MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 plasmid pFS01

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013888	A	6	6	66	71	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013888	T	6	6	341	346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013888	T	6	6	446	451	0 %	100 %	0 %	0 %	289193302
4	NC_013888	T	6	6	526	531	0 %	100 %	0 %	0 %	289193302
5	NC_013888	A	6	6	1040	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013888	T	6	6	1125	1130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013888	A	6	6	1196	1201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013888	A	7	7	1274	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013888	A	6	6	1744	1749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013888	T	6	6	1983	1988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013888	A	6	6	2276	2281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013888	T	7	7	2350	2356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013888	T	6	6	2435	2440	0 %	100 %	0 %	0 %	289193303
14	NC_013888	T	6	6	2530	2535	0 %	100 %	0 %	0 %	289193303
15	NC_013888	A	6	6	2556	2561	100 %	0 %	0 %	0 %	289193303
16	NC_013888	A	6	6	2634	2639	100 %	0 %	0 %	0 %	289193303
17	NC_013888	T	6	6	2705	2710	0 %	100 %	0 %	0 %	289193303
18	NC_013888	T	6	6	2714	2719	0 %	100 %	0 %	0 %	289193303
19	NC_013888	T	6	6	2888	2893	0 %	100 %	0 %	0 %	289193304
20	NC_013888	T	6	6	2983	2988	0 %	100 %	0 %	0 %	289193304
21	NC_013888	T	6	6	3146	3151	0 %	100 %	0 %	0 %	289193304
22	NC_013888	A	6	6	3163	3168	100 %	0 %	0 %	0 %	289193304
23	NC_013888	T	6	6	3224	3229	0 %	100 %	0 %	0 %	289193304
24	NC_013888	T	6	6	3671	3676	0 %	100 %	0 %	0 %	289193304
25	NC_013888	C	6	6	3858	3863	0 %	0 %	0 %	100 %	289193304
26	NC_013888	T	6	6	4184	4189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013888	A	6	6	4675	4680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013888	T	6	6	4693	4698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013888	A	6	6	4967	4972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013888	A	8	8	5543	5550	100 %	0 %	0 %	0 %	289193305
31	NC_013888	A	7	7	5922	5928	100 %	0 %	0 %	0 %	289193306
32	NC_013888	T	6	6	6481	6486	0 %	100 %	0 %	0 %	289193306
33	NC_013888	A	6	6	6489	6494	100 %	0 %	0 %	0 %	289193306
34	NC_013888	A	7	7	6882	6888	100 %	0 %	0 %	0 %	289193306
35	NC_013888	G	6	6	6911	6916	0 %	0 %	100 %	0 %	289193306
36	NC_013888	A	6	6	6919	6924	100 %	0 %	0 %	0 %	289193306
37	NC_013888	A	6	6	7582	7587	100 %	0 %	0 %	0 %	289193306
38	NC_013888	A	6	6	7615	7620	100 %	0 %	0 %	0 %	289193306
39	NC_013888	A	6	6	8261	8266	100 %	0 %	0 %	0 %	289193307
40	NC_013888	T	6	6	8407	8412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013888	A	6	6	8773	8778	100 %	0 %	0 %	0 %	289193309
42	NC_013888	A	6	6	9150	9155	100 %	0 %	0 %	0 %	289193310
43	NC_013888	A	6	6	9362	9367	100 %	0 %	0 %	0 %	289193310
44	NC_013888	A	6	6	9504	9509	100 %	0 %	0 %	0 %	289193310
45	NC_013888	T	6	6	9592	9597	0 %	100 %	0 %	0 %	289193311
46	NC_013888	A	6	6	10081	10086	100 %	0 %	0 %	0 %	289193312
47	NC_013888	T	6	6	10180	10185	0 %	100 %	0 %	0 %	289193312
48	NC_013888	A	6	6	10630	10635	100 %	0 %	0 %	0 %	289193313
49	NC_013888	A	6	6	10943	10948	100 %	0 %	0 %	0 %	289193313
50	NC_013888	A	6	6	11114	11119	100 %	0 %	0 %	0 %	289193313
51	NC_013888	A	6	6	11147	11152	100 %	0 %	0 %	0 %	289193313
52	NC_013888	A	6	6	11167	11172	100 %	0 %	0 %	0 %	289193313
53	NC_013888	T	6	6	11355	11360	0 %	100 %	0 %	0 %	289193313
54	NC_013888	A	6	6	11940	11945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013888	A	6	6	12049	12054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.