MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Xenorhabdus bovienii SS-2004 chromosome

Total Repeats: 1227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013892	CGCCAA	2	12	1175	1186	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	290473095
2	NC_013892	GAAATG	2	12	1699	1710	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	290473096
3	NC_013892	GATTTC	2	12	5812	5823	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290473098
4	NC_013892	TATAAA	2	12	6578	6589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473099
5	NC_013892	ACATCA	2	12	8558	8569	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	290473102
6	NC_013892	ATCTGA	2	12	10841	10852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290473103
7	NC_013892	ATACCA	2	12	10959	10970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	290473103
8	NC_013892	TATCCA	2	12	17315	17326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473110
9	NC_013892	AAGTTA	2	12	17374	17385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290473110
10	NC_013892	TCAACT	2	12	21382	21393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473112
11	NC_013892	TTTCAG	2	12	23120	23131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290473113
12	NC_013892	ACAGAG	2	12	29196	29207	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	290473118
13	NC_013892	CTGTTT	2	12	29236	29247	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	290473118
14	NC_013892	ATCTGC	2	12	35321	35332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	290473125
15	NC_013892	CGTGAG	2	12	38379	38390	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473128
16	NC_013892	AAAACC	2	12	47104	47115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473136
17	NC_013892	ATTGAA	2	12	55931	55942	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290473138
18	NC_013892	TGTCCT	2	12	67194	67205	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	290473150
19	NC_013892	GAGCCA	2	12	70946	70957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473153
20	NC_013892	TGCGGT	2	12	79043	79054	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	290473159
21	NC_013892	GGCAAT	2	12	82204	82215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290473162
22	NC_013892	TCTAAT	2	12	84253	84264	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	290473166
23	NC_013892	GCCACC	2	12	89235	89246	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	290473171
24	NC_013892	GGTTGG	2	12	91046	91057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473173
25	NC_013892	TATTCA	2	12	93626	93637	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	290473175
26	NC_013892	CCAGAA	2	12	95186	95197	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	290473176
27	NC_013892	ATCGGC	2	12	95967	95978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	290473177
28	NC_013892	GTAAAC	2	12	96187	96198	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	290473177
29	NC_013892	CTGGAT	2	12	99016	99027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290473179
30	NC_013892	TGAGCA	2	12	101339	101350	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290473181
31	NC_013892	TTGGCA	2	12	107942	107953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290473186
32	NC_013892	ATCAAC	2	12	116996	117007	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	290473197
33	NC_013892	GGGATA	2	12	119101	119112	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	290473202
34	NC_013892	GTTCCA	2	12	121212	121223	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	290473204
35	NC_013892	TCAGGC	2	12	121395	121406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	290473204
36	NC_013892	ATTTTG	2	12	122821	122832	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290473206
37	NC_013892	CATAAA	2	12	123525	123536	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	290473206
38	NC_013892	TGTTTC	2	12	127234	127245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	290473210
39	NC_013892	TGTAAT	2	12	127586	127597	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290473210
40	NC_013892	TCATTG	2	12	129097	129108	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290473213
41	NC_013892	TGCTGG	2	12	131398	131409	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	290473214
42	NC_013892	TTTCAG	2	12	141726	141737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290473224
43	NC_013892	GTACGG	2	12	141880	141891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473224
44	NC_013892	CAATCA	2	12	142361	142372	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	290473224
45	NC_013892	TGCGCT	2	12	145409	145420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473229
46	NC_013892	TAAATT	2	12	151560	151571	50 %	50 %	0 %	0 %	290473239
47	NC_013892	CTGAAG	2	12	153375	153386	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290473241
48	NC_013892	TTTATG	2	12	154209	154220	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290473242
49	NC_013892	AAAGGG	2	12	156977	156988	50 %	0 %	50 %	0 %	290473245
50	NC_013892	GGAGAA	2	12	159098	159109	50 %	0 %	50 %	0 %	290473249
51	NC_013892	AAAGCC	2	12	171501	171512	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	290473264
52	NC_013892	CTTCCT	2	12	176823	176834	0 %	50 %	0 %	50 %	290473267
53	NC_013892	CGAAAA	2	12	177945	177956	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	290473268
54	NC_013892	TTTTGG	2	12	181504	181515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473272
55	NC_013892	GATTGG	2	12	188293	188304	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	290473280
56	NC_013892	TAAAGA	2	12	189140	189151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	290473280
57	NC_013892	ATACTT	2	12	189823	189834	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	290473280
58	NC_013892	CAAAGT	2	12	189897	189908	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	290473280
59	NC_013892	TTATTT	2	12	196120	196131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	290473284
60	NC_013892	TATGAA	2	12	196652	196663	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290473286
61	NC_013892	TGGCGG	2	12	197800	197811	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	290473288
62	NC_013892	CTGTTG	2	12	197896	197907	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	290473288
63	NC_013892	ATGGCA	2	12	200242	200253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290473289
64	NC_013892	GGTTCC	2	12	200864	200875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473290
65	NC_013892	CCAGAA	2	12	202398	202409	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	290473291
66	NC_013892	GGTTCG	2	12	204485	204496	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	290473293
67	NC_013892	TGGATC	2	12	211679	211690	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290473296
68	NC_013892	ATTCAA	2	12	214305	214316	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	290473297
69	NC_013892	TTGAAA	2	12	219956	219967	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290473305
70	NC_013892	ACCATC	2	12	222891	222902	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	290473307
