MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 1629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013889	CTGGC	2	10	1891	1900	0 %	20 %	40 %	40 %	289207189
2	NC_013889	CGGGA	2	10	2761	2770	20 %	0 %	60 %	20 %	289207189
3	NC_013889	CAGGC	2	10	3423	3432	20 %	0 %	40 %	40 %	289207190
4	NC_013889	GGTCG	2	10	3648	3657	0 %	20 %	60 %	20 %	289207190
5	NC_013889	TGGTG	2	10	3917	3926	0 %	40 %	60 %	0 %	289207190
6	NC_013889	GGGAC	2	10	5327	5336	20 %	0 %	60 %	20 %	289207191
7	NC_013889	CGCCC	2	10	5738	5747	0 %	0 %	20 %	80 %	289207191
8	NC_013889	CGGCG	2	10	6029	6038	0 %	0 %	60 %	40 %	289207191
9	NC_013889	CTCGC	2	10	6066	6075	0 %	20 %	20 %	60 %	289207191
10	NC_013889	GGCCC	2	10	8759	8768	0 %	0 %	40 %	60 %	289207193
11	NC_013889	TCGCC	2	10	11225	11234	0 %	20 %	20 %	60 %	289207195
12	NC_013889	GGGCT	2	10	11242	11251	0 %	20 %	60 %	20 %	289207195
13	NC_013889	TGTCG	2	10	12452	12461	0 %	40 %	40 %	20 %	289207197
14	NC_013889	CCGCG	2	10	13505	13514	0 %	0 %	40 %	60 %	289207198
15	NC_013889	GGCCG	2	10	15147	15156	0 %	0 %	60 %	40 %	289207200
16	NC_013889	GGTCG	2	10	15539	15548	0 %	20 %	60 %	20 %	289207200
17	NC_013889	GCTCG	2	10	17966	17975	0 %	20 %	40 %	40 %	289207202
18	NC_013889	GTCGA	2	10	18410	18419	20 %	20 %	40 %	20 %	289207203
19	NC_013889	GCCAG	2	10	18837	18846	20 %	0 %	40 %	40 %	289207203
20	NC_013889	AGCTG	2	10	20523	20532	20 %	20 %	40 %	20 %	289207204
21	NC_013889	CGCTG	2	10	25589	25598	0 %	20 %	40 %	40 %	289207208
22	NC_013889	GCTTC	2	10	28623	28632	0 %	40 %	20 %	40 %	289207210
23	NC_013889	TGTTC	2	10	29025	29034	0 %	60 %	20 %	20 %	289207210
24	NC_013889	CGGCC	2	10	29418	29427	0 %	0 %	40 %	60 %	289207211
25	NC_013889	GGCGG	2	10	35621	35630	0 %	0 %	80 %	20 %	289207218
26	NC_013889	GACCT	2	10	36742	36751	20 %	20 %	20 %	40 %	289207219
27	NC_013889	GGCGT	2	10	41121	41130	0 %	20 %	60 %	20 %	289207222
28	NC_013889	CTGGC	2	10	43104	43113	0 %	20 %	40 %	40 %	289207223
29	NC_013889	TGCAG	2	10	46072	46081	20 %	20 %	40 %	20 %	289207226
30	NC_013889	GCGCC	2	10	50974	50983	0 %	0 %	40 %	60 %	289207231
31	NC_013889	GCCGA	2	10	51823	51832	20 %	0 %	40 %	40 %	289207231
32	NC_013889	GCCGC	2	10	57286	57295	0 %	0 %	40 %	60 %	289207236
33	NC_013889	TGCGG	2	10	59142	59151	0 %	20 %	60 %	20 %	289207238
34	NC_013889	GCCGG	2	10	59199	59208	0 %	0 %	60 %	40 %	289207238
35	NC_013889	ACGCC	2	10	59437	59446	20 %	0 %	20 %	60 %	289207238
36	NC_013889	TGCGT	2	10	61943	61952	0 %	40 %	40 %	20 %	289207241
37	NC_013889	CGCAT	2	10	68626	68635	20 %	20 %	20 %	40 %	289207246
38	NC_013889	GTACC	2	10	69702	69711	20 %	20 %	20 %	40 %	289207246
39	NC_013889	GGAGG	2	10	72459	72468	20 %	0 %	80 %	0 %	289207249
40	NC_013889	TCCGG	2	10	75585	75594	0 %	20 %	40 %	40 %	289207252
41	NC_013889	CCCCG	2	10	78655	78664	0 %	0 %	20 %	80 %	289207256
42	NC_013889	CTCGC	2	10	81266	81275	0 %	20 %	20 %	60 %	289207259
43	NC_013889	CTGCC	2	10	81304	81313	0 %	20 %	20 %	60 %	289207259
44	NC_013889	GTGCC	2	10	83210	83219	0 %	20 %	40 %	40 %	289207261
45	NC_013889	CCACA	2	10	86386	86395	40 %	0 %	0 %	60 %	289207264
46	NC_013889	CCCGC	2	10	86531	86540	0 %	0 %	20 %	80 %	289207264
