MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954 chromosome

Total Repeats: 1121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013891	AACAAA	2	12	1031	1042	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	289433374
2	NC_013891	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013891	GAAATT	2	12	6230	6241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289433379
4	NC_013891	TTTGAT	2	12	6602	6613	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289433379
5	NC_013891	TCGTAC	2	12	6619	6630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289433379
6	NC_013891	TTATAT	2	12	7636	7647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433379
7	NC_013891	GAAGAT	2	12	9550	9561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289433380
8	NC_013891	AGAAAA	2	12	10996	11007	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289433381
9	NC_013891	TTGAAA	2	12	15395	15406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289433385
10	NC_013891	TGGTTT	2	12	19119	19130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289433387
11	NC_013891	ATTTTC	2	12	19869	19880	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289433388
12	NC_013891	CAATAT	2	12	21272	21283	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289433390
13	NC_013891	TGAAAG	2	12	22333	22344	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289433392
14	NC_013891	GATAAA	2	12	22905	22916	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433392
15	NC_013891	GTAATT	2	12	23600	23611	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289433394
16	NC_013891	AGAAAA	2	12	30220	30231	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013891	TCAAAA	2	12	35042	35053	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	289433405
18	NC_013891	TTTATA	2	12	39961	39972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289433412
19	NC_013891	AGGTAA	2	12	41499	41510	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289433413
20	NC_013891	ATATAA	2	12	44894	44905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013891	AGCAGA	2	12	46036	46047	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289433417
22	NC_013891	AGAAAC	2	12	46933	46944	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289433417
23	NC_013891	AAAAAT	2	12	47179	47190	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289433417
24	NC_013891	AGCGAC	2	12	49826	49837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289433420
25	NC_013891	AAAAGT	2	12	55367	55378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433421
26	NC_013891	GGCAGA	2	12	57906	57917	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289433424
27	NC_013891	TAGAAG	2	12	60553	60564	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289433430
28	NC_013891	TATGGA	2	12	60662	60673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433430
29	NC_013891	TAAAAA	2	12	63758	63769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289433432
30	NC_013891	AAGTAA	2	12	65189	65200	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433434
31	NC_013891	TTTAAA	2	12	66428	66439	50 %	50 %	0 %	0 %	289433435
32	NC_013891	TAGAAA	2	12	66689	66700	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433436
33	NC_013891	TTAAAC	2	12	69643	69654	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289433441
34	NC_013891	AAAGTA	2	12	70608	70619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433442
35	NC_013891	CAGATG	2	12	71217	71228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289433442
36	NC_013891	GAAAAT	2	12	71363	71374	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433443
37	NC_013891	AAAATG	2	12	72030	72041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433444
38	NC_013891	CTTAAA	2	12	72581	72592	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289433444
39	NC_013891	TCGCTT	2	12	76561	76572	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013891	GAACTA	2	12	78918	78929	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289433453
41	NC_013891	TAAAAT	2	12	79904	79915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433454
42	NC_013891	TAATAT	2	12	82686	82697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013891	TATTAG	2	12	87047	87058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289433463
44	NC_013891	TAGCAG	2	12	87110	87121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289433463
45	NC_013891	GGCGGA	2	12	87556	87567	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	289433463
46	NC_013891	TGATTT	2	12	90564	90575	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289433469
47	NC_013891	TAAAAA	2	12	92055	92066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013891	ATCAGA	2	12	93418	93429	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	289433471
49	NC_013891	TTTTCA	2	12	96158	96169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289433475
50	NC_013891	GTTACA	2	12	103065	103076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289433479
51	NC_013891	GACTGC	2	12	103295	103306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289433479
52	NC_013891	AGTGGA	2	12	106880	106891	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	289433482
53	NC_013891	ATTTCT	2	12	116404	116415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289433490
54	NC_013891	TAGAAA	2	12	121635	121646	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433496
55	NC_013891	AAAGCA	2	12	125681	125692	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289433500
56	NC_013891	ACGCTA	2	12	127824	127835	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289433502
57	NC_013891	GACAAG	2	12	130158	130169	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289433504
58	NC_013891	TGGCGG	2	12	142581	142592	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	289433514
59	NC_013891	TCTTTT	2	12	148894	148905	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289433522
60	NC_013891	AAGCAA	2	12	151228	151239	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289433525
61	NC_013891	TTATGG	2	12	152552	152563	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	289433525
62	NC_013891	TTATGA	2	12	155140	155151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289433527
63	NC_013891	ATTATG	2	12	155408	155419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289433528
64	NC_013891	AAAGAT	2	12	156545	156556	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433529
65	NC_013891	CCATCT	2	12	156932	156943	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	289433529
66	NC_013891	AAAAGA	2	12	158431	158442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289433530
67	NC_013891	TGAAGT	2	12	160801	160812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289433530
68	NC_013891	AAAGAA	2	12	161698	161709	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289433531
69	NC_013891	CATTGA	2	12	168944	168955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289433537
70	NC_013891	GAAAAT	2	12	169278	169289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433538
71	NC_013891	ATTGTT	2	12	172089	172100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289433541
72	NC_013891	TTGCAA	2	12	173251	173262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289433542
73	NC_013891	ACGGAA	2	12	180369	180380	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289433549