71	NC_013892	CATGAC	2	12	223550	223561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	290473307
72	NC_013892	CAGCAA	2	12	228188	228199	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	290473311
73	NC_013892	TTTGTC	2	12	230352	230363	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	290473313
74	NC_013892	GCTGGA	2	12	238112	238123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473319
75	NC_013892	GAATGC	2	12	243204	243215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290473324
76	NC_013892	CCAGAG	2	12	243385	243396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473324
77	NC_013892	GTGATG	2	12	248288	248299	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	290473327
78	NC_013892	TTATCG	2	12	258603	258614	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290473337
79	NC_013892	GAAATG	2	12	260935	260946	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	290473340
80	NC_013892	ACTGCC	2	12	262922	262933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	290473341
81	NC_013892	CGGTGA	2	12	263851	263862	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473341
82	NC_013892	TGATAT	2	12	264127	264138	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290473341
83	NC_013892	GAACTG	2	12	273035	273046	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290473349
84	NC_013892	GATTTT	2	12	273167	273178	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290473349
85	NC_013892	GCCAGT	2	12	274483	274494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	290473350
86	NC_013892	GCGTTA	2	12	282058	282069	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290473356
87	NC_013892	CGTCAG	2	12	282727	282738	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	290473356
88	NC_013892	GCTGCG	2	12	285468	285479	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	290473359
89	NC_013892	GCCGGT	2	12	285537	285548	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	290473359
90	NC_013892	CGCCAG	2	12	285616	285627	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	290473359
91	NC_013892	CGGGTG	2	12	289247	289258	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	290473360
92	NC_013892	CATCCG	2	12	290756	290767	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	290473361
93	NC_013892	GAAGGC	2	12	292003	292014	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	290473361
94	NC_013892	GCGGCA	2	12	294190	294201	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	290473364
95	NC_013892	TATGAG	2	12	296326	296337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473364
96	NC_013892	ATATCT	2	12	298808	298819	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	290473365
97	NC_013892	CGGTGG	2	12	300663	300674	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	290473369
98	NC_013892	GTCAGG	2	12	301892	301903	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473371
99	NC_013892	ACGAAG	2	12	304034	304045	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	290473375
100	NC_013892	TAAGAA	2	12	304308	304319	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	290473375
101	NC_013892	AGTTTT	2	12	304793	304804	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290473376
102	NC_013892	GTGATG	2	12	308976	308987	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	290473384
103	NC_013892	TGACCG	2	12	309256	309267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	290473384
104	NC_013892	GGGAAG	2	12	325614	325625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290473396
105	NC_013892	GGTTTC	2	12	339660	339671	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	290473407
106	NC_013892	GAAGGA	2	12	340802	340813	50 %	0 %	50 %	0 %	290473408
107	NC_013892	CCTGAA	2	12	350150	350161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	290473422
108	NC_013892	CGTCTG	2	12	350804	350815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473422
109	NC_013892	TGAGTT	2	12	353311	353322	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	290473422
110	NC_013892	TTTTTC	2	12	361476	361487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	290473433
111	NC_013892	GTTAAA	2	12	362091	362102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290473434
112	NC_013892	AACGGT	2	12	365869	365880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290473438
113	NC_013892	ACTTTG	2	12	366373	366384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290473439
114	NC_013892	GGCTTC	2	12	369931	369942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473442
115	NC_013892	TGATGG	2	12	370985	370996	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	290473443
116	NC_013892	TGAAGA	2	12	371537	371548	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	290473443
117	NC_013892	GGTGCG	2	12	371884	371895	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	290473444
118	NC_013892	TTACGG	2	12	373042	373053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290473445
119	NC_013892	GAAAAA	2	12	375208	375219	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	290473447
120	NC_013892	GAAGCG	2	12	375355	375366	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	290473447
121	NC_013892	AGTGAA	2	12	376923	376934	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	290473447
122	NC_013892	CCCAGC	2	12	378235	378246	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	290473449
123	NC_013892	AGGTGA	2	12	379838	379849	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	290473451
124	NC_013892	GCACTG	2	12	379995	380006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	290473451
125	NC_013892	ATCGAA	2	12	381357	381368	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	290473451
126	NC_013892	TCGTGA	2	12	384766	384777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290473453
127	NC_013892	CGATAT	2	12	391629	391640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290473457
128	NC_013892	GATATT	2	12	394525	394536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290473460
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130	NC_013892	TTTTTA	2	12	399089	399100	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	290473465
131	NC_013892	TTTCTA	2	12	399360	399371	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	290473465
132	NC_013892	CCTTTT	2	12	401123	401134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473468
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134	NC_013892	TTTTGT	2	12	405650	405661	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	290473475
135	NC_013892	TGATTC	2	12	422667	422678	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290473489
136	NC_013892	TATGTT	2	12	422686	422697	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290473489
137	NC_013892	ATGACT	2	12	422930	422941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290473489
138	NC_013892	ATCTTC	2	12	423221	423232	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	290473489
139	NC_013892	TATGAA	2	12	434816	434827	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290473503
140	NC_013892	GAAGAC	3	18	437434	437451	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	290473505
