MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xenorhabdus bovienii SS-2004 chromosome

Total Repeats: 54839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013892	GAT	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013892	TCA	2	6	70	75	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013892	GGA	2	6	78	83	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013892	TAT	2	6	113	118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013892	TTA	2	6	130	135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013892	GCA	2	6	176	181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473095
7	NC_013892	TTA	2	6	342	347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473095
8	NC_013892	TAA	2	6	395	400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473095
9	NC_013892	TTG	2	6	565	570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473095
10	NC_013892	GGC	2	6	657	662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473095
11	NC_013892	CAT	2	6	707	712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473095
12	NC_013892	AGA	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473095
13	NC_013892	TTA	2	6	815	820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473095
14	NC_013892	CTG	2	6	837	842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473095
15	NC_013892	GAT	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473095
16	NC_013892	AAG	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473095
17	NC_013892	CTG	2	6	912	917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473095
18	NC_013892	ATT	2	6	933	938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473095
19	NC_013892	GAA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473095
20	NC_013892	TTA	2	6	1239	1244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473095
21	NC_013892	ATA	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473095
22	NC_013892	TGG	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473095
23	NC_013892	ACA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473095
24	NC_013892	TTC	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473095
25	NC_013892	AGA	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473095
26	NC_013892	ATT	2	6	1578	1583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473096
27	NC_013892	CAG	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473096
28	NC_013892	AGC	2	6	1603	1608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473096
29	NC_013892	GCC	2	6	1619	1624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473096
30	NC_013892	TTG	3	9	1648	1656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473096
31	NC_013892	CAA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473096
32	NC_013892	TGA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473096
33	NC_013892	GAA	2	6	2044	2049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473096
34	NC_013892	GCT	2	6	2166	2171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473096
35	NC_013892	GGC	2	6	2176	2181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473096
36	NC_013892	CTG	2	6	2188	2193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473096
37	NC_013892	GCA	2	6	2207	2212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473096
38	NC_013892	CCG	2	6	2283	2288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473096
39	NC_013892	GCG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473096
40	NC_013892	GTG	2	6	2387	2392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473096
41	NC_013892	AAC	2	6	2434	2439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473096
42	NC_013892	GAA	2	6	2449	2454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473096
43	NC_013892	GCA	2	6	2828	2833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473097
44	NC_013892	GAA	2	6	2866	2871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473097
45	NC_013892	TTC	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473097
46	NC_013892	GGC	2	6	2885	2890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473097
47	NC_013892	TGC	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473097
48	NC_013892	GCT	2	6	3045	3050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473097
49	NC_013892	CCG	2	6	3069	3074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473097
50	NC_013892	GCT	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473097
51	NC_013892	GCT	2	6	3144	3149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473097
52	NC_013892	GCG	2	6	3163	3168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473097
53	NC_013892	CAG	2	6	3337	3342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473097
54	NC_013892	AGA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473097
55	NC_013892	TGA	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473097
56	NC_013892	CTC	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	290473098
57	NC_013892	GAT	2	6	3871	3876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473098
58	NC_013892	CAC	2	6	3889	3894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473098
59	NC_013892	GTT	2	6	3907	3912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473098
60	NC_013892	CGA	2	6	3924	3929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473098
61	NC_013892	GAT	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473098
62	NC_013892	GAA	3	9	4030	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473098
63	NC_013892	CAG	2	6	4046	4051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473098
64	NC_013892	TCA	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473098
65	NC_013892	TGC	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473098
66	NC_013892	GGT	2	6	4117	4122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473098
67	NC_013892	TGT	2	6	4143	4148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473098
68	NC_013892	AGA	2	6	4416	4421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473098
69	NC_013892	GGT	2	6	4438	4443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473098
70	NC_013892	TTG	2	6	4454	4459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473098
71	NC_013892	TCT	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473098
72	NC_013892	CAA	2	6	4590	4595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473098
73	NC_013892	ACA	2	6	4685	4690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473098
74	NC_013892	TGA	2	6	4716	4721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473098
75	NC_013892	TCT	2	6	4804	4809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473098
76	NC_013892	CTG	2	6	4861	4866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473098
77	NC_013892	GTC	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473098
78	NC_013892	AGC	2	6	4929	4934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473098
79	NC_013892	CGC	2	6	4957	4962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473098
80	NC_013892	TGG	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473098
81	NC_013892	TGT	2	6	5162	5167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473098
82	NC_013892	TGA	2	6	5220	5225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473098
83	NC_013892	ATC	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473098
84	NC_013892	CTG	3	9	5305	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473098
85	NC_013892	AAT	2	6	5599	5604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473098
86	NC_013892	ACC	2	6	5612	5617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473098
87	NC_013892	GAA	2	6	5659	5664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473098
88	NC_013892	GCA	2	6	5711	5716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473098
89	NC_013892	CCG	2	6	5841	5846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473098
90	NC_013892	GAA	2	6	5884	5889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473098
91	NC_013892	CCG	2	6	5970	5975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473098
92	NC_013892	ACC	2	6	6037	6042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473098
93	NC_013892	ATG	2	6	6064	6069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473098
94	NC_013892	TAA	2	6	6193	6198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473098
95	NC_013892	CTT	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013892	ATA	3	9	6392	6400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013892	TAA	3	9	6403	6411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013892	CAA	2	6	6517	6522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473099
99	NC_013892	TAA	2	6	6672	6677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473100
100	NC_013892	ATA	2	6	6683	6688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473100
101	NC_013892	TAT	2	6	6690	6695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473100
102	NC_013892	TAA	2	6	6729	6734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473100
103	NC_013892	ACA	2	6	6796	6801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473100
104	NC_013892	AAC	2	6	7018	7023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473101
