MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013890	CTTTA	2	10	3482	3491	20 %	60 %	0 %	20 %	289431958
2	NC_013890	GCTGG	2	10	3493	3502	0 %	20 %	60 %	20 %	289431958
3	NC_013890	ATTTC	2	10	5800	5809	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013890	GTTTG	2	10	7248	7257	0 %	60 %	40 %	0 %	289431960
5	NC_013890	GCATG	2	10	8589	8598	20 %	20 %	40 %	20 %	289431961
6	NC_013890	GCTCA	2	10	9412	9421	20 %	20 %	20 %	40 %	289431961
7	NC_013890	ACTGA	2	10	12500	12509	40 %	20 %	20 %	20 %	289431965
8	NC_013890	CTTAG	2	10	12836	12845	20 %	40 %	20 %	20 %	289431965
9	NC_013890	GGGGT	2	10	13770	13779	0 %	20 %	80 %	0 %	289431966
10	NC_013890	TCGGG	2	10	14626	14635	0 %	20 %	60 %	20 %	289431967
11	NC_013890	GTGAA	2	10	15198	15207	40 %	20 %	40 %	0 %	289431968
12	NC_013890	CTGAA	2	10	15471	15480	40 %	20 %	20 %	20 %	289431968
13	NC_013890	ATGAA	2	10	16736	16745	60 %	20 %	20 %	0 %	289431970
14	NC_013890	CGCTC	2	10	17524	17533	0 %	20 %	20 %	60 %	289431970
15	NC_013890	TATTC	2	10	17825	17834	20 %	60 %	0 %	20 %	289431971
16	NC_013890	TAAAA	2	10	18489	18498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013890	GGCCT	2	10	18590	18599	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013890	TAATT	2	10	19571	19580	40 %	60 %	0 %	0 %	289431974
19	NC_013890	GGGCT	2	10	19873	19882	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013890	TTTCT	2	10	21314	21323	0 %	80 %	0 %	20 %	289431976
21	NC_013890	CTGTG	2	10	21715	21724	0 %	40 %	40 %	20 %	289431977
22	NC_013890	CGGCA	2	10	22187	22196	20 %	0 %	40 %	40 %	289431977
23	NC_013890	GGCAG	2	10	22405	22414	20 %	0 %	60 %	20 %	289431977
24	NC_013890	CAGGT	2	10	22416	22425	20 %	20 %	40 %	20 %	289431977
25	NC_013890	CATAT	2	10	23786	23795	40 %	40 %	0 %	20 %	289431978
26	NC_013890	GGGCA	2	10	23920	23929	20 %	0 %	60 %	20 %	289431978
27	NC_013890	CGGGG	2	10	24528	24537	0 %	0 %	80 %	20 %	289431979
28	NC_013890	TTGCT	2	10	29545	29554	0 %	60 %	20 %	20 %	289431985
29	NC_013890	ACCGC	2	10	31565	31574	20 %	0 %	20 %	60 %	289431988
30	NC_013890	ATTTC	2	10	33879	33888	20 %	60 %	0 %	20 %	289431990
31	NC_013890	ATGGT	2	10	36346	36355	20 %	40 %	40 %	0 %	289431994
32	NC_013890	TATCT	2	10	41525	41534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013890	GGCGG	2	10	42439	42448	0 %	0 %	80 %	20 %	289432002
34	NC_013890	CTGAA	2	10	43755	43764	40 %	20 %	20 %	20 %	289432002
35	NC_013890	CTGAT	2	10	44016	44025	20 %	40 %	20 %	20 %	289432002
36	NC_013890	CAGCT	2	10	46645	46654	20 %	20 %	20 %	40 %	289432005
37	NC_013890	GTGAA	2	10	48101	48110	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013890	TCCCG	2	10	50409	50418	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_013890	GCTTT	2	10	50497	50506	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013890	AGGTG	2	10	51597	51606	20 %	20 %	60 %	0 %	289432006
41	NC_013890	GTTCG	2	10	52365	52374	0 %	40 %	40 %	20 %	289432006
42	NC_013890	TAAAA	2	10	53211	53220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013890	GGAAT	2	10	53621	53630	40 %	20 %	40 %	0 %	289432007
44	NC_013890	TGAAA	2	10	54326	54335	60 %	20 %	20 %	0 %	289432007
45	NC_013890	GCCGC	2	10	54491	54500	0 %	0 %	40 %	60 %	289432007
46	NC_013890	TACCT	2	10	56238	56247	20 %	40 %	0 %	40 %	289432010
47	NC_013890	TGTTT	2	10	57899	57908	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013890	CCATC	2	10	58738	58747	20 %	20 %	0 %	60 %	289432011
