MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013862	AGTC	2	8	2006	2013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013862	GATA	2	8	10030	10037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013862	AAAG	2	8	10136	10143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013862	AGAA	2	8	10163	10170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013862	GATA	2	8	10275	10282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013862	TGAA	2	8	11658	11665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013862	CGTG	2	8	11671	11678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013862	AGTT	2	8	13614	13621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013862	AGTC	2	8	16514	16521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013862	GGAT	2	8	16599	16606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013862	TGTA	2	8	16687	16694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013862	ATGT	2	8	16889	16896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013862	ATGA	2	8	16960	16967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013862	GTCA	2	8	19026	19033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013862	CGTT	2	8	22521	22528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013862	CATC	2	8	24410	24417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013862	AAGA	2	8	25357	25364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013862	AAAG	2	8	25405	25412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013862	TAAC	2	8	29669	29676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013862	TAGC	2	8	30800	30807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013862	ACCG	2	8	33428	33435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013862	GTTT	2	8	33469	33476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013862	TTTG	2	8	33498	33505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013862	GTTT	2	8	36841	36848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013862	TGAT	2	8	36853	36860	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013862	CTGC	2	8	37483	37490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013862	GGTT	2	8	38797	38804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.