MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Xenorhabdus bovienii SS-2004 chromosome

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013892	TTTCGC	2	12	42071	42082	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013892	TTTGTT	2	12	49379	49390	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013892	CATCAG	2	12	52044	52055	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013892	CTTATT	2	12	72672	72683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013892	ATATTA	2	12	74026	74037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013892	CAATTT	2	12	78796	78807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013892	AGTAAT	2	12	81510	81521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013892	GACGAT	2	12	103562	103573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013892	ATTTTT	2	12	129844	129855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013892	TTAAAA	2	12	132679	132690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013892	ATTTTT	2	12	161337	161348	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013892	GGCTCT	2	12	179030	179041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013892	TTGCTC	2	12	207301	207312	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013892	TAAAGT	2	12	239529	239540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013892	GAAAAA	2	12	268509	268520	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013892	TAAGTG	2	12	269170	269181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013892	TCTGTA	2	12	324827	324838	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013892	AAATGA	2	12	382844	382855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013892	TAAATA	2	12	390968	390979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013892	AATAAA	2	12	392630	392641	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013892	TAATTT	2	12	405993	406004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013892	CAATAG	2	12	406226	406237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013892	AAACCT	2	12	410152	410163	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013892	AAATAA	2	12	426895	426906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013892	AAAGAC	2	12	450822	450833	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013892	ATCATT	2	12	462414	462425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013892	ATTGTT	2	12	469950	469961	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013892	TTATTT	2	12	490729	490740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013892	CGATAC	2	12	495491	495502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013892	ATCTTG	2	12	497881	497892	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013892	CATCAG	2	12	527405	527416	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013892	TTATTT	2	12	545782	545793	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013892	TATTCA	2	12	545878	545889	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013892	GCATCT	2	12	571053	571064	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013892	ATTTTT	2	12	594477	594488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013892	TGTAAT	2	12	608405	608416	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013892	TTTTTA	2	12	638207	638218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013892	TATCGT	2	12	642771	642782	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013892	CATCAG	2	12	646141	646152	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013892	TGATTT	2	12	649513	649524	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013892	AACAGG	2	12	653878	653889	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013892	TTTAAT	2	12	654479	654490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013892	AGATAT	2	12	657191	657202	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013892	AATTTT	2	12	662989	663000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013892	ATGTCC	2	12	663197	663208	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013892	AAAAAT	2	12	699499	699510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013892	ACATAA	2	12	709084	709095	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013892	TTGACA	2	12	714764	714775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013892	CCTGAT	2	12	734722	734733	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013892	GATAAC	2	12	744522	744533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013892	AACAAG	2	12	786780	786791	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013892	AAATGT	2	12	803488	803499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013892	ACCAAA	2	12	829863	829874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013892	CCCCGT	2	12	853242	853253	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_013892	ACATTA	2	12	869314	869325	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013892	TCATTA	2	12	869326	869337	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013892	AATTAA	2	12	877595	877606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013892	TAAAAT	2	12	919680	919691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013892	TATCAA	2	12	955397	955408	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013892	TTTAAT	2	12	991810	991821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013892	CATTGA	2	12	1029759	1029770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013892	TATAAA	4	24	1045280	1045303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013892	TAACAG	2	12	1075520	1075531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013892	GGTTTT	2	12	1100478	1100489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013892	CAACCA	2	12	1126403	1126414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013892	TCAGGT	2	12	1167284	1167295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013892	TAATTT	2	12	1242441	1242452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013892	TTTAAA	2	12	1270060	1270071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013892	ATAAAA	2	12	1294004	1294015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013892	TAAATT	2	12	1323609	1323620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013892	CTATAT	2	12	1359353	1359364	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013892	TGATTT	2	12	1364951	1364962	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013892	AGGGTG	2	12	1366249	1366260	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013892	GCATTT	2	12	1384995	1385006	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013892	GGTTCA	2	12	1388072	1388083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013892	CGCCAC	2	12	1389794	1389805	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013892	TTTTTA	2	12	1423575	1423586	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013892	AAAATA	2	12	1455355	1455366	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013892	ATCGTT	2	12	1516829	1516840	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013892	ATAAAA	2	12	1522515	1522526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013892	AAATAT	2	12	1586047	1586058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013892	AAAATA	2	12	1586162	1586173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013892	ACAATA	2	12	1586196	1586207	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013892	AGTTTA	2	12	1597522	1597533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013892	ATTTTT	2	12	1600601	1600612	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013892	TAAAAT	2	12	1604576	1604587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013892	GTATCC	2	12	1605178	1605189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013892	TTTCTA	2	12	1666248	1666259	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013892	ACTAAA	2	12	1670837	1670848	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013892	CTTAAT	2	12	1675475	1675486	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013892	TAATTT	2	12	1703131	1703142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013892	AAGCAG	2	12	1730395	1730406	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013892	AATTAA	2	12	1740723	1740734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013892	TTATCG	2	12	1745010	1745021	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013892	ATTTTT	2	12	1746076	1746087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013892	TATTCA	2	12	1746733	1746744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013892	TTTCCT	2	12	1771925	1771936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013892	GTTAAT	2	12	1790237	1790248	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013892	CAATGA	2	12	1805467	1805478	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013892	GTTTTT	2	12	1809340	1809351	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013892	ATAAAT	2	12	1830271	1830282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013892	ATGTCA	2	12	1865400	1865411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013892	GTTAAA	2	12	1877426	1877437	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013892	TTATAT	2	12	1878226	1878237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013892	ATGAAA	2	12	1959904	1959915	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013892	ACTGGA	2	12	1968138	1968149	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013892	TGGCGA	2	12	1969490	1969501	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013892	TGACGG	2	12	1969820	1969831	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013892	ATCTGC	2	12	1972730	1972741	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013892	CGCCAC	2	12	1977156	1977167	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013892	TTTGTA	2	12	2000309	2000320	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013892	TTAACT	2	12	2000963	2000974	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013892	ATGCTT	2	12	2043181	2043192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013892	TGAAAA	2	12	2065566	2065577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013892	TATATC	3	18	2107891	2107908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013892	ATTTAT	2	12	2108110	2108121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013892	TAAGCC	2	12	2114848	2114859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013892	TGTTTA	2	12	2115272	2115283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013892	TATTTA	8	48	2115284	2115331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013892	TAAAAA	2	12	2155423	2155434	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013892	ATTTTT	2	12	2203767	2203778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013892	CATAAT	2	12	2225697	2225708	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013892	TAATAT	2	12	2233570	2233581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013892	AGGTAA	2	12	2259856	2259867	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013892	GAATAT	2	12	2267709	2267720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013892	TATTGC	2	12	2309495	2309506	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_013892	AATAAC	2	12	2320267	2320278	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013892	ATAAAT	2	12	2388840	2388851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013892	AAAAAT	2	12	2433750	2433761	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013892	ATAGTA	2	12	2464728	2464739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013892	AGTTAT	2	12	2464792	2464803	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013892	ATAAAT	2	12	2484393	2484404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013892	ATAAAA	2	12	2514488	2514499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_013892	ATTTTT	2	12	2917495	2917506	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_013892	AAAATA	2	12	3003440	3003451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.