MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954 chromosome

Total Repeats: 2100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013891	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013891	TTAAA	2	10	2566	2575	60 %	40 %	0 %	0 %	289433375
3	NC_013891	TATTC	2	10	2584	2593	20 %	60 %	0 %	20 %	289433375
4	NC_013891	ATTTT	2	10	4499	4508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013891	TCATT	2	10	6861	6870	20 %	60 %	0 %	20 %	289433379
6	NC_013891	AAACT	2	10	7074	7083	60 %	20 %	0 %	20 %	289433379
7	NC_013891	ATGAA	2	10	17240	17249	60 %	20 %	20 %	0 %	289433386
8	NC_013891	GAATG	2	10	18982	18991	40 %	20 %	40 %	0 %	289433387
9	NC_013891	ATTAA	2	10	20646	20655	60 %	40 %	0 %	0 %	289433390
10	NC_013891	AATTA	2	10	23372	23381	60 %	40 %	0 %	0 %	289433393
11	NC_013891	GACCA	2	10	23553	23562	40 %	0 %	20 %	40 %	289433394
12	NC_013891	GATTT	2	10	23814	23823	20 %	60 %	20 %	0 %	289433394
13	NC_013891	ATTTG	2	10	26749	26758	20 %	60 %	20 %	0 %	289433396
14	NC_013891	AATTG	2	10	26830	26839	40 %	40 %	20 %	0 %	289433396
15	NC_013891	TTCAA	2	10	27075	27084	40 %	40 %	0 %	20 %	289433396
16	NC_013891	TTTCT	2	10	27674	27683	0 %	80 %	0 %	20 %	289433397
17	NC_013891	GTCAC	2	10	28321	28330	20 %	20 %	20 %	40 %	289433398
18	NC_013891	TAAAT	2	10	29128	29137	60 %	40 %	0 %	0 %	289433399
19	NC_013891	TAAAA	2	10	30642	30651	80 %	20 %	0 %	0 %	289433400
20	NC_013891	ATTTT	2	10	32016	32025	20 %	80 %	0 %	0 %	289433402
21	NC_013891	ACTGG	2	10	32111	32120	20 %	20 %	40 %	20 %	289433402
22	NC_013891	GTAGA	2	10	34231	34240	40 %	20 %	40 %	0 %	289433404
23	NC_013891	TTACT	2	10	35219	35228	20 %	60 %	0 %	20 %	289433406
24	NC_013891	AAAAG	2	10	35728	35737	80 %	0 %	20 %	0 %	289433407
25	NC_013891	ATGAA	2	10	35875	35884	60 %	20 %	20 %	0 %	289433407
26	NC_013891	AAATT	2	10	36124	36133	60 %	40 %	0 %	0 %	289433407
27	NC_013891	TAAAA	2	10	37225	37234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013891	GTTTT	2	10	37562	37571	0 %	80 %	20 %	0 %	289433410
29	NC_013891	TAATA	2	10	37701	37710	60 %	40 %	0 %	0 %	289433410
30	NC_013891	TTATG	2	10	39428	39437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013891	CTAAC	2	10	39690	39699	40 %	20 %	0 %	40 %	289433412
32	NC_013891	TGATT	2	10	42549	42558	20 %	60 %	20 %	0 %	289433414
33	NC_013891	ATGGT	2	10	43762	43771	20 %	40 %	40 %	0 %	289433415
34	NC_013891	GTTAT	2	10	48330	48339	20 %	60 %	20 %	0 %	289433417
35	NC_013891	ACAAA	2	10	49188	49197	80 %	0 %	0 %	20 %	289433418
36	NC_013891	CAAAA	2	10	49282	49291	80 %	0 %	0 %	20 %	289433418
37	NC_013891	GTAAT	2	10	54808	54817	40 %	40 %	20 %	0 %	289433421
38	NC_013891	GAGAT	2	10	56784	56793	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013891	AAGTA	2	10	57396	57405	60 %	20 %	20 %	0 %	289433424
40	NC_013891	AATGA	2	10	57436	57445	60 %	20 %	20 %	0 %	289433424
41	NC_013891	TGTTT	2	10	59113	59122	0 %	80 %	20 %	0 %	289433427
42	NC_013891	GAAAT	3	15	59248	59262	60 %	20 %	20 %	0 %	289433427
43	NC_013891	TGTTT	2	10	59333	59342	0 %	80 %	20 %	0 %	289433427
44	NC_013891	ACTTA	2	10	59496	59505	40 %	40 %	0 %	20 %	289433428
45	NC_013891	CTATT	2	10	59934	59943	20 %	60 %	0 %	20 %	289433429
46	NC_013891	ATGGA	2	10	60285	60294	40 %	20 %	40 %	0 %	289433429
47	NC_013891	GGGAA	2	10	63785	63794	40 %	0 %	60 %	0 %	289433432
48	NC_013891	AAAAT	2	10	65741	65750	80 %	20 %	0 %	0 %	289433435
49	NC_013891	TTTTC	2	10	66611	66620	0 %	80 %	0 %	20 %	289433436
