MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 5920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013887	TC	3	6	549	554	0 %	50 %	0 %	50 %	289191497
2	NC_013887	AT	3	6	1784	1789	50 %	50 %	0 %	0 %	289191499
3	NC_013887	GA	3	6	2765	2770	50 %	0 %	50 %	0 %	289191500
4	NC_013887	GA	3	6	2849	2854	50 %	0 %	50 %	0 %	289191500
5	NC_013887	AG	3	6	2935	2940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013887	GA	4	8	3961	3968	50 %	0 %	50 %	0 %	289191501
7	NC_013887	AG	3	6	4436	4441	50 %	0 %	50 %	0 %	289191501
8	NC_013887	GA	3	6	4556	4561	50 %	0 %	50 %	0 %	289191501
9	NC_013887	GA	3	6	4846	4851	50 %	0 %	50 %	0 %	289191502
10	NC_013887	GA	3	6	4876	4881	50 %	0 %	50 %	0 %	289191502
11	NC_013887	CA	3	6	5233	5238	50 %	0 %	0 %	50 %	289191502
12	NC_013887	AG	3	6	5378	5383	50 %	0 %	50 %	0 %	289191502
13	NC_013887	AG	3	6	5757	5762	50 %	0 %	50 %	0 %	289191502
14	NC_013887	AG	3	6	6105	6110	50 %	0 %	50 %	0 %	289191502
15	NC_013887	AG	3	6	6634	6639	50 %	0 %	50 %	0 %	289191503
16	NC_013887	AG	3	6	6792	6797	50 %	0 %	50 %	0 %	289191504
17	NC_013887	AT	3	6	7158	7163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013887	TG	3	6	7421	7426	0 %	50 %	50 %	0 %	289191505
19	NC_013887	AT	3	6	7474	7479	50 %	50 %	0 %	0 %	289191505
20	NC_013887	TC	3	6	7659	7664	0 %	50 %	0 %	50 %	289191506
21	NC_013887	TC	3	6	7862	7867	0 %	50 %	0 %	50 %	289191506
22	NC_013887	AT	3	6	7972	7977	50 %	50 %	0 %	0 %	289191506
23	NC_013887	TC	3	6	8178	8183	0 %	50 %	0 %	50 %	289191506
24	NC_013887	TC	4	8	8390	8397	0 %	50 %	0 %	50 %	289191506
25	NC_013887	TG	3	6	8448	8453	0 %	50 %	50 %	0 %	289191506
26	NC_013887	GA	3	6	8505	8510	50 %	0 %	50 %	0 %	289191506
27	NC_013887	TA	3	6	8649	8654	50 %	50 %	0 %	0 %	289191506
28	NC_013887	TA	3	6	8679	8684	50 %	50 %	0 %	0 %	289191506
29	NC_013887	TC	3	6	8729	8734	0 %	50 %	0 %	50 %	289191506
30	NC_013887	AT	3	6	10765	10770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013887	AT	3	6	11218	11223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013887	CT	3	6	12244	12249	0 %	50 %	0 %	50 %	289191509
33	NC_013887	TC	3	6	12469	12474	0 %	50 %	0 %	50 %	289191509
34	NC_013887	TC	3	6	12765	12770	0 %	50 %	0 %	50 %	289191509
35	NC_013887	TC	3	6	12942	12947	0 %	50 %	0 %	50 %	289191510
36	NC_013887	AT	3	6	12999	13004	50 %	50 %	0 %	0 %	289191510
37	NC_013887	AT	4	8	13406	13413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013887	TA	3	6	13477	13482	50 %	50 %	0 %	0 %	289191511
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41	NC_013887	TA	3	6	14478	14483	50 %	50 %	0 %	0 %	289191512
42	NC_013887	CT	4	8	14594	14601	0 %	50 %	0 %	50 %	289191512
43	NC_013887	TC	3	6	14688	14693	0 %	50 %	0 %	50 %	289191513
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50	NC_013887	GT	3	6	16930	16935	0 %	50 %	50 %	0 %	289191515
51	NC_013887	AT	3	6	16954	16959	50 %	50 %	0 %	0 %	289191515
52	NC_013887	AT	3	6	17412	17417	50 %	50 %	0 %	0 %	289191516
53	NC_013887	AT	3	6	17603	17608	50 %	50 %	0 %	0 %	289191516
54	NC_013887	TA	3	6	17614	17619	50 %	50 %	0 %	0 %	289191516
55	NC_013887	AT	3	6	17928	17933	50 %	50 %	0 %	0 %	289191516
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57	NC_013887	GA	3	6	17950	17955	50 %	0 %	50 %	0 %	289191516
58	NC_013887	TA	3	6	17956	17961	50 %	50 %	0 %	0 %	289191516
59	NC_013887	AG	3	6	18034	18039	50 %	0 %	50 %	0 %	289191516
60	NC_013887	TA	3	6	18176	18181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62	NC_013887	AT	3	6	19766	19771	50 %	50 %	0 %	0 %	289191519
