MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 1524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013890	AGG	2	6	11	16	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013890	GTT	3	9	1616	1624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013890	TTA	4	12	1808	1819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013890	TAA	2	6	3860	3865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013890	AGA	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013890	TAA	2	6	8211	8216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013890	CAG	2	6	8237	8242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013890	CCT	2	6	11371	11376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013890	CCG	2	6	12342	12347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_013890	GAA	2	6	12389	12394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013890	AGC	3	9	13871	13879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013890	GGT	2	6	14808	14813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013890	GGA	2	6	14838	14843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013890	AGG	2	6	15574	15579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013890	CAG	2	6	16405	16410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013890	CCT	2	6	18225	18230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_013890	CAA	2	6	18379	18384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013890	CTG	2	6	18607	18612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013890	GAA	2	6	18634	18639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013890	ATA	2	6	18664	18669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013890	TGG	2	6	18740	18745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013890	GCC	2	6	18785	18790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013890	ATG	3	9	18900	18908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013890	TAT	2	6	18938	18943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013890	TAG	2	6	18981	18986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013890	AAT	2	6	19001	19006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013890	GCA	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013890	CAG	3	9	19965	19973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013890	GTC	2	6	20097	20102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013890	CAG	2	6	20127	20132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013890	GAC	2	6	20221	20226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013890	ATC	2	6	20301	20306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013890	CAG	2	6	20328	20333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013890	CTG	2	6	20404	20409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013890	ACC	2	6	20434	20439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013890	TGG	2	6	20494	20499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013890	GAT	2	6	20568	20573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013890	AGG	2	6	20695	20700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013890	ATA	2	6	21127	21132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013890	CGG	2	6	21358	21363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013890	TCC	2	6	24262	24267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013890	GCT	2	6	29078	29083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013890	AAT	2	6	29088	29093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013890	ATG	2	6	29108	29113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013890	GTT	2	6	29114	29119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013890	AGG	2	6	29300	29305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013890	CAG	2	6	32004	32009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013890	GTG	2	6	34649	34654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013890	TTC	2	6	34663	34668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013890	TGG	2	6	34881	34886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013890	CAG	2	6	34924	34929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013890	CCA	2	6	35025	35030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013890	CTT	2	6	35058	35063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013890	CCT	2	6	35125	35130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_013890	ATT	2	6	35160	35165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013890	ATA	2	6	36017	36022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013890	TAT	2	6	36032	36037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013890	TTA	2	6	36546	36551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013890	TAT	2	6	36566	36571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013890	TTA	2	6	36761	36766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013890	TAA	2	6	36778	36783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013890	TCC	2	6	38644	38649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013890	AGA	2	6	41464	41469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013890	ATT	2	6	41480	41485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013890	TGA	2	6	41499	41504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013890	GGC	2	6	45845	45850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013890	TCT	2	6	45899	45904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013890	ATG	2	6	45908	45913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013890	ATA	2	6	47155	47160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013890	TAC	2	6	47297	47302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013890	TGG	2	6	47347	47352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013890	ATT	2	6	47549	47554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013890	TAG	2	6	47559	47564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013890	AAG	2	6	47638	47643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013890	CCG	2	6	47804	47809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013890	TGA	2	6	47837	47842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013890	GAA	2	6	47965	47970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013890	CGA	2	6	47976	47981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013890	GTT	2	6	48152	48157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013890	AGC	2	6	48466	48471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013890	GTG	2	6	48508	48513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013890	AAC	2	6	48619	48624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013890	CAG	2	6	48775	48780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013890	TTA	2	6	48782	48787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013890	CAC	2	6	48794	48799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013890	AGG	2	6	48825	48830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013890	TGG	2	6	48921	48926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013890	GAG	2	6	49237	49242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013890	CGG	2	6	49281	49286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013890	AAC	2	6	49356	49361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013890	TGG	2	6	49531	49536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013890	TGG	2	6	49606	49611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013890	CCT	2	6	49633	49638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013890	TCG	2	6	49884	49889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013890	CGT	2	6	49964	49969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013890	CGT	2	6	49990	49995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013890	GTT	2	6	50068	50073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013890	TGG	2	6	50379	50384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013890	ACC	2	6	50400	50405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013890	AGG	2	6	50456	50461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013890	TAA	2	6	50638	50643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013890	TGC	2	6	53373	53378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013890	ATT	2	6	53440	53445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013890	TCT	2	6	53528	53533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013890	CCA	2	6	57633	57638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013890	CTC	2	6	57879	57884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_013890	TCA	2	6	57918	57923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013890	CTA	2	6	61642	61647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013890	CAA	2	6	61673	61678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013890	GGT	2	6	77023	77028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013890	AAT	2	6	77035	77040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013890	TAT	2	6	77133	77138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013890	ATT	2	6	77148	77153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013890	CCT	2	6	77714	77719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013890	CCT	2	6	79016	79021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013890	TCC	2	6	79270	79275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013890	CCG	2	6	79375	79380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_013890	TAG	2	6	80908	80913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013890	TGT	2	6	81658	81663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013890	CAA	2	6	81704	81709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013890	AAT	2	6	81765	81770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013890	GAT	2	6	81799	81804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013890	ATT	2	6	81812	81817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013890	TGA	2	6	81857	81862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013890	TAC	2	6	91860	91865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013890	CCT	2	6	93615	93620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_013890	CCT	2	6	94214	94219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_013890	CCT	2	6	94452	94457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_013890	ATA	2	6	94470	94475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013890	TCC	2	6	94704	94709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_013890	CCT	2	6	95049	95054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013890	TAA	2	6	95184	95189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013890	CCT	2	6	96797	96802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_013890	ACC	2	6	96875	96880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013890	ACC	2	6	98167	98172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013890	CAT	2	6	98177	98182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013890	CTG	2	6	98185	98190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013890	CTT	2	6	98216	98221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013890	TCC	2	6	101948	101953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_013890	ATC	2	6	102020	102025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013890	GTA	2	6	102326	102331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013890	TAT	2	6	102425	102430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013890	AGG	2	6	102439	102444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013890	GAG	2	6	102446	102451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013890	ATC	2	6	103831	103836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013890	CGC	2	6	103911	103916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_013890	TGT	2	6	103929	103934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013890	TGA	2	6	103950	103955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013890	TAT	2	6	104088	104093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013890	GTC	2	6	104128	104133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013890	CTT	2	6	104268	104273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013890	TCC	2	6	104286	104291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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161	NC_013890	CTG	2	6	104896	104901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_013890	TAA	2	6	104906	104911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013890	TTG	2	6	105023	105028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013890	AGC	2	6	105144	105149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_013890	TGA	2	6	105204	105209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013890	ATT	2	6	105216	105221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013890	ATA	2	6	107939	107944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_013890	ATT	2	6	107950	107955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013890	TAT	2	6	107974	107979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013890	ATT	2	6	108061	108066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013890	ATA	3	9	109320	109328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013890	GTA	2	6	109332	109337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013890	ATA	2	6	109688	109693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013890	TCC	2	6	110476	110481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_013890	CCT	2	6	110521	110526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
176	NC_013890	TAA	2	6	111083	111088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013890	TAT	2	6	111089	111094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_013890	ATA	2	6	111165	111170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_013890	ACT	2	6	111199	111204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_013890	CTG	2	6	113050	113055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_013890	CCT	2	6	113060	113065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_013890	ATC	2	6	113105	113110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_013890	CCT	2	6	113155	113160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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192	NC_013890	TAT	2	6	115083	115088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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