50	NC_013891	TTATT	2	10	67625	67634	20 %	80 %	0 %	0 %	289433438
51	NC_013891	ATATA	2	10	68834	68843	60 %	40 %	0 %	0 %	289433440
52	NC_013891	ATAGA	2	10	68970	68979	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013891	TTTTG	2	10	70252	70261	0 %	80 %	20 %	0 %	289433442
54	NC_013891	AAGTA	2	10	71411	71420	60 %	20 %	20 %	0 %	289433443
55	NC_013891	GAAAA	2	10	72531	72540	80 %	0 %	20 %	0 %	289433444
56	NC_013891	ATTTT	2	10	72933	72942	20 %	80 %	0 %	0 %	289433445
57	NC_013891	TTAAT	2	10	73003	73012	40 %	60 %	0 %	0 %	289433445
58	NC_013891	ACTAA	2	10	74487	74496	60 %	20 %	0 %	20 %	289433447
59	NC_013891	TGGCA	2	10	75990	75999	20 %	20 %	40 %	20 %	289433449
60	NC_013891	GAAAA	2	10	78484	78493	80 %	0 %	20 %	0 %	289433452
61	NC_013891	TGCGA	2	10	78798	78807	20 %	20 %	40 %	20 %	289433453
62	NC_013891	TATGA	2	10	79182	79191	40 %	40 %	20 %	0 %	289433453
63	NC_013891	AAATG	2	10	79643	79652	60 %	20 %	20 %	0 %	289433453
64	NC_013891	AAATT	2	10	80415	80424	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013891	ACATA	2	10	80438	80447	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013891	CACTT	2	10	82400	82409	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013891	CGCTA	2	10	88873	88882	20 %	20 %	20 %	40 %	289433465
68	NC_013891	TATCA	2	10	89911	89920	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013891	TACGA	2	10	90785	90794	40 %	20 %	20 %	20 %	289433469
70	NC_013891	AGTGA	2	10	93342	93351	40 %	20 %	40 %	0 %	289433471
71	NC_013891	CAAAT	2	10	93776	93785	60 %	20 %	0 %	20 %	289433472
72	NC_013891	CTATT	2	10	95163	95172	20 %	60 %	0 %	20 %	289433473
73	NC_013891	TTTAT	2	10	95253	95262	20 %	80 %	0 %	0 %	289433473
74	NC_013891	TAAAA	2	10	95455	95464	80 %	20 %	0 %	0 %	289433473
75	NC_013891	AAACA	2	10	95784	95793	80 %	0 %	0 %	20 %	289433474
76	NC_013891	TATTG	2	10	96328	96337	20 %	60 %	20 %	0 %	289433475
77	NC_013891	TTATC	2	10	96597	96606	20 %	60 %	0 %	20 %	289433475
78	NC_013891	TTTAC	2	10	96745	96754	20 %	60 %	0 %	20 %	289433475
79	NC_013891	CCAAA	2	10	101271	101280	60 %	0 %	0 %	40 %	289433478
80	NC_013891	AAATT	2	10	103504	103513	60 %	40 %	0 %	0 %	289433479
81	NC_013891	CGTTT	2	10	104288	104297	0 %	60 %	20 %	20 %	289433479
82	NC_013891	CTTTT	2	10	105200	105209	0 %	80 %	0 %	20 %	289433479
83	NC_013891	AAAAG	2	10	105319	105328	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013891	TAAAA	2	10	105781	105790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013891	AAAAG	2	10	107687	107696	80 %	0 %	20 %	0 %	289433482
86	NC_013891	TTTAC	2	10	114054	114063	20 %	60 %	0 %	20 %	289433487
87	NC_013891	TAACT	2	10	114931	114940	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013891	GAGAA	2	10	115039	115048	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013891	AAATG	2	10	116129	116138	60 %	20 %	20 %	0 %	289433490
90	NC_013891	AAATA	2	10	117329	117338	80 %	20 %	0 %	0 %	289433492
91	NC_013891	TTTTA	2	10	117449	117458	20 %	80 %	0 %	0 %	289433492
92	NC_013891	TAATT	2	10	117564	117573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013891	TTGAT	2	10	118446	118455	20 %	60 %	20 %	0 %	289433494
94	NC_013891	TTACT	2	10	118851	118860	20 %	60 %	0 %	20 %	289433495
95	NC_013891	AGAGA	2	10	119117	119126	60 %	0 %	40 %	0 %	289433495
96	NC_013891	TTGTT	2	10	120292	120301	0 %	80 %	20 %	0 %	289433495
97	NC_013891	ATCAA	2	10	121506	121515	60 %	20 %	0 %	20 %	289433496
98	NC_013891	ATTTA	2	10	123024	123033	40 %	60 %	0 %	0 %	289433497
