MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 44728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013889	GCA	2	6	177	182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
2	NC_013889	GAG	2	6	214	219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207188
3	NC_013889	CTG	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207188
4	NC_013889	CCG	2	6	383	388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207188
5	NC_013889	GCG	2	6	438	443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207188
6	NC_013889	AGC	2	6	444	449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
7	NC_013889	TCG	2	6	503	508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207188
8	NC_013889	GGC	2	6	595	600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207188
9	NC_013889	ATC	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207188
10	NC_013889	TCG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207188
11	NC_013889	GCA	2	6	723	728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
12	NC_013889	CGA	2	6	738	743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
13	NC_013889	AGC	2	6	749	754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
14	NC_013889	CCT	2	6	774	779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207188
15	NC_013889	CGA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
16	NC_013889	CAA	2	6	804	809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207188
17	NC_013889	GAA	2	6	823	828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207188
18	NC_013889	CAG	3	9	862	870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
19	NC_013889	ATC	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207188
20	NC_013889	AGG	2	6	899	904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207188
21	NC_013889	GAG	2	6	916	921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207188
22	NC_013889	AGA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207188
23	NC_013889	GCA	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
24	NC_013889	CGG	2	6	1368	1373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207188
25	NC_013889	CTG	2	6	1462	1467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207188
26	NC_013889	AGC	2	6	1477	1482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207188
27	NC_013889	GCC	2	6	1487	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013889	TTA	2	6	1689	1694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013889	TCA	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013889	GGC	2	6	1794	1799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207189
31	NC_013889	GGC	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207189
32	NC_013889	ACC	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207189
33	NC_013889	GCG	2	6	1909	1914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207189
34	NC_013889	GCT	2	6	1959	1964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207189
35	NC_013889	CAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207189
36	NC_013889	CGA	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207189
37	NC_013889	GCA	2	6	2178	2183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207189
38	NC_013889	TGG	2	6	2216	2221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207189
39	NC_013889	CGG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207189
40	NC_013889	TCG	2	6	2555	2560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207189
41	NC_013889	TGA	2	6	2598	2603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207189
42	NC_013889	TGA	2	6	2615	2620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207189
43	NC_013889	GCC	2	6	2676	2681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207189
44	NC_013889	CTC	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207189
45	NC_013889	GCC	2	6	2796	2801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207189
46	NC_013889	CGT	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207189
47	NC_013889	TGG	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207190
48	NC_013889	TGG	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207190
49	NC_013889	CGC	2	6	3033	3038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207190
50	NC_013889	CGG	2	6	3252	3257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207190
51	NC_013889	CAA	2	6	3312	3317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207190
52	NC_013889	AAC	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207190
53	NC_013889	CGC	2	6	3344	3349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207190
54	NC_013889	TCG	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207190
55	NC_013889	GAA	2	6	3588	3593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207190
56	NC_013889	CGG	2	6	3658	3663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207190
57	NC_013889	CGG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207190
58	NC_013889	GGT	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207190
59	NC_013889	GAT	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207190
60	NC_013889	CAC	2	6	3848	3853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207190
61	NC_013889	CCG	2	6	3986	3991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013889	TTC	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207191
63	NC_013889	CCA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207191
64	NC_013889	GTC	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
65	NC_013889	GAA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207191
66	NC_013889	CGG	2	6	4325	4330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207191
67	NC_013889	AAC	2	6	4341	4346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207191
68	NC_013889	CGG	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207191
69	NC_013889	AGA	3	9	4714	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207191
70	NC_013889	GAT	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207191
71	NC_013889	CGT	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
72	NC_013889	TCT	2	6	4822	4827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207191
73	NC_013889	CAA	2	6	4835	4840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207191
74	NC_013889	GGC	2	6	4857	4862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207191
75	NC_013889	AAG	2	6	4935	4940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207191
76	NC_013889	CCG	2	6	4954	4959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207191
77	NC_013889	CGA	2	6	4961	4966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207191
78	NC_013889	TCC	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207191
79	NC_013889	TCG	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
80	NC_013889	CTG	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
81	NC_013889	GGC	2	6	5156	5161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207191
82	NC_013889	CGC	2	6	5202	5207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207191
83	NC_013889	TGG	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207191
84	NC_013889	CCG	2	6	5416	5421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207191
