MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 chromosome

Total Repeats: 575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013893	AAATG	2	10	3204	3213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013893	ATAAA	2	10	8702	8711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013893	CCCCA	2	10	9046	9055	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_013893	TTGCT	2	10	9058	9067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013893	ACTAA	2	10	9224	9233	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013893	TAAAT	2	10	20596	20605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013893	TTTTG	2	10	29596	29605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013893	TATTT	2	10	29652	29661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013893	TAGAA	2	10	30610	30619	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013893	AGTAA	2	10	30637	30646	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013893	AAATT	2	10	39965	39974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013893	TAAAT	2	10	42724	42733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013893	AATAT	2	10	64425	64434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013893	ATGTG	2	10	77534	77543	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013893	TGGGG	2	10	82799	82808	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013893	TGGGG	2	10	82983	82992	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013893	AATAT	2	10	96861	96870	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013893	ATGTG	2	10	109970	109979	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013893	TGGGG	2	10	115235	115244	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013893	TGGGG	2	10	115419	115428	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013893	TAAAA	2	10	124930	124939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013893	TAAAA	2	10	128652	128661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013893	TTTAA	2	10	128663	128672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013893	GGTTG	2	10	128799	128808	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013893	ATTTA	2	10	131613	131622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013893	ATATT	2	10	132647	132656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013893	TAAAA	2	10	164397	164406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013893	TGAAT	2	10	166973	166982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013893	TAAAT	2	10	170268	170277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013893	GGATT	2	10	172598	172607	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013893	AAAGA	2	10	176052	176061	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013893	TGGGG	2	10	177346	177355	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013893	TTATT	2	10	181128	181137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013893	TGTAT	2	10	182330	182339	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013893	ATAAA	2	10	193994	194003	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013893	ATTGT	2	10	214542	214551	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013893	TTATG	2	10	219130	219139	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013893	ATTTT	2	10	221419	221428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013893	TTGCT	2	10	221866	221875	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013893	GAGTA	2	10	234911	234920	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013893	TTGCT	2	10	235777	235786	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013893	GCCCC	2	10	235822	235831	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
43	NC_013893	TTGCT	2	10	235836	235845	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013893	GCCCC	2	10	235880	235889	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
45	NC_013893	TTGCT	2	10	235894	235903	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013893	ATTGG	2	10	241656	241665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013893	TGGGG	2	10	252297	252306	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013893	TGGGG	2	10	252354	252363	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013893	TAACA	2	10	259694	259703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013893	GAATT	2	10	263159	263168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013893	GATTT	2	10	268219	268228	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013893	ATTTT	2	10	274466	274475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013893	AGATT	2	10	276916	276925	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013893	CAATC	2	10	277079	277088	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_013893	AGTTC	2	10	277122	277131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013893	TGAAT	2	10	286708	286717	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013893	ACTAA	2	10	286914	286923	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013893	GTAAA	2	10	306047	306056	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013893	AACAT	2	10	310943	310952	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013893	TATAA	2	10	311067	311076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013893	AGTTA	2	10	312125	312134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013893	TCAAT	2	10	312208	312217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013893	CAAAA	2	10	312630	312639	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013893	TTTAG	2	10	320490	320499	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013893	AACTA	2	10	325024	325033	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013893	TTAAA	2	10	325087	325096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013893	ATGAT	2	10	334001	334010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013893	ATCAT	2	10	335016	335025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013893	ATTTA	2	10	338459	338468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013893	AGGAG	2	10	357085	357094	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013893	AAAGT	2	10	362390	362399	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013893	TTATA	2	10	363083	363092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013893	AAATA	2	10	378723	378732	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013893	TATAG	2	10	385070	385079	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013893	AGTTC	2	10	385160	385169	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013893	TAAAA	2	10	386120	386129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013893	GTTTT	2	10	392162	392171	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013893	TTAAA	2	10	394243	394252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013893	TTGCT	2	10	401150	401159	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013893	TTGCT	2	10	401208	401217	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013893	CATTT	2	10	401432	401441	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013893	CTTAT	2	10	401458	401467	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013893	TTTAT	2	10	405965	405974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013893	AAGCA	2	10	407794	407803	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013893	TTAAA	2	10	409153	409162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013893	GATAA	2	10	410570	410579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013893	TTAAC	2	10	412212	412221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013893	ATTTA	2	10	416086	416095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013893	AAATT	2	10	418737	