MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 chromosome

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013893	TGCAAC	2	12	6777	6788	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013893	TATTTT	2	12	57397	57408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013893	AGAGGA	2	12	73008	73019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013893	AGAGGA	2	12	105444	105455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013893	AATGTT	2	12	154320	154331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013893	ATGTTT	2	12	170382	170393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013893	TTTCAC	2	12	182342	182353	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013893	AAAATA	2	12	191111	191122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013893	ATAAAA	2	12	195403	195414	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013893	AGTGGT	2	12	214559	214570	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013893	TAAAAA	2	12	227635	227646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013893	TTTTTG	2	12	260268	260279	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013893	AATTTA	2	12	282120	282131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013893	TGTTAA	2	12	287267	287278	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013893	TGTATT	2	12	290904	290915	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013893	AATAAA	2	12	292430	292441	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013893	CTTGTG	2	12	293507	293518	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013893	TATGGA	2	12	311913	311924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013893	TTTGTT	2	12	320501	320512	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013893	ATTTGA	2	12	329250	329261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013893	ATATTA	2	12	366211	366222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013893	CCCCAA	2	12	401195	401206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013893	TTTTAA	2	12	401418	401429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013893	TATAAT	2	12	418754	418765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013893	AGTGTA	2	12	429679	429690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013893	GGATAT	2	12	443201	443212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013893	ATTAAA	2	12	456861	456872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013893	AAATAT	2	12	468083	468094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013893	TAAGAA	2	12	477413	477424	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013893	AATTAA	2	12	497877	497888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013893	TAAAGA	2	12	500822	500833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013893	TCGAAA	2	12	539260	539271	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013893	TCGAAA	2	12	539762	539773	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013893	TTTAAT	2	12	580218	580229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013893	AAGCTG	2	12	584044	584055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013893	TTTTAA	2	12	584138	584149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013893	TGGCTA	2	12	648176	648187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013893	TTATAA	2	12	668727	668738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013893	ATAGTA	2	12	674747	674758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013893	TAAGTA	2	12	675195	675206	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013893	TAAATT	2	12	693741	693752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013893	TAGATA	2	12	708000	708011	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013893	TAATTT	2	12	721031	721042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013893	ATAATG	2	12	724692	724703	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013893	TCATTA	2	12	728141	728152	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013893	TAAAAA	2	12	742995	743006	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013893	GATTAT	2	12	748699	748710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013893	TTTAAT	2	12	762084	762095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013893	ATGATA	2	12	775180	775191	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013893	TTAAAG	2	12	807042	807053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013893	AAAAGA	2	12	822976	822987	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013893	ATGTTA	2	12	828835	828846	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013893	ATTGTT	2	12	848348	848359	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013893	CATTAT	2	12	855450	855461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013893	AATGTA	2	12	859646	859657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013893	TCTTTA	2	12	859718	859729	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013893	TGATAA	2	12	899561	899572	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013893	TAATGA	2	12	942701	942712	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013893	AGTATA	2	12	942793	942804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013893	TAAAAA	2	12	965883	965894	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013893	TTATTT	2	12	985705	985716	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013893	TTTAAA	2	12	1037193	1037204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013893	ATATTA	2	12	1049039	1049050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013893	GATAAA	2	12	1055560	1055571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013893	TCATTG	2	12	1067500	1067511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013893	AATATG	2	12	1092420	1092431	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013893	ATGAAG	2	12	1101122	1101133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013893	GTATTT	2	12	1101859	1101870	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013893	ATTTGA	2	12	1101946	1101957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013893	TAATTA	2	12	1110013	1110024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013893	ATAAGT	2	12	1115582	1115593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013893	TATTAA	2	12	1129353	1129364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013893	TCAATT	2	12	1142931	1142942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013893	TTATTT	2	12	1186542	1186553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013893	CTTGCA	2	12	1197759	1197770	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013893	TTTGCA	2	12	1237714	1237725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013893	GTCTGG	2	12	1269825	1269836	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013893	ACAATA	2	12	1275444	1275455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013893	GTAGAG	2	12	1287299	1287310	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013893	AGTCAA	2	12	1377317	1377328	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013893	TTTTAT	2	12	1413241	1413252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013893	ATTATA	2	12	1418672	1418683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013893	TTCAAA	2	12	1428168	1428179	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013893	TTAAAA	2	12	1458126	1458137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013893	TTATCA	2	12	1472302	1472313	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013893	TTAATT	2	12	1578272	1578283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013893	ATTAAA	2	12	1578955	1578966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013893	TAAAAA	2	12	1610644	1610655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013893	CAGCTT	2	12	1621111	1621122	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013893	ATTTAT	2	12	1629444	1629455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013893	TTAATC	2	12	1632897	1632908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013893	TCAAAA	2	12	1656360	1656371	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013893	TATTTT	2	12	1656391	1656402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013893	TTTTGT	2	12	1704815	1704826	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013893	TATTTA	2	12	1746883	1746894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013893	TATTTT	2	12	1801227	1801238	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013893	AAAAAT	2	12	1804961	1804972	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013893	TTAAAT	2	12	1807416	1807427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013893	ATTAAA	2	12	1813735	1813746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013893	TTTTTA	2	12	1817605	1817616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013893	ATTCTA	2	12	1824026	1824037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013893	TTAAAT	2	12	1866532	1866543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013893	TAATTT	2	12	1884543	1884554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013893	CTTTAA	2	12	1910474	1910485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013893	CTATAT	2	12	1910661	1910672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013893	AATTTA	2	12	1911017	1911028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013893	GTTATA	2	12	1919440	1919451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013893	TGAAAC	2	12	1924271	1924282	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013893	ATTAAA	2	12	1945479	1945490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013893	TGACTT	2	12	1959591	1959602	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013893	AAAGAA	2	12	1959716	1959727	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013893	ATTTTT	2	12	2020387	2020398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013893	AAATTC	2	12	2037863	2037874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013893	TAAAAA	2	12	2040148	2040159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013893	TATTTA	2	12	2044928	2044939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013893	ACAATG	2	12	2062524	2062535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013893	TAATTT	2	12	2069480	2069491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013893	ATTTCT	2	12	2089606	2089617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_013893	AATTAA	2	12	2096598	2096609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013893	TTCTTT	2	12	2097799	2097810	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_013893	AAATAT	2	12	2105606	2105617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013893	GTACTC	2	12	2108485	2108496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013893	TGCATT	2	12	2143574	2143585	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013893	TTTCAT	2	12	2163019	2163030	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_013893	ATGAGC	2	12	2165835	2165846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013893	GATAAT	2	12	2170399	2170410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013893	ATCATT	2	12	2174837	2174848	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013893	AAAAGC	2	12	2176179	2176190	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013893	TGCCAT	2	12	2190861	2190872	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013893	TACACA	2	12	2200026	2200037	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013893	TAGAAA	2	12	2217582	2217593	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013893	AAAGTA	2	12	2233560	2233571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013893	AAAATT	2	12	2234652	2234663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013893	ATGAAT	2	12	2241324	2241335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_013893	AAATTT	2	12	2258749	2258760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013893	TAGTAT	2	12	2266647	2266658	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.