47	NC_013889	CGGAG	2	10	87579	87588	20 %	0 %	60 %	20 %	289207265
48	NC_013889	GGACC	2	10	88037	88046	20 %	0 %	40 %	40 %	289207266
49	NC_013889	CCCGA	2	10	89753	89762	20 %	0 %	20 %	60 %	289207268
50	NC_013889	GCGCC	2	10	93303	93312	0 %	0 %	40 %	60 %	289207270
51	NC_013889	CCTGC	2	10	95864	95873	0 %	20 %	20 %	60 %	289207272
52	NC_013889	CGCTG	2	10	97992	98001	0 %	20 %	40 %	40 %	289207276
53	NC_013889	GCGCC	2	10	98857	98866	0 %	0 %	40 %	60 %	289207278
54	NC_013889	ACGAG	2	10	101087	101096	40 %	0 %	40 %	20 %	289207280
55	NC_013889	AGCGC	2	10	101604	101613	20 %	0 %	40 %	40 %	289207281
56	NC_013889	GCGCC	2	10	104128	104137	0 %	0 %	40 %	60 %	289207283
57	NC_013889	CGGCC	2	10	107236	107245	0 %	0 %	40 %	60 %	289207284
58	NC_013889	TCCTG	2	10	110187	110196	0 %	40 %	20 %	40 %	289207286
59	NC_013889	ACGCG	2	10	111190	111199	20 %	0 %	40 %	40 %	289207287
60	NC_013889	ACGTT	2	10	112600	112609	20 %	40 %	20 %	20 %	289207288
61	NC_013889	TGATC	2	10	116445	116454	20 %	40 %	20 %	20 %	289207292
62	NC_013889	TGCGA	2	10	117326	117335	20 %	20 %	40 %	20 %	289207293
63	NC_013889	TCTTT	2	10	121996	122005	0 %	80 %	0 %	20 %	289207300
64	NC_013889	CCGGT	2	10	126226	126235	0 %	20 %	40 %	40 %	289207305
65	NC_013889	CGCGG	2	10	126454	126463	0 %	0 %	60 %	40 %	289207305
66	NC_013889	GCCCG	2	10	127534	127543	0 %	0 %	40 %	60 %	289207306
67	NC_013889	GATGC	2	10	131190	131199	20 %	20 %	40 %	20 %	289207312
68	NC_013889	TGGTG	2	10	132168	132177	0 %	40 %	60 %	0 %	289207313
69	NC_013889	CAGGT	2	10	143752	143761	20 %	20 %	40 %	20 %	289207326
70	NC_013889	CCGAT	2	10	150380	150389	20 %	20 %	20 %	40 %	289207330
71	NC_013889	CGAGC	2	10	150771	150780	20 %	0 %	40 %	40 %	289207330
72	NC_013889	TGCCG	2	10	153503	153512	0 %	20 %	40 %	40 %	289207334
73	NC_013889	GATCG	2	10	154462	154471	20 %	20 %	40 %	20 %	289207335
74	NC_013889	TCCGG	2	10	154504	154513	0 %	20 %	40 %	40 %	289207335
75	NC_013889	CGTAC	2	10	157191	157200	20 %	20 %	20 %	40 %	289207338
76	NC_013889	CGTCA	2	10	157871	157880	20 %	20 %	20 %	40 %	289207338
77	NC_013889	TGCCC	2	10	158390	158399	0 %	20 %	20 %	60 %	289207339
78	NC_013889	GGGCT	2	10	159694	159703	0 %	20 %	60 %	20 %	289207340
79	NC_013889	GGTGG	2	10	159964	159973	0 %	20 %	80 %	0 %	289207340
80	NC_013889	GGCGC	2	10	161884	161893	0 %	0 %	60 %	40 %	289207343
81	NC_013889	GCTGG	2	10	163857	163866	0 %	20 %	60 %	20 %	289207344
82	NC_013889	AGCCG	2	10	165139	165148	20 %	0 %	40 %	40 %	289207346
83	NC_013889	GGCCT	2	10	165956	165965	0 %	20 %	40 %	40 %	289207347
84	NC_013889	GGCGC	2	10	171162	171171	0 %	0 %	60 %	40 %	289207350
85	NC_013889	GCGCC	2	10	172074	172083	0 %	0 %	40 %	60 %	289207353
86	NC_013889	TGCGC	2	10	172409	172418	0 %	20 %	40 %	40 %	289207353
87	NC_013889	GGGCA	2	10	173818	173827	20 %	0 %	60 %	20 %	289207354
88	NC_013889	TCGGC	2	10	175811	175820	0 %	20 %	40 %	40 %	289207357
89	NC_013889	GGCGG	2	10	177228	177237	0 %	0 %	80 %	20 %	289207358
90	NC_013889	GCCGA	2	10	179517	179526	20 %	0 %	40 %	40 %	289207360
91	NC_013889	GTGGC	2	10	180307	180316	0 %	20 %	60 %	20 %	289207360
