MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 plasmid pFS01

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013888	TAA	2	6	89	94	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013888	ATG	2	6	333	338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013888	ATT	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193302
4	NC_013888	ACA	2	6	502	507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193302
5	NC_013888	AAC	2	6	607	612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193302
6	NC_013888	GTT	2	6	648	653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193302
7	NC_013888	ATA	2	6	696	701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193302
8	NC_013888	TAT	2	6	811	816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193302
9	NC_013888	TAT	3	9	988	996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013888	GTG	3	9	999	1007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013888	TAA	2	6	1214	1219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013888	TCC	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013888	AAC	2	6	1385	1390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013888	TCC	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013888	TCC	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013888	AAG	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013888	TCC	2	6	1574	1579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_013888	TAG	2	6	1617	1622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013888	TCC	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_013888	TAA	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013888	ATC	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013888	TTA	2	6	2066	2071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013888	TAA	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013888	AAT	2	6	2124	2129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013888	TTA	2	6	2190	2195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013888	TTA	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013888	AAC	2	6	2247	2252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013888	ATT	2	6	2310	2315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013888	ACA	2	6	2421	2426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013888	ATA	2	6	2494	2499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193303
31	NC_013888	TCA	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193303
32	NC_013888	AAC	2	6	2657	2662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193303
33	NC_013888	TCT	2	6	2700	2705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193303
34	NC_013888	ATT	2	6	2751	2756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013888	CTT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
36	NC_013888	CTA	2	6	2838	2843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193304
37	NC_013888	TGT	2	6	2924	2929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193304
38	NC_013888	TCT	2	6	3003	3008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
39	NC_013888	ATA	2	6	3127	3132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193304
40	NC_013888	TCT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
41	NC_013888	CAT	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193304
42	NC_013888	TGT	2	6	3219	3224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193304
43	NC_013888	ACA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193304
44	NC_013888	CTT	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
45	NC_013888	TGT	2	6	3679	3684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193304
46	NC_013888	TTA	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193304
47	NC_013888	CCT	2	6	3828	3833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289193304
48	NC_013888	TTC	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
49	NC_013888	TCT	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289193304
50	NC_013888	CCA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013888	TGT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013888	GTG	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013888	AAT	2	6	4237	4242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013888	CGT	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013888	ACG	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013888	GTT	2	6	4515	4520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013888	TCC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013888	CCT	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013888	GAG	2	6	4845	4850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013888	TTA	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013888	TTA	2	6	5204	5209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013888	TAG	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013888	TAT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193305
64	NC_013888	TAC	2	6	5438	5443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193305
65	NC_013888	TAT	2	6	5508	5513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193305
66	NC_013888	TTA	2	6	5638	5643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013888	TAT	2	6	5715	5720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
68	NC_013888	TAA	2	6	5813	5818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
69	NC_013888	TAG	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
70	NC_013888	AGG	2	6	5837	5842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193306
71	NC_013888	ACA	2	6	5900	5905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193306
72	NC_013888	TTA	2	6	5972	5977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
73	NC_013888	ATG	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
74	NC_013888	TGA	2	6	6024	6029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
75	NC_013888	TGT	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193306
76	NC_013888	ATT	2	6	6215	6220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
77	NC_013888	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
78	NC_013888	ATT	2	6	6246	6251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
79	NC_013888	TAT	2	6	6262	6267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
80	NC_013888	GTT	2	6	6298	6303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193306
81	NC_013888	TAA	2	6	6336	6341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
82	NC_013888	TAA	2	6	6360	6365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
83	NC_013888	GTA	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
84	NC_013888	GAA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193306
85	NC_013888	TGT	2	6	6626	6631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193306
86	NC_013888	GTT	2	6	6727	6732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193306
87	NC_013888	GAG	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193306
88	NC_013888	AAG	2	6	6781	6786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193306
89	NC_013888	TAT	2	6	6836	6841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193306
90	NC_013888	ACA	2	6	6900	6905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289193306
91	NC_013888	TAA	2	6	7017	7022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
92	NC_013888	AGA	2	6	7073	7078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193306
93	NC_013888	TGA	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
94	NC_013888	TAC	2	6	7179	7184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193306
95	NC_013888	AGG	2	6	7227	7232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193306
96	NC_013888	TAA	2	6	7461	7466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
97	NC_013888	TGT	2	6	7695	7700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193306
98	NC_013888	AGG	2	6	7718	7723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193306
99	NC_013888	AAT	2	6	7797	7802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193306
100	NC_013888	TAG	2	6	7812	7817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
101	NC_013888	AGA	2	6	7854	7859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193306
102	NC_013888	TGA	2	6	7896	7901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
103	NC_013888	GAA	2	6	7918	7923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193306
104	NC_013888	TGA	2	6	7986	7991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193306
105	NC_013888	CTG	2	6	8054	8059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013888	GTT	2	6	8103	8108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193307
107	NC_013888	GAA	2	6	8130	8135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193307
108	NC_013888	ATG	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193307
109	NC_013888	GTT	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193307
110	NC_013888	TAA	2	6	8168	8173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193307
111	NC_013888	GAT	2	6	8209	8214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193307
112	NC_013888	CTA	2	6	8231	8236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289193307
113	NC_013888	GGA	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193307
114	NC_013888	GGA	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193307
115	NC_013888	ATA	2	6	8303	8308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193307
116	NC_013888	GGA	2	6	8479	8484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193308
117	NC_013888	ATA	2	6	8526	8531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193308
118	NC_013888	ATT	2	6	8576	8581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193308
119	NC_013888	ATA	2	6	8650	8655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193308
120	NC_013888	AGG	2	6	8712	8717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193309
121	NC_013888	AGG	2	6	8861	8866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193309
122	NC_013888	AGG	2	6	8892	8897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193309
123	NC_013888	ATT	2	6	8910	8915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193309
124	NC_013888	TGT	2	6	8916	8921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193309
125	NC_013888	AAG	3	9	8933	8941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193309
126	NC_013888	GTT	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193309
127	NC_013888	GAT	2	6	9052	9057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289193309
128	NC_013888	TTG	2	6	9075	9080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193309
129	NC_013888	TAG	2	6	9115	9120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013888	ATT	2	6	9224	9229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193310
131	NC_013888	ATT	2	6	9287	9292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193310
132	NC_013888	AGA	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289193310
133	NC_013888	AAT	2	6	9479	9484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289193310
134	NC_013888	ATT	2	6	9518	9523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289193310
135	NC_013888	TTG	2	6	9543	9548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289193310
136	NC_013888	AGG	2	6	9611	9616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193311
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139	NC_013888	AGG	2	6	9855	9860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289193312
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.