MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella longbeachae NSW150 chromosome

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013861	ACAATA	2	12	18783	18794	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013861	ATTAAA	2	12	27531	27542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013861	ATAAAA	2	12	32182	32193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013861	TTCATT	2	12	33830	33841	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013861	ATTAAA	2	12	39552	39563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013861	CAAATT	2	12	43550	43561	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013861	ATAAAA	2	12	54856	54867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013861	AAATAA	2	12	81887	81898	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013861	ATTCAA	2	12	82546	82557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013861	ATATTA	2	12	94229	94240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013861	CCTAAC	2	12	102569	102580	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013861	TTTAAT	2	12	110853	110864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013861	TATTTA	2	12	204861	204872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013861	GATCCT	2	12	259373	259384	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013861	AAATGA	2	12	285807	285818	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013861	TTGAAT	2	12	344480	344491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013861	TGAAAT	2	12	348637	348648	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013861	AAAATT	2	12	427043	427054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013861	ATTCGA	2	12	441841	441852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013861	TTTGCT	2	12	462387	462398	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013861	TAAAAA	2	12	504443	504454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013861	AATGGG	2	12	511174	511185	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013861	TGAAAT	2	12	544103	544114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013861	TGGTTT	2	12	662069	662080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013861	TTTCCC	2	12	664903	664914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013861	AACCAA	2	12	672493	672504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013861	TAATGG	2	12	694880	694891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013861	ATGAAA	2	12	728178	728189	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013861	TGAGTT	2	12	800411	800422	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013861	ATTATA	2	12	813117	813128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013861	AAATCA	2	12	847347	847358	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013861	CTTATT	2	12	852378	852389	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013861	AAAACT	2	12	877801	877812	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013861	AATTTA	2	12	878961	878972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013861	CTATAC	2	12	899881	899892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013861	TGCACT	2	12	905856	905867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013861	TTAAAT	2	12	962803	962814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013861	TTAAAG	2	12	1010367	1010378	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013861	CTTATT	2	12	1022491	1022502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013861	CTTTTG	2	12	1026455	1026466	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013861	GAGAAT	2	12	1040232	1040243	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013861	TGTACA	2	12	1085028	1085039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013861	AACTCT	2	12	1098625	1098636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013861	CAATAA	2	12	1101088	1101099	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013861	CAATAT	2	12	1110913	1110924	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013861	TATTTT	2	12	1111161	1111172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013861	AAAAGT	2	12	1113538	1113549	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013861	CTTTTC	2	12	1117213	1117224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013861	TGAAAT	2	12	1121795	1121806	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013861	AATCAT	2	12	1157430	1157441	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013861	ATTGTT	2	12	1206972	1206983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013861	ATTATA	2	12	1241104	1241115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013861	ACTGAA	2	12	1276796	1276807	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013861	AATTTT	2	12	1281559	1281570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013861	ATTAAT	2	12	1301441	1301452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013861	TTTTAA	2	12	1340354	1340365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013861	ATTCAG	2	12	1343221	1343232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013861	AGCTGT	2	12	1344389	1344400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013861	ATGGAG	2	12	1402303	1402314	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013861	TTAAAT	2	12	1406099	1406110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013861	ATATTT	2	12	1442060	1442071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013861	TAAATA	2	12	1458562	1458573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013861	AATTAA	2	12	1501260	1501271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013861	TGAAAA	2	12	1525175	1525186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013861	CATTAT	2	12	1525827	1525838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013861	GTTTTT	2	12	1533635	1533646	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013861	AAAGCG	2	12	1536018	1536029	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013861	TTTTTG	2	12	1543266	1543277	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013861	TACTTA	2	12	1575977	1575988	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013861	TTTATA	2	12	1609611	1609622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013861	TCAAAT	2	12	1615607	1615618	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013861	ATATAA	2	12	1626353	1626364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013861	TGGTAT	2	12	1635389	1635400	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013861	TCTTAT	2	12	1655117	1655128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013861	CTTATT	3	18	1694839	1694856	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013861	TTTTTA	2	12	1715495	1715506	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013861	ATTTAT	2	12	1754054	1754065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013861	TAAATT	2	12	1756808	1756819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013861	AGTTAA	2	12	1758791	1758802	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013861	TCATTA	2	12	1765708	1765719	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013861	ACACTA	2	12	1774678	1774689	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013861	TATTTT	2	12	1781981	1781992	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013861	AATTAA	2	12	1842371	1842382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013861	GACCAC	2	12	1844059	1844070	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013861	GCAATA	2	12	1893458	1893469	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013861	ATTGAT	2	12	1914735	1914746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013861	