92	NC_013889	AGCCC	2	10	183222	183231	20 %	0 %	20 %	60 %	289207362
93	NC_013889	CCAGG	2	10	185724	185733	20 %	0 %	40 %	40 %	289207363
94	NC_013889	GCCAC	2	10	186491	186500	20 %	0 %	20 %	60 %	289207364
95	NC_013889	CGATC	2	10	189200	189209	20 %	20 %	20 %	40 %	289207366
96	NC_013889	TGCTT	2	10	194856	194865	0 %	60 %	20 %	20 %	289207369
97	NC_013889	TCGCC	2	10	195631	195640	0 %	20 %	20 %	60 %	289207370
98	NC_013889	GCGTT	2	10	198680	198689	0 %	40 %	40 %	20 %	289207373
99	NC_013889	TGCTG	2	10	200527	200536	0 %	40 %	40 %	20 %	289207376
100	NC_013889	GGCCC	2	10	201332	201341	0 %	0 %	40 %	60 %	289207376
101	NC_013889	CCGCG	2	10	201898	201907	0 %	0 %	40 %	60 %	289207377
102	NC_013889	GGCTG	2	10	205746	205755	0 %	20 %	60 %	20 %	289207382
103	NC_013889	GGCCG	2	10	209418	209427	0 %	0 %	60 %	40 %	289207387
104	NC_013889	GACCT	2	10	211734	211743	20 %	20 %	20 %	40 %	289207388
105	NC_013889	GCCGA	2	10	215119	215128	20 %	0 %	40 %	40 %	289207391
106	NC_013889	GGCCT	2	10	217840	217849	0 %	20 %	40 %	40 %	289207395
107	NC_013889	TGTGG	2	10	219031	219040	0 %	40 %	60 %	0 %	289207395
108	NC_013889	GGCCC	2	10	220212	220221	0 %	0 %	40 %	60 %	289207395
109	NC_013889	GCCCG	2	10	223062	223071	0 %	0 %	40 %	60 %	289207400
110	NC_013889	TCGAC	2	10	223959	223968	20 %	20 %	20 %	40 %	289207401
111	NC_013889	TCGGT	2	10	223996	224005	0 %	40 %	40 %	20 %	289207401
112	NC_013889	AGGTC	2	10	224031	224040	20 %	20 %	40 %	20 %	289207401
113	NC_013889	GCCGG	2	10	229313	229322	0 %	0 %	60 %	40 %	289207406
114	NC_013889	GGGGC	2	10	231807	231816	0 %	0 %	80 %	20 %	289207410
115	NC_013889	TGCCG	2	10	233357	233366	0 %	20 %	40 %	40 %	289207412
116	NC_013889	CGGCG	2	10	233540	233549	0 %	0 %	60 %	40 %	289207412
117	NC_013889	GCGCT	2	10	236046	236055	0 %	20 %	40 %	40 %	289207415
118	NC_013889	CGGCG	2	10	238977	238986	0 %	0 %	60 %	40 %	289207419
119	NC_013889	GCGCC	2	10	240304	240313	0 %	0 %	40 %	60 %	289207421
120	NC_013889	CCTGG	2	10	241739	241748	0 %	20 %	40 %	40 %	289207423
121	NC_013889	CCGGA	2	10	242786	242795	20 %	0 %	40 %	40 %	289207426
122	NC_013889	CCGAC	2	10	251565	251574	20 %	0 %	20 %	60 %	289207432
123	NC_013889	GCCGC	2	10	252428	252437	0 %	0 %	40 %	60 %	289207432
124	NC_013889	GGCTT	2	10	252680	252689	0 %	40 %	40 %	20 %	289207432
125	NC_013889	GCGGG	2	10	253095	253104	0 %	0 %	80 %	20 %	289207433
126	NC_013889	CCGTG	2	10	253130	253139	0 %	20 %	40 %	40 %	289207433
127	NC_013889	GGTGA	2	10	253765	253774	20 %	20 %	60 %	0 %	289207433
128	NC_013889	GGGCA	2	10	254680	254689	20 %	0 %	60 %	20 %	289207433
129	NC_013889	TCGCC	2	10	254994	255003	0 %	20 %	20 %	60 %	289207433
130	NC_013889	TGCCA	2	10	260090	260099	20 %	20 %	20 %	40 %	289207438
131	NC_013889	TGCGC	2	10	261593	261602	0 %	20 %	40 %	40 %	289207440
132	NC_013889	CACCG	2	10	269494	269503	20 %	0 %	20 %	60 %	289207447
133	NC_013889	CGGGT	2	10	270324	270333	0 %	20 %	60 %	20 %	289207448
134	NC_013889	GGCGA	2	10	270540	270549	20 %	0 %	60 %	20 %	289207448
135	NC_013889	GGGCA	2	10	273085	273094	20 %	0 %	60 %	20 %	289207449
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