49	NC_013890	ATGTT	2	10	60160	60169	20 %	60 %	20 %	0 %	289432013
50	NC_013890	CTTCC	2	10	60852	60861	0 %	40 %	0 %	60 %	289432014
51	NC_013890	AGCTG	2	10	63785	63794	20 %	20 %	40 %	20 %	289432016
52	NC_013890	TTCTA	2	10	64554	64563	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013890	AGATG	2	10	64820	64829	40 %	20 %	40 %	0 %	289432017
54	NC_013890	CGACG	2	10	67337	67346	20 %	0 %	40 %	40 %	289432017
55	NC_013890	GTTCT	2	10	67780	67789	0 %	60 %	20 %	20 %	289432018
56	NC_013890	TACGT	2	10	67949	67958	20 %	40 %	20 %	20 %	289432018
57	NC_013890	AAGAT	2	10	68532	68541	60 %	20 %	20 %	0 %	289432018
58	NC_013890	GTTTT	2	10	70357	70366	0 %	80 %	20 %	0 %	289432018
59	NC_013890	TTTTA	2	10	70667	70676	20 %	80 %	0 %	0 %	289432018
60	NC_013890	CTTCC	2	10	72657	72666	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_013890	AATTG	2	10	73892	73901	40 %	40 %	20 %	0 %	289432020
62	NC_013890	TCAAC	2	10	75237	75246	40 %	20 %	0 %	40 %	289432021
63	NC_013890	CCTTC	2	10	78438	78447	0 %	40 %	0 %	60 %	289432026
64	NC_013890	CCCTG	2	10	79447	79456	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_013890	GTTCA	2	10	79574	79583	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013890	GCTTC	2	10	79617	79626	0 %	40 %	20 %	40 %	289432029
67	NC_013890	CAAGC	2	10	81137	81146	40 %	0 %	20 %	40 %	289432030
68	NC_013890	ATAGG	2	10	81549	81558	40 %	20 %	40 %	0 %	289432030
69	NC_013890	TTTCG	2	10	84071	84080	0 %	60 %	20 %	20 %	289432033
70	NC_013890	CCTGT	2	10	84748	84757	0 %	40 %	20 %	40 %	289432033
71	NC_013890	TTAAA	2	10	85348	85357	60 %	40 %	0 %	0 %	289432035
72	NC_013890	ACCGC	2	10	87007	87016	20 %	0 %	20 %	60 %	289432038
73	NC_013890	CTTGC	2	10	89878	89887	0 %	40 %	20 %	40 %	289432043
74	NC_013890	ATCTC	2	10	90569	90578	20 %	40 %	0 %	40 %	289432043
75	NC_013890	TGCTG	2	10	94683	94692	0 %	40 %	40 %	20 %	289432052
76	NC_013890	CTTTC	2	10	97120	97129	0 %	60 %	0 %	40 %	289432058
77	NC_013890	TATGG	2	10	99828	99837	20 %	40 %	40 %	0 %	289432062
78	NC_013890	TTCTC	2	10	102161	102170	0 %	60 %	0 %	40 %	289432064
79	NC_013890	GGAAG	2	10	103523	103532	40 %	0 %	60 %	0 %	289432066
80	NC_013890	AACAA	2	10	104016	104025	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013890	CTCTT	2	10	107307	107316	0 %	60 %	0 %	40 %	289432068
82	NC_013890	GGGCA	2	10	107612	107621	20 %	0 %	60 %	20 %	289432068
83	NC_013890	TGTAT	2	10	110183	110192	20 %	60 %	20 %	0 %	289432072
84	NC_013890	GGTTT	2	10	111849	111858	0 %	60 %	40 %	0 %	289432075
85	NC_013890	AATTC	2	10	113540	113549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013890	TGACC	2	10	113634	113643	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_013890	GATTT	2	10	117258	117267	20 %	60 %	20 %	0 %	289432080
88	NC_013890	TAGGG	2	10	120386	120395	20 %	20 %	60 %	0 %	289432082
89	NC_013890	GAACC	2	10	122757	122766	40 %	0 %	20 %	40 %	289432083
90	NC_013890	ATAAA	2	10	125044	125053	80 %	20 %	0 %	0 %	289432085
91	NC_013890	GCTGG	2	10	127195	127204	0 %	20 %	60 %	20 %	289432087
92	NC_013890	GCTGT	2	10	127358	127367	0 %	40 %	40 %	20 %	289432087
93	NC_013890	TTCGG	2	10	129045	129054	0 %	40 %	40 %	20 %	289432089
94	NC_013890	CGCGG	2	10	133373	133382	0 %	0 %	60 %	40 %	289432092
