MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02

Total Repeats: 392

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013862	CGG	2	6	294	299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986932
2	NC_013862	CAG	2	6	476	481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986932
3	NC_013862	GAA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986932
4	NC_013862	GTT	2	6	564	569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288986932
5	NC_013862	AAT	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288986933
6	NC_013862	AGC	2	6	969	974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986934
7	NC_013862	CTA	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986934
8	NC_013862	AAG	2	6	1089	1094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986934
9	NC_013862	GAA	2	6	1510	1515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986935
10	NC_013862	GAT	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986936
11	NC_013862	GCC	2	6	1601	1606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986936
12	NC_013862	AGC	2	6	1664	1669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986936
13	NC_013862	ACA	2	6	1765	1770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986936
14	NC_013862	TCG	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986936
15	NC_013862	GCA	2	6	1879	1884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986936
16	NC_013862	CTG	2	6	2095	2100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986937
17	NC_013862	TGC	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986937
18	NC_013862	GTC	2	6	2159	2164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986937
19	NC_013862	CCA	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986937
20	NC_013862	CTG	2	6	2251	2256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986937
21	NC_013862	GAA	2	6	2301	2306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986937
22	NC_013862	TGT	2	6	2342	2347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288986937
23	NC_013862	GAT	2	6	2368	2373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986937
24	NC_013862	CTG	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986937
25	NC_013862	CCG	2	6	2561	2566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986937
26	NC_013862	CTG	2	6	2611	2616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986937
27	NC_013862	GTG	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288986937
28	NC_013862	GGA	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288986937
29	NC_013862	TCA	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986937
30	NC_013862	CCG	2	6	2902	2907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986937
31	NC_013862	GCT	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986937
32	NC_013862	CTG	2	6	3025	3030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986937
33	NC_013862	CGC	2	6	3098	3103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986937
34	NC_013862	TGG	2	6	3167	3172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288986937
35	NC_013862	ATC	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986937
36	NC_013862	ACA	2	6	3206	3211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986937
37	NC_013862	AGA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986937
38	NC_013862	AAG	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986937
39	NC_013862	GCC	2	6	3705	3710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986937
40	NC_013862	TGC	2	6	3893	3898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986938
41	NC_013862	TGT	2	6	3899	3904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288986938
42	NC_013862	GCG	2	6	3973	3978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986938
43	NC_013862	TGG	2	6	4138	4143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288986939
44	NC_013862	GTG	2	6	4317	4322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288986939
45	NC_013862	CTG	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986939
46	NC_013862	GCG	2	6	4335	4340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986939
47	NC_013862	GCG	2	6	4399	4404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986939
48	NC_013862	GCT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986939
49	NC_013862	CGA	2	6	4567	4572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986940
50	NC_013862	GAA	2	6	4673	4678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986940
51	NC_013862	GTG	2	6	4731	4736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288986940
52	NC_013862	GTT	2	6	4757	4762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288986940
53	NC_013862	TAT	2	6	4764	4769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288986940
54	NC_013862	TCG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986940
55	NC_013862	CTG	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986940
56	NC_013862	CTT	2	6	5504	5509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288986940
57	NC_013862	AAC	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986940
58	NC_013862	GCT	2	6	5564	5569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986940
59	NC_013862	ACC	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986940
60	NC_013862	CCG	2	6	5688	5693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986940
61	NC_013862	CCT	2	6	5713	5718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288986940
62	NC_013862	CGC	2	6	5726	5731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986940
63	NC_013862	CGG	2	6	5745	5750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986940
64	NC_013862	GAT	2	6	5831	5836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986941
65	NC_013862	CGA	2	6	5837	5842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986941
66	NC_013862	CGG	2	6	5866	5871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986941
67	NC_013862	CGC	2	6	5995	6000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986941
68	NC_013862	CGA	2	6	6208	6213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986942
