	20 %	40 %	20 %	289548118
211	NC_013894	TAAGG	2	10	345106	345115	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
212	NC_013894	GAAGG	2	10	346244	346253	40 %	0 %	60 %	0 %	289548120
213	NC_013894	AGGGA	2	10	346559	346568	40 %	0 %	60 %	0 %	289548120
214	NC_013894	CTTTT	2	10	346661	346670	0 %	80 %	0 %	20 %	289548120
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216	NC_013894	CCTGT	2	10	351502	351511	0 %	40 %	20 %	40 %	289548125
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222	NC_013894	AGGAG	2	10	358853	358862	40 %	0 %	60 %	0 %	289548135
223	NC_013894	CCTCT	2	10	360534	360543	0 %	40 %	0 %	60 %	289548137
224	NC_013894	CTTTC	2	10	362624	362633	0 %	60 %	0 %	40 %	289548140
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230	NC_013894	TCATA	2	10	373648	373657	40 %	40 %	0 %	20 %	289548153
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234	NC_013894	TGGGT	2	10	382476	382485	0 %	40 %	60 %	0 %	289548162
235	NC_013894	TTCTC	2	10	383729	383738	0 %	60 %	0 %	40 %	289548163
236	NC_013894	GTTCT	2	10	384545	384554	0 %	60 %	20 %	20 %	289548164
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240	NC_013894	TTATA	2	10	386596	386605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_013894	CTCTT	2	10	387747	387756	0 %	60 %	0 %	40 %	289548167
242	NC_013894	CACCG	2	10	388516	388525	20 %	0 %	20 %	60 %	289548168
243	NC_013894	AATGA	2	10	391412	391421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
244	NC_013894	TCTCT	2	10	392638	392647	0 %	60 %	0 %	40 %	289548170
245	NC_013894	CTCTT	2	10	393483	393492	0 %	60 %	0 %	40 %	289548170
246	NC_013894	CTGTT	2	10	393703	393712	0 %	60 %	20 %	20 %	289548170
247	NC_013894	CTACT	2	10	394428	394437	20 %	40 %	0 %	40 %	289548171
248	NC_013894	CTCAG	2	10	394578	394587	20 %	20 %	20 %	40 %	289548171
249	NC_013894	TAGTG	2	10	394885	394894	20 %	40 %	40 %	0 %	289548171
250	NC_013894	CCTTT	2	10	397188	397197	0 %	60 %	0 %	40 %	289548175
251	NC_013894	TTCAC	2	10	397954	397963	20 %	40 %	0 %	40 %	289548177
252	NC_013894	TTGAG	2	10	399629	399638	20 %	40 %	40 %	0 %	289548178
253	NC_013894	GGCCT	2	10	400339	400348	0 %	20 %	40 %	40 %	289548179
254	NC_013894	AAGTG	2	10	400733	400742	40 %	20 %	40 %	0 %	289548179
255	NC_013894	CTTCT	2	10	404794	404803	0 %	60 %	0 %	40 %	289548183
256	NC_013894	CGGCC	2	10	405023	405032	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
257	NC_013894	AAAAG	2	10	406556	406565	80 %	0 %	20 %	0 %	289548187
258	NC_013894	TAAGT	2	10	407099	407108	40 %	40 %	20 %	0 %	289548187
259	NC_013894	GCAAG	2	10	407185	407194	40 %	0 %	40 %	20 %	289548187
260	NC_013894	CTCTT	2	10	410772	410781	0 %	60 %	0 %	40 %	289548194
261	NC_013894	GGATC	2	10	412798	412807	20 %	20 %	40 %	20 %	289548196
262	NC_013894	GAAAG	2	10	414166	414175	60 %	0 %	40 %	0 %	289548197
263	NC_013894	AAAAG	2	10	414888	414897	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_013894	ATCAA	2	10	415920	415929	60 %	20 %	0 %	20 %	289548199
265	NC_013894	GAACT	2	10	417405	417414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_013894	CCAAA	2	10	420573	420582	60 %	0 %	0 %	40 %	289548202
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