MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510e

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013859	TGAC	2	8	456	463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013859	GGGA	2	8	6045	6052	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013859	GCCA	2	8	7184	7191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013859	GCCG	2	8	9434	9441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013859	TTCA	2	8	9459	9466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013859	TCAA	2	8	14751	14758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013859	GAAC	2	8	16467	16474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013859	GTGA	2	8	16810	16817	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013859	GTCA	2	8	16974	16981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013859	GGAC	2	8	17122	17129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013859	GGAA	2	8	18271	18278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013859	GGCC	2	8	18393	18400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013859	GGCT	2	8	18418	18425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013859	GCGA	2	8	18766	18773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013859	GCCA	2	8	18785	18792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013859	CAGA	2	8	19444	19451	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013859	GGTG	2	8	19453	19460	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013859	AAAG	2	8	19588	19595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013859	ATTC	2	8	24049	24056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013859	CAGT	2	8	24350	24357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013859	CGGT	2	8	26673	26680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013859	GCTG	2	8	26845	26852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013859	TCGA	2	8	27050	27057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013859	CGCC	2	8	27141	27148	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_013859	GACG	2	8	27221	27228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013859	GGAT	2	8	27374	27381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013859	GGGT	2	8	27416	27423	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013859	AAGC	2	8	27906	27913	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013859	CCCG	2	8	27988	27995	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_013859	ATAA	2	8	29407	29414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013859	AACC	2	8	33467	33474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013859	AGGG	2	8	33892	33899	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013859	CCTC	2	8	37049	37056	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_013859	GCAC	2	8	37069	37076	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013859	CTCA	2	8	37281	37288	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013859	CTGA	2	8	48208	48215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013859	ATGA	2	8	48231	48238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013859	GTCC	2	8	60420	60427	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013859	GACA	2	8	61028	61035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013859	TCGG	2	8	61183	61190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013859	CGGC	2	8	72169	72176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013859	GGCC	2	8	78827	78834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013859	ACTC	2	8	78890	78897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013859	CCTT	2	8	78905	78912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013859	CGTG	2	8	79652	79659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013859	ACGC	2	8	79875	79882	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013859	TGAT	2	8	81883	81890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013859	GCCG	2	8	85196	85203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013859	CTTT	2	8	85998	86005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013859	ATTA	2	8	86326	86333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013859	TTGA	2	8	86334	86341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013859	GCTG	2	8	86547	86554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013859	CAAC	2	8	92680	92687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013859	GTGA	2	8	92774	92781	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013859	GGCG	2	8	94561	94568	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013859	AGCC	2	8	95374	95381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013859	CGAC	2	8	109424	109431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013859	CTGG	2	8	109503	109510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013859	GGCT	2	8	109540	109547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013859	CGGT	2	8	109814	109821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013859	CGCC	2	8	113571	113578	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_013859	GAGG	2	8	121461	121468	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013859	TCCC	2	8	137959	137966	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_013859	GAGG	2	8	137976	137983	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013859	CGAA	2	8	141635	141642	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013859	TCCC	2	8	142698	142705	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_013859	GCCG	2	8	144200	144207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013859	CCCG	2	8	145469	145476	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_013859	GACG	2	8	145487	145494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013859	CTGT	2	8	148392	148399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013859	GTGC	2	8	149939	149946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013859	CCGG	2	8	153617	153624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013859	GCGG	2	8	156199	156206	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013859	CGGA	2	8	159700	159707	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013859	ATTA	2	8	159858	159865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013859	GCCG	2	8	159889	159896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013859	GGCG	2	8	165217	165224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013859	CCGC	3	12	175920	175931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_013859	GCGG	3	12	175942	175953	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013859	GTTG	2	8	177256	177263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013859	GCCC	2	8	178248	178255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_013859	AGCC	2	8	178573	178580	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013859	TGCC	2	8	182411	182418	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013859	CGGC	2	8	185076	185083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013859	CAGC	2	8	185140	185147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013859	ACGG	2	8	186552	186559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013859	GGGC	2	8	189249	189256	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013859	GCCC	2	8	192222	192229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_013859	CGAC	2	8	192308	192315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013859	GCCC	2	8	192467	192474	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_013859	TCCG	2	8	192483	192490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013859	ATTC	2	8	201066	201073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013859	ACGG	2	8	201211	201218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013859	GGCG	2	8	204884	204891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013859	CGGC	2	8	