99	NC_013891	AAAAT	2	10	123594	123603	80 %	20 %	0 %	0 %	289433497
100	NC_013891	TTATT	2	10	124603	124612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013891	AGGCA	2	10	124738	124747	40 %	0 %	40 %	20 %	289433500
102	NC_013891	AACTT	2	10	124919	124928	40 %	40 %	0 %	20 %	289433500
103	NC_013891	ACAAA	2	10	125021	125030	80 %	0 %	0 %	20 %	289433500
104	NC_013891	TATTT	2	10	126509	126518	20 %	80 %	0 %	0 %	289433501
105	NC_013891	TTCCA	2	10	126652	126661	20 %	40 %	0 %	40 %	289433501
106	NC_013891	GTGTC	2	10	128384	128393	0 %	40 %	40 %	20 %	289433503
107	NC_013891	TAAGT	2	10	128883	128892	40 %	40 %	20 %	0 %	289433503
108	NC_013891	AAATA	2	10	129308	129317	80 %	20 %	0 %	0 %	289433503
109	NC_013891	ACGGC	2	10	129472	129481	20 %	0 %	40 %	40 %	289433503
110	NC_013891	AATTT	2	10	129730	129739	40 %	60 %	0 %	0 %	289433503
111	NC_013891	GATAA	2	10	129897	129906	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013891	TTTGT	2	10	133262	133271	0 %	80 %	20 %	0 %	289433507
113	NC_013891	GCGAT	2	10	133660	133669	20 %	20 %	40 %	20 %	289433507
114	NC_013891	ACTTT	2	10	134063	134072	20 %	60 %	0 %	20 %	289433507
115	NC_013891	ATGAA	2	10	136339	136348	60 %	20 %	20 %	0 %	289433509
116	NC_013891	ATGAA	2	10	137219	137228	60 %	20 %	20 %	0 %	289433510
117	NC_013891	TAGAA	2	10	140504	140513	60 %	20 %	20 %	0 %	289433512
118	NC_013891	GAATA	2	10	141359	141368	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013891	TTTAC	2	10	141892	141901	20 %	60 %	0 %	20 %	289433514
120	NC_013891	GGAAT	2	10	144805	144814	40 %	20 %	40 %	0 %	289433516
121	NC_013891	AAGAT	2	10	145226	145235	60 %	20 %	20 %	0 %	289433516
122	NC_013891	GAATT	2	10	145597	145606	40 %	40 %	20 %	0 %	289433517
123	NC_013891	TTTTA	2	10	145830	145839	20 %	80 %	0 %	0 %	289433517
124	NC_013891	ATTTT	2	10	148197	148206	20 %	80 %	0 %	0 %	289433521
125	NC_013891	AACGA	2	10	148377	148386	60 %	0 %	20 %	20 %	289433521
126	NC_013891	AAATA	2	10	148649	148658	80 %	20 %	0 %	0 %	289433521
127	NC_013891	ACAAA	2	10	149711	149720	80 %	0 %	0 %	20 %	289433523
128	NC_013891	AAAGA	2	10	150880	150889	80 %	0 %	20 %	0 %	289433524
129	NC_013891	TTTAC	2	10	155668	155677	20 %	60 %	0 %	20 %	289433528
130	NC_013891	AAACC	2	10	158763	158772	60 %	0 %	0 %	40 %	289433530
131	NC_013891	CGTAT	2	10	159681	159690	20 %	40 %	20 %	20 %	289433530
132	NC_013891	GCTCA	2	10	160134	160143	20 %	20 %	20 %	40 %	289433530
133	NC_013891	TCCAT	2	10	161404	161413	20 %	40 %	0 %	40 %	289433531
134	NC_013891	TACCG	2	10	161467	161476	20 %	20 %	20 %	40 %	289433531
135	NC_013891	GTAAA	2	10	163067	163076	60 %	20 %	20 %	0 %	289433531
136	NC_013891	ATTTC	2	10	163751	163760	20 %	60 %	0 %	20 %	289433532
137	NC_013891	GATAT	2	10	163975	163984	40 %	40 %	20 %	0 %	289433532
138	NC_013891	CAAAT	2	10	166636	166645	60 %	20 %	0 %	20 %	289433534
139	NC_013891	ATAGA	2	10	169241	169250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_013891	TAAAA	2	10	184541	184550	80 %	20 %	0 %	0 %	289433552
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261	NC_013891	GTACC	2	10	315439	315448	20 %	20 %	20 %	40 %	289433654
262	NC_013891	TACAT	2	10	315696	315705	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_013891	GCCCC	2	10	319456	319465	0 %	0 %	20 %	80 %	289433657
268	NC_013891	CTATG	2	10	319722	319731	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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