105	NC_013892	ACC	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473101
106	NC_013892	ATA	2	6	7100	7105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473101
107	NC_013892	ACA	2	6	7127	7132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473101
108	NC_013892	AGA	2	6	7182	7187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473101
109	NC_013892	TTA	2	6	7453	7458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473101
110	NC_013892	TAT	2	6	7515	7520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473101
111	NC_013892	ATC	2	6	7523	7528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473101
112	NC_013892	CCG	2	6	7770	7775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473101
113	NC_013892	ATG	2	6	7782	7787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473101
114	NC_013892	ATT	2	6	7794	7799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013892	TAA	2	6	7858	7863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013892	ACA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473102
117	NC_013892	TGC	2	6	8213	8218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473102
118	NC_013892	CAC	2	6	8351	8356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473102
119	NC_013892	GCA	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473102
120	NC_013892	CAG	2	6	8457	8462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473102
121	NC_013892	CAC	2	6	8480	8485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473102
122	NC_013892	AAT	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473102
123	NC_013892	AAT	2	6	8655	8660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473102
124	NC_013892	CAT	2	6	8666	8671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473102
125	NC_013892	ATG	2	6	8776	8781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473102
126	NC_013892	TCA	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473102
127	NC_013892	AGC	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013892	CAG	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013892	TTG	2	6	9402	9407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013892	GCT	2	6	9478	9483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013892	CGG	2	6	9545	9550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013892	TCT	2	6	9585	9590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473103
133	NC_013892	TCA	2	6	9678	9683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473103
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136	NC_013892	CTG	2	6	9849	9854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473103
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157	NC_013892	ATT	2	6	11073	11078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013892	ATT	2	6	11142	11147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473104
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257	NC_013892	GGA	2	6	19134	19139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290473111
258	NC_013892	TAC	2	6	19211	19216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
259	NC_013892	ATC	2	6	19247	19252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
260	NC_013892	CAT	2	6	19270	19275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
261	NC_013892	AAT	2	6	19294	19299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473111
262	NC_013892	CCA	2	6	19525	19530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473111
263	NC_013892	AAT	2	6	19563	19568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473111
264	NC_013892	ACT	2	6	19679	19684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
265	NC_013892	TTA	2	6	19827	19832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473111
266	NC_013892	CAG	2	6	19912	19917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473111
267	NC_013892	AAT	2	6	19943	19948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473111
268	NC_013892	AAT	2	6	19994	19999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473111
269	NC_013892	TGG	2	6	20156	20161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473111
270	NC_013892	TCT	2	6	20190	20195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473111
271	NC_013892	TTA	2	6	20223	20228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473111
272	NC_013892	AGG	2	6	20234	20239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290473111
273	NC_013892	ATC	2	6	20279	20284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
274	NC_013892	CTG	2	6	20315	20320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473111
275	NC_013892	TGA	2	6	20375	20380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473111
276	NC_013892	AGT	2	6	20381	20386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473111
277	NC_013892	TCA	2	6	20430	20435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
278	NC_013892	AAG	2	6	20444	20449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473111
279	NC_013892	ATC	2	6	20630	20635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
280	NC_013892	CCA	2	6	20637	20642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473111
281	NC_013892	ATT	2	6	20648	20653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473111
282	NC_013892	ATC	2	6	20703	20708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
283	NC_013892	TTC	2	6	20729	20734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473111
284	NC_013892	TCA	2	6	20778	20783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
285	NC_013892	ATC	2	6	20849	20854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
286	NC_013892	AAT	2	6	20879	20884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473111
287	NC_013892	GAG	2	6	21038	21043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
288	NC_013892	CTT	2	6	21051	21056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_013892	AAT	2	6	21083	21088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013892	ATT	2	6	21119	21124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013892	ATT	2	6	21250	21255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473112
292	NC_013892	ATC	2	6	21267	21272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473112
293	NC_013892	GGC	2	6	21327	21332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473112
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295	NC_013892	ACT	2	6	21498	21503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473112
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297	NC_013892	ACG	2	6	21624	21629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473112
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300	NC_013892	AAT	2	6	21810	21815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473112
301	NC_013892	ACC	2	6	21882	21887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473112
302	NC_013892	TAC	2	6	21891	21896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473112
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308	NC_013892	TAT	2	6	22426	22431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_013892	GAT	2	6	22438	22443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
310	NC_013892	AAT	2	6	22543	22548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_013892	ACA	2	6	22831	22836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473113
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314	NC_013892	GCC	2	6	22958	22963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473113
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333	NC_013892	GCG	2	6	23975	23980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473113
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372	NC_013892	GTG	2	6	26511	26516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473115
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378	NC_013892	AAG	2	6	26840	26845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473116
379	NC_013892	TCT	2	6	26882	26887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473116
380	NC_013892	GAT	2	6	26917	26922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473116
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382	NC_013892	CAA	2	6	26991	26996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473116
383	NC_013892	GAC	2	6	27012	27017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473116
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387	NC_013892	GAA	2	6	27204	27209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473116
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403	NC_013892	ACG	2	6	28242	28247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473117
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473	NC_013892	TAA	2	6	33689	33694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_013892	TTC	2	6	35155	35160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473125
499	NC_013892	TGA	2	6	35411	35416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473125
500	NC_013892	GAT	2	6	35485	35490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473125

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