206232	206239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013859	ATCC	2	8	206274	206281	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013859	GCCC	2	8	210550	210557	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_013859	CCGG	2	8	211543	211550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013859	GCCG	2	8	216357	216364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013859	GGAC	2	8	220891	220898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013859	ACCG	2	8	222432	222439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013859	GCCA	2	8	227596	227603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013859	GGGA	2	8	227704	227711	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013859	GCCG	2	8	230533	230540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013859	GCCA	2	8	230613	230620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013859	GGGA	2	8	232619	232626	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013859	GTCC	2	8	238796	238803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013859	CGGG	2	8	238845	238852	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013859	GCCG	2	8	241099	241106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013859	GATT	2	8	241294	241301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013859	GGGA	2	8	242038	242045	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013859	CCGG	2	8	246223	246230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013859	CGGT	2	8	246254	246261	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013859	GGCG	2	8	249234	249241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013859	AAGG	2	8	250829	250836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013859	CGGG	2	8	256429	256436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013859	GGGC	2	8	256469	256476	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013859	CATT	2	8	256554	256561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013859	TCGT	2	8	256563	256570	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013859	GAGC	2	8	256575	256582	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013859	GCAA	2	8	269092	269099	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013859	TTCC	2	8	278809	278816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013859	GTCG	2	8	282814	282821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013859	CGGC	2	8	284200	284207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013859	ACGG	2	8	284340	284347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013859	ATCC	3	12	284471	284482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013859	AAAC	2	8	287449	287456	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013859	AAAT	2	8	287479	287486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013859	CATC	2	8	291733	291740	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013859	TCGA	2	8	299079	299086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013859	AGGG	2	8	300596	300603	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013859	CGGA	2	8	303892	303899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013859	GCCC	2	8	303921	303928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_013859	CCTT	2	8	305446	305453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013859	GACC	2	8	305507	305514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013859	TCCC	3	12	306901	306912	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_013859	CCAG	2	8	309969	309976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013859	GCCC	2	8	311167	311174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_013859	GTTT	2	8	312386	312393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013859	CGGC	2	8	320252	320259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013859	ACGG	2	8	321526	321533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013859	CGGA	3	12	321586	321597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013859	TCCC	2	8	324191	324198	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_013859	CGGG	2	8	324203	324210	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013859	AACC	2	8	328207	328214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013859	GATG	2	8	334661	334668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013859	GCCA	2	8	334710	334717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013859	CGGC	2	8	336353	336360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013859	TCCG	2	8	336458	336465	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013859	TGCC	2	8	337925	337932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013859	CGCC	2	8	338059	338066	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
152	NC_013859	GACG	2	8	341047	341054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_013859	TCGA	2	8	379555	379562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_013859	GACC	2	8	398153	398160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
182	NC_013859	CGGA	2	8	400892	400899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_013859	CGCC	2	8	402395	402402	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
186	NC_013859	GAAG	2	8	411482	411489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_013859	CCGG	2	8	416757	416764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
189	NC_013859	GCCG	2	8	418228	418235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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191	NC_013859	CATC	2	8	429157	429164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
192	NC_013859	TAAT	2	8	429301	429308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_013859	TCTT	2	8	432202	432209	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
194	NC_013859	AAAT	2	8	432326	432333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_013859	GGCC	2	8	436863	436870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
196	NC_013859	GCCT	2	8	439877	439884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
197	NC_013859	AAAG	2	8	439906	439913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
198	NC_013859	CCGG	2	8	440290	440297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
199	NC_013859	GGAT	2	8	450100	450107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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201	NC_013859	CCGG	2	8	456002	456009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
202	NC_013859	CCAA	2	8	456014	456021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
203	NC_013859	CCGC	2	8	456155	456162	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
204	NC_013859	ACCG	2	8	461102	461109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
205	NC_013859	CCGC	3	12	473199	473210	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
206	NC_013859	CGCC	2	8	473218	473225	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
207	NC_013859	ACCA	2	8	474525	474532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
208	NC_013859	GCGG	2	8	476310	476317	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
209	NC_013859	CCGC	3	12	476329	476340	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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217	NC_013859	ATTG	2	8	501473	501480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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219	NC_013859	CCCG	2	8	506044	506051	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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225	NC_013859	CGGG	2	8	516742	516749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
226	NC_013859	CGCC	2	8	518541	518548	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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230	NC_013859	GGGA	2	8	528484	528491	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.