141	NC_013892	TCACAG	2	12	437601	437612	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	290473506
142	NC_013892	CTTCAC	2	12	444863	444874	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	290473517
143	NC_013892	GCAGTT	2	12	449871	449882	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290473523
144	NC_013892	TTAGGT	2	12	451238	451249	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	290473524
145	NC_013892	TGGCGC	2	12	452106	452117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	290473524
146	NC_013892	TTTCTT	2	12	454624	454635	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	290473527
147	NC_013892	TCATCG	2	12	458563	458574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	290473529
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149	NC_013892	TCTGTA	2	12	463728	463739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290473534
150	NC_013892	CGGTGG	2	12	464728	464739	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	290473537
151	NC_013892	TCAATA	2	12	465345	465356	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	290473538
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162	NC_013892	TCAGCT	2	12	491271	491282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	290473566
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180	NC_013892	GTCATA	2	12	579104	579115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290473636
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183	NC_013892	TGAACA	2	12	607091	607102	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	290473657
184	NC_013892	CCAGAT	2	12	608057	608068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	290473658
185	NC_013892	ATTGAA	2	12	608914	608925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290473659
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214	NC_013892	TCTGAG	2	12	710242	710253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290473783
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216	NC_013892	TACGAT	2	12	715312	715323	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290473790
217	NC_013892	ACCCAA	2	12	723130	723141	50 %	0 %	0 %	50 %	290473794
218	NC_013892	ATATCA	2	12	735089	735100	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	290473803
219	NC_013892	AATATT	2	12	738860	738871	50 %	50 %	0 %	0 %	290473806
220	NC_013892	CGCCAC	2	12	740835	740846	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	290473809
221	NC_013892	TTATCT	2	12	742263	742274	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	290473812
222	NC_013892	AAATCA	2	12	747917	747928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	290473820
223	NC_013892	CATTTT	2	12	748497	748508	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	290473821
224	NC_013892	CATAAA	2	12	750343	750354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	290473823
225	NC_013892	CCCTGA	2	12	757106	757117	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	290473831
226	NC_013892	ATTGAT	2	12	757280	757291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290473832
227	NC_013892	TCAGGG	2	12	760382	760393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473835
228	NC_013892	TCAGGG	2	12	763565	763576	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473835
229	NC_013892	CACCGG	2	12	764574	764585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	290473835
230	NC_013892	TCAGGG	2	12	768047	768058	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473835
231	NC_013892	CACCGG	2	12	769056	769067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	290473835
232	NC_013892	TCAGGG	2	12	772854	772865	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473836
233	NC_013892	CACCGG	2	12	773863	773874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	290473836
234	NC_013892	TCAGGG	2	12	775989	776000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473836
235	NC_013892	CACCGG	2	12	776998	777009	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	290473836
236	NC_013892	TCAGGG	2	12	779124	779135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290473836
237	NC_013892	CATCGG	2	12	782269	782280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	290473836
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239	NC_013892	CACCGG	2	12	783367	783378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	290473836
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250	NC_013892	ACGCTC	2	12	833195	833206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	290473875
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321	NC_013892	GACAGA	2	12	1073989	1074000	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	290474129
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325	NC_013892	CATCGC	2	12	1085448	1085459	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	290474141
326	NC_013892	CTTTCG	2	12	1087554	1087565	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	290474141
327	NC_013892	CCGCAG	2	12	1088874	1088885	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	290474141
328	NC_013892	GGTTAG	2	12	1090875	1090886	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	290474141
329	NC_013892	TGTGCC	2	12	1094329	1094340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290474141
330	NC_013892	GTTGCC	2	12	1097020	1097031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290474141
331	NC_013892	CGCCAT	2	12	1097811	1097822	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	290474141
332	NC_013892	GCAAAC	2	12	1098086	1098097	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	290474141
333	NC_013892	ATAAAA	2	12	1100856	1100867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	290474144
334	NC_013892	GTCTGG	2	12	1103777	1103788	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	290474145
335	NC_013892	GCTGGC	2	12	1104599	1104610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	290474146
336	NC_013892	TGAAAT	2	12	1107344	1107355	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290474148
337	NC_013892	GAAAAC	2	12	1107892	1107903	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	290474148
338	NC_013892	AATGTC	2	12	1109667	1109678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290474150
339	NC_013892	CCTGAA	2	12	1110359	1110370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	290474150
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341	NC_013892	TCATCC	2	12	1114105	1114116	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	290474151
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448	NC_013892	AACGGC	2	12	1468337	1468348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290474533
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451	NC_013892	CAACGG	2	12	1475256	1475267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290474538
452	NC_013892	ACGGTA	2	12	1476335	1476346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290474538
453	NC_013892	CACCAT	2	12	1480259	1480270	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	290474543
454	NC_013892	CATTCG	2	12	1480351	1480362	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	290474543
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