MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 1400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013887	ATAAA	2	10	785	794	80 %	20 %	0 %	0 %	289191498
2	NC_013887	AGAAA	2	10	896	905	80 %	0 %	20 %	0 %	289191498
3	NC_013887	AGGAC	2	10	4072	4081	40 %	0 %	40 %	20 %	289191501
4	NC_013887	CATTT	2	10	6341	6350	20 %	60 %	0 %	20 %	289191503
5	NC_013887	TATAT	2	10	10080	10089	40 %	60 %	0 %	0 %	289191507
6	NC_013887	GAAAA	2	10	11515	11524	80 %	0 %	20 %	0 %	289191508
7	NC_013887	TTGTG	2	10	11894	11903	0 %	60 %	40 %	0 %	289191509
8	NC_013887	TCTCT	2	10	12014	12023	0 %	60 %	0 %	40 %	289191509
9	NC_013887	ACTTA	2	10	12183	12192	40 %	40 %	0 %	20 %	289191509
10	NC_013887	CATCC	2	10	12452	12461	20 %	20 %	0 %	60 %	289191509
11	NC_013887	TAGCA	2	10	15246	15255	40 %	20 %	20 %	20 %	289191513
12	NC_013887	TAATA	2	10	17888	17897	60 %	40 %	0 %	0 %	289191516
13	NC_013887	ATTGG	2	10	17993	18002	20 %	40 %	40 %	0 %	289191516
14	NC_013887	ATTTT	2	10	19639	19648	20 %	80 %	0 %	0 %	289191519
15	NC_013887	TATAT	2	10	20267	20276	40 %	60 %	0 %	0 %	289191520
16	NC_013887	CTCTT	2	10	21268	21277	0 %	60 %	0 %	40 %	289191520
17	NC_013887	AAAAT	2	10	23053	23062	80 %	20 %	0 %	0 %	289191522
18	NC_013887	AGGAG	2	10	26573	26582	40 %	0 %	60 %	0 %	289191527
19	NC_013887	AATTA	2	10	28012	28021	60 %	40 %	0 %	0 %	289191529
20	NC_013887	TAAAT	2	10	33635	33644	60 %	40 %	0 %	0 %	289191537
21	NC_013887	TTTCA	2	10	34832	34841	20 %	60 %	0 %	20 %	289191538
22	NC_013887	AATTT	2	10	35572	35581	40 %	60 %	0 %	0 %	289191538
23	NC_013887	CAATC	2	10	35956	35965	40 %	20 %	0 %	40 %	289191538
24	NC_013887	AATTA	2	10	36011	36020	60 %	40 %	0 %	0 %	289191538
25	NC_013887	TTTGG	2	10	37770	37779	0 %	60 %	40 %	0 %	289191540
26	NC_013887	AGTTA	2	10	37807	37816	40 %	40 %	20 %	0 %	289191540
27	NC_013887	ACTTA	2	10	38230	38239	40 %	40 %	0 %	20 %	289191541
28	NC_013887	TTTAA	2	10	38330	38339	40 %	60 %	0 %	0 %	289191541
29	NC_013887	ACTAT	2	10	39290	39299	40 %	40 %	0 %	20 %	289191543
30	NC_013887	GTTAA	2	10	39314	39323	40 %	40 %	20 %	0 %	289191543
31	NC_013887	TAGGG	2	10	40537	40546	20 %	20 %	60 %	0 %	289191544
32	NC_013887	ATTTA	2	10	40647	40656	40 %	60 %	0 %	0 %	289191544
33	NC_013887	GTTGA	2	10	41009	41018	20 %	40 %	40 %	0 %	289191544
34	NC_013887	TATTT	2	10	49079	49088	20 %	80 %	0 %	0 %	289191551
35	NC_013887	TTATT	2	10	51195	51204	20 %	80 %	0 %	0 %	289191553
36	NC_013887	AATCC	2	10	53353	53362	40 %	20 %	0 %	40 %	289191555
37	NC_013887	AATTT	2	10	53557	53566	40 %	60 %	0 %	0 %	289191555
38	NC_013887	TAATT	2	10	53873	53882	40 %	60 %	0 %	0 %	289191556
39	NC_013887	TTATC	2	10	54215	54224	20 %	60 %	0 %	20 %	289191557
40	NC_013887	ATATA	2	10	54503	54512	60 %	40 %	0 %	0 %	289191558
41	NC_013887	CTATG	2	10	54519	54528	20 %	40 %	20 %	20 %	289191558
42	NC_013887	CATTT	2	10	56981	56990	20 %	60 %	0 %	20 %	289191561
43	NC_013887	ATTTT	2	10	57730	57739	20 %	80 %	0 %	0 %	289191561
44	NC_013887	ATTTA	2	10	58651	58660	40 %	60 %	0 %	0 %	289191563
45	NC_013887	GATTT	2	10	59477	59486	20 %	60 %	20 %	0 %	289191563
