MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 14724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013890	AGC	2	6	277	282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431956
2	NC_013890	ACG	2	6	357	362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431956
3	NC_013890	TAC	2	6	454	459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431956
4	NC_013890	GCT	2	6	512	517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431956
5	NC_013890	GCC	2	6	629	634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431956
6	NC_013890	CCG	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431956
7	NC_013890	TCT	2	6	788	793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431956
8	NC_013890	GAA	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431956
9	NC_013890	GAT	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431956
10	NC_013890	GAA	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431956
11	NC_013890	CCG	2	6	1040	1045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431956
12	NC_013890	GCC	2	6	1352	1357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431956
13	NC_013890	ACA	2	6	1408	1413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289431956
14	NC_013890	GAA	2	6	1455	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431956
15	NC_013890	ACC	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431956
16	NC_013890	CGG	2	6	1949	1954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
17	NC_013890	CGG	2	6	1997	2002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
18	NC_013890	CGG	2	6	2018	2023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
19	NC_013890	CGG	2	6	2027	2032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
20	NC_013890	GGT	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431957
21	NC_013890	CTA	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431957
22	NC_013890	GGA	2	6	2201	2206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289431957
23	NC_013890	GCG	2	6	2353	2358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
24	NC_013890	TAT	2	6	2402	2407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431957
25	NC_013890	CTG	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431957
26	NC_013890	TAC	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431957
27	NC_013890	CTG	2	6	2640	2645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431957
28	NC_013890	GAT	2	6	2670	2675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431957
29	NC_013890	GGT	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431957
30	NC_013890	GAA	2	6	2784	2789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431957
31	NC_013890	AAG	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431957
32	NC_013890	CTG	2	6	2865	2870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431957
33	NC_013890	GCG	2	6	2904	2909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
34	NC_013890	ATT	2	6	3036	3041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431957
35	NC_013890	AGG	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289431957
36	NC_013890	TAT	2	6	3305	3310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431958
37	NC_013890	AAG	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431958
38	NC_013890	ATA	2	6	3545	3550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431958
39	NC_013890	TGA	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431958
40	NC_013890	CAG	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431958
41	NC_013890	CTT	2	6	3678	3683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431958
42	NC_013890	CGG	2	6	3735	3740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431958
43	NC_013890	CAG	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431959
44	NC_013890	GGC	2	6	3972	3977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431959
45	NC_013890	TCC	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289431959
46	NC_013890	CAT	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431959
47	NC_013890	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431959
48	NC_013890	GAA	2	6	4230	4235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431959
49	NC_013890	TGA	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431959
50	NC_013890	TTC	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431959
51	NC_013890	GCG	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431959
52	NC_013890	ACC	2	6	4482	4487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431959
53	NC_013890	GGC	2	6	4635	4640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431959
54	NC_013890	ATC	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431959
55	NC_013890	TTC	2	6	4683	4688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431959
56	NC_013890	CCG	2	6	4936	4941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431959
57	NC_013890	ACC	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431959
58	NC_013890	TAA	2	6	5122	5127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431959
59	NC_013890	TCG	2	6	5149	5154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431959
60	NC_013890	TTG	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289431959
61	NC_013890	GTG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431959
62	NC_013890	GTG	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431959
63	NC_013890	CTT	2	6	5300	5305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431959
64	NC_013890	CCG	2	6	5428	5433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431959
65	NC_013890	GCC	2	6	5451	5456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431959
66	NC_013890	GTA	2	6	5512	5517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431959
67	NC_013890	TTA	2	6	6044	6049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431960
68	NC_013890	GTG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431960
69	NC_013890	TTC	2	6	6261	6266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
70	NC_013890	TTC	2	6	6306	6311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
71	NC_013890	TAT	2	6	6378	6383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431960
72	NC_013890	GCA	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431960
73	NC_013890	TGG	2	6	6476	6481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431960
74	NC_013890	ACC	2	6	6499	6504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431960
75	NC_013890	CTG	2	6	6516	6521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431960
76	NC_013890	GAG	2	6	6525	6530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289431960
77	NC_013890	TGA	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431960
78	NC_013890	CTT	2	6	6711	6716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
79	NC_013890	GGT	2	6	6810	6815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431960
80	NC_013890	ACC	2	6	6826	6831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431960
81	NC_013890	TTC	2	6	7032	7037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
82	NC_013890	TCT	2	6	7108	7113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
83	NC_013890	CGG	2	6	7118	7123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
84	NC_013890	GGC	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
85	NC_013890	CGG	2	6	7223	7228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
86	NC_013890	ATC	2	6	7272	7277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431960
87	NC_013890	GGC	2	6	7451	7456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
88	NC_013890	GCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
89	NC_013890	CCA	2	6	7787	7792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431960
90	NC_013890	GCC	2	6	7833	7838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431960
91	NC_013890	TCT	2	6	7852	7857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
92	NC_013890	GGC	2	6	8001	8006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
93	NC_013890	GCG	2	6	8098	8103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
94	NC_013890	CCT	2	6	8117	8122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289431960
95	NC_013890	AGA	2	6	8340	8345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431961
96	NC_013890	CAA	2	6	8386	8391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289431961
97	NC_013890	GCC	2	6	8392	8397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431961
98	NC_013890	GCC	2	6	8404	8409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431961
99	NC_013890	TTA	2	6	8625	8630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431961
100	NC_013890	ATA	2	6	8740	8745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431961
101	NC_013890	CTG	2	6	8770	8775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431961
102	NC_013890	GCC	2	6	8825	8830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431961
103	NC_013890	TAC	2	6	8857	8862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431961
104	NC_013890	CTG	2	6	8926	8931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431961
105	NC_013890	GCC	2	6	9020	9025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431961
106	NC_013890	ATT	2	6	9092	9097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431961
107	NC_013890	GGC	3	9	9154	9162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431961
108	NC_013890	ATT	2	6	9241	9246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431961
109	NC_013890	GGT	2	6	9450	9455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431961
110	NC_013890	GAA	3	9	9466	9474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431961
111	NC_013890	TTC	2	6	9494	9499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431961
112	NC_013890	AAG	2	6	9559	9564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431961
113	NC_013890	CGG	2	6	9593	9598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431962
114	NC_013890	TGC	2	6	9628	9633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431962
115	NC_013890	GGC	2	6	9666	9671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431962
116	NC_013890	AGA	2	6	9758	9763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431962
117	NC_013890	AAG	2	6	9778	9783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431962
118	NC_013890	TAG	2	6	9802	9807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431962
119	NC_013890	TGG	2	6	9808	9813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431962
120	NC_013890	TGC	2	6	9851	9856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431962
121	NC_013890	AGA	2	6	9931	9936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431962
122	NC_013890	TCA	2	6	10013	10018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431962
123	NC_013890	CAC	2	6	10025	10030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431962
124	NC_013890	ACT	2	6	10278	10283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431962
125	NC_013890	AAG	2	6	10378	10383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431962
126	NC_013890	CTT	2	6	10509	10514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431962
127	NC_013890	TAG	2	6	10552	10557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431962
128	NC_013890	CGC	2	6	10590	10595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431962
129	NC_013890	TAT	2	6	10605	10610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431962
130	NC_013890	TGG	2	6	10639	10644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431962
131	NC_013890	TGG	2	6	10690	10695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431962
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