95	NC_013890	GTAAA	2	10	135263	135272	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013890	AAATG	2	10	135457	135466	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013890	TCATC	2	10	136235	136244	20 %	40 %	0 %	40 %	289432094
98	NC_013890	CCGGC	2	10	139685	139694	0 %	0 %	40 %	60 %	289432098
99	NC_013890	GTAAA	2	10	141425	141434	60 %	20 %	20 %	0 %	289432099
100	NC_013890	GAAGC	2	10	141679	141688	40 %	0 %	40 %	20 %	289432099
101	NC_013890	GGGCT	2	10	143023	143032	0 %	20 %	60 %	20 %	289432100
102	NC_013890	TCATT	2	10	143344	143353	20 %	60 %	0 %	20 %	289432100
103	NC_013890	ATGAA	2	10	143376	143385	60 %	20 %	20 %	0 %	289432100
104	NC_013890	TTCTT	2	10	144033	144042	0 %	80 %	0 %	20 %	289432102
105	NC_013890	GAAGG	2	10	145419	145428	40 %	0 %	60 %	0 %	289432102
106	NC_013890	GGCAG	2	10	145511	145520	20 %	0 %	60 %	20 %	289432102
107	NC_013890	GCAGG	2	10	146570	146579	20 %	0 %	60 %	20 %	289432103
108	NC_013890	AGGGA	2	10	147194	147203	40 %	0 %	60 %	0 %	289432103
109	NC_013890	GGGTG	2	10	147664	147673	0 %	20 %	80 %	0 %	289432104
110	NC_013890	GGGCA	2	10	153644	153653	20 %	0 %	60 %	20 %	289432107
111	NC_013890	GGGGC	2	10	155715	155724	0 %	0 %	80 %	20 %	289432111
112	NC_013890	ACGGA	2	10	157585	157594	40 %	0 %	40 %	20 %	289432114
113	NC_013890	TAAAC	2	10	161109	161118	60 %	20 %	0 %	20 %	289432117
114	NC_013890	ATTTC	2	10	162849	162858	20 %	60 %	0 %	20 %	289432119
115	NC_013890	TAAAA	2	10	162904	162913	80 %	20 %	0 %	0 %	289432120
116	NC_013890	TCTGG	2	10	163325	163334	0 %	40 %	40 %	20 %	289432120
117	NC_013890	ATACT	2	10	163480	163489	40 %	40 %	0 %	20 %	289432120
118	NC_013890	GGACT	2	10	163534	163543	20 %	20 %	40 %	20 %	289432120
119	NC_013890	GCTTG	2	10	167619	167628	0 %	40 %	40 %	20 %	289432125
120	NC_013890	CTGAC	2	10	167714	167723	20 %	20 %	20 %	40 %	289432125
121	NC_013890	TAACA	2	10	171480	171489	60 %	20 %	0 %	20 %	289432130
122	NC_013890	GGTGC	2	10	172857	172866	0 %	20 %	60 %	20 %	289432131
123	NC_013890	TCATC	2	10	174557	174566	20 %	40 %	0 %	40 %	289432133
124	NC_013890	GACAA	2	10	176622	176631	60 %	0 %	20 %	20 %	289432134
125	NC_013890	CCATA	2	10	179713	179722	40 %	20 %	0 %	40 %	289432138
126	NC_013890	GAAAG	2	10	182421	182430	60 %	0 %	40 %	0 %	289432142
127	NC_013890	CACAG	2	10	184856	184865	40 %	0 %	20 %	40 %	289432148
128	NC_013890	GAGAT	2	10	188972	188981	40 %	20 %	40 %	0 %	289432157
129	NC_013890	TATTT	2	10	189213	189222	20 %	80 %	0 %	0 %	289432157
130	NC_013890	GCAAG	2	10	189663	189672	40 %	0 %	40 %	20 %	289432157
131	NC_013890	GCGGT	2	10	192534	192543	0 %	20 %	60 %	20 %	289432162
132	NC_013890	TTTAA	2	10	194193	194202	40 %	60 %	0 %	0 %	289432165
133	NC_013890	GACAG	2	10	194792	194801	40 %	0 %	40 %	20 %	289432167
134	NC_013890	CGAAA	2	10	195470	195479	60 %	0 %	20 %	20 %	289432167
135	NC_013890	CCTAT	2	10	197991	198000	20 %	40 %	0 %	40 %	289432170
136	NC_013890	GCTTG	2	10	198403	198412	0 %	40 %	40 %	20 %	289432170
137	NC_013890	CTGAA	2	10	199965	199974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013890	CAGGG	2	10	200093	200102	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013890	GGAAG	2	10	201101	201110	40 %	0 %	60 %	0 %	289432174
140	NC_013890	GAATG	2	10	202457	202466	40 %	20 %	40 %	0 %	289432177
141	NC_013890	GAGGG	2	10	202681	202690	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013890	ACCCT	2	10	205283	205292	20 %	20 %	0 %	60 %	289432178
143	NC_013890	GGCAA	3	15	207208	207222	40 %	0 %	40 %	20 %	289432179
