MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013894	ATCTT	2	10	108	117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013894	ATATT	2	10	372	381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013894	TTAAT	2	10	54178	54187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013894	CGGGG	2	10	67523	67532	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013894	AGGGT	2	10	136061	136070	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013894	ACCAG	2	10	161503	161512	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013894	TAACA	2	10	226894	226903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013894	TACTT	2	10	230447	230456	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013894	CAGGA	2	10	248014	248023	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013894	AGGAT	2	10	248132	248141	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013894	AGGAT	2	10	248672	248681	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013894	CGTGC	2	10	249215	249224	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013894	ACCGT	2	10	250271	250280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013894	TATGA	2	10	330760	330769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013894	TAAGG	2	10	345106	345115	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013894	TTATA	2	10	386596	386605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013894	AATGA	2	10	391412	391421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013894	CGGCC	2	10	405023	405032	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_013894	AAAAG	2	10	414888	414897	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013894	GAACT	2	10	417405	417414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013894	TAAAA	2	10	432006	432015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013894	TAATA	2	10	444249	444258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013894	TCAGG	2	10	472393	472402	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013894	TACAG	2	10	491367	491376	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013894	AAAGG	2	10	600829	600838	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013894	AATAT	2	10	605820	605829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013894	TAAAA	2	10	683064	683073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013894	TAGAG	2	10	683079	683088	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013894	CTCAC	2	10	718099	718108	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_013894	CATAC	2	10	780318	780327	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013894	ATATA	2	10	790458	790467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013894	CCTCT	2	10	807466	807475	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_013894	ATTAA	2	10	813134	813143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013894	TAACC	2	10	826881	826890	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013894	GAAGA	2	10	850601	850610	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013894	TTTCC	2	10	855142	855151	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_013894	CTGAC	2	10	855998	856007	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_013894	CACGA	2	10	856121	856130	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013894	TTATA	2	10	871250	871259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013894	TATAA	2	10	1064370	1064379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013894	TTATA	2	10	1081404	1081413	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013894	GTATA	2	10	1111530	1111539	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013894	TCATA	2	10	1121664	1121673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013894	CAAGG	2	10	1178273	1178282	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013894	GTTTT	2	10	1178314	1178323	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013894	ATTAA	2	10	1180084	1180093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013894	TATAA	2	10	1193631	1193640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013894	ATTAT	2	10	1194771	1194780	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013894	TATTT	2	10	1228240	1228249	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013894	GAGAG	2	10	1228513	1228522	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013894	ACTTC	2	10	1240165	1240174	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013894	AGGTA	2	10	1300555	1300564	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013894	ATTAA	2	10	1320245	1320254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013894	AGGGA	2	10	1347281	1347290	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013894	ATATT	2	10	1352260	1352269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013894	GAGGG	2	10	1363630	1363639	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013894	TCTTA	2	10	1464006	1464015	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013894	TTTTA	2	10	1471526	1471535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013894	AATAT	2	10	1479875	1479884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013894	AAGTC	2	10	1489233	1489242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013894	AACGC	2	10	1497914	1497923	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_013894	AAACA	2	10	1498780	1498789	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013894	ACCGC	2	10	1500142	1500151	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.