MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013894	AG	3	6	135	140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013894	CT	3	6	212	217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013894	CT	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013894	AT	3	6	16429	16434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013894	AT	3	6	16450	16455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013894	AC	3	6	19765	19770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013894	TA	3	6	54223	54228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013894	TA	3	6	67533	67538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013894	GT	4	8	77748	77755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013894	AG	4	8	78113	78120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013894	CT	3	6	78121	78126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013894	TC	3	6	78197	78202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013894	AC	3	6	78796	78801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013894	GA	3	6	78802	78807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013894	GA	3	6	78991	78996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013894	TA	3	6	106940	106945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013894	AG	3	6	116541	116546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013894	TA	3	6	135239	135244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013894	AT	3	6	147380	147385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013894	TC	3	6	157035	157040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013894	AT	3	6	157056	157061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013894	GT	3	6	161516	161521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013894	AG	3	6	177385	177390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013894	AG	3	6	177539	177544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013894	AG	3	6	177801	177806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013894	GA	3	6	178009	178014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013894	GT	3	6	178894	178899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013894	AG	3	6	180180	180185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013894	CT	3	6	180257	180262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013894	CT	3	6	180270	180275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013894	AG	3	6	182621	182626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013894	TC	3	6	205128	205133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013894	AC	4	8	205162	205169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013894	AT	3	6	205397	205402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013894	GA	3	6	205537	205542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013894	GA	3	6	205867	205872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013894	GA	3	6	246401	246406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013894	AG	3	6	246415	246420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013894	CT	3	6	246492	246497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013894	GT	3	6	246731	246736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013894	GA	3	6	247456	247461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013894	GA	3	6	248008	248013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013894	AG	3	6	248255	248260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013894	CT	4	8	248415	248422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013894	AT	3	6	258468	258473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013894	TA	3	6	274747	274752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013894	TA	3	6	274760	274765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013894	CT	3	6	320306	320311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013894	AT	3	6	323130	323135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013894	AT	3	6	344551	344556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013894	AC	3	6	345196	345201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013894	AT	3	6	350435	350440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013894	AT	3	6	350442	350447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013894	AC	3	6	357700	357705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013894	TA	3	6	373521	373526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013894	GA	3	6	389486	389491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013894	AG	3	6	389500	389505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013894	CT	3	6	389577	389582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013894	TG	3	6	390810	390815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013894	GA	3	6	391077	391082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013894	GA	3	6	392510	392515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013894	TA	3	6	396629	396634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013894	GC	3	6	417466	417471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013894	TC	3	6	417508	417513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013894	TG	3	6	417528	417533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013894	TC	3	6	418092	418097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013894	AT	3	6	418172	418177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013894	AG	3	6	418237	418242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013894	CT	3	6	418333	418338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013894	GA	3	6	418369	418374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013894	GA	3	6	418686	418691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013894	CG	3	6	439268	439273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013894	AT	3	6	457891	457896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013894	AG	3	6	467170	467175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013894	TC	3	6	481101	481106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013894	GC	3	6	481110	481115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013894	AC	3	6	487606	487611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013894	TC	3	6	542196	542201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013894	CG	3	6	556110	556115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013894	TA	3	6	570146	570151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013894	AC	3	6	578244	578249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013894	CT	3	6	607186	607191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013894	CT	3	6	612205	612210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013894	TG	3	6	634181	634186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013894	GC	3	6	667926	667931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013894	AG	3	6	678780	678785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013894	AT	6	12	679111	679122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013894	TC	3	6	679132	679137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013894	AT	3	6	683310	683315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013894	AG	3	6	683334	683339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013894	TA	3	6	691749	691754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013894	TA	3	6	691761	691766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013894	AT	3	6	691767	691772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013894	AT	3	6	718162	718167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013894	GT	3	6	740073	740078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013894	GC	3	6	755989	755994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013894	AT	3	6	766498	766503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013894	TA	3	6	780405	780410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013894	TA	3	6	787625	787630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013894	TA	3	6	802981	802986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013894	AT	3	6	815584	815589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013894	TC	3	6	817740	817745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013894	TC	4	8	826771	826778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013894	GT	3	6	826963	826968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013894	AG	3	6	827234	827239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013894	AT	3	6	841398	841403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013894	TA	3	6	850646	850651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013894	AG	3	6	850656	850661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013894	GT	3	6	855800	855805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013894	TA	4	8	857392	857399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013894	GA	3	6	857411	857416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013894	AT	3	6	901135	901140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013894	AT	3	6	901151	901156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013894	AT	3	6	918119	918124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013894	AT	3	6	918630	918635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013894	AT	3	6	922443	922448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013894	AC	3	6	944541	944546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013894	AT	3	6	944555	944560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013894	TC	3	6	948517	948522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013894	GA	3	6	988370	988375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013894	AG	3	6	1017883	1017888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013894	TA	3	6	1017924	1017929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013894	AT	3	6	1026281	1026286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013894	GA	3	6	1029623	1029628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013894	TA	3	6	1058981	1058986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013894	AT	3	6	1066398	1066403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013894	AT	3	6	1074021	1074026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013894	AT	3	6	1074397	1074402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013894	GA	3	6	1108108	1108113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013894	AT	3	6	1108843	1108848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013894	GT	3	6	1116356	1116361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013894	GC	3	6	1121683	1121688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013894	AT	3	6	1138050	1138055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013894	CT	3	6	1166727	1166732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013894	TA	3	6	1178338	1178343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013894	TA	3	6	1183284	1183289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013894	GA	4	8	1194406	1194413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013894	CT	3	6	1194900	1194905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013894	AT	3	6	1194979	1194984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013894	AG	3	6	1195040	1195045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013894	GT	3	6	1195341	1195346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013894	AT	3	6	1200083	1200088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013894	AC	4	8	1241387	1241394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013894	AC	3	6	1241418	1241423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013894	AC	3	6	1247135	1247140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013894	GT	3	6	1256243	1256248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013894	GT	3	6	1257115	1257120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013894	TA	4	8	1261264	1261271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013894	CA	3	6	1261758	1261763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013894	TC	3	6	1262374	1262379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013894	TA	3	6	1262718	1262723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013894	TA	3	6	1284583	1284588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.