TAACCT	2	12	1923727	1923738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013861	TAAATG	2	12	1935212	1935223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013861	TGATAA	2	12	1935263	1935274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013861	AGCAAA	2	12	1942151	1942162	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013861	CTTTAA	2	12	1945472	1945483	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013861	ATAGGA	2	12	1959475	1959486	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013861	ATACTG	2	12	2019034	2019045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013861	TACGAG	2	12	2024711	2024722	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013861	ACTTTT	2	12	2032038	2032049	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013861	TTTGTT	2	12	2033702	2033713	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013861	AACATT	2	12	2081341	2081352	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013861	TATAAA	2	12	2157918	2157929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013861	ATTTAT	2	12	2183510	2183521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013861	TATTCT	2	12	2186540	2186551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013861	CACAAT	2	12	2202293	2202304	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013861	CTTTTT	2	12	2202423	2202434	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013861	CGATAT	2	12	2224521	2224532	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013861	CCAATA	2	12	2229776	2229787	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013861	CACAAA	2	12	2238453	2238464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013861	TTTAAT	2	12	2238582	2238593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013861	ATGAAA	2	12	2249733	2249744	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013861	TAATAT	2	12	2266658	2266669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013861	TAAATA	2	12	2267987	2267998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013861	TTTGAT	2	12	2290580	2290591	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013861	AATAGT	2	12	2290813	2290824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013861	GATAGG	2	12	2308058	2308069	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013861	GCTTTT	2	12	2334043	2334054	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013861	GCAGGA	3	18	2343675	2343692	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013861	AGAATA	2	12	2358316	2358327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013861	TGAAAA	2	12	2394658	2394669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013861	AACTGG	2	12	2429931	2429942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013861	ATTCCT	2	12	2436724	2436735	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013861	AATCTC	2	12	2451240	2451251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013861	GCAATT	2	12	2452278	2452289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_013861	TAAAGA	2	12	2455239	2455250	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013861	CAAAAA	2	12	2481861	2481872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013861	TAAAAA	2	12	2483506	2483517	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013861	GTCAAG	2	12	2484547	2484558	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_013861	TATAAT	2	12	2506575	2506586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013861	ACCAAG	2	12	2556636	2556647	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013861	CAAATT	2	12	2565422	2565433	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013861	AGATCA	2	12	2575631	2575642	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013861	CAACAG	2	12	2589658	2589669	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013861	ATTAGA	2	12	2622454	2622465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013861	TACTGA	2	12	2685539	2685550	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013861	TCTAAA	2	12	2741749	2741760	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_013861	CAAAAG	2	12	2762810	2762821	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013861	ATCATT	2	12	2784486	2784497	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_013861	CCAATA	2	12	2793324	2793335	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013861	TAATGA	2	12	2809659	2809670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013861	ATAATC	2	12	2826879	2826890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_013861	TATTTT	2	12	2840430	2840441	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013861	CCTGCT	2	12	2855575	2855586	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013861	AAATTT	2	12	2891309	2891320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013861	TTTTTA	2	12	2914479	2914490	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013861	CACCCC	2	12	2943414	2943425	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
143	NC_013861	TGCAAA	2	12	3001715	3001726	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_013861	TTTCGC	2	12	3012456	3012467	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013861	ATCCCA	3	18	3012550	3012567	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013861	TCGAAT	2	12	3014690	3014701	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_013861	ATTTCA	2	12	3084868	3084879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_013861	CAATAC	2	12	3106964	3106975	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_013861	TATGAC	2	12	3129143	3129154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_013861	AAATAA	2	12	3139031	3139042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013861	TAAATC	2	12	3156595	3156606	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_013861	TCAAAA	2	12	3187591	3187602	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_013861	CAATTT	2	12	3210118	3210129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_013861	TAAAGA	2	12	3214013	3214024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013861	TTTAAA	2	12	3256344	3256355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013861	TGTTTT	2	12	3298005	3298016	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013861	GATTAA	2	12	3298091	3298102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013861	AAAATA	2	12	3301578	3301589	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013861	ATGTTT	2	12	3309874	3309885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013861	CTTTTT	2	12	3331134	3331145	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_013861	TTCAGC	2	12	3439703	3439714	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_013861	ATCTTG	2	12	3450586	3450597	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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165	NC_013861	TAAAAT	2	12	3467762	3467773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013861	CTCAAT	2	12	3471440	3471451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_013861	CCTCAA	2	12	3505381	3505392	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_013861	ATTCTG	2	12	3545080	3545091	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
170	NC_013861	TCCATC	2	12	3552287	3552298	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
171	NC_013861	GTTATC	2	12	3576387	3576398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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178	NC_013861	TGACAT	2	12	3780280	3780291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
179	NC_013861	AACAAA	2	12	3800034	3800045	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.