MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510f

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013860	GGCGAT	2	12	2558	2569	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288963028
2	NC_013860	GGCCGA	2	12	7301	7312	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288963031
3	NC_013860	CGCCCG	2	12	7322	7333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288963031
4	NC_013860	CCTTCA	2	12	12828	12839	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	288963034
5	NC_013860	GATCGA	2	12	14068	14079	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288963036
6	NC_013860	CAGCCC	2	12	14630	14641	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	288963036
7	NC_013860	CCGGGG	2	12	15537	15548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288963037
8	NC_013860	GTGACG	2	12	16353	16364	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288963037
9	NC_013860	CCGATC	2	12	20688	20699	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288963040
10	NC_013860	GGCAAG	2	12	22711	22722	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	288963041
11	NC_013860	GTCGGC	2	12	24355	24366	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	288963043
12	NC_013860	ATGAAC	2	12	24968	24979	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	288963043
13	NC_013860	CCAGGC	2	12	27367	27378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288963046
14	NC_013860	TCAACG	2	12	32434	32445	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288963053
15	NC_013860	ACCGGC	2	12	34091	34102	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288963054
16	NC_013860	CCATGG	2	12	34684	34695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963054
17	NC_013860	TGCTGG	2	12	34704	34715	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	288963054
18	NC_013860	GGTGAT	2	12	35281	35292	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	288963055
19	NC_013860	GCGAGC	2	12	35940	35951	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288963056
20	NC_013860	GCCGAT	2	12	41248	41259	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963061
21	NC_013860	GAAAAA	2	12	42267	42278	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	288963062
22	NC_013860	CGAGGA	2	12	43062	43073	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	288963063
23	NC_013860	CCGATG	2	12	46819	46830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963064
24	NC_013860	CGCGCC	2	12	51785	51796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288963068
25	NC_013860	AGCCGG	2	12	52405	52416	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288963069
26	NC_013860	CGTCCA	2	12	53457	53468	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288963070
27	NC_013860	TTCCCC	2	12	55948	55959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288963072
28	NC_013860	CTTGTC	2	12	56654	56665	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	288963073
29	NC_013860	CTTGCC	2	12	57026	57037	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	288963073
30	NC_013860	ACATCC	2	12	57995	58006	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	288963074
31	NC_013860	TGCCGA	2	12	58673	58684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963075
32	NC_013860	CGGCCG	2	12	66058	66069	0 %	0 %	50 %	50 %	288963082
33	NC_013860	CCCTCC	2	12	67663	67674	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	288963084
34	NC_013860	GCAGTC	2	12	68328	68339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963086
35	NC_013860	CTCCGT	2	12	69096	69107	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	288963086
36	NC_013860	GCGAGC	2	12	70448	70459	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288963087
37	NC_013860	TCGAAC	2	12	73045	73056	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288963090
38	NC_013860	CGCCAA	2	12	73733	73744	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	288963091
39	NC_013860	GTTCCT	2	12	75338	75349	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	288963092
40	NC_013860	CGGCGA	2	12	86697	86708	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288963099
41	NC_013860	GCCGCA	2	12	87216	87227	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288963099
42	NC_013860	CAGCGA	2	12	88746	88757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288963100
43	NC_013860	TGCCGG	2	12	95078	95089	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	288963100
44	NC_013860	TCGCCG	2	12	97085	97096	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	288963101
45	NC_013860	GTCACA	2	12	98705	98716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288963102
46	NC_013860	TCGAAC	2	12	108166	108177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288963113
47	NC_013860	CGCCAA	2	12	108854	108865	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	288963114
48	NC_013860	GGACTT	2	12	109067	109078	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288963114
49	NC_013860	TGGAGG	2	12	110881	110892	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	288963115
50	NC_013860	CATCCT	2	12	112269	112280	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	288963118
51	NC_013860	GGCCTC	2	12	121402	121413	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	288963125
52	NC_013860	CAAGGC	2	12	121678	121689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288963125
53	NC_013860	GGCCGC	2	12	121912	121923	0 %	0 %	50 %	50 %	288963125
54	NC_013860	TCGGCG	2	12	124595	124606	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	288963127
55	NC_013860	CTTGGC	2	12	128522	128533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288963131
56	NC_013860	CAGGCA	2	12	131757	131768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288963133
57	NC_013860	GGCGAT	2	12	131940	131951	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288963133
58	NC_013860	TGGCGA	2	12	131960	131971	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288963133
59	NC_013860	CCCTCG	2	12	135836	135847	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	288963136
60	NC_013860	GCCTTG	2	12	136924	136935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288963137
61	NC_013860	ACATCG	2	12	137684	137695	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288963137
62	NC_013860	CGACCG	2	12	140792	140803	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288963140
63	NC_013860	GCCGGG	2	12	142064	142075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288963140
64	NC_013860	GGAGCG	2	12	142486	142497	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	288963141
65	NC_013860	CAGGCA	2	12	143673	143684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288963142
66	NC_013860	CGGTGG	2	12	148425	148436	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	288963145
67	NC_013860	CGCCGT	2	12	150641	150652	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	288963147
68	NC_013860	CGAGGC	2	12	152187	152198	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288963148
69	NC_013860	CCCTAT	2	12	154612	154623	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	288963150
70	NC_013860	CGACCT	2	12	156064	156075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288963151
