MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 chromosome

Total Repeats: 1185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013893	AATTAT	2	12	4016	4027	50 %	50 %	0 %	0 %	289549377
2	NC_013893	GATGTA	2	12	6620	6631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549380
3	NC_013893	TGCAAC	2	12	6777	6788	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013893	CAAAGG	2	12	7300	7311	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289549381
5	NC_013893	AGAATC	2	12	11956	11967	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289549387
6	NC_013893	AAATGA	2	12	12891	12902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289549389
7	NC_013893	TGAAAT	2	12	13074	13085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289549389
8	NC_013893	ATGACG	2	12	14061	14072	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289549390
9	NC_013893	CTAAAG	2	12	14460	14471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289549390
10	NC_013893	ATTTTT	2	12	17182	17193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	289549393
11	NC_013893	TGAAAA	2	12	20720	20731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289549397
12	NC_013893	TAAATC	2	12	21102	21113	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289549397
13	NC_013893	TAAAAC	2	12	22919	22930	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	289549399
14	NC_013893	CAAAAA	2	12	24236	24247	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	289549400
15	NC_013893	ATTATG	2	12	27833	27844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289549404
16	NC_013893	GGCGAT	2	12	40732	40743	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289549412
17	NC_013893	CTTTTT	2	12	46053	46064	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289549419
18	NC_013893	TAAAAA	2	12	54722	54733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289549428
19	NC_013893	TAAAAA	2	12	56007	56018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289549428
20	NC_013893	TATTTT	2	12	57397	57408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013893	ACGAAT	2	12	57931	57942	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289549429
22	NC_013893	TCATCT	2	12	58984	58995	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	289549429
23	NC_013893	GTTGTA	2	12	64007	64018	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289549432
24	NC_013893	TGTTGC	2	12	67741	67752	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289549436
25	NC_013893	CAACAC	2	12	71811	71822	50 %	0 %	0 %	50 %	289549438
26	NC_013893	AATTTT	2	12	72037	72048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549438
27	NC_013893	AGAGGA	2	12	73008	73019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013893	CATTTA	2	12	74824	74835	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289549442
29	NC_013893	ATAAAA	2	12	75995	76006	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289549444
30	NC_013893	TAAACC	2	12	78045	78056	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289549445
31	NC_013893	ATAAGT	2	12	79113	79124	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289549446
32	NC_013893	TGTAGG	2	12	83373	83384	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289549452
33	NC_013893	CACCTT	2	12	83816	83827	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	289549452
34	NC_013893	CAACGT	2	12	85131	85142	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289549453
35	NC_013893	AGATGA	2	12	86919	86930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289549455
36	NC_013893	TCATGA	2	12	90152	90163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289549457
37	NC_013893	TAGCTG	2	12	90869	90880	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289549458
38	NC_013893	TCATCT	2	12	91420	91431	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	289549458
39	NC_013893	GTTGTA	2	12	96443	96454	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289549461
40	NC_013893	TGTTGC	2	12	100177	100188	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289549465
41	NC_013893	CAACAC	2	12	104247	104258	50 %	0 %	0 %	50 %	289549467
42	NC_013893	AATTTT	2	12	104473	104484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549467
43	NC_013893	AGAGGA	2	12	105444	105455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013893	CATTTA	2	12	107260	107271	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289549471
45	NC_013893	ATAAAA	2	12	108431	108442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289549473
46	NC_013893	TAAACC	2	12	110481	110492	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289549474
47	NC_013893	ATAAGT	2	12	111549	111560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289549475
48	NC_013893	TGTAGG	2	12	115809	115820	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289549481
49	NC_013893	CACCTT	2	12	116252	116263	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	289549481
50	NC_013893	CAACGT	2	12	117567	117578	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289549482
51	NC_013893	AGATGA	2	12	119355	119366	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289549484
52	NC_013893	TCATGA	2	12	122588	122599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289549486
53	NC_013893	TAGCTG	2	12	123305	123316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289549487
54	NC_013893	TTCAAA	2	12	127470	127481	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289549491
55	NC_013893	TGTCAT	2	12	127966	127977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289549492
56	NC_013893	CAGAAG	2	12	131327	131338	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289549497
57	NC_013893	ATTTCT	2	12	132145	132156	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289549498
58	NC_013893	ATAAAA	2	12	134244	134255	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289549500
59	NC_013893	TAAAGC	2	12	134461	134472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289549500
60	NC_013893	TCATGG	2	12	136507	136518	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289549502
61	NC_013893	AGAAGC	2	12	144843	144854	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289549510
62	NC_013893	TAATCC	2	12	149656	149667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549513
63	NC_013893	TAATCA	2	12	154209	154220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289549516
64	NC_013893	AATGTT	2	12	154320	154331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013893	CCTTTA	2	12	154799	154810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	289549517
66	NC_013893	TTTATT	2	12	155481	155492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	289549517
67	NC_013893	TTAGGC	2	12	159845	159856	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289549521
68	NC_013893	TCGACA	2	12	160927	160938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289549523
69	NC_013893	AGTGGC	2	12	161006	161017	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289549523
70	NC_013893	TTTATA	2	12	167070	167081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549528
