MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510f

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013860	GGTT	2	8	91	98	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013860	AGGA	2	8	288	295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013860	GCGG	2	8	342	349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013860	TGGA	2	8	1747	1754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013860	CGGG	2	8	10467	10474	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013860	TTTA	2	8	13608	13615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013860	TCCG	2	8	19340	19347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013860	GGCG	2	8	20575	20582	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013860	GGTC	2	8	23592	23599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013860	TCGA	2	8	23901	23908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013860	GGGC	2	8	28889	28896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013860	TCCG	2	8	36443	36450	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013860	CAAT	2	8	38242	38249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013860	GACG	2	8	40078	40085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013860	GCTT	2	8	40139	40146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013860	TTAA	2	8	41603	41610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013860	TGAG	2	8	41621	41628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013860	GGCC	2	8	47471	47478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013860	CCGG	2	8	56469	56476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013860	GGGC	2	8	58337	58344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013860	TGGC	2	8	68075	68082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013860	GGCT	2	8	68096	68103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013860	CCGC	2	8	69445	69452	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_013860	TGAG	2	8	70080	70087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013860	CCCG	2	8	76968	76975	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_013860	AGCG	2	8	97618	97625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013860	GATC	2	8	97631	97638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013860	CGGG	2	8	97716	97723	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013860	AAAG	2	8	98127	98134	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013860	TTTA	2	8	98226	98233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013860	AGAA	2	8	98330	98337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013860	CGCC	2	8	98420	98427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_013860	ATTC	2	8	101706	101713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013860	ATAC	2	8	101736	101743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013860	GCAT	2	8	101930	101937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013860	ATCA	2	8	102017	102024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013860	CGGA	2	8	106445	106452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013860	CTGA	2	8	110997	111004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013860	GCCT	2	8	122303	122310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013860	TCCG	2	8	122348	122355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013860	GCCT	2	8	125491	125498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013860	CGGT	2	8	132560	132567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013860	GCAA	2	8	132710	132717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013860	CCGG	3	12	133907	133918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013860	CCGG	2	8	139284	139291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013860	GCCG	2	8	142259	142266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013860	CACG	2	8	145282	145289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013860	CCTG	2	8	148820	148827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013860	GCGG	2	8	151781	151788	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013860	TCCG	2	8	154330	154337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013860	CCCG	2	8	154425	154432	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_013860	CCGC	2	8	155317	155324	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_013860	CCAT	2	8	155332	155339	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013860	GGGA	2	8	155479	155486	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013860	GCCG	2	8	155613	155620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013860	CCGG	2	8	158576	158583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013860	CTGC	2	8	178064	178071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013860	GTGA	2	8	184764	184771	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013860	CGGC	2	8	185963	185970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013860	TCAC	2	8	190290	190297	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013860	CGCT	2	8	216185	216192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013860	GGTT	2	8	216270	216277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013860	CGGG	2	8	216912	216919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013860	GGGC	2	8	230066	230073	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013860	AAGC	2	8	230087	230094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013860	TCCG	2	8	232919	232926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013860	GCCG	2	8	234806	234813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013860	ACGC	2	8	235554	235561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013860	TGAC	2	8	239177	239184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013860	GAAG	2	8	249820	249827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.