MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013862	TC	3	6	3237	3242	0 %	50 %	0 %	50 %	288986937
2	NC_013862	TC	3	6	4127	4132	0 %	50 %	0 %	50 %	288986939
3	NC_013862	CT	3	6	7821	7826	0 %	50 %	0 %	50 %	288986944
4	NC_013862	TG	3	6	8728	8733	0 %	50 %	50 %	0 %	288986944
5	NC_013862	TC	3	6	9209	9214	0 %	50 %	0 %	50 %	288986944
6	NC_013862	AG	3	6	9462	9467	50 %	0 %	50 %	0 %	288986944
7	NC_013862	GC	3	6	9784	9789	0 %	0 %	50 %	50 %	288986944
8	NC_013862	AT	3	6	11556	11561	50 %	50 %	0 %	0 %	288986946
9	NC_013862	GA	3	6	12327	12332	50 %	0 %	50 %	0 %	288986948
10	NC_013862	TG	3	6	12526	12531	0 %	50 %	50 %	0 %	288986948
11	NC_013862	AT	3	6	12642	12647	50 %	50 %	0 %	0 %	288986948
12	NC_013862	GT	3	6	12910	12915	0 %	50 %	50 %	0 %	288986948
13	NC_013862	CG	3	6	12941	12946	0 %	0 %	50 %	50 %	288986948
14	NC_013862	CA	3	6	14076	14081	50 %	0 %	0 %	50 %	288986949
15	NC_013862	AC	3	6	14479	14484	50 %	0 %	0 %	50 %	288986949
16	NC_013862	TG	3	6	19328	19333	0 %	50 %	50 %	0 %	288986954
17	NC_013862	CA	3	6	20400	20405	50 %	0 %	0 %	50 %	288986955
18	NC_013862	GC	3	6	20999	21004	0 %	0 %	50 %	50 %	288986955
19	NC_013862	AC	3	6	22970	22975	50 %	0 %	0 %	50 %	288986958
20	NC_013862	GC	3	6	24181	24186	0 %	0 %	50 %	50 %	288986958
21	NC_013862	AC	3	6	25694	25699	50 %	0 %	0 %	50 %	288986960
22	NC_013862	CA	4	8	26057	26064	50 %	0 %	0 %	50 %	288986961
23	NC_013862	AT	3	6	27690	27695	50 %	50 %	0 %	0 %	288986963
24	NC_013862	CT	3	6	31381	31386	0 %	50 %	0 %	50 %	288986967
25	NC_013862	TG	3	6	31583	31588	0 %	50 %	50 %	0 %	288986967
26	NC_013862	TC	3	6	32686	32691	0 %	50 %	0 %	50 %	288986970
27	NC_013862	CG	3	6	34145	34150	0 %	0 %	50 %	50 %	288986971
28	NC_013862	GC	3	6	34518	34523	0 %	0 %	50 %	50 %	288986972
29	NC_013862	AC	3	6	38251	38256	50 %	0 %	0 %	50 %	288986978
30	NC_013862	GA	3	6	39831	39836	50 %	0 %	50 %	0 %	288986979

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.