144	NC_013890	TGATC	2	10	214870	214879	20 %	40 %	20 %	20 %	289432184
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146	NC_013890	TTTTA	2	10	220953	220962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013890	AGGTG	2	10	221003	221012	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013890	AGAAA	2	10	224786	224795	80 %	0 %	20 %	0 %	289432193
149	NC_013890	GTTCT	2	10	225509	225518	0 %	60 %	20 %	20 %	289432194
150	NC_013890	TAAGC	2	10	226217	226226	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_013890	GCAGG	2	10	226895	226904	20 %	0 %	60 %	20 %	289432195
152	NC_013890	CTGGC	2	10	230911	230920	0 %	20 %	40 %	40 %	289432197
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154	NC_013890	GGCAG	2	10	234329	234338	20 %	0 %	60 %	20 %	289432202
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158	NC_013890	GGGGC	2	10	238054	238063	0 %	0 %	80 %	20 %	289432204
159	NC_013890	GCTGA	2	10	239529	239538	20 %	20 %	40 %	20 %	289432206
160	NC_013890	CTTTT	2	10	242623	242632	0 %	80 %	0 %	20 %	289432210
161	NC_013890	CACCC	2	10	243220	243229	20 %	0 %	0 %	80 %	289432212
162	NC_013890	CGGAG	2	10	243281	243290	20 %	0 %	60 %	20 %	289432212
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165	NC_013890	ATGAA	2	10	248546	248555	60 %	20 %	20 %	0 %	289432216
166	NC_013890	GCGGG	2	10	251199	251208	0 %	0 %	80 %	20 %	289432219
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172	NC_013890	TGTGC	2	10	262763	262772	0 %	40 %	40 %	20 %	289432231
173	NC_013890	TGCCT	2	10	262790	262799	0 %	40 %	20 %	40 %	289432231
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179	NC_013890	CCGGC	2	10	276349	276358	0 %	0 %	40 %	60 %	289432243
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183	NC_013890	ATTAG	2	10	280218	280227	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013890	CCTGA	2	10	285741	285750	20 %	20 %	20 %	40 %	289432252
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192	NC_013890	TACCA	2	10	293824	293833	40 %	20 %	0 %	40 %	289432260
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199	NC_013890	TTACC	2	10	300311	300320	20 %	40 %	0 %	40 %	289432265
200	NC_013890	ACCGC	2	10	300885	300894	20 %	0 %	20 %	60 %	289432266
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241	NC_013890	GGTCT	2	10	366112	366121	0 %	40 %	40 %	20 %	289432332
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243	NC_013890	TTGGG	2	10	366931	366940	0 %	40 %	60 %	0 %	289432334
244	NC_013890	TACAA	2	10	369246	369255	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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253	NC_013890	GTCAG	2	10	384221	384230	20 %	20 %	40 %	20 %	289432356
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259	NC_013890	TTACC	2	10	389277	389286	20 %	40 %	0 %	40 %	289432362
260	NC_013890	ATTTG	2	10	389772	389781	20 %	60 %	20 %	0 %	289432362
261	NC_013890	GATAA	2	10	393125	393134	60 %	20 %	20 %	0 %	289432366
262	NC_013890	GGGTA	2	10	394304	394313	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
263	NC_013890	GCAGA	2	10	395021	395030	40 %	0 %	40 %	20 %	289432370
264	NC_013890	TTTGC	2	10	395592	395601	0 %	60 %	20 %	20 %	289432371
265	NC_013890	TTGTA	2	10	397591	397600	20 %	60 %	20 %	0 %	289432376
266	NC_013890	GGTTT	2	10	397787	397796	0 %	60 %	40 %	0 %	289432377
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