418746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013893	ATTTG	2	10	429038	429047	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013893	GTCCC	2	10	451795	451804	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_013893	TTTTA	2	10	451841	451850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013893	ATAAA	2	10	456825	456834	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013893	TTTAG	2	10	456944	456953	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013893	GCTAT	2	10	461586	461595	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013893	TGGGG	2	10	463141	463150	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013893	AATAT	2	10	468122	468131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013893	TGGGG	2	10	472971	472980	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013893	ATTAT	2	10	480882	480891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013893	ATTTA	2	10	481085	481094	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013893	TGAAT	2	10	482717	482726	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013893	ACTAA	2	10	482834	482843	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013893	TTAAT	2	10	493043	493052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013893	AATGT	2	10	496255	496264	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013893	ATATT	2	10	496272	496281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013893	ACATA	2	10	497835	497844	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013893	AAATA	2	10	532445	532454	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013893	AGTAT	2	10	536970	536979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013893	TTTAA	2	10	552284	552293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013893	AAATT	2	10	552496	552505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013893	TAGAA	2	10	554689	554698	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013893	CACTT	2	10	564784	564793	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013893	TAATA	2	10	564904	564913	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013893	TTCAA	2	10	569380	569389	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013893	ATATT	2	10	571836	571845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013893	AAAAG	2	10	571909	571918	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013893	TTCTT	2	10	574112	574121	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013893	TGGGG	2	10	574251	574260	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013893	TGTTT	2	10	581450	581459	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013893	TGGGG	2	10	582079	582088	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013893	TAAAA	2	10	582222	582231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013893	ACTAT	2	10	587774	587783	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013893	AATGT	2	10	592910	592919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013893	TAAAT	2	10	596458	596467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013893	AATTT	2	10	604192	604201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013893	TTGTT	2	10	617288	617297	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013893	TATAA	2	10	617388	617397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013893	ACTCA	2	10	624048	624057	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_013893	TATAA	2	10	624138	624147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013893	TTTTA	2	10	635014	635023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013893	GTTAT	2	10	637720	637729	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013893	TATAA	2	10	639591	639600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013893	AGGAT	2	10	642279	642288	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013893	ATATT	2	10	646334	646343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013893	AAGTG	2	10	668803	668812	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013893	TGAAT	2	10	670859	670868	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013893	ACTAA	2	10	671065	671074	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013893	TTATT	2	10	671874	671883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013893	TAAAA	2	10	674665	674674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013893	ATGTA	2	10	675013	675022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013893	CAGTC	2	10	680741	680750	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_013893	ATTTT	2	10	682949	682958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013893	TATAA	2	10	695735	695744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013893	CCCCA	2	10	700338	700347	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
145	NC_013893	ATGAC	2	10	700485	700494	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_013893	ATTTT	2	10	706335	706344	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013893	CGGGA	2	10	707104	707113	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_013893	ATAAG	2	10	710295	710304	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_013893	ATTGA	2	10	712629	712638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013893	AAAGA	2	10	713713	713722	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_013893	AATTG	2	10	775104	775113	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_013893	TTGCT	2	10	1253426	1253435	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
274	NC_013893	AATAT	2	10	1253599	1253608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_013893	ATTTT	2	10	1254153	1254162	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_013893	AAAAG	3	15	1272031	1272045	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_013893	TAATC	2	10	1284323	1284332	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_013893	TGGGA	2	10	1287397	1287406	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013893	TACTG	2	10	1289600	1289609	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_013893	ATGTG	2	10	1289617	1289626	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
287	NC_013893	AAAAG	2	10	1289708	1289717	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_013893	CAAAT	2	10	1296059	1296068	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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463	NC_013893	AAGAC	2	10	2214842	2214851	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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485	NC_013893	TCATT	2	10	2264754	2264763	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
486	NC_013893	TGTCT	2	10	2291203	2291212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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488	NC_013893	ACATA	2	10	2294082	2294091	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
489	NC_013893	TAATA	2	10	2295627	2295636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_013893	ACGTT	2	10	2300836	2300845	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
491	NC_013893	TGCTT	2	10	2304044	2304053	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
492	NC_013893	ACTCC	2	10	2306572	2306581	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
493	NC_013893	ACCAA	2	10	2306935	2306944	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
494	NC_013893	TAAAA	2	10	2315244	2315253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_013893	ATAAA	2	10	2317867	2317876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_013893	TGAAT	2	10	2351187	2351196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_013893	AGTTA	2	10	2390293	2390302	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

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