MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013889	AGCG	2	8	32	39	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013889	CCCG	2	8	11393	11400	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_013889	CCTG	2	8	11991	11998	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013889	TTGC	2	8	12073	12080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013889	GGGC	2	8	21117	21124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013889	GGCC	2	8	22911	22918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013889	CTCG	2	8	26061	26068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013889	ACGG	2	8	38500	38507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013889	ACCG	2	8	63677	63684	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013889	TGCG	2	8	66714	66721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013889	TCGG	2	8	69860	69867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013889	TGGA	2	8	70676	70683	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013889	GCAA	2	8	72990	72997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013889	ATCG	2	8	73925	73932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013889	AGGA	2	8	84243	84250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013889	CCCG	2	8	84398	84405	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_013889	CGCA	2	8	84574	84581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013889	CGGC	2	8	84704	84711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013889	AGGG	2	8	85838	85845	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013889	GGCA	2	8	101365	101372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013889	ATGG	2	8	101769	101776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013889	GATC	2	8	102638	102645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013889	CCGG	2	8	104920	104927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013889	TGCG	2	8	114066	114073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013889	CGGG	2	8	116188	116195	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013889	GGCG	2	8	122417	122424	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013889	GCCG	2	8	124385	124392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013889	CCCG	2	8	124514	124521	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_013889	GTTC	2	8	129138	129145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013889	CCCG	2	8	140745	140752	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_013889	GCAA	2	8	140793	140800	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013889	GCGA	2	8	142656	142663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013889	AATA	2	8	148120	148127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013889	CGGC	2	8	151187	151194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013889	CGGC	2	8	152997	153004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013889	GTCC	2	8	154150	154157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013889	GGAG	2	8	154296	154303	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013889	CCCT	2	8	156748	156755	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_013889	TGGG	2	8	160846	160853	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013889	AAGC	2	8	167820	167827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013889	GATG	2	8	172824	172831	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013889	CCGT	2	8	187783	187790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013889	GCCG	2	8	189526	189533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013889	GCCG	2	8	203677	203684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013889	GCCG	2	8	208035	208042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013889	GCCG	2	8	208096	208103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013889	GCCG	2	8	208897	208904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013889	GGCC	2	8	208957	208964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013889	GGCC	2	8	210065	210072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013889	GGGT	2	8	215683	215690	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013889	AAAT	2	8	215766	215773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013889	GCCG	2	8	216043	216050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013889	CTTC	2	8	223701	223708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013889	CGGT	2	8	228048	228055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013889	GAGG	2	8	228230	228237	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013889	GTGG	2	8	231686	231693	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013889	CGTC	2	8	235008	235015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013889	GTCG	2	8	235508	235515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013889	CAAG	2	8	258580	258587	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013889	CATC	2	8	259382	259389	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013889	CGGG	2	8	261339	261346	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013889	CACT	2	8	266278	266285	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013889	GCCA	2	8	269864	269871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013889	AATC	2	8	272224	272231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013889	CGCC	2	8	272269	272276	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_013889	GGGC	2	8	278914	278921	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013889	GCGT	2	8	283217	283224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013889	TCCC	2	8	303416	303423	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_013889	GGGT	2	8	304092	304099	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013889	CAGA	2	8	306342	306349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013889	GTTT	2	8	306551	306558	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013889	GTCC	2	8	307251	307258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013889	CGCA	2	8	322255	322262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013889	GCCC	2	8	322595	322602	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_013889	CGCA	2	8	322615	322622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013889	GCTG	2	8	329119	329126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013889	CTGG	2	8	331813	331820	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013889	GGGC	2	8	331910	331917	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013889	CGGG	2	8	350451	350458	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013889	GCCG	2	8	350519	350526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013889	CCGT	2	8	361241	361248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013889	AGGC	2	8	365050	365057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013889	CGAC	2	8	365145	365152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013889	AGGC	2	8	365266	365273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013889	GCCC	2	8	369154	369161	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_013889	GGGC	2	8	370504	370511	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013889	GCCC	2	8	370619	370626	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_013889	GCCC	3	12	370650	370661	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_013889	CGCA	2	8	381001	381008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013889	GTCT	2	8	400123	400130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013889	GTCG	2	8	401417	401424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013889	GGGC	2	8	401498	401505	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013889	GCAA	2	8	407630	407637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013889	CCAG	2	8	407723	407730	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013889	AGGC	2	8	407735	407742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013889	CGCA	2	8	413191	413198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013889	TGAA	2	8	419730	419737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013889	TCGG	2	8	420182	420189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013889	AAGC	2	8	423142	423149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013889	TACC	2	8	424202	424209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013889	GCGA	2	8	425439	425446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013889	ACCG	2	8	425621	425628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013889	ACTT	2	8	425766	425773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013889	CGTC	2	8	426140	426147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013889	AAAG	2	8	426263	426270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013889	TTGT	2	8	427273	427280	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013889	GACA	2	8	427522	427529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013889	TGGT	2	8	428093	428100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013889	CTGG	3	12	429965	429976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013889	GCGG	2	8	430078	430085	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013889	TGCG	2	8	435889	435896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013889	GCCG	2	8	436584	436591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013889	CTTG	2	8	443059	443066	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013889	GCAG	2	8	444925	444932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013889	GCCG	3	12	447723	447734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013889	CGAG	2	8	448680	448687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013889	GACG	2	8	454858	454865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013889	CGGG	2	8	455583	455590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013889	GGCC	2	8	455599	455606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013889	GTGC	2	8	455728	455735	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013889	CCCT	2	8	457723	457730	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
122	NC_013889	AGGT	2	8	458507	458514	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013889	TTGC	2	8	458896	458903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013889	CGGG	2	8	462069	462076	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013889	GGAC	2	8	462084	462091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013889	AATC	2	8	462115	462122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013889	GCCA	2	8	462941	462948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013889	CAGC	2	8	462964	462971	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013889	CCCT	2	8	465871	465878	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_013889	GCCG	2	8	466295	466302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013889	CGGG	2	8	475362	475369	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013889	CGGG	2	8	487701	487708	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013889	GCGG	2	8	499511	499518	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013889	AGGT	2	8	503479	503486	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013889	GCTG	2	8	503703	503710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013889	GCAA	2	8	503907	503914	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013889	GCCA	2	8	503999	504006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013889	CGGG	2	8	518888	518895	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013889	CGGA	2	8	542957	542964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013889	GCGG	2	8	543146	543153	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013889	CATG	2	8	548760	548767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013889	TTCA	2	8	549489	549496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013889	CGGG	3	12	552408	552419	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013889	GTGG	2	8	552433	552440	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013889	CCTG	2	8	553578	553585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013889	AAGC	2	8	559967	559974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013889	CGGC	2	8	571531	571538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013889	GGCC	2	8	572946	572953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013889	GCTC	2	8	573010	573017	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013889	CCAT	2	8	574120	574127	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013889	GAGC	2	8	574169	574176	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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486	NC_013889	CCAG	2	8	1635124	1635131	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_013889	GATC	2	8	1635369	1635376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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494	NC_013889	CAGG	2	8	1640812	1640819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_013889	CCCA	2	8	1645782	1645789	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
498	NC_013889	CCCT	3	12	1646993	1647004	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
499	NC_013889	CGGC	2	8	1650292	1650299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
500	NC_013889	CTCG	2	8	1650412	1650419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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