MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 plasmid pFS01

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013888	AAAG	2	8	114	121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013888	ATTT	2	8	359	366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013888	TAAG	2	8	787	794	50 %	25 %	25 %	0 %	289193302
4	NC_013888	TCAT	2	8	851	858	25 %	50 %	0 %	25 %	289193302
5	NC_013888	ACAT	2	8	1075	1082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013888	ACCC	2	8	1150	1157	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_013888	TTTA	2	8	1954	1961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013888	TTGG	2	8	2042	2049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013888	TAAA	2	8	2153	2160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013888	CAAA	2	8	2258	2265	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013888	ATTA	2	8	2733	2740	50 %	50 %	0 %	0 %	289193303
12	NC_013888	TGAT	2	8	3243	3250	25 %	50 %	25 %	0 %	289193304
13	NC_013888	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	289193304
14	NC_013888	TAAA	2	8	4101	4108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013888	GTTT	3	12	4202	4213	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013888	TGGA	2	8	5012	5019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013888	GATA	2	8	5043	5050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013888	ATAG	2	8	5154	5161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013888	CCTA	2	8	5764	5771	25 %	25 %	0 %	50 %	289193306
20	NC_013888	AAAG	2	8	5773	5780	75 %	0 %	25 %	0 %	289193306
21	NC_013888	CATT	2	8	5906	5913	25 %	50 %	0 %	25 %	289193306
22	NC_013888	TGAT	2	8	6185	6192	25 %	50 %	25 %	0 %	289193306
23	NC_013888	ATTG	2	8	6573	6580	25 %	50 %	25 %	0 %	289193306
24	NC_013888	AGGA	2	8	6817	6824	50 %	0 %	50 %	0 %	289193306
25	NC_013888	AGAT	2	8	6843	6850	50 %	25 %	25 %	0 %	289193306
26	NC_013888	AAGA	2	8	6993	7000	75 %	0 %	25 %	0 %	289193306
27	NC_013888	TGTA	2	8	7143	7150	25 %	50 %	25 %	0 %	289193306
28	NC_013888	CTTT	2	8	7263	7270	0 %	75 %	0 %	25 %	289193306
29	NC_013888	GTAT	2	8	8596	8603	25 %	50 %	25 %	0 %	289193308
30	NC_013888	AATT	2	8	8634	8641	50 %	50 %	0 %	0 %	289193308
31	NC_013888	AAAG	2	8	8809	8816	75 %	0 %	25 %	0 %	289193309
32	NC_013888	ATGA	2	8	9143	9150	50 %	25 %	25 %	0 %	289193310
33	NC_013888	TAAA	2	8	9183	9190	75 %	25 %	0 %	0 %	289193310
34	NC_013888	TAAG	2	8	9584	9591	50 %	25 %	25 %	0 %	289193310
35	NC_013888	CTAT	2	8	9598	9605	25 %	50 %	0 %	25 %	289193311
36	NC_013888	TAGA	2	8	9719	9726	50 %	25 %	25 %	0 %	289193311
37	NC_013888	ACAA	2	8	9914	9921	75 %	0 %	0 %	25 %	289193312
38	NC_013888	CAGA	2	8	10139	10146	50 %	0 %	25 %	25 %	289193312
39	NC_013888	AAAC	2	8	10215	10222	75 %	0 %	0 %	25 %	289193312
40	NC_013888	GAAT	2	8	10444	10451	50 %	25 %	25 %	0 %	289193313
41	NC_013888	GGAA	2	8	10503	10510	50 %	0 %	50 %	0 %	289193313
42	NC_013888	AATG	2	8	10862	10869	50 %	25 %	25 %	0 %	289193313
43	NC_013888	GATT	2	8	11041	11048	25 %	50 %	25 %	0 %	289193313
44	NC_013888	GGAG	2	8	11316	11323	25 %	0 %	75 %	0 %	289193313
45	NC_013888	GTTG	2	8	11474	11481	0 %	50 %	50 %	0 %	289193313
46	NC_013888	AAAG	2	8	12013	12020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.