MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 plasmid pFS01

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013888	TAAG	2	8	787	794	50 %	25 %	25 %	0 %	289193302
2	NC_013888	TCAT	2	8	851	858	25 %	50 %	0 %	25 %	289193302
3	NC_013888	ATTA	2	8	2733	2740	50 %	50 %	0 %	0 %	289193303
4	NC_013888	TGAT	2	8	3243	3250	25 %	50 %	25 %	0 %	289193304
5	NC_013888	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	289193304
6	NC_013888	CCTA	2	8	5764	5771	25 %	25 %	0 %	50 %	289193306
7	NC_013888	AAAG	2	8	5773	5780	75 %	0 %	25 %	0 %	289193306
8	NC_013888	CATT	2	8	5906	5913	25 %	50 %	0 %	25 %	289193306
9	NC_013888	TGAT	2	8	6185	6192	25 %	50 %	25 %	0 %	289193306
10	NC_013888	ATTG	2	8	6573	6580	25 %	50 %	25 %	0 %	289193306
11	NC_013888	AGGA	2	8	6817	6824	50 %	0 %	50 %	0 %	289193306
12	NC_013888	AGAT	2	8	6843	6850	50 %	25 %	25 %	0 %	289193306
13	NC_013888	AAGA	2	8	6993	7000	75 %	0 %	25 %	0 %	289193306
14	NC_013888	TGTA	2	8	7143	7150	25 %	50 %	25 %	0 %	289193306
15	NC_013888	CTTT	2	8	7263	7270	0 %	75 %	0 %	25 %	289193306
16	NC_013888	GTAT	2	8	8596	8603	25 %	50 %	25 %	0 %	289193308
17	NC_013888	AATT	2	8	8634	8641	50 %	50 %	0 %	0 %	289193308
18	NC_013888	AAAG	2	8	8809	8816	75 %	0 %	25 %	0 %	289193309
19	NC_013888	ATGA	2	8	9143	9150	50 %	25 %	25 %	0 %	289193310
20	NC_013888	TAAA	2	8	9183	9190	75 %	25 %	0 %	0 %	289193310
21	NC_013888	TAAG	2	8	9584	9591	50 %	25 %	25 %	0 %	289193310
22	NC_013888	CTAT	2	8	9598	9605	25 %	50 %	0 %	25 %	289193311
23	NC_013888	TAGA	2	8	9719	9726	50 %	25 %	25 %	0 %	289193311
24	NC_013888	ACAA	2	8	9914	9921	75 %	0 %	0 %	25 %	289193312
25	NC_013888	CAGA	2	8	10139	10146	50 %	0 %	25 %	25 %	289193312
26	NC_013888	AAAC	2	8	10215	10222	75 %	0 %	0 %	25 %	289193312
27	NC_013888	GAAT	2	8	10444	10451	50 %	25 %	25 %	0 %	289193313
28	NC_013888	GGAA	2	8	10503	10510	50 %	0 %	50 %	0 %	289193313
29	NC_013888	AATG	2	8	10862	10869	50 %	25 %	25 %	0 %	289193313
30	NC_013888	GATT	2	8	11041	11048	25 %	50 %	25 %	0 %	289193313
31	NC_013888	GGAG	2	8	11316	11323	25 %	0 %	75 %	0 %	289193313
32	NC_013888	GTTG	2	8	11474	11481	0 %	50 %	50 %	0 %	289193313

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.