85	NC_013889	ACC	2	6	5494	5499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207191
86	NC_013889	CAT	4	12	5501	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207191
87	NC_013889	CTG	3	9	5550	5558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
88	NC_013889	CTT	3	9	5561	5569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207191
89	NC_013889	GCC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207191
90	NC_013889	CGA	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207191
91	NC_013889	CTG	2	6	6120	6125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
92	NC_013889	GCT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
93	NC_013889	AGG	2	6	6205	6210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207191
94	NC_013889	GCC	2	6	6211	6216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207191
95	NC_013889	AGC	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207191
96	NC_013889	ACG	2	6	6279	6284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207191
97	NC_013889	CTG	2	6	6306	6311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207191
98	NC_013889	CAC	2	6	6353	6358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207191
99	NC_013889	TCG	2	6	6677	6682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207192
100	NC_013889	CAA	2	6	6750	6755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207192
101	NC_013889	GTG	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207192
102	NC_013889	CGC	2	6	6848	6853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207192
103	NC_013889	CTG	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207193
104	NC_013889	TCC	2	6	7134	7139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207193
105	NC_013889	TTG	2	6	7188	7193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207193
106	NC_013889	GCA	2	6	7240	7245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207193
107	NC_013889	CAG	2	6	7306	7311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207193
108	NC_013889	GCA	2	6	7375	7380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207193
109	NC_013889	CGC	2	6	7393	7398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207193
110	NC_013889	GCG	2	6	7447	7452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207193
111	NC_013889	GTG	2	6	7491	7496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207193
112	NC_013889	GAG	2	6	7571	7576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207193
113	NC_013889	CGA	2	6	7615	7620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207193
114	NC_013889	CGC	2	6	7645	7650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207193
115	NC_013889	TGA	2	6	7737	7742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207193
116	NC_013889	GAC	2	6	7751	7756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207193
117	NC_013889	GCC	2	6	7767	7772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207193
118	NC_013889	ACA	2	6	7833	7838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207193
119	NC_013889	TCC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207193
120	NC_013889	GAG	2	6	7871	7876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207193
121	NC_013889	CGG	2	6	7979	7984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207193
122	NC_013889	GCC	2	6	8081	8086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207193
123	NC_013889	GCG	2	6	8101	8106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207193
124	NC_013889	TCG	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207193
125	NC_013889	GGC	2	6	8327	8332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207193
126	NC_013889	CAG	2	6	8378	8383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207193
127	NC_013889	CCG	2	6	8417	8422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207193
128	NC_013889	ACG	2	6	8451	8456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207193
129	NC_013889	CAC	2	6	8495	8500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207193
130	NC_013889	GGT	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207193
131	NC_013889	GCC	2	6	8833	8838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207193
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257	NC_013889	GGC	2	6	16977	16982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207202
258	NC_013889	GGA	2	6	17057	17062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207202
259	NC_013889	CGA	2	6	17162	17167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207202
260	NC_013889	CGC	2	6	17171	17176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207202
261	NC_013889	AAG	2	6	17262	17267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207202
262	NC_013889	CGA	2	6	17336	17341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207202
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265	NC_013889	TCC	2	6	17536	17541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207202
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273	NC_013889	TGA	2	6	17887	17892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207202
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281	NC_013889	AGC	2	6	18322	18327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207202
282	NC_013889	GGT	2	6	18359	18364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013889	CAC	2	6	18374	18379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_013889	CAC	2	6	18445	18450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207203
285	NC_013889	AGC	2	6	18461	18466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207203
286	NC_013889	GGT	2	6	18513	18518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207203
287	NC_013889	CTC	2	6	18619	18624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207203
288	NC_013889	GAT	2	6	18808	18813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207203
289	NC_013889	TTC	2	6	18857	18862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207203
290	NC_013889	TTG	2	6	18878	18883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207203
291	NC_013889	CTC	2	6	18889	18894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207203
292	NC_013889	TCC	2	6	18906	18911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_013889	TCG	2	6	18994	18999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_013889	CAT	2	6	19002	19007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_013889	TGC	2	6	19446	19451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207204
296	NC_013889	CTC	2	6	19453	19458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207204
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299	NC_013889	GCG	2	6	19589	19594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207204
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330	NC_013889	GCA	2	6	21321	21326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207206
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343	NC_013889	GAT	2	6	21822	21827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207206
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371	NC_013889	GAG	2	6	22856	22861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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