46	NC_013887	TTCTC	2	10	61128	61137	0 %	60 %	0 %	40 %	289191564
47	NC_013887	GATTG	2	10	62936	62945	20 %	40 %	40 %	0 %	289191566
48	NC_013887	AACTT	2	10	63725	63734	40 %	40 %	0 %	20 %	289191567
49	NC_013887	CCAAT	2	10	64959	64968	40 %	20 %	0 %	40 %	289191567
50	NC_013887	ATATT	2	10	65324	65333	40 %	60 %	0 %	0 %	289191568
51	NC_013887	TTTTA	2	10	66426	66435	20 %	80 %	0 %	0 %	289191569
52	NC_013887	TATTT	2	10	68035	68044	20 %	80 %	0 %	0 %	289191570
53	NC_013887	TGGAT	2	10	68481	68490	20 %	40 %	40 %	0 %	289191571
54	NC_013887	CTCTT	2	10	69252	69261	0 %	60 %	0 %	40 %	289191573
55	NC_013887	GCTTG	2	10	71125	71134	0 %	40 %	40 %	20 %	289191577
56	NC_013887	AATCC	2	10	71776	71785	40 %	20 %	0 %	40 %	289191578
57	NC_013887	TAACC	2	10	72243	72252	40 %	20 %	0 %	40 %	289191579
58	NC_013887	GGATG	2	10	76334	76343	20 %	20 %	60 %	0 %	289191586
59	NC_013887	TAAAT	2	10	81268	81277	60 %	40 %	0 %	0 %	289191592
60	NC_013887	GAAAT	2	10	84001	84010	60 %	20 %	20 %	0 %	289191595
61	NC_013887	AGATA	2	10	86101	86110	60 %	20 %	20 %	0 %	289191597
62	NC_013887	ACCTT	2	10	87284	87293	20 %	40 %	0 %	40 %	289191598
63	NC_013887	ATTGT	2	10	89025	89034	20 %	60 %	20 %	0 %	289191601
64	NC_013887	ATAAA	2	10	91200	91209	80 %	20 %	0 %	0 %	289191604
65	NC_013887	AAGAG	2	10	91729	91738	60 %	0 %	40 %	0 %	289191604
66	NC_013887	GATAA	2	10	92030	92039	60 %	20 %	20 %	0 %	289191604
67	NC_013887	ATTAT	2	10	92172	92181	40 %	60 %	0 %	0 %	289191605
68	NC_013887	ATTTG	2	10	92298	92307	20 %	60 %	20 %	0 %	289191605
69	NC_013887	ATTTT	2	10	92893	92902	20 %	80 %	0 %	0 %	289191606
70	NC_013887	ATAAA	2	10	94639	94648	80 %	20 %	0 %	0 %	289191607
71	NC_013887	AGAGC	2	10	96127	96136	40 %	0 %	40 %	20 %	289191608
72	NC_013887	GGATG	2	10	96395	96404	20 %	20 %	60 %	0 %	289191609
73	NC_013887	TTGGA	2	10	97012	97021	20 %	40 %	40 %	0 %	289191609
74	NC_013887	TTAGA	2	10	97129	97138	40 %	40 %	20 %	0 %	289191609
75	NC_013887	CAATG	2	10	97226	97235	40 %	20 %	20 %	20 %	289191609
76	NC_013887	ATAAA	2	10	97396	97405	80 %	20 %	0 %	0 %	289191609
77	NC_013887	ATTTT	2	10	97984	97993	20 %	80 %	0 %	0 %	289191610
78	NC_013887	TATTT	2	10	98698	98707	20 %	80 %	0 %	0 %	289191610
79	NC_013887	TTATC	2	10	107140	107149	20 %	60 %	0 %	20 %	289191615
80	NC_013887	GAATG	2	10	107159	107168	40 %	20 %	40 %	0 %	289191615
81	NC_013887	AGGAG	2	10	113396	113405	40 %	0 %	60 %	0 %	289191620
82	NC_013887	TAAAA	2	10	114782	114791	80 %	20 %	0 %	0 %	289191621
83	NC_013887	ATAAA	2	10	114829	114838	80 %	20 %	0 %	0 %	289191621
84	NC_013887	TAAAT	2	10	115423	115432	60 %	40 %	0 %	0 %	289191622
85	NC_013887	ATTAC	2	10	118251	118260	40 %	40 %	0 %	20 %	289191626
86	NC_013887	TAGAG	2	10	120965	120974	40 %	20 %	40 %	0 %	289191627
87	NC_013887	AGAGA	2	10	121293	121302	60 %	0 %	40 %	0 %	289191627
88	NC_013887	AAAAT	2	10	121471	121480	80 %	20 %	0 %	0 %	289191627
89	NC_013887	AGAAA	2	10	122346	122355	80 %	0 %	20 %	0 %	289191627
90	NC_013887	ATTTA	2	10	124731	124740	40 %	60 %	0 %	0 %	289191630
91	NC_013887	GAAGA	2	10	125015	125024	60 %	0 %	40 %	0 %	289191630