71	NC_013860	CCGGCT	2	12	156697	156708	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	288963152
72	NC_013860	CGAAGG	2	12	158112	158123	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	288963153
73	NC_013860	GCGAGG	2	12	159262	159273	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	288963154
74	NC_013860	CACAAC	2	12	159698	159709	50 %	0 %	0 %	50 %	288963154
75	NC_013860	AACATC	2	12	160068	160079	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	288963154
76	NC_013860	CACCGC	2	12	160508	160519	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	288963154
77	NC_013860	TCACCA	2	12	161302	161313	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	288963154
78	NC_013860	CAGGAC	2	12	161373	161384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288963154
79	NC_013860	CGGCAA	2	12	162032	162043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288963154
80	NC_013860	TGACGG	2	12	163162	163173	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288963154
81	NC_013860	TCCCTG	2	12	163431	163442	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	288963154
82	NC_013860	TCCGGC	2	12	163833	163844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	288963154
83	NC_013860	CCGGCG	2	12	163858	163869	0 %	0 %	50 %	50 %	288963154
84	NC_013860	ACGCTG	2	12	164124	164135	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963154
85	NC_013860	CAAGAC	2	12	164399	164410	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	288963154
86	NC_013860	CGCCGG	2	12	164675	164686	0 %	0 %	50 %	50 %	288963154
87	NC_013860	GACCCT	2	12	164801	164812	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288963154
88	NC_013860	ACGCTG	2	12	165336	165347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963154
89	NC_013860	CCTGAC	2	12	165734	165745	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288963154
90	NC_013860	CCAACG	2	12	165802	165813	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	288963154
91	NC_013860	GCCGGC	2	12	166035	166046	0 %	0 %	50 %	50 %	288963154
92	NC_013860	GGCACC	2	12	166734	166745	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288963154
93	NC_013860	CCGTCA	2	12	167074	167085	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288963154
94	NC_013860	CCGTCA	3	18	167335	167352	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288963154
95	NC_013860	CGTCAC	2	12	167702	167713	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288963154
96	NC_013860	CCGACG	2	12	167854	167865	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288963154
97	NC_013860	CACCGT	2	12	168803	168814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288963154
98	NC_013860	CGCCGG	2	12	170045	170056	0 %	0 %	50 %	50 %	288963154
99	NC_013860	CAGAAT	2	12	170922	170933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	288963154
100	NC_013860	AGGCGG	2	12	175182	175193	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	288963157
101	NC_013860	CTGGCA	2	12	178320	178331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963160
102	NC_013860	CGCTGG	2	12	189538	189549	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	288963172
103	NC_013860	TGTCGG	2	12	191513	191524	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	288963175
104	NC_013860	GCATCG	2	12	191530	191541	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963175
105	NC_013860	GCCGAG	2	12	191820	191831	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288963175
106	NC_013860	ATGGCC	2	12	193368	193379	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963178
107	NC_013860	GCAGAT	2	12	194676	194687	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288963179
108	NC_013860	CGCAAC	2	12	196400	196411	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	288963179
109	NC_013860	GGTCAC	2	12	197348	197359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963180
110	NC_013860	CGGTGC	3	18	203101	203118	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	288963180
111	NC_013860	GCCGAG	2	12	206269	206280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288963181
112	NC_013860	CCGGAA	2	12	206947	206958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288963181
113	NC_013860	AGCGGA	2	12	210989	211000	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	288963184
114	NC_013860	GCCAAG	2	12	211233	211244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288963184
115	NC_013860	CGTTGC	2	12	212186	212197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288963184
116	NC_013860	CGGCCT	2	12	218764	218775	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	288963188
117	NC_013860	CCGAGG	2	12	220227	220238	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288963190
118	NC_013860	TGGCGG	2	12	221702	221713	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	288963191
119	NC_013860	CTCGTC	2	12	223549	223560	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	288963191
120	NC_013860	GAAGGG	2	12	223693	223704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288963191
121	NC_013860	GAAGGC	2	12	227087	227098	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	288963192
122	NC_013860	CGGGGC	2	12	227701	227712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288963192
123	NC_013860	GTGCAG	2	12	228965	228976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288963192
124	NC_013860	CCTGAC	2	12	234039	234050	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288963194
125	NC_013860	ACCAGC	2	12	245261	245272	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	288963201
126	NC_013860	GGCACC	2	12	247283	247294	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288963202
127	NC_013860	GAAGCG	2	12	248528	248539	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	288963202
128	NC_013860	CCGGCG	2	12	248736	248747	0 %	0 %	50 %	50 %	288963202
129	NC_013860	CATAGG	2	12	248880	248891	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288963202
130	NC_013860	GCTTCC	2	12	251139	251150	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	288963204
131	NC_013860	CAGGAC	2	12	255617	255628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288963208
132	NC_013860	GGAAGG	2	12	256185	256196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288963209
133	NC_013860	CCTCCA	2	12	256263	256274	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	288963209
134	NC_013860	CGCAGC	2	12	256577	256588	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288963209
135	NC_013860	AGCACC	2	12	257111	257122	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	288963209
136	NC_013860	GCGATG	2	12	257657	257668	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288963210
137	NC_013860	CTCGAT	2	12	258094	258105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288963210
138	NC_013860	AGCGCG	2	12	259004	259015	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	288963210
139	NC_013860	CCTGGG	2	12	260525	260536	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	288963212
140	NC_013860	GGAACA	2	12	260939	260950	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	288963212
141	NC_013860	TAGCCG	2	12	261079	261090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288963212

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.