69	NC_013862	CTT	2	6	6214	6219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288986942
70	NC_013862	GCG	2	6	6318	6323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986943
71	NC_013862	ATC	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986943
72	NC_013862	TGC	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986943
73	NC_013862	GCG	2	6	6453	6458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986943
74	NC_013862	CAA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986943
75	NC_013862	CGC	2	6	6722	6727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986944
76	NC_013862	GCC	2	6	6756	6761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986944
77	NC_013862	CGG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
78	NC_013862	GAA	2	6	6848	6853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986944
79	NC_013862	GCC	2	6	6867	6872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986944
80	NC_013862	TGC	2	6	6877	6882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986944
81	NC_013862	GAC	2	6	6886	6891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986944
82	NC_013862	TGC	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986944
83	NC_013862	GCT	2	6	6947	6952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986944
84	NC_013862	CGC	2	6	7028	7033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986944
85	NC_013862	CGG	2	6	7129	7134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
86	NC_013862	CTG	2	6	7233	7238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986944
87	NC_013862	GCC	2	6	7356	7361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986944
88	NC_013862	CGG	2	6	7382	7387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
89	NC_013862	GGA	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288986944
90	NC_013862	CCA	2	6	7514	7519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986944
91	NC_013862	GGC	2	6	7569	7574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
92	NC_013862	GCG	2	6	7629	7634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
93	NC_013862	ACG	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986944
94	NC_013862	TGG	2	6	7690	7695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288986944
95	NC_013862	GTG	2	6	7764	7769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288986944
96	NC_013862	CCA	2	6	7771	7776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986944
97	NC_013862	GGC	2	6	7788	7793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
98	NC_013862	AAG	2	6	7833	7838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986944
99	NC_013862	GCC	2	6	7896	7901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986944
100	NC_013862	GCG	2	6	7962	7967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
101	NC_013862	CGG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
102	NC_013862	GGC	2	6	8019	8024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
103	NC_013862	CTG	2	6	8043	8048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986944
104	NC_013862	GAC	2	6	8060	8065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986944
105	NC_013862	CGA	2	6	8327	8332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986944
106	NC_013862	ACA	2	6	8374	8379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986944
107	NC_013862	GGT	3	9	8396	8404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288986944
108	NC_013862	GCT	2	6	8432	8437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986944
109	NC_013862	GTC	2	6	8473	8478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986944
110	NC_013862	GGC	2	6	8494	8499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
111	NC_013862	GAC	2	6	8667	8672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986944
112	NC_013862	CAA	2	6	8693	8698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986944
113	NC_013862	CGG	2	6	8767	8772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
114	NC_013862	ACC	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986944
115	NC_013862	TGG	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288986944
116	NC_013862	TAC	2	6	8877	8882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986944
117	NC_013862	CCG	2	6	8887	8892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986944
118	NC_013862	GAC	2	6	8964	8969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986944
119	NC_013862	GCA	2	6	9065	9070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986944
120	NC_013862	GGC	2	6	9077	9082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
121	NC_013862	GAC	2	6	9114	9119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288986944
122	NC_013862	GCG	2	6	9123	9128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288986944
123	NC_013862	AAG	2	6	9171	9176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288986944
124	NC_013862	TCT	2	6	9259	9264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288986944
125	NC_013862	ATC	2	6	9468	9473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986944
126	NC_013862	GAT	2	6	9510	9515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986944
127	NC_013862	GCT	2	6	9554	9559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986944
128	NC_013862	CAA	2	6	9590	9595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288986944
129	NC_013862	CAT	2	6	9650	9655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986944
130	NC_013862	GCC	2	6	9666	9671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288986944
131	NC_013862	CAC	2	6	10825	10830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288986945
132	NC_013862	GAT	2	6	11306	11311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288986946
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251	NC_013862	CAT	2	6	24924	24929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288986959
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377	NC_013862	CTG	2	6	37237	37242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288986977
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.