MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 chromosome

Total Repeats: 35391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013893	AAG	2	6	577	582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549372
2	NC_013893	TCA	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549372
3	NC_013893	ACA	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549372
4	NC_013893	ATG	2	6	810	815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549372
5	NC_013893	TGT	3	9	1114	1122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549373
6	NC_013893	GTA	2	6	1126	1131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549373
7	NC_013893	AAT	2	6	1155	1160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549373
8	NC_013893	CAA	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549373
9	NC_013893	TTC	2	6	1337	1342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549373
10	NC_013893	TTC	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549373
11	NC_013893	CAT	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549373
12	NC_013893	TAA	2	6	1437	1442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549373
13	NC_013893	TTA	2	6	1478	1483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549373
14	NC_013893	TAA	2	6	1603	1608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
15	NC_013893	TAG	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549374
16	NC_013893	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549374
17	NC_013893	ATA	2	6	1731	1736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
18	NC_013893	AAT	2	6	1812	1817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
19	NC_013893	CTA	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549374
20	NC_013893	AGA	2	6	2325	2330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549375
21	NC_013893	TAA	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549375
22	NC_013893	TCA	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549376
23	NC_013893	ATT	2	6	2541	2546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549376
24	NC_013893	ATT	2	6	2643	2648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549376
25	NC_013893	TCA	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549376
26	NC_013893	AAT	2	6	2743	2748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549376
27	NC_013893	ATG	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549377
28	NC_013893	TAT	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
29	NC_013893	TCA	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549377
30	NC_013893	ACA	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
31	NC_013893	ATT	2	6	3472	3477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
32	NC_013893	TTG	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549377
33	NC_013893	GGT	2	6	3611	3616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549377
34	NC_013893	ACA	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
35	NC_013893	AAC	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
36	NC_013893	TAA	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549377
37	NC_013893	ATT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
38	NC_013893	AGA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549377
39	NC_013893	GAA	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549377
40	NC_013893	CTG	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549378
41	NC_013893	TGT	2	6	4487	4492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549378
42	NC_013893	TTC	3	9	4511	4519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
43	NC_013893	GAA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549378
44	NC_013893	TAT	2	6	4591	4596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549378
45	NC_013893	CTT	2	6	4627	4632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
46	NC_013893	TTC	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
47	NC_013893	TAA	2	6	4816	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549378
48	NC_013893	AGC	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549379
49	NC_013893	TGA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
50	NC_013893	ATG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
51	NC_013893	TCA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549379
52	NC_013893	AGA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
53	NC_013893	AGA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
54	NC_013893	ACA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549379
55	NC_013893	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549379
56	NC_013893	GCA	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549379
57	NC_013893	CGT	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549379
58	NC_013893	ATT	2	6	5477	5482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
59	NC_013893	AGA	2	6	5513	5518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
60	NC_013893	AGA	2	6	5558	5563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
61	NC_013893	GTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549379
62	NC_013893	AGA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
63	NC_013893	TGA	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
64	NC_013893	CAA	2	6	5635	5640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549379
65	NC_013893	ATT	3	9	5656	5664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
66	NC_013893	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
67	NC_013893	TGA	2	6	5756	5761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
68	NC_013893	AGC	2	6	5840	5845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549379
69	NC_013893	AAC	2	6	5853	5858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549379
70	NC_013893	TAC	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549379
71	NC_013893	ATT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549380
72	NC_013893	ATT	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549380
73	NC_013893	ATG	2	6	6340	6345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549380
74	NC_013893	ATG	2	6	6448	6453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549380
75	NC_013893	TGA	2	6	7131	7136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549381
76	NC_013893	TTG	2	6	7202	7207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549381
77	NC_013893	AAT	2	6	7233	7238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
78	NC_013893	TTC	2	6	7268	7273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549381
79	NC_013893	TCG	2	6	7434	7439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549381
80	NC_013893	TCA	2	6	7569	7574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549381
81	NC_013893	ATA	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
82	NC_013893	TTG	2	6	7627	7632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549381
83	NC_013893	AAT	2	6	7637	7642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
84	NC_013893	GCT	2	6	7816	7821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549381
85	NC_013893	GAA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549381
86	NC_013893	TGC	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549381
87	NC_013893	ATA	2	6	8025	8030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
88	NC_013893	ATG	2	6	8073	8078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549382
89	NC_013893	ATG	2	6	8091	8096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549382
90	NC_013893	CAT	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549382
91	NC_013893	ATT	2	6	9697	9702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549383
92	NC_013893	TAT	2	6	9703	9708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549383
93	NC_013893	AGG	2	6	9717	9722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549383
94	NC_013893	AAT	2	6	9728	9733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549383
95	NC_013893	AGG	2	6	9800	9805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549383
96	NC_013893	TGC	2	6	9807	9812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549383
97	NC_013893	GTT	2	6	9820	9825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549383
98	NC_013893	CAG	2	6	9868	9873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549383
99	NC_013893	AAT	2	6	9983	9988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549384
100	NC_013893	TAA	2	6	10006	10011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549384
101	NC_013893	TTA	2	6	10094	10099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549384
102	NC_013893	GCG	2	6	10116	10121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289549384
103	NC_013893	GAA	2	6	10241	10246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549384
104	NC_013893	TGA	2	6	10378	10383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549384
105	NC_013893	TTA	2	6	10421	10426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549384
106	NC_013893	TGA	2	6	10483	10488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549384
107	NC_013893	ATT	2	6	10534	10539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549384
108	NC_013893	ATC	2	6	10617	10622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549384
109	NC_013893	GAT	2	6	10631	10636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549384
110	NC_013893	ACG	2	6	10704	10709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549384
111	NC_013893	TTA	2	6	10710	10715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549384
112	NC_013893	GGA	2	6	10792	10797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549384
113	NC_013893	ATC	2	6	10879	10884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549385
114	NC_013893	ATG	2	6	10885	10890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549385
115	NC_013893	TTA	3	9	10895	10903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549385
116	NC_013893	TTA	2	6	10997	11002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549385
117	NC_013893	TAG	2	6	11076	11081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549385
118	NC_013893	ATT	2	6	11098	11103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549385
119	NC_013893	CTT	2	6	11112	11117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549385
120	NC_013893	ATT	2	6	11146	11151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549385
121	NC_013893	CTT	2	6	11202	11207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549385
122	NC_013893	TAA	2	6	11267	11272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549385
123	NC_013893	TTA	2	6	11287	11292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549385
124	NC_013893	ATT	2	6	11329	11334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549385
125	NC_013893	GAG	2	6	11534	11539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549385
126	NC_013893	ATT	2	6	11574	11579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549386
127	NC_013893	CAT	2	6	11609	11614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549386
128	NC_013893	TTA	2	6	11685	11690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549386
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130	NC_013893	ATT	2	6	11793	11798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549386
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