71	NC_013893	ATGTTT	2	12	170382	170393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013893	TGTTGG	2	12	176503	176514	0 %	50 %	50 %	0 %	289549537
73	NC_013893	CAGTAT	2	12	179199	179210	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289549539
74	NC_013893	ATGAAC	2	12	181642	181653	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289549540
75	NC_013893	TTTCAC	2	12	182342	182353	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013893	GGACGT	2	12	183990	184001	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289549542
77	NC_013893	TGATAA	2	12	186155	186166	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289549543
78	NC_013893	TTAGCA	2	12	187718	187729	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289549545
79	NC_013893	TATGGG	2	12	187903	187914	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289549545
80	NC_013893	TTTATT	2	12	189290	189301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	289549547
81	NC_013893	AAAATA	2	12	191111	191122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013893	GCAATG	2	12	192762	192773	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289549552
83	NC_013893	AGCCAT	2	12	194353	194364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289549553
84	NC_013893	ATCCAT	2	12	194598	194609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549553
85	NC_013893	GAATAA	2	12	194704	194715	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289549553
86	NC_013893	AAATGA	2	12	195246	195257	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289549553
87	NC_013893	ATAAAA	2	12	195403	195414	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013893	CATTCG	2	12	196195	196206	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289549555
89	NC_013893	TTCATA	2	12	197277	197288	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289549556
90	NC_013893	GGTGTA	2	12	197291	197302	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289549556
91	NC_013893	TGATAA	2	12	200601	200612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289549559
92	NC_013893	CAGGTG	2	12	201500	201511	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289549559
93	NC_013893	TAAAAT	2	12	203986	203997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549562
94	NC_013893	CTTTAG	2	12	204376	204387	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289549563
95	NC_013893	TTTTTG	2	12	208206	208217	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	289549567
96	NC_013893	TTATCT	2	12	208528	208539	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289549567
97	NC_013893	TTCTTT	2	12	208608	208619	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289549567
98	NC_013893	CTGATT	2	12	209978	209989	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289549568
99	NC_013893	AGTGGT	2	12	214559	214570	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013893	GTTTAG	2	12	214797	214808	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289549573
101	NC_013893	CACCAA	2	12	217400	217411	50 %	0 %	0 %	50 %	289549575
102	NC_013893	GTTTTT	2	12	220669	220680	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	289549579
103	NC_013893	ATTTTC	2	12	227073	227084	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289549586
104	NC_013893	TAAAAA	2	12	227635	227646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013893	CGTTGT	2	12	236611	236622	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289549594
106	NC_013893	TTAAAT	2	12	242210	242221	50 %	50 %	0 %	0 %	289549597
107	NC_013893	TTACAG	2	12	245594	245605	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289549600
108	NC_013893	AAGTGA	2	12	246305	246316	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289549600
109	NC_013893	GGTGCA	2	12	248048	248059	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289549602
110	NC_013893	ATGACA	2	12	248731	248742	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289549603
111	NC_013893	TAACTG	2	12	249470	249481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289549603
112	NC_013893	ATTTTT	2	12	256320	256331	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	289549609
113	NC_013893	TATGAT	2	12	258033	258044	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289549610
114	NC_013893	TTTTTG	2	12	260268	260279	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013893	TCTGAT	2	12	261394	261405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289549615
116	NC_013893	TAATGT	2	12	261599	261610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289549615
117	NC_013893	ACAGTT	2	12	261615	261626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289549615
118	NC_013893	TGATAT	2	12	261870	261881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289549615
119	NC_013893	ATTAAT	2	12	262255	262266	50 %	50 %	0 %	0 %	289549616
120	NC_013893	ATGAAA	2	12	262310	262321	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289549616
121	NC_013893	TGGTTC	2	12	266319	266330	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289549618
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123	NC_013893	CAATTT	2	12	271227	271238	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289549625
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127	NC_013893	AATTTA	2	12	282120	282131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013893	CAAGAA	2	12	282270	282281	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289549638
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235	NC_013893	CAATCA	2	12	522498	522509	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289549844
236	NC_013893	CAATCA	2	12	522636	522647	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289549844
237	NC_013893	CAATCA	2	12	523005	523016	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289549844
238	NC_013893	CAATTA	2	12	523356	523367	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289549844
239	NC_013893	CAATTA	2	12	523587	523598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289549844
240	NC_013893	CAATTA	2	12	524547	524558	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289549844
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242	NC_013893	CAGTAA	2	12	525693	525704	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289549844
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349	NC_013893	TCATTT	2	12	772310	772321	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289550077
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351	NC_013893	TTTGAT	2	12	775296	775307	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289550080
352	NC_013893	TTGGTA	2	12	777604	777615	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289550083
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468	NC_013893	AGTGAT	2	12	1036740	1036751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289550331
469	NC_013893	TGTAGG	2	12	1036769	1036780	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289550331
470	NC_013893	TTTAAA	2	12	1037193	1037204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_013893	TCCATT	2	12	1038701	1038712	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	289550333
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