74	NC_013891	AATATT	2	12	181985	181996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013891	TGAAAG	2	12	183994	184005	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013891	TTTTCT	2	12	188791	188802	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289433555
77	NC_013891	AAAAAT	2	12	189151	189162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289433555
78	NC_013891	GTGAAA	2	12	195612	195623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289433559
79	NC_013891	AGTAAA	2	12	196498	196509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433560
80	NC_013891	TCATTA	2	12	196707	196718	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289433560
81	NC_013891	TTCTTT	2	12	199799	199810	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	289433565
82	NC_013891	TTTACC	2	12	202127	202138	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	289433567
83	NC_013891	GAAAAA	2	12	203112	203123	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289433569
84	NC_013891	AAAAGA	2	12	203807	203818	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289433569
85	NC_013891	TGCTTA	2	12	205844	205855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289433569
86	NC_013891	AAGTAG	2	12	208939	208950	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289433572
87	NC_013891	AGCAGA	2	12	215890	215901	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289433577
88	NC_013891	CGGTAG	2	12	218878	218889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289433580
89	NC_013891	ATTGAT	2	12	219196	219207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289433581
90	NC_013891	ACCAGA	2	12	220216	220227	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	289433582
91	NC_013891	ATTCAA	2	12	222506	222517	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013891	AAGGAA	2	12	224077	224088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013891	TAGGCG	2	12	225731	225742	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013891	ATTTTT	2	12	228169	228180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013891	ATTCAA	2	12	228523	228534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013891	AAGGAA	2	12	230094	230105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013891	TAGGCG	2	12	231748	231759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013891	ACAGAA	2	12	235254	235265	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289433586
99	NC_013891	CGTGTG	2	12	241610	241621	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289433591
100	NC_013891	GCTGTA	2	12	242195	242206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289433591
101	NC_013891	TAAAGG	2	12	242932	242943	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289433591
102	NC_013891	TTATAT	2	12	247907	247918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013891	AAAACA	2	12	248609	248620	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	289433600
104	NC_013891	CTGTAG	2	12	251735	251746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289433605
105	NC_013891	TTATTT	2	12	252876	252887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	289433607
106	NC_013891	TAAAAA	2	12	252993	253004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	289433607
107	NC_013891	GTATCG	2	12	253364	253375	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289433607
108	NC_013891	AAAGCG	2	12	256896	256907	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289433611
109	NC_013891	TTAAAC	2	12	257485	257496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_013891	AAGAAA	2	12	258658	258669	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289433612
111	NC_013891	TTCGTG	2	12	264417	264428	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289433613
112	NC_013891	CTGGTA	2	12	264831	264842	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289433613
113	NC_013891	ATCAAT	2	12	276289	276300	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	289433623
114	NC_013891	GCTTTT	2	12	277741	277752	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	289433625
115	NC_013891	AAAAGA	2	12	279944	279955	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289433627
116	NC_013891	ACGTTG	2	12	281169	281180	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289433628
117	NC_013891	TTAAAA	2	12	286764	286775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289433633
118	NC_013891	TTTTGA	2	12	288541	288552	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289433635
119	NC_013891	TGAATT	2	12	290996	291007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289433637
120	NC_013891	ATGAAA	2	12	292979	292990	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289433638
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352	NC_013891	ATGATA	2	12	935686	935697	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289434257
353	NC_013891	CAAAAG	2	12	937373	937384	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289434258
354	NC_013891	TAAATA	2	12	942064	942075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289434263
355	NC_013891	TGTTTT	2	12	942234	942245	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
356	NC_013891	TTGACT	2	12	945088	945099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
357	NC_013891	GGAACC	2	12	947119	947130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289434268
358	NC_013891	TTAGGC	2	12	950726	950737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289434271
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366	NC_013891	TAATTG	2	12	968347	968358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	289434291
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369	NC_013891	TGATTT	2	12	982088	982099	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	289434304
370	NC_013891	ATTCTT	2	12	982671	982682	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	289434305
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376	NC_013891	TACATC	2	12	986908	986919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289434312
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449	NC_013891	TGAAAA	2	12	1171318	1171329	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289434512
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453	NC_013891	AGATGA	2	12	1177919	1177930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
454	NC_013891	TTTAAT	2	12	1178633	1178644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289434517
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456	NC_013891	GAAAAG	2	12	1180155	1180166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
457	NC_013891	AGGCAA	2	12	1187017	1187028	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289434529
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461	NC_013891	TGACAT	2	12	1195490	1195501	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289434538
462	NC_013891	ATTTAC	2	12	1195974	1195985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289434539
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464	NC_013891	AAGAAA	2	12	1204045	1204056	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	289434549
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500	NC_013891	ATGATA	2	12	1297136	1297147	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	289434646

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