MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510e

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013859	CAGGA	2	10	244	253	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013859	CGCAC	2	10	745	754	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_013859	GCCGG	2	10	9491	9500	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013859	AAAGT	2	10	16124	16133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013859	TTCGG	2	10	16560	16569	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013859	TTCGG	2	10	17407	17416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013859	TCGTG	2	10	17454	17463	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013859	ACGGG	2	10	18336	18345	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013859	AATCA	2	10	19295	19304	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013859	AGAGG	2	10	20243	20252	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013859	TTGAA	2	10	20261	20270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013859	ATCCC	2	10	21436	21445	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_013859	TCAAT	2	10	25345	25354	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013859	CCGCG	2	10	27652	27661	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_013859	AGGCG	2	10	28204	28213	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013859	CCATC	2	10	35623	35632	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_013859	ATTCC	2	10	48415	48424	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013859	CATGC	2	10	54881	54890	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013859	CGCCC	2	10	55213	55222	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_013859	GTCCG	2	10	59187	59196	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013859	TCCAT	2	10	84594	84603	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013859	TGCGT	2	10	84631	84640	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013859	ATCCG	2	10	92626	92635	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013859	GCCCC	2	10	98548	98557	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25	NC_013859	CCGGC	2	10	144231	144240	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_013859	GGTGA	2	10	145518	145527	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013859	CGTCC	2	10	151999	152008	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_013859	CGTGA	2	10	163994	164003	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013859	CGGCC	2	10	200277	200286	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_013859	CCGCC	2	10	206214	206223	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_013859	GGACA	2	10	206836	206845	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013859	CGCGG	2	10	206950	206959	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013859	TCCCG	2	10	217855	217864	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_013859	GGCGT	2	10	224180	224189	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013859	CGGCG	2	10	238827	238836	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_013859	CCCTC	2	10	238872	238881	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_013859	CCGGC	2	10	239823	239832	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_013859	TCGGC	2	10	239833	239842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013859	CCGGC	2	10	239843	239852	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_013859	GCCCG	2	10	246121	246130	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_013859	CGCAG	2	10	249980	249989	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013859	ATACA	2	10	253455	253464	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013859	GCGCG	2	10	254658	254667	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_013859	GCCAC	2	10	254672	254681	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_013859	CAAAA	2	10	270271	270280	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013859	GGCCG	2	10	278959	278968	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_013859	CAGGG	2	10	296825	296834	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013859	CCTTT	2	10	308315	308324	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013859	CGGCG	2	10	334742	334751	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013859	GCAAC	2	10	340769	340778	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_013859	TCGTC	2	10	340946	340955	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013859	GTACG	2	10	362488	362497	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013859	CCGGA	2	10	402183	402192	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_013859	GGATC	2	10	427668	427677	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013859	ATCAA	2	10	427724	427733	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013859	TCATG	2	10	427858	427867	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013859	ATCGG	2	10	460124	460133	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013859	CGCCT	2	10	463551	463560	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_013859	GCGCC	2	10	485190	485199	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_013859	GACCG	2	10	485391	485400	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013859	TCAGA	2	10	499930	499939	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013859	CGCGG	2	10	511721	511730	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013859	TGCCG	2	10	513049	513058	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_013859	GGAGG	2	10	513474	513483	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013859	CCCGG	2	10	515698	515707	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_013859	CCGGC	2	10	516665	516674	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_013859	CCCCA	2	10	518455	518464	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
68	NC_013859	CGCCC	2	10	522432	522441	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
69	NC_013859	CCCTT	2	10	526070	526079	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.