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64	NC_013887	TC	3	6	20731	20736	0 %	50 %	0 %	50 %	289191520
65	NC_013887	CT	3	6	20762	20767	0 %	50 %	0 %	50 %	289191520
66	NC_013887	TC	3	6	20893	20898	0 %	50 %	0 %	50 %	289191520
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69	NC_013887	AT	3	6	22100	22105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013887	TA	5	10	22134	22143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013887	TA	3	6	22175	22180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74	NC_013887	AT	3	6	23561	23566	50 %	50 %	0 %	0 %	289191523
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80	NC_013887	TA	3	6	25678	25683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013887	GA	3	6	25877	25882	50 %	0 %	50 %	0 %	289191526
82	NC_013887	GA	3	6	26069	26074	50 %	0 %	50 %	0 %	289191526
83	NC_013887	AG	3	6	26127	26132	50 %	0 %	50 %	0 %	289191526
84	NC_013887	TA	4	8	26274	26281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_013887	TC	3	6	27262	27267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013887	GA	3	6	27433	27438	50 %	0 %	50 %	0 %	289191528
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95	NC_013887	TA	3	6	28827	28832	50 %	50 %	0 %	0 %	289191530
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104	NC_013887	TA	3	6	31136	31141	50 %	50 %	0 %	0 %	289191532
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111	NC_013887	AT	3	6	32737	32742	50 %	50 %	0 %	0 %	289191536
112	NC_013887	TA	3	6	33672	33677	50 %	50 %	0 %	0 %	289191537
113	NC_013887	AT	3	6	33995	34000	50 %	50 %	0 %	0 %	289191537
114	NC_013887	AT	3	6	34081	34086	50 %	50 %	0 %	0 %	289191537
115	NC_013887	TA	3	6	34217	34222	50 %	50 %	0 %	0 %	289191537
116	NC_013887	AT	3	6	34857	34862	50 %	50 %	0 %	0 %	289191538
117	NC_013887	TA	4	8	34880	34887	50 %	50 %	0 %	0 %	289191538
118	NC_013887	AT	3	6	35123	35128	50 %	50 %	0 %	0 %	289191538
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123	NC_013887	AT	3	6	36809	36814	50 %	50 %	0 %	0 %	289191539
124	NC_013887	AT	3	6	37347	37352	50 %	50 %	0 %	0 %	289191540
125	NC_013887	TC	3	6	37387	37392	0 %	50 %	0 %	50 %	289191540
126	NC_013887	TC	3	6	38038	38043	0 %	50 %	0 %	50 %	289191541
127	NC_013887	TC	3	6	38101	38106	0 %	50 %	0 %	50 %	289191541
128	NC_013887	CA	3	6	38496	38501	50 %	0 %	0 %	50 %	289191541
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131	NC_013887	TC	3	6	38987	38992	0 %	50 %	0 %	50 %	289191542
132	NC_013887	TA	3	6	39451	39456	50 %	50 %	0 %	0 %	289191543
133	NC_013887	AT	3	6	39495	39500	50 %	50 %	0 %	0 %	289191543
134	NC_013887	GA	3	6	39751	39756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013887	TA	3	6	39883	39888	50 %	50 %	0 %	0 %	289191544
136	NC_013887	TA	3	6	40052	40057	50 %	50 %	0 %	0 %	289191544
137	NC_013887	GA	3	6	40063	40068	50 %	0 %	50 %	0 %	289191544
138	NC_013887	AG	3	6	40279	40284	50 %	0 %	50 %	0 %	289191544
139	NC_013887	GA	4	8	40325	40332	50 %	0 %	50 %	0 %	289191544
140	NC_013887	AG	3	6	40456	40461	50 %	0 %	50 %	0 %	289191544
141	NC_013887	CT	3	6	40594	40599	0 %	50 %	0 %	50 %	289191544
142	NC_013887	AG	3	6	40975	40980	50 %	0 %	50 %	0 %	289191544
143	NC_013887	TA	3	6	42114	42119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013887	AC	3	6	42374	42379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013887	AT	3	6	42692	42697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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