MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013862	TC	3	6	3237	3242	0 %	50 %	0 %	50 %	288986937
2	NC_013862	TC	3	6	4127	4132	0 %	50 %	0 %	50 %	288986939
3	NC_013862	CT	3	6	7821	7826	0 %	50 %	0 %	50 %	288986944
4	NC_013862	TG	3	6	8728	8733	0 %	50 %	50 %	0 %	288986944
5	NC_013862	TC	3	6	9209	9214	0 %	50 %	0 %	50 %	288986944
6	NC_013862	AG	3	6	9462	9467	50 %	0 %	50 %	0 %	288986944
7	NC_013862	GC	3	6	9784	9789	0 %	0 %	50 %	50 %	288986944
8	NC_013862	GT	4	8	9947	9954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013862	CT	3	6	10470	10475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013862	AT	3	6	11556	11561	50 %	50 %	0 %	0 %	288986946
11	NC_013862	GA	3	6	12327	12332	50 %	0 %	50 %	0 %	288986948
12	NC_013862	TG	3	6	12526	12531	0 %	50 %	50 %	0 %	288986948
13	NC_013862	AT	3	6	12642	12647	50 %	50 %	0 %	0 %	288986948
14	NC_013862	GT	3	6	12910	12915	0 %	50 %	50 %	0 %	288986948
15	NC_013862	CG	3	6	12941	12946	0 %	0 %	50 %	50 %	288986948
16	NC_013862	TC	3	6	13600	13605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013862	CA	3	6	14076	14081	50 %	0 %	0 %	50 %	288986949
18	NC_013862	AC	3	6	14479	14484	50 %	0 %	0 %	50 %	288986949
19	NC_013862	TG	3	6	16704	16709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013862	GC	3	6	16784	16789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013862	CT	4	8	16811	16818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013862	TA	3	6	17002	17007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013862	AT	3	6	17220	17225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013862	CA	3	6	18028	18033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013862	CT	3	6	18981	18986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013862	CT	3	6	19007	19012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013862	TG	3	6	19328	19333	0 %	50 %	50 %	0 %	288986954
28	NC_013862	CA	3	6	20400	20405	50 %	0 %	0 %	50 %	288986955
29	NC_013862	GC	3	6	20999	21004	0 %	0 %	50 %	50 %	288986955
30	NC_013862	AC	3	6	22970	22975	50 %	0 %	0 %	50 %	288986958
31	NC_013862	GC	3	6	24181	24186	0 %	0 %	50 %	50 %	288986958
32	NC_013862	GT	3	6	25518	25523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013862	AC	3	6	25694	25699	50 %	0 %	0 %	50 %	288986960
34	NC_013862	CA	4	8	26057	26064	50 %	0 %	0 %	50 %	288986961
35	NC_013862	AT	3	6	27690	27695	50 %	50 %	0 %	0 %	288986963
36	NC_013862	GC	3	6	31223	31228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013862	CT	3	6	31381	31386	0 %	50 %	0 %	50 %	288986967
38	NC_013862	TG	3	6	31583	31588	0 %	50 %	50 %	0 %	288986967
39	NC_013862	TC	3	6	32686	32691	0 %	50 %	0 %	50 %	288986970
40	NC_013862	CG	3	6	34145	34150	0 %	0 %	50 %	50 %	288986971
41	NC_013862	GA	3	6	34412	34417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013862	GC	3	6	34518	34523	0 %	0 %	50 %	50 %	288986972
43	NC_013862	AT	3	6	36834	36839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013862	GA	3	6	37693	37698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013862	GT	3	6	37848	37853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013862	AC	3	6	38251	38256	50 %	0 %	0 %	50 %	288986978
47	NC_013862	GA	3	6	38953	38958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013862	GA	3	6	38997	39002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013862	GA	3	6	39831	39836	50 %	0 %	50 %	0 %	288986979

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.