92	NC_013887	ATACT	2	10	125475	125484	40 %	40 %	0 %	20 %	289191630
93	NC_013887	GCAGA	2	10	126317	126326	40 %	0 %	40 %	20 %	289191632
94	NC_013887	TTCTT	2	10	128454	128463	0 %	80 %	0 %	20 %	289191634
95	NC_013887	TAAAT	2	10	130692	130701	60 %	40 %	0 %	0 %	289191637
96	NC_013887	TTTTA	2	10	133016	133025	20 %	80 %	0 %	0 %	289191640
97	NC_013887	GTCTT	2	10	134487	134496	0 %	60 %	20 %	20 %	289191641
98	NC_013887	GAAGG	2	10	135768	135777	40 %	0 %	60 %	0 %	289191642
99	NC_013887	TGATA	2	10	136457	136466	40 %	40 %	20 %	0 %	289191643
100	NC_013887	AATAT	2	10	137140	137149	60 %	40 %	0 %	0 %	289191644
101	NC_013887	CAAAA	2	10	137651	137660	80 %	0 %	0 %	20 %	289191645
102	NC_013887	ATATT	2	10	138007	138016	40 %	60 %	0 %	0 %	289191645
103	NC_013887	TCAAC	2	10	139795	139804	40 %	20 %	0 %	40 %	289191646
104	NC_013887	CATTG	2	10	140165	140174	20 %	40 %	20 %	20 %	289191647
105	NC_013887	ACTTT	2	10	141817	141826	20 %	60 %	0 %	20 %	289191647
106	NC_013887	ATCTC	2	10	142261	142270	20 %	40 %	0 %	40 %	289191648
107	NC_013887	CCCTC	2	10	142432	142441	0 %	20 %	0 %	80 %	289191648
108	NC_013887	ATAAA	2	10	142965	142974	80 %	20 %	0 %	0 %	289191648
109	NC_013887	ATCTT	2	10	143114	143123	20 %	60 %	0 %	20 %	289191649
110	NC_013887	AGTAG	2	10	146318	146327	40 %	20 %	40 %	0 %	289191652
111	NC_013887	TATAA	2	10	147389	147398	60 %	40 %	0 %	0 %	289191652
112	NC_013887	AAGCT	2	10	147532	147541	40 %	20 %	20 %	20 %	289191653
113	NC_013887	TAGTT	2	10	148451	148460	20 %	60 %	20 %	0 %	289191653
114	NC_013887	CTAAT	2	10	149079	149088	40 %	40 %	0 %	20 %	289191654
115	NC_013887	TTAGT	2	10	151473	151482	20 %	60 %	20 %	0 %	289191655
116	NC_013887	GTATT	2	10	151524	151533	20 %	60 %	20 %	0 %	289191655
117	NC_013887	TTTAA	2	10	152497	152506	40 %	60 %	0 %	0 %	289191655
118	NC_013887	TTCAA	2	10	153710	153719	40 %	40 %	0 %	20 %	289191657
119	NC_013887	CCAAT	2	10	154841	154850	40 %	20 %	0 %	40 %	289191658
120	NC_013887	TAAAC	2	10	154867	154876	60 %	20 %	0 %	20 %	289191658
121	NC_013887	AAACA	2	10	156302	156311	80 %	0 %	0 %	20 %	289191660
122	NC_013887	TATGT	2	10	158080	158089	20 %	60 %	20 %	0 %	289191662
123	NC_013887	TTCCT	2	10	158638	158647	0 %	60 %	0 %	40 %	289191663
124	NC_013887	CTTCT	2	10	160211	160220	0 %	60 %	0 %	40 %	289191664
125	NC_013887	TCCAA	2	10	161327	161336	40 %	20 %	0 %	40 %	289191665
126	NC_013887	TTAAC	2	10	163078	163087	40 %	40 %	0 %	20 %	289191667
127	NC_013887	CTGAG	2	10	163373	163382	20 %	20 %	40 %	20 %	289191667
128	NC_013887	CTCTT	2	10	164460	164469	0 %	60 %	0 %	40 %	289191669
129	NC_013887	CTTAA	2	10	165853	165862	40 %	40 %	0 %	20 %	289191670
130	NC_013887	ATTAT	2	10	165904	165913	40 %	60 %	0 %	0 %	289191670
131	NC_013887	TTATT	2	10	167303	167312	20 %	80 %	0 %	0 %	289191671
132	NC_013887	AAAAC	2	10	169075	169084	80 %	0 %	0 %	20 %	289191671
133	NC_013887	TTGTT	2	10	171360	171369	0 %	80 %	20 %	0 %	289191673
134	NC_013887	TTGGA	2	10	172691	172700	20 %	40 %	40 %	0 %	289191674
135	NC_013887	ATGAG	2	10	172867	172876	40 